Pathway_ID Pathway_Name Accession_Count Accessions KEGG: 00760+3.6.1.9 Nicotinate and nicotinamide metabolism 1 CFLO002000-PA KEGG: 00591+3.1.1.4 Linoleic acid metabolism 9 CFLO003207-PA;CFLO002075-PA;CFLO005099-PA;CFLO005379-PA;CFLO017976-PA;CFLO013271-PA;CFLO016978-PA;CFLO000557-PA;CFLO006994-PA Reactome: R-HSA-4755609 Defective DHDDS causes retinitis pigmentosa 59 2 CFLO002639-PA;CFLO018648-PA Reactome: R-HSA-176409 APC/C:Cdc20 mediated degradation of mitotic proteins 8 CFLO006992-PA;CFLO009576-PA;CFLO010492-PA;CFLO007123-PA;CFLO007015-PA;CFLO012167-PA;CFLO005584-PA;CFLO006211-PA Reactome: R-HSA-1963642 PI3K events in ERBB2 signaling 1 CFLO009698-PA Reactome: R-HSA-8943723 Regulation of PTEN mRNA translation 5 CFLO012806-PA;CFLO011446-PA;CFLO005758-PA;CFLO012800-PA;CFLO001535-PA Reactome: R-HSA-6794361 Neurexins and neuroligins 7 CFLO002951-PA;CFLO016449-PA;CFLO005713-PA;CFLO011075-PA;CFLO003613-PA;CFLO012219-PA;CFLO006070-PA Reactome: R-HSA-1227986 Signaling by ERBB2 2 CFLO005384-PA;CFLO009698-PA Reactome: R-HSA-203927 MicroRNA (miRNA) biogenesis 15 CFLO012806-PA;CFLO000311-PA;CFLO004196-PA;CFLO007012-PA;CFLO009635-PA;CFLO019644-PA;CFLO011446-PA;CFLO010911-PA;CFLO000873-PA;CFLO001535-PA;CFLO012983-PA;CFLO012800-PA;CFLO015637-PA;CFLO006277-PA;CFLO014021-PA MetaCyc: PWY-5136 Fatty acid beta-oxidation II (plant peroxisome) 4 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA;CFLO013479-PA;CFLO013638-PA KEGG: 00620+1.1.1.37 Pyruvate metabolism 2 CFLO007214-PA;CFLO018047-PA Reactome: R-HSA-6784531 tRNA processing in the nucleus 41 CFLO004815-PA;CFLO002141-PA;CFLO004070-PA;CFLO001248-PA;CFLO002797-PA;CFLO004819-PA;CFLO012747-PA;CFLO006277-PA;CFLO003946-PA;CFLO014832-PA;CFLO010496-PA;CFLO004818-PA;CFLO008709-PA;CFLO017625-PA;CFLO002998-PA;CFLO012487-PA;CFLO012013-PA;CFLO006553-PA;CFLO013926-PA;CFLO013495-PA;CFLO011466-PA;CFLO013542-PA;CFLO005636-PA;CFLO003215-PA;CFLO006585-PA;CFLO010441-PA;CFLO002749-PA;CFLO014829-PA;CFLO008090-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO004010-PA;CFLO000572-PA;CFLO005698-PA;CFLO008087-PA;CFLO008088-PA;CFLO013550-PA;CFLO002763-PA;CFLO014833-PA;CFLO005532-PA;CFLO000120-PA Reactome: R-HSA-198323 AKT phosphorylates targets in the cytosol 3 CFLO007329-PA;CFLO005536-PA;CFLO011980-PA KEGG: 00030+1.1.1.44 Pentose phosphate pathway 1 CFLO007188-PA KEGG: 00362+4.2.1.17 Benzoate degradation 1 CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-1912420 Pre-NOTCH Processing in Golgi 2 CFLO004389-PA;CFLO000670-PA Reactome: R-HSA-5676934 Protein repair 2 CFLO014195-PA;CFLO008192-PA Reactome: R-HSA-9656255 Defective OGG1 Substrate Binding 1 CFLO003212-PA KEGG: 00230+2.4.2.7 Purine metabolism 1 CFLO000881-PA KEGG: 00550+2.4.1.227 Peptidoglycan biosynthesis 1 CFLO008725-PA Reactome: R-HSA-937039 IRAK1 recruits IKK complex 1 CFLO001451-PA MetaCyc: PWY-7115 C4 photosynthetic carbon assimilation cycle, NAD-ME type 6 CFLO007214-PA;CFLO003306-PA;CFLO003089-PA;CFLO016169-PA;CFLO018047-PA;CFLO000623-PA KEGG: 00230+3.6.1.9 Purine metabolism 1 CFLO002000-PA MetaCyc: PWY-7767 L-leucine degradation IV (Stickland reaction) 1 CFLO006978-PA KEGG: 05165+2.7.1.153 Human papillomavirus infection 1 CFLO011291-PA KEGG: 00524+2.7.1.1 Neomycin, kanamycin and gentamicin biosynthesis 1 CFLO006809-PA KEGG: 00520+5.3.1.8 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 1 CFLO000596-PA KEGG: 00010+2.7.1.11 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO000222-PA KEGG: 00710+2.7.2.3 Carbon fixation in photosynthetic organisms 1 CFLO015634-PA Reactome: R-HSA-5617833 Cilium Assembly 9 CFLO016852-PA;CFLO014186-PA;CFLO006561-PA;CFLO009841-PA;CFLO001242-PA;CFLO004179-PA;CFLO002905-PA;CFLO010953-PA;CFLO008841-PA Reactome: R-HSA-9033807 ABO blood group biosynthesis 1 CFLO000956-PA KEGG: 00564+2.7.1.107 Glycerophospholipid metabolism 6 CFLO016462-PA;CFLO010224-PA;CFLO001719-PA;CFLO006114-PA;CFLO006115-PA;CFLO006116-PA MetaCyc: PWY-6352 3-phosphoinositide biosynthesis 3 CFLO000498-PA;CFLO011291-PA;CFLO008697-PA Reactome: R-HSA-5358751 S45 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated 3 CFLO001327-PA;CFLO007019-PA;CFLO015916-PA Reactome: R-HSA-2022090 Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures 3 CFLO016374-PA;CFLO012358-PA;CFLO018020-PA Reactome: R-HSA-180534 Vpu mediated degradation of CD4 39 CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO004457-PA;CFLO000953-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO014805-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO009082-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO009081-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO001064-PA;CFLO006007-PA MetaCyc: PWY-7282 4-amino-2-methyl-5-phosphomethylpyrimidine biosynthesis 4 CFLO011458-PA;CFLO015233-PA;CFLO004155-PA;CFLO004461-PA Reactome: R-HSA-69202 Cyclin E associated events during G1/S transition 5 CFLO010322-PA;CFLO007346-PA;CFLO002764-PA;CFLO013980-PA;CFLO006247-PA Reactome: R-HSA-2161541 Abacavir metabolism 1 CFLO004064-PA MetaCyc: PWY-2161 Folate polyglutamylation 4 CFLO014967-PA;CFLO000972-PA;CFLO010087-PA;CFLO003993-PA KEGG: 00473+5.1.1.1 D-Alanine metabolism 1 CFLO003043-PA Reactome: R-HSA-430039 mRNA decay by 5' to 3' exoribonuclease 12 CFLO002580-PA;CFLO010268-PA;CFLO012325-PA;CFLO004904-PA;CFLO010059-PA;CFLO005696-PA;CFLO006113-PA;CFLO011248-PA;CFLO012566-PA;CFLO004177-PA;CFLO015852-PA;CFLO000171-PA KEGG: 00350+2.6.1.5 Tyrosine metabolism 1 CFLO012357-PA KEGG: 00730+2.7.6.2 Thiamine metabolism 1 CFLO003438-PA Reactome: R-HSA-165159 mTOR signalling 7 CFLO015017-PA;CFLO018008-PA;CFLO003386-PA;CFLO005536-PA;CFLO015160-PA;CFLO005629-PA;CFLO003088-PA KEGG: 00260+1.1.1.1 Glycine, serine and threonine metabolism 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-419037 NCAM1 interactions 2 CFLO012358-PA;CFLO002975-PA KEGG: 00970+6.1.1.11 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 3 CFLO006260-PA;CFLO000024-PA;CFLO009893-PA Reactome: R-HSA-5339716 Misspliced GSK3beta mutants stabilize beta-catenin 3 CFLO015916-PA;CFLO007019-PA;CFLO001327-PA Reactome: R-HSA-442742 CREB1 phosphorylation through NMDA receptor-mediated activation of RAS signaling 1 CFLO004063-PA KEGG: 00760+6.3.4.21 Nicotinate and nicotinamide metabolism 1 CFLO002055-PA KEGG: 00561+2.7.1.30 Glycerolipid metabolism 5 CFLO009826-PA;CFLO001808-PA;CFLO015003-PA;CFLO003214-PA;CFLO003232-PA KEGG: 00280+2.6.1.42 Valine, leucine and isoleucine degradation 1 CFLO006978-PA Reactome: R-HSA-72187 mRNA 3'-end processing 23 CFLO015268-PA;CFLO013670-PA;CFLO002733-PA;CFLO007295-PA;CFLO013992-PA;CFLO013926-PA;CFLO012401-PA;CFLO000613-PA;CFLO001068-PA;CFLO011459-PA;CFLO007347-PA;CFLO008219-PA;CFLO013126-PA;CFLO008709-PA;CFLO000562-PA;CFLO007349-PA;CFLO017483-PA;CFLO013732-PA;CFLO013673-PA;CFLO003235-PA;CFLO014491-PA;CFLO008706-PA;CFLO016375-PA Reactome: R-HSA-264876 Insulin processing 7 CFLO018657-PA;CFLO005962-PA;CFLO006179-PA;CFLO004109-PA;CFLO011599-PA;CFLO016175-PA;CFLO000332-PA Reactome: R-HSA-392154 Nitric oxide stimulates guanylate cyclase 6 CFLO005105-PA;CFLO005107-PA;CFLO012007-PA;CFLO015446-PA;CFLO009325-PA;CFLO010397-PA MetaCyc: PWY-8072 Alanine racemization 1 CFLO003043-PA KEGG: 00020+1.8.1.4 Citrate cycle (TCA cycle) 1 CFLO000151-PA Reactome: R-HSA-68616 Assembly of the ORC complex at the origin of replication 7 CFLO018836-PA;CFLO003334-PA;CFLO010697-PA;CFLO010055-PA;CFLO004463-PA;CFLO002602-PA;CFLO004726-PA Reactome: R-HSA-75876 Synthesis of very long-chain fatty acyl-CoAs 15 CFLO008781-PA;CFLO008778-PA;CFLO007106-PA;CFLO006701-PA;CFLO010956-PA;CFLO008779-PA;CFLO010863-PA;CFLO010959-PA;CFLO010625-PA;CFLO015666-PA;CFLO008782-PA;CFLO010957-PA;CFLO004004-PA;CFLO015015-PA;CFLO008780-PA MetaCyc: PWY-6788 Cellulose degradation II (fungi) 1 CFLO000491-PA MetaCyc: PWY-7856 Heme a biosynthesis 1 CFLO013489-PA Reactome: R-HSA-5223345 Miscellaneous transport and binding events 3 CFLO008786-PA;CFLO006677-PA;CFLO000940-PA Reactome: R-HSA-5610785 GLI3 is processed to GLI3R by the proteasome 40 CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO001095-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO009082-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO004457-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO014819-PA;CFLO005641-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO006007-PA;CFLO001064-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO009081-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA MetaCyc: PWY-4984 Urea cycle 1 CFLO004683-PA MetaCyc: PWY-5074 Mevalonate degradation 1 CFLO005374-PA Reactome: R-HSA-2142753 Arachidonic acid metabolism 2 CFLO011441-PA;CFLO014338-PA Reactome: R-HSA-6803207 TP53 Regulates Transcription of Caspase Activators and Caspases 2 CFLO003390-PA;CFLO006104-PA Reactome: R-HSA-6791461 RPIA deficiency: failed conversion of RU5P to R5P 1 CFLO001993-PA KEGG: 00030+5.3.1.6 Pentose phosphate pathway 1 CFLO001993-PA Reactome: R-HSA-425381 Bicarbonate transporters 2 CFLO010339-PA;CFLO000173-PA Reactome: R-HSA-4793954 Defective MOGS causes MOGS-CDG (CDG-2b) 2 CFLO015264-PA;CFLO019370-PA KEGG: 00565+3.1.1.4 Ether lipid metabolism 9 CFLO006994-PA;CFLO000557-PA;CFLO016978-PA;CFLO013271-PA;CFLO017976-PA;CFLO002075-PA;CFLO005099-PA;CFLO005379-PA;CFLO003207-PA Reactome: R-HSA-68962 Activation of the pre-replicative complex 33 CFLO001238-PA;CFLO014200-PA;CFLO008924-PA;CFLO005301-PA;CFLO003010-PA;CFLO018658-PA;CFLO010604-PA;CFLO003985-PA;CFLO012315-PA;CFLO019062-PA;CFLO004463-PA;CFLO011907-PA;CFLO004877-PA;CFLO008828-PA;CFLO006346-PA;CFLO004429-PA;CFLO008927-PA;CFLO015230-PA;CFLO002077-PA;CFLO015227-PA;CFLO010697-PA;CFLO010055-PA;CFLO001338-PA;CFLO003334-PA;CFLO007147-PA;CFLO002602-PA;CFLO004726-PA;CFLO001616-PA;CFLO012204-PA;CFLO002987-PA;CFLO000045-PA;CFLO009733-PA;CFLO018836-PA Reactome: R-HSA-167242 Abortive elongation of HIV-1 transcript in the absence of Tat 16 CFLO013992-PA;CFLO019592-PA;CFLO005353-PA;CFLO007113-PA;CFLO018085-PA;CFLO007012-PA;CFLO008569-PA;CFLO015189-PA;CFLO010911-PA;CFLO014021-PA;CFLO015637-PA;CFLO013674-PA;CFLO007118-PA;CFLO008811-PA;CFLO002885-PA;CFLO004196-PA Reactome: R-HSA-425366 Transport of bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds 10 CFLO001083-PA;CFLO011424-PA;CFLO010485-PA;CFLO005109-PA;CFLO005376-PA;CFLO010512-PA;CFLO004710-PA;CFLO003001-PA;CFLO000064-PA;CFLO007791-PA MetaCyc: PWY-5523 5,6-dimethylbenzimidazole biosynthesis I (aerobic) 1 CFLO006180-PA KEGG: 00910+6.3.1.2 Nitrogen metabolism 3 CFLO007634-PA;CFLO007633-PA;CFLO007632-PA MetaCyc: PWY-6282 Palmitoleate biosynthesis I (from (5Z)-dodec-5-enoate) 3 CFLO002012-PA;CFLO002013-PA;CFLO016519-PA Reactome: R-HSA-2564830 Cytosolic iron-sulfur cluster assembly 7 CFLO000877-PA;CFLO002374-PA;CFLO009087-PA;CFLO009626-PA;CFLO005917-PA;CFLO007745-PA;CFLO006706-PA Reactome: R-HSA-446199 Synthesis of Dolichyl-phosphate 4 CFLO015626-PA;CFLO018648-PA;CFLO001964-PA;CFLO002639-PA KEGG: 00531+3.2.1.35 Glycosaminoglycan degradation 3 CFLO002275-PA;CFLO002277-PA;CFLO002276-PA Reactome: R-HSA-74259 Purine catabolism 4 CFLO016529-PA;CFLO011185-PA;CFLO000145-PA;CFLO002281-PA Reactome: R-HSA-2586552 Signaling by Leptin 1 CFLO002010-PA KEGG: 00020+2.3.1.61 Citrate cycle (TCA cycle) 2 CFLO015982-PA;CFLO015979-PA Reactome: R-HSA-8935964 RUNX1 regulates expression of components of tight junctions 2 CFLO007361-PA;CFLO007362-PA KEGG: 00332+2.7.2.11+1.2.1.41 Carbapenem biosynthesis 1 CFLO002293-PA Reactome: R-HSA-5218920 VEGFR2 mediated vascular permeability 7 CFLO014421-PA;CFLO000209-PA;CFLO018008-PA;CFLO014425-PA;CFLO011784-PA;CFLO008104-PA;CFLO004869-PA MetaCyc: PWY-7102 Bisabolene biosynthesis (engineered) 1 CFLO008710-PA Reactome: R-HSA-983189 Kinesins 28 CFLO001745-PA;CFLO016852-PA;CFLO004153-PA;CFLO015146-PA;CFLO009841-PA;CFLO009616-PA;CFLO006561-PA;CFLO004019-PA;CFLO004179-PA;CFLO007144-PA;CFLO014436-PA;CFLO008841-PA;CFLO004993-PA;CFLO001427-PA;CFLO005365-PA;CFLO007308-PA;CFLO001242-PA;CFLO014433-PA;CFLO004795-PA;CFLO014186-PA;CFLO009870-PA;CFLO002905-PA;CFLO004813-PA;CFLO009043-PA;CFLO016843-PA;CFLO002963-PA;CFLO016840-PA;CFLO006285-PA KEGG: 00670+2.1.1.45 One carbon pool by folate 2 CFLO005098-PA;CFLO005088-PA Reactome: R-HSA-446210 Synthesis of UDP-N-acetyl-glucosamine 3 CFLO004651-PA;CFLO017590-PA;CFLO018399-PA Reactome: R-HSA-209543 p75NTR recruits signalling complexes 1 CFLO018652-PA MetaCyc: PWY-6147 6-hydroxymethyl-dihydropterin diphosphate biosynthesis I 1 CFLO002629-PA MetaCyc: PWY-7226 Guanosine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis I 8 CFLO010539-PA;CFLO005692-PA;CFLO012552-PA;CFLO012591-PA;CFLO001680-PA;CFLO000685-PA;CFLO000684-PA;CFLO015574-PA KEGG: 00970+6.1.1.17 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 2 CFLO019070-PA;CFLO001718-PA MetaCyc: PWY-7053 Docosahexaenoate biosynthesis I (lower eukaryotes) 2 CFLO007106-PA;CFLO006701-PA KEGG: 00240+3.1.3.5 Pyrimidine metabolism 2 CFLO011225-PA;CFLO011228-PA Reactome: R-HSA-1362277 Transcription of E2F targets under negative control by DREAM complex 5 CFLO002764-PA;CFLO008680-PA;CFLO007346-PA;CFLO002077-PA;CFLO013980-PA Reactome: R-HSA-209905 Catecholamine biosynthesis 1 CFLO000009-PA Reactome: R-HSA-5686938 Regulation of TLR by endogenous ligand 3 CFLO019853-PA;CFLO011745-PA;CFLO002286-PA Reactome: R-HSA-204174 Regulation of pyruvate dehydrogenase (PDH) complex 4 CFLO013555-PA;CFLO011048-PA;CFLO000151-PA;CFLO011080-PA MetaCyc: PWY-8004 Entner-Doudoroff pathway I 10 CFLO016901-PA;CFLO014828-PA;CFLO009751-PA;CFLO009597-PA;CFLO007127-PA;CFLO008606-PA;CFLO015634-PA;CFLO008875-PA;CFLO007423-PA;CFLO003967-PA MetaCyc: PWY-6837 Fatty acid beta-oxidation V (unsaturated, odd number, di-isomerase-dependent) 2 CFLO013638-PA;CFLO013479-PA Reactome: R-HSA-198933 Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell 1 CFLO002788-PA KEGG: 00720+6.4.1.2 Carbon fixation pathways in prokaryotes 1 CFLO005702-PA MetaCyc: PWY-6679 Jadomycin biosynthesis 1 CFLO005702-PA Reactome: R-HSA-69205 G1/S-Specific Transcription 12 CFLO000045-PA;CFLO005098-PA;CFLO005088-PA;CFLO004877-PA;CFLO015230-PA;CFLO002077-PA;CFLO002764-PA;CFLO013980-PA;CFLO012204-PA;CFLO012613-PA;CFLO008680-PA;CFLO007346-PA Reactome: R-HSA-8854214 TBC/RABGAPs 3 CFLO011980-PA;CFLO015261-PA;CFLO016893-PA MetaCyc: PWY-5941 Glycogen degradation II 2 CFLO001588-PA;CFLO018464-PA Reactome: R-HSA-73772 RNA Polymerase I Promoter Escape 28 CFLO007399-PA;CFLO014021-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO010911-PA;CFLO007437-PA;CFLO008042-PA;CFLO006370-PA;CFLO004197-PA;CFLO004196-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO010322-PA;CFLO002136-PA;CFLO011191-PA;CFLO007128-PA;CFLO006247-PA;CFLO011812-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO012310-PA;CFLO010821-PA;CFLO019070-PA;CFLO008703-PA;CFLO007391-PA;CFLO003630-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA Reactome: R-HSA-5683826 Surfactant metabolism 3 CFLO005138-PA;CFLO012573-PA;CFLO012580-PA Reactome: R-HSA-5389840 Mitochondrial translation elongation 52 CFLO004314-PA;CFLO003031-PA;CFLO006168-PA;CFLO011956-PA;CFLO009221-PA;CFLO012130-PA;CFLO010710-PA;CFLO015389-PA;CFLO017155-PA;CFLO018653-PA;CFLO002093-PA;CFLO008755-PA;CFLO015387-PA;CFLO005125-PA;CFLO001247-PA;CFLO010952-PA;CFLO014432-PA;CFLO010951-PA;CFLO001694-PA;CFLO004662-PA;CFLO011982-PA;CFLO016805-PA;CFLO009374-PA;CFLO006227-PA;CFLO002303-PA;CFLO000163-PA;CFLO016920-PA;CFLO014229-PA;CFLO004978-PA;CFLO008273-PA;CFLO000368-PA;CFLO002743-PA;CFLO007143-PA;CFLO012499-PA;CFLO003945-PA;CFLO000324-PA;CFLO000394-PA;CFLO004033-PA;CFLO007760-PA;CFLO008846-PA;CFLO019069-PA;CFLO001318-PA;CFLO016807-PA;CFLO008626-PA;CFLO006493-PA;CFLO018418-PA;CFLO012369-PA;CFLO008786-PA;CFLO007023-PA;CFLO012496-PA;CFLO012287-PA;CFLO018124-PA KEGG: 00790+2.8.1.9 Folate biosynthesis 1 CFLO003369-PA MetaCyc: PWY-8041 Ultra-long-chain fatty acid biosynthesis 15 CFLO015015-PA;CFLO004004-PA;CFLO008780-PA;CFLO010957-PA;CFLO008782-PA;CFLO008779-PA;CFLO010863-PA;CFLO010956-PA;CFLO010959-PA;CFLO010625-PA;CFLO015666-PA;CFLO007106-PA;CFLO008778-PA;CFLO008781-PA;CFLO006701-PA KEGG: 00360+4.2.1.17 Phenylalanine metabolism 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-9020702 Interleukin-1 signaling 42 CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO009081-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO006007-PA;CFLO001064-PA;CFLO000939-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO002615-PA;CFLO007718-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO002304-PA;CFLO014805-PA;CFLO018092-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO000953-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO009082-PA;CFLO001095-PA;CFLO015469-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO010590-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO014819-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO001451-PA;CFLO004457-PA;CFLO011518-PA;CFLO018652-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA MetaCyc: PWY-7269 NAD/NADP-NADH/NADPH mitochondrial interconversion (yeast) 2 CFLO006142-PA;CFLO019576-PA KEGG: 00071+1.1.1.1 Fatty acid degradation 1 CFLO016846-PA MetaCyc: PWY-6471 Peptidoglycan biosynthesis IV (Enterococcus faecium) 2 CFLO008725-PA;CFLO016451-PA MetaCyc: PWY-6030 Serotonin and melatonin biosynthesis 1 CFLO004689-PA MetaCyc: PWY-5895 Menaquinol-13 biosynthesis 1 CFLO018555-PA KEGG: 00600+1.14.19.17 Sphingolipid metabolism 1 CFLO018552-PA MetaCyc: PWY-5849 Menaquinol-6 biosynthesis 1 CFLO018555-PA KEGG: 00680+6.2.1.1 Methane metabolism 2 CFLO016628-PA;CFLO016902-PA MetaCyc: PWY-7222 Guanosine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis II 8 CFLO010539-PA;CFLO012552-PA;CFLO001680-PA;CFLO012591-PA;CFLO000685-PA;CFLO005692-PA;CFLO000684-PA;CFLO015574-PA Reactome: R-HSA-5362768 Hh mutants that don't undergo autocatalytic processing are degraded by ERAD 37 CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO014819-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO004457-PA;CFLO000953-PA;CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO010590-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO001095-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO016610-PA;CFLO000939-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO002304-PA;CFLO007718-PA;CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO013733-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO001064-PA KEGG: 04070+3.1.4.11 Phosphatidylinositol signaling system 7 CFLO005525-PA;CFLO013725-PA;CFLO001388-PA;CFLO007261-PA;CFLO009620-PA;CFLO008821-PA;CFLO005526-PA KEGG: 00230+2.7.4.6 Purine metabolism 4 CFLO012591-PA;CFLO015574-PA;CFLO005692-PA;CFLO010539-PA KEGG: 00240+3.6.1.9 Pyrimidine metabolism 1 CFLO002000-PA Reactome: R-HSA-1834949 Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA 17 CFLO010841-PA;CFLO002623-PA;CFLO017331-PA;CFLO003937-PA;CFLO010802-PA;CFLO004196-PA;CFLO000579-PA;CFLO010911-PA;CFLO017589-PA;CFLO001122-PA;CFLO014021-PA;CFLO010805-PA;CFLO016607-PA;CFLO010673-PA;CFLO019070-PA;CFLO019378-PA;CFLO000558-PA Reactome: R-HSA-425986 Sodium/Proton exchangers 2 CFLO002060-PA;CFLO015249-PA Reactome: R-HSA-1251985 Nuclear signaling by ERBB4 4 CFLO015617-PA;CFLO001428-PA;CFLO009368-PA;CFLO008212-PA Reactome: R-HSA-8951430 RUNX3 regulates WNT signaling 1 CFLO009267-PA Reactome: R-HSA-211897 Cytochrome P450 - arranged by substrate type 1 CFLO004172-PA Reactome: R-HSA-975957 Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) 89 CFLO013992-PA;CFLO013281-PA;CFLO004176-PA;CFLO011221-PA;CFLO005673-PA;CFLO003311-PA;CFLO010535-PA;CFLO016302-PA;CFLO010712-PA;CFLO002739-PA;CFLO015631-PA;CFLO003320-PA;CFLO012333-PA;CFLO012240-PA;CFLO002329-PA;CFLO014026-PA;CFLO002901-PA;CFLO008335-PA;CFLO006483-PA;CFLO002660-PA;CFLO004224-PA;CFLO014883-PA;CFLO019287-PA;CFLO004825-PA;CFLO006234-PA;CFLO013411-PA;CFLO013407-PA;CFLO018839-PA;CFLO006768-PA;CFLO011906-PA;CFLO016897-PA;CFLO004405-PA;CFLO000744-PA;CFLO005096-PA;CFLO004931-PA;CFLO005709-PA;CFLO017730-PA;CFLO011483-PA;CFLO017946-PA;CFLO000629-PA;CFLO012584-PA;CFLO010962-PA;CFLO004325-PA;CFLO000326-PA;CFLO004278-PA;CFLO008851-PA;CFLO014395-PA;CFLO002568-PA;CFLO001584-PA;CFLO005804-PA;CFLO013732-PA;CFLO000325-PA;CFLO005822-PA;CFLO009848-PA;CFLO000918-PA;CFLO013126-PA;CFLO012297-PA;CFLO003235-PA;CFLO004181-PA;CFLO019663-PA;CFLO014117-PA;CFLO004466-PA;CFLO003083-PA;CFLO004441-PA;CFLO000339-PA;CFLO008061-PA;CFLO008228-PA;CFLO018800-PA;CFLO017594-PA;CFLO012986-PA;CFLO005150-PA;CFLO012596-PA;CFLO012166-PA;CFLO000889-PA;CFLO005334-PA;CFLO013848-PA;CFLO013673-PA;CFLO000349-PA;CFLO010240-PA;CFLO008263-PA;CFLO017942-PA;CFLO005789-PA;CFLO001260-PA;CFLO007528-PA;CFLO000612-PA;CFLO013459-PA;CFLO013929-PA;CFLO006630-PA;CFLO010554-PA MetaCyc: PWY-6433 Hydroxylated fatty acid biosynthesis (plants) 15 CFLO010625-PA;CFLO015666-PA;CFLO010959-PA;CFLO008779-PA;CFLO010863-PA;CFLO010956-PA;CFLO006701-PA;CFLO007106-PA;CFLO008781-PA;CFLO008778-PA;CFLO008780-PA;CFLO004004-PA;CFLO015015-PA;CFLO010957-PA;CFLO008782-PA KEGG: 00600+3.2.1.45 Sphingolipid metabolism 1 CFLO003423-PA MetaCyc: PWY-7227 Adenosine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis 8 CFLO015574-PA;CFLO000684-PA;CFLO005692-PA;CFLO012552-PA;CFLO001680-PA;CFLO012591-PA;CFLO000685-PA;CFLO010539-PA KEGG: 00790+4.1.99.22 Folate biosynthesis 1 CFLO000312-PA KEGG: 00062+2.3.1.199 Fatty acid elongation 13 CFLO008779-PA;CFLO010863-PA;CFLO010956-PA;CFLO010625-PA;CFLO015666-PA;CFLO010959-PA;CFLO008778-PA;CFLO008781-PA;CFLO015015-PA;CFLO004004-PA;CFLO008780-PA;CFLO010957-PA;CFLO008782-PA KEGG: 00260+2.6.1.52 Glycine, serine and threonine metabolism 1 CFLO003969-PA KEGG: 00960+2.6.1.5 Tropane, piperidine and pyridine alkaloid biosynthesis 1 CFLO012357-PA Reactome: R-HSA-72702 Ribosomal scanning and start codon recognition 48 CFLO005334-PA;CFLO013407-PA;CFLO012160-PA;CFLO012596-PA;CFLO017594-PA;CFLO008061-PA;CFLO019287-PA;CFLO017947-PA;CFLO012191-PA;CFLO004224-PA;CFLO003095-PA;CFLO006483-PA;CFLO014117-PA;CFLO000744-PA;CFLO004405-PA;CFLO016897-PA;CFLO013459-PA;CFLO005013-PA;CFLO006768-PA;CFLO014479-PA;CFLO017942-PA;CFLO005789-PA;CFLO008263-PA;CFLO000349-PA;CFLO013848-PA;CFLO001584-PA;CFLO010535-PA;CFLO004727-PA;CFLO001752-PA;CFLO004278-PA;CFLO008829-PA;CFLO011221-PA;CFLO017333-PA;CFLO012584-PA;CFLO014362-PA;CFLO015650-PA;CFLO017946-PA;CFLO000629-PA;CFLO005537-PA;CFLO013281-PA;CFLO005709-PA;CFLO000828-PA;CFLO010904-PA;CFLO014026-PA;CFLO012297-PA;CFLO005822-PA;CFLO009848-PA;CFLO005804-PA MetaCyc: PWY-7216 (R)- and (S)-3-hydroxybutanoate biosynthesis (engineered) 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-5658442 Regulation of RAS by GAPs 38 CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO007718-PA;CFLO008854-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO001064-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO000691-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO011518-PA;CFLO002663-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO004457-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO010590-PA;CFLO015469-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA;CFLO000953-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA Reactome: R-HSA-450520 HuR (ELAVL1) binds and stabilizes mRNA 1 CFLO001592-PA MetaCyc: PWY-1722 Formate assimilation into 5,10-methylenetetrahydrofolate 3 CFLO004433-PA;CFLO003993-PA;CFLO001271-PA KEGG: 00240+2.4.2.3 Pyrimidine metabolism 1 CFLO003449-PA KEGG: 00460+3.5.1.1 Cyanoamino acid metabolism 1 CFLO001491-PA Reactome: R-HSA-2644607 Loss of Function of FBXW7 in Cancer and NOTCH1 Signaling 4 CFLO009082-PA;CFLO002615-PA;CFLO009081-PA;CFLO006007-PA Reactome: R-HSA-211981 Xenobiotics 4 CFLO011969-PA;CFLO013597-PA;CFLO002851-PA;CFLO008946-PA KEGG: 00983+2.7.4.6 Drug metabolism - other enzymes 4 CFLO012591-PA;CFLO015574-PA;CFLO005692-PA;CFLO010539-PA KEGG: 00620+2.7.1.40 Pyruvate metabolism 1 CFLO003967-PA MetaCyc: PWY-5892 Menaquinol-12 biosynthesis 1 CFLO018555-PA Reactome: R-HSA-2206305 MPS IIID - Sanfilippo syndrome D 1 CFLO000660-PA KEGG: 00643+1.13.11.5 Styrene degradation 1 CFLO003143-PA MetaCyc: PWY-6855 Chitin degradation I (archaea) 12 CFLO006976-PA;CFLO010596-PA;CFLO001781-PA;CFLO008237-PA;CFLO001724-PA;CFLO007127-PA;CFLO008050-PA;CFLO004926-PA;CFLO004916-PA;CFLO010218-PA;CFLO006957-PA;CFLO001957-PA Reactome: R-HSA-975956 Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) 78 CFLO013992-PA;CFLO013281-PA;CFLO004176-PA;CFLO011221-PA;CFLO003311-PA;CFLO010535-PA;CFLO016302-PA;CFLO010712-PA;CFLO003320-PA;CFLO015631-PA;CFLO012333-PA;CFLO002739-PA;CFLO002329-PA;CFLO012240-PA;CFLO014026-PA;CFLO002901-PA;CFLO006483-PA;CFLO008335-PA;CFLO004224-PA;CFLO019287-PA;CFLO014883-PA;CFLO004825-PA;CFLO013411-PA;CFLO006234-PA;CFLO018839-PA;CFLO013407-PA;CFLO006768-PA;CFLO011906-PA;CFLO004405-PA;CFLO016897-PA;CFLO005096-PA;CFLO000744-PA;CFLO005709-PA;CFLO011483-PA;CFLO017730-PA;CFLO000629-PA;CFLO017946-PA;CFLO010962-PA;CFLO012584-PA;CFLO000326-PA;CFLO004278-PA;CFLO004325-PA;CFLO014395-PA;CFLO008851-PA;CFLO001584-PA;CFLO002568-PA;CFLO005804-PA;CFLO000325-PA;CFLO005822-PA;CFLO009848-PA;CFLO000918-PA;CFLO012297-PA;CFLO019663-PA;CFLO004181-PA;CFLO003083-PA;CFLO014117-PA;CFLO000339-PA;CFLO004441-PA;CFLO018800-PA;CFLO017594-PA;CFLO008061-PA;CFLO008228-PA;CFLO012596-PA;CFLO005150-PA;CFLO005334-PA;CFLO000889-PA;CFLO013848-PA;CFLO008263-PA;CFLO000349-PA;CFLO010240-PA;CFLO001260-PA;CFLO005789-PA;CFLO017942-PA;CFLO013459-PA;CFLO000612-PA;CFLO006630-PA;CFLO013929-PA;CFLO010554-PA KEGG: 00790+2.8.1.12 Folate biosynthesis 1 CFLO011045-PA Reactome: R-HSA-4419969 Depolymerisation of the Nuclear Lamina 2 CFLO000216-PA;CFLO009454-PA MetaCyc: PWY-7445 Luteolin triglucuronide degradation 1 CFLO008216-PA KEGG: 00230+2.7.1.20 Purine metabolism 2 CFLO004445-PA;CFLO013599-PA Reactome: R-HSA-1474228 Degradation of the extracellular matrix 7 CFLO002727-PA;CFLO017985-PA;CFLO016400-PA;CFLO005622-PA;CFLO002728-PA;CFLO008212-PA;CFLO018112-PA KEGG: 00760+3.1.3.5 Nicotinate and nicotinamide metabolism 2 CFLO011228-PA;CFLO011225-PA Reactome: R-HSA-3322077 Glycogen synthesis 4 CFLO017262-PA;CFLO015784-PA;CFLO015783-PA;CFLO009992-PA Reactome: R-HSA-5362798 Release of Hh-Np from the secreting cell 3 CFLO009368-PA;CFLO018032-PA;CFLO018031-PA Reactome: R-HSA-3065678 SUMO is transferred from E1 to E2 (UBE2I, UBC9) 1 CFLO016531-PA Reactome: R-HSA-2173795 Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity 1 CFLO012226-PA Reactome: R-HSA-8939256 RUNX1 regulates transcription of genes involved in WNT signaling 2 CFLO007362-PA;CFLO007361-PA Reactome: R-HSA-164378 PKA activation in glucagon signalling 4 CFLO008619-PA;CFLO019116-PA;CFLO015242-PA;CFLO008792-PA KEGG: 00010+4.2.1.11 Glycolysis / Gluconeogenesis 2 CFLO009597-PA;CFLO016901-PA Reactome: R-HSA-5358752 T41 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated 3 CFLO001327-PA;CFLO015916-PA;CFLO007019-PA KEGG: 00680+1.1.1.37 Methane metabolism 2 CFLO018047-PA;CFLO007214-PA Reactome: R-HSA-416572 Sema4D induced cell migration and growth-cone collapse 1 CFLO010318-PA MetaCyc: PWY-7036 Very long chain fatty acid biosynthesis II 15 CFLO008782-PA;CFLO010957-PA;CFLO008780-PA;CFLO004004-PA;CFLO015015-PA;CFLO006701-PA;CFLO008781-PA;CFLO008778-PA;CFLO007106-PA;CFLO010625-PA;CFLO015666-PA;CFLO010959-PA;CFLO010956-PA;CFLO008779-PA;CFLO010863-PA Reactome: R-HSA-1483166 Synthesis of PA 23 CFLO008267-PA;CFLO005379-PA;CFLO015439-PA;CFLO003207-PA;CFLO003647-PA;CFLO000557-PA;CFLO004213-PA;CFLO016376-PA;CFLO006994-PA;CFLO008294-PA;CFLO013271-PA;CFLO006857-PA;CFLO011434-PA;CFLO005099-PA;CFLO002075-PA;CFLO007382-PA;CFLO015620-PA;CFLO006892-PA;CFLO006890-PA;CFLO014422-PA;CFLO002146-PA;CFLO011437-PA;CFLO016978-PA MetaCyc: PWY-7494 Choline degradation IV 5 CFLO000494-PA;CFLO005749-PA;CFLO003254-PA;CFLO001229-PA;CFLO005748-PA MetaCyc: PWY-6012 Acyl carrier protein metabolism 1 CFLO000719-PA MetaCyc: PWY-5744 Glyoxylate assimilation 5 CFLO015478-PA;CFLO005702-PA;CFLO016169-PA;CFLO003089-PA;CFLO008550-PA MetaCyc: PWY-5749 Itaconate degradation 1 CFLO005915-PA KEGG: 00630+2.3.3.9 Glyoxylate and dicarboxylate metabolism 1 CFLO010827-PA KEGG: 00590+3.1.1.4 Arachidonic acid metabolism 9 CFLO005379-PA;CFLO002075-PA;CFLO005099-PA;CFLO003207-PA;CFLO006994-PA;CFLO000557-PA;CFLO016978-PA;CFLO017976-PA;CFLO013271-PA Reactome: R-HSA-174178 APC/C:Cdh1 mediated degradation of Cdc20 and other APC/C:Cdh1 targeted proteins in late mitosis/early G1 43 CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO015469-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO006992-PA;CFLO010590-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO006211-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO007123-PA;CFLO004457-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO014819-PA;CFLO007015-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO009576-PA;CFLO001064-PA;CFLO005584-PA;CFLO012167-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO007718-PA;CFLO010492-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA MetaCyc: PWY-5133 Colupulone and cohumulone biosynthesis 2 CFLO016902-PA;CFLO016628-PA Reactome: R-HSA-1663150 The activation of arylsulfatases 5 CFLO005172-PA;CFLO013230-PA;CFLO013504-PA;CFLO013231-PA;CFLO013232-PA Reactome: R-HSA-3108214 SUMOylation of DNA damage response and repair proteins 36 CFLO000572-PA;CFLO001720-PA;CFLO004183-PA;CFLO009733-PA;CFLO005894-PA;CFLO014833-PA;CFLO000120-PA;CFLO008087-PA;CFLO013550-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO005698-PA;CFLO017448-PA;CFLO005636-PA;CFLO009875-PA;CFLO004457-PA;CFLO008090-PA;CFLO012226-PA;CFLO010441-PA;CFLO014829-PA;CFLO000294-PA;CFLO004818-PA;CFLO014832-PA;CFLO008828-PA;CFLO017578-PA;CFLO012487-PA;CFLO002998-PA;CFLO014479-PA;CFLO005778-PA;CFLO004819-PA;CFLO000698-PA;CFLO004815-PA;CFLO012610-PA;CFLO016589-PA;CFLO001352-PA;CFLO012747-PA KEGG: 00130+1.14.99.60 Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis 1 CFLO001545-PA MetaCyc: PWY-7921 Protein O-mannosylation I (yeast) 7 CFLO001486-PA;CFLO001127-PA;CFLO002995-PA;CFLO002603-PA;CFLO013866-PA;CFLO010944-PA;CFLO017852-PA Reactome: R-HSA-8964046 VLDL clearance 3 CFLO002286-PA;CFLO019853-PA;CFLO011745-PA KEGG: 00625+1.1.1.1 Chloroalkane and chloroalkene degradation 1 CFLO016846-PA MetaCyc: PWY-5839 Menaquinol-7 biosynthesis 1 CFLO018555-PA Reactome: R-HSA-8941333 RUNX2 regulates genes involved in differentiation of myeloid cells 2 CFLO007362-PA;CFLO007361-PA KEGG: 00230+2.1.2.2 Purine metabolism 1 CFLO019130-PA KEGG: 00052+2.7.1.1 Galactose metabolism 1 CFLO006809-PA Reactome: R-HSA-8847993 ERBB2 Activates PTK6 Signaling 1 CFLO009698-PA Reactome: R-HSA-114608 Platelet degranulation 2 CFLO007032-PA;CFLO004492-PA Reactome: R-HSA-168928 DDX58/IFIH1-mediated induction of interferon-alpha/beta 2 CFLO010852-PA;CFLO002737-PA MetaCyc: PWY-6118 Glycerol-3-phosphate shuttle 3 CFLO006890-PA;CFLO006857-PA;CFLO008294-PA KEGG: 00562+2.7.1.134+2.7.1.159 Inositol phosphate metabolism 1 CFLO002434-PA Reactome: R-HSA-191859 snRNP Assembly 36 CFLO012487-PA;CFLO002998-PA;CFLO001441-PA;CFLO004818-PA;CFLO014832-PA;CFLO011293-PA;CFLO001591-PA;CFLO012747-PA;CFLO004819-PA;CFLO017858-PA;CFLO002441-PA;CFLO004815-PA;CFLO000120-PA;CFLO014833-PA;CFLO002661-PA;CFLO005552-PA;CFLO008088-PA;CFLO013550-PA;CFLO002763-PA;CFLO008087-PA;CFLO005698-PA;CFLO016506-PA;CFLO000572-PA;CFLO001720-PA;CFLO002679-PA;CFLO004183-PA;CFLO013992-PA;CFLO008090-PA;CFLO001308-PA;CFLO014829-PA;CFLO010441-PA;CFLO010733-PA;CFLO004326-PA;CFLO005636-PA;CFLO013907-PA;CFLO013795-PA Reactome: R-HSA-3560801 Defective B3GAT3 causes JDSSDHD 5 CFLO005601-PA;CFLO019476-PA;CFLO012314-PA;CFLO012312-PA;CFLO013499-PA KEGG: 00860+4.99.1.1 Porphyrin and chlorophyll metabolism 1 CFLO001831-PA Reactome: R-HSA-162658 Golgi Cisternae Pericentriolar Stack Reorganization 4 CFLO019169-PA;CFLO013244-PA;CFLO013491-PA;CFLO017507-PA KEGG: 00500+2.4.1.15 Starch and sucrose metabolism 1 CFLO013101-PA KEGG: 00520+3.2.1.52 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 8 CFLO005046-PA;CFLO005047-PA;CFLO018671-PA;CFLO007240-PA;CFLO006861-PA;CFLO019181-PA;CFLO014190-PA;CFLO007387-PA KEGG: 00720+4.2.1.17 Carbon fixation pathways in prokaryotes 1 CFLO011836-PA KEGG: 00966+2.6.1.42 Glucosinolate biosynthesis 1 CFLO006978-PA KEGG: 00970+6.1.1.22 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 1 CFLO002872-PA Reactome: R-HSA-5173105 O-linked glycosylation 3 CFLO001486-PA;CFLO002995-PA;CFLO009857-PA MetaCyc: PWY-561 Superpathway of glyoxylate cycle and fatty acid degradation 5 CFLO013472-PA;CFLO006431-PA;CFLO004684-PA;CFLO018047-PA;CFLO007214-PA Reactome: R-HSA-70921 Histidine catabolism 1 CFLO013266-PA KEGG: 00620+1.8.1.4 Pyruvate metabolism 1 CFLO000151-PA Reactome: R-HSA-166058 MyD88:MAL(TIRAP) cascade initiated on plasma membrane 1 CFLO019450-PA Reactome: R-HSA-5621575 CD209 (DC-SIGN) signaling 2 CFLO016304-PA;CFLO015438-PA MetaCyc: PWY-5857 Ubiquinol-10 biosynthesis (prokaryotic) 4 CFLO002566-PA;CFLO018371-PA;CFLO005148-PA;CFLO001545-PA Reactome: R-HSA-1483148 Synthesis of PG 5 CFLO015439-PA;CFLO005159-PA;CFLO008267-PA;CFLO017332-PA;CFLO016376-PA Reactome: R-HSA-434316 Fatty Acids bound to GPR40 (FFAR1) regulate insulin secretion 2 CFLO003448-PA;CFLO013725-PA Reactome: R-HSA-264870 Caspase-mediated cleavage of cytoskeletal proteins 2 CFLO010486-PA;CFLO016449-PA MetaCyc: PWY-7205 CMP phosphorylation 4 CFLO012591-PA;CFLO015574-PA;CFLO005692-PA;CFLO010539-PA Reactome: R-HSA-390522 Striated Muscle Contraction 6 CFLO003956-PA;CFLO007286-PA;CFLO007288-PA;CFLO009573-PA;CFLO007287-PA;CFLO014870-PA Reactome: R-HSA-8853383 Lysosomal oligosaccharide catabolism 2 CFLO018023-PA;CFLO003984-PA KEGG: 00020+2.3.3.8 Citrate cycle (TCA cycle) 1 CFLO004169-PA MetaCyc: PWYG-321 3 CFLO002012-PA;CFLO002013-PA;CFLO016519-PA Reactome: R-HSA-422085 Synthesis, secretion, and deacylation of Ghrelin 5 CFLO008115-PA;CFLO007303-PA;CFLO013862-PA;CFLO001058-PA;CFLO002192-PA MetaCyc: PWY-5531 3,8-divinyl-chlorophyllide a biosynthesis II (anaerobic) 1 CFLO008202-PA Reactome: R-HSA-4086398 Ca2+ pathway 10 CFLO018565-PA;CFLO002753-PA;CFLO012806-PA;CFLO001535-PA;CFLO013725-PA;CFLO012800-PA;CFLO018567-PA;CFLO005758-PA;CFLO011446-PA;CFLO009267-PA Reactome: R-HSA-8939246 RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of myeloid cells 2 CFLO007362-PA;CFLO007361-PA MetaCyc: PWY-7942 5-oxo-L-proline metabolism 3 CFLO008882-PA;CFLO013383-PA;CFLO008866-PA KEGG: 00520+2.6.1.16 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 1 CFLO017590-PA Reactome: R-HSA-964975 Vitamins B6 activation to pyridoxal phosphate 3 CFLO015233-PA;CFLO004155-PA;CFLO011458-PA Reactome: R-HSA-167290 Pausing and recovery of HIV elongation 18 CFLO000994-PA;CFLO013674-PA;CFLO007118-PA;CFLO002885-PA;CFLO008811-PA;CFLO004196-PA;CFLO015189-PA;CFLO005811-PA;CFLO010911-PA;CFLO014021-PA;CFLO015637-PA;CFLO019592-PA;CFLO005353-PA;CFLO006869-PA;CFLO007113-PA;CFLO018085-PA;CFLO007012-PA;CFLO008569-PA Reactome: R-HSA-5358493 Synthesis of diphthamide-EEF2 4 CFLO002420-PA;CFLO003941-PA;CFLO007609-PA;CFLO003316-PA Reactome: R-HSA-2122947 NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription 15 CFLO008006-PA;CFLO004594-PA;CFLO009082-PA;CFLO002615-PA;CFLO008515-PA;CFLO006007-PA;CFLO016304-PA;CFLO006738-PA;CFLO006734-PA;CFLO008793-PA;CFLO015438-PA;CFLO001797-PA;CFLO009081-PA;CFLO000142-PA;CFLO005540-PA KEGG: 04150+2.7.11.24 mTOR signaling pathway 4 CFLO014413-PA;CFLO013244-PA;CFLO014527-PA;CFLO005675-PA Reactome: R-HSA-445095 Interaction between L1 and Ankyrins 5 CFLO010486-PA;CFLO012328-PA;CFLO009836-PA;CFLO012259-PA;CFLO017597-PA KEGG: 00790+1.5.1.3 Folate biosynthesis 1 CFLO012613-PA Reactome: R-HSA-392517 Rap1 signalling 1 CFLO018565-PA MetaCyc: PWY-5873 Ubiquinol-7 biosynthesis (eukaryotic) 4 CFLO005148-PA;CFLO018371-PA;CFLO002566-PA;CFLO001545-PA MetaCyc: PWY-241 C4 photosynthetic carbon assimilation cycle, NADP-ME type 2 CFLO016169-PA;CFLO003089-PA Reactome: R-HSA-162594 Early Phase of HIV Life Cycle 1 CFLO004549-PA KEGG: 00040+1.1.1.22 Pentose and glucuronate interconversions 1 CFLO003101-PA Reactome: R-HSA-1489509 DAG and IP3 signaling 1 CFLO002753-PA Reactome: R-HSA-2024096 HS-GAG degradation 12 CFLO003984-PA;CFLO003383-PA;CFLO012314-PA;CFLO019476-PA;CFLO010946-PA;CFLO001981-PA;CFLO012387-PA;CFLO004328-PA;CFLO013499-PA;CFLO017853-PA;CFLO012312-PA;CFLO005601-PA KEGG: 00790+4.2.3.12 Folate biosynthesis 1 CFLO011963-PA Reactome: R-HSA-167152 Formation of HIV elongation complex in the absence of HIV Tat 27 CFLO019592-PA;CFLO005353-PA;CFLO007113-PA;CFLO006869-PA;CFLO018085-PA;CFLO008569-PA;CFLO007012-PA;CFLO012310-PA;CFLO013992-PA;CFLO000994-PA;CFLO006247-PA;CFLO011191-PA;CFLO013674-PA;CFLO007118-PA;CFLO008811-PA;CFLO002885-PA;CFLO006370-PA;CFLO010322-PA;CFLO012515-PA;CFLO009087-PA;CFLO004196-PA;CFLO015189-PA;CFLO005811-PA;CFLO010911-PA;CFLO007399-PA;CFLO014021-PA;CFLO015637-PA Reactome: R-HSA-428540 Activation of RAC1 2 CFLO012169-PA;CFLO016939-PA KEGG: 00230+6.3.4.4 Purine metabolism 1 CFLO002187-PA Reactome: R-HSA-73863 RNA Polymerase I Transcription Termination 16 CFLO007128-PA;CFLO002136-PA;CFLO011191-PA;CFLO006247-PA;CFLO006370-PA;CFLO004196-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO010322-PA;CFLO010911-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO003630-PA;CFLO019070-PA;CFLO008703-PA;CFLO012310-PA KEGG: 00053+1.13.99.1 Ascorbate and aldarate metabolism 1 CFLO014480-PA Reactome: R-HSA-388844 Receptor-type tyrosine-protein phosphatases 2 CFLO002413-PA;CFLO010608-PA Reactome: R-HSA-674695 RNA Polymerase II Pre-transcription Events 46 CFLO004758-PA;CFLO004744-PA;CFLO007113-PA;CFLO006869-PA;CFLO008569-PA;CFLO018085-PA;CFLO015226-PA;CFLO012310-PA;CFLO005799-PA;CFLO008811-PA;CFLO007118-PA;CFLO006370-PA;CFLO010322-PA;CFLO006247-PA;CFLO003054-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO000074-PA;CFLO015169-PA;CFLO010911-PA;CFLO005811-PA;CFLO000122-PA;CFLO007012-PA;CFLO006498-PA;CFLO005353-PA;CFLO019592-PA;CFLO009375-PA;CFLO008336-PA;CFLO019377-PA;CFLO013992-PA;CFLO012113-PA;CFLO006374-PA;CFLO002885-PA;CFLO004196-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO001309-PA;CFLO011191-PA;CFLO000994-PA;CFLO002134-PA;CFLO019772-PA;CFLO013674-PA;CFLO000007-PA;CFLO015637-PA;CFLO015189-PA;CFLO001312-PA KEGG: 00380+4.2.1.17 Tryptophan metabolism 1 CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-112308 Presynaptic depolarization and calcium channel opening 2 CFLO002975-PA;CFLO012553-PA Reactome: R-HSA-1236974 ER-Phagosome pathway 38 CFLO004457-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO015469-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO002818-PA;CFLO015341-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO008291-PA;CFLO010590-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO007718-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO018775-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO001064-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA Reactome: R-HSA-2468052 Establishment of Sister Chromatid Cohesion 5 CFLO017511-PA;CFLO013783-PA;CFLO017514-PA;CFLO001352-PA;CFLO007475-PA Reactome: R-HSA-1632852 Macroautophagy 28 CFLO016893-PA;CFLO018008-PA;CFLO018531-PA;CFLO004761-PA;CFLO008775-PA;CFLO015017-PA;CFLO011980-PA;CFLO015160-PA;CFLO012771-PA;CFLO018838-PA;CFLO000265-PA;CFLO008697-PA;CFLO013444-PA;CFLO001746-PA;CFLO010192-PA;CFLO015380-PA;CFLO003386-PA;CFLO012780-PA;CFLO019071-PA;CFLO012150-PA;CFLO012782-PA;CFLO008120-PA;CFLO005629-PA;CFLO003088-PA;CFLO015140-PA;CFLO012781-PA;CFLO012750-PA;CFLO009016-PA MetaCyc: PWY-181 Photorespiration 2 CFLO014967-PA;CFLO010087-PA Reactome: R-HSA-167590 Nef Mediated CD4 Down-regulation 5 CFLO006324-PA;CFLO004757-PA;CFLO002135-PA;CFLO005139-PA;CFLO002131-PA KEGG: 00220+3.5.3.1 Arginine biosynthesis 1 CFLO004683-PA KEGG: 00534+5.1.3.17 Glycosaminoglycan biosynthesis - heparan sulfate / heparin 1 CFLO008170-PA Reactome: R-HSA-9603798 Class I peroxisomal membrane protein import 7 CFLO009319-PA;CFLO003180-PA;CFLO015635-PA;CFLO018091-PA;CFLO000240-PA;CFLO001998-PA;CFLO010925-PA KEGG: 00564+4.1.1.65 Glycerophospholipid metabolism 1 CFLO008188-PA KEGG: 00561+2.3.1.51 Glycerolipid metabolism 5 CFLO014422-PA;CFLO011434-PA;CFLO002146-PA;CFLO015620-PA;CFLO011437-PA Reactome: R-HSA-167162 RNA Polymerase II HIV Promoter Escape 26 CFLO000007-PA;CFLO007399-PA;CFLO014021-PA;CFLO003054-PA;CFLO015637-PA;CFLO000074-PA;CFLO015169-PA;CFLO001312-PA;CFLO010911-PA;CFLO006370-PA;CFLO007118-PA;CFLO001309-PA;CFLO010322-PA;CFLO009087-PA;CFLO004196-PA;CFLO012515-PA;CFLO006247-PA;CFLO011191-PA;CFLO012310-PA;CFLO008336-PA;CFLO012113-PA;CFLO019377-PA;CFLO007113-PA;CFLO006498-PA;CFLO007012-PA;CFLO019592-PA MetaCyc: PWY-6802 Salidroside biosynthesis 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-5696394 DNA Damage Recognition in GG-NER 11 CFLO013619-PA;CFLO004448-PA;CFLO015409-PA;CFLO018666-PA;CFLO004893-PA;CFLO011804-PA;CFLO012226-PA;CFLO015759-PA;CFLO006171-PA;CFLO000294-PA;CFLO016589-PA Reactome: R-HSA-196819 Vitamin B1 (thiamin) metabolism 3 CFLO018945-PA;CFLO003438-PA;CFLO013990-PA KEGG: 00510+2.4.1.68 N-Glycan biosynthesis 1 CFLO015339-PA KEGG: 00500+5.3.1.9 Starch and sucrose metabolism 1 CFLO019811-PA Reactome: R-HSA-611105 Respiratory electron transport 52 CFLO002848-PA;CFLO012127-PA;CFLO012546-PA;CFLO019662-PA;CFLO012334-PA;CFLO018840-PA;CFLO014059-PA;CFLO001346-PA;CFLO012779-PA;CFLO015618-PA;CFLO013985-PA;CFLO002139-PA;CFLO005178-PA;CFLO000330-PA;CFLO012554-PA;CFLO012224-PA;CFLO010057-PA;CFLO001444-PA;CFLO012727-PA;CFLO013259-PA;CFLO000241-PA;CFLO005664-PA;CFLO012308-PA;CFLO009887-PA;CFLO009837-PA;CFLO013472-PA;CFLO007743-PA;CFLO017652-PA;CFLO015466-PA;CFLO013492-PA;CFLO007297-PA;CFLO006783-PA;CFLO019189-PA;CFLO009910-PA;CFLO006789-PA;CFLO005865-PA;CFLO005471-PA;CFLO007256-PA;CFLO006431-PA;CFLO012622-PA;CFLO009564-PA;CFLO005777-PA;CFLO008777-PA;CFLO006719-PA;CFLO002830-PA;CFLO004951-PA;CFLO007445-PA;CFLO010215-PA;CFLO009092-PA;CFLO014618-PA;CFLO002101-PA;CFLO001543-PA Reactome: R-HSA-69481 G2/M Checkpoints 35 CFLO014819-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO004457-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO000953-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO010590-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO000939-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO007718-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO002304-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO015984-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO001064-PA KEGG: 00600+3.1.4.12 Sphingolipid metabolism 1 CFLO003152-PA Reactome: R-HSA-2022928 HS-GAG biosynthesis 8 CFLO012314-PA;CFLO019476-PA;CFLO008170-PA;CFLO000703-PA;CFLO013499-PA;CFLO012312-PA;CFLO005601-PA;CFLO000704-PA Reactome: R-HSA-9009391 Extra-nuclear estrogen signaling 1 CFLO005740-PA KEGG: 00020+1.3.5.1 Citrate cycle (TCA cycle) 2 CFLO013472-PA;CFLO006431-PA Reactome: R-HSA-8943724 Regulation of PTEN gene transcription 12 CFLO018008-PA;CFLO003386-PA;CFLO013244-PA;CFLO015017-PA;CFLO016512-PA;CFLO009089-PA;CFLO013292-PA;CFLO015646-PA;CFLO016183-PA;CFLO003088-PA;CFLO015160-PA;CFLO005629-PA Reactome: R-HSA-1236382 Constitutive Signaling by Ligand-Responsive EGFR Cancer Variants 1 CFLO005384-PA KEGG: 00970+6.1.1.14 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 1 CFLO004692-PA Reactome: R-HSA-1482922 Acyl chain remodelling of PI 8 CFLO003207-PA;CFLO005379-PA;CFLO002075-PA;CFLO005099-PA;CFLO013271-PA;CFLO016978-PA;CFLO000557-PA;CFLO006994-PA Reactome: R-HSA-6811558 PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling 5 CFLO013244-PA;CFLO015916-PA;CFLO009698-PA;CFLO005740-PA;CFLO001327-PA KEGG: 00332+2.7.2.11 Carbapenem biosynthesis 1 CFLO002293-PA Reactome: R-HSA-9627069 Regulation of the apoptosome activity 7 CFLO002725-PA;CFLO005777-PA;CFLO003390-PA;CFLO013244-PA;CFLO004951-PA;CFLO012308-PA;CFLO012256-PA MetaCyc: PWY-6692 Fe(II) oxidation 1 CFLO007517-PA MetaCyc: PWY-7124 Ethylene biosynthesis V (engineered) 3 CFLO009985-PA;CFLO016901-PA;CFLO009597-PA KEGG: 05170+2.7.1.153 Human immunodeficiency virus 1 infection 1 CFLO011291-PA Reactome: R-HSA-9013507 NOTCH3 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus 9 CFLO001395-PA;CFLO007222-PA;CFLO002955-PA;CFLO008212-PA;CFLO002956-PA;CFLO001428-PA;CFLO010507-PA;CFLO001394-PA;CFLO015617-PA KEGG: 00710+5.3.1.6 Carbon fixation in photosynthetic organisms 1 CFLO001993-PA MetaCyc: PWY-7187 Pyrimidine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis II 8 CFLO015574-PA;CFLO002000-PA;CFLO005098-PA;CFLO005088-PA;CFLO010539-PA;CFLO014417-PA;CFLO005692-PA;CFLO012591-PA MetaCyc: PWY-7980 ATP biosynthesis 6 CFLO012495-PA;CFLO017029-PA;CFLO006081-PA;CFLO017030-PA;CFLO007384-PA;CFLO017035-PA Reactome: R-HSA-75035 Chk1/Chk2(Cds1) mediated inactivation of Cyclin B:Cdk1 complex 2 CFLO018046-PA;CFLO000223-PA Reactome: R-HSA-8875656 MET receptor recycling 2 CFLO009017-PA;CFLO015261-PA Reactome: R-HSA-165054 Rev-mediated nuclear export of HIV RNA 24 CFLO014833-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO012487-PA;CFLO005698-PA;CFLO008087-PA;CFLO013550-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO004818-PA;CFLO000572-PA;CFLO001720-PA;CFLO004183-PA;CFLO014832-PA;CFLO008090-PA;CFLO006277-PA;CFLO001592-PA;CFLO010441-PA;CFLO014829-PA;CFLO012747-PA;CFLO005636-PA;CFLO004819-PA;CFLO004815-PA;CFLO002880-PA KEGG: 00550+2.7.8.13 Peptidoglycan biosynthesis 1 CFLO016451-PA MetaCyc: PWY-6672 Cis-genanyl-coa degradation 2 CFLO016902-PA;CFLO016628-PA MetaCyc: PWY-621 Sucrose degradation III (sucrose invertase) 1 CFLO019811-PA Reactome: R-HSA-425410 Metal ion SLC transporters 2 CFLO003115-PA;CFLO007343-PA Reactome: R-HSA-5610780 Degradation of GLI1 by the proteasome 40 CFLO000953-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO010590-PA;CFLO015469-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO009082-PA;CFLO001095-PA;CFLO000566-PA;CFLO005641-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO004457-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO009081-PA;CFLO001064-PA;CFLO006007-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA Reactome: R-HSA-201722 Formation of the beta-catenin:TCF transactivating complex 22 CFLO002572-PA;CFLO004197-PA;CFLO008042-PA;CFLO011812-PA;CFLO015438-PA;CFLO007437-PA;CFLO009267-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO000122-PA;CFLO016304-PA;CFLO004744-PA;CFLO007408-PA;CFLO007368-PA;CFLO007391-PA;CFLO010821-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO006738-PA;CFLO012980-PA;CFLO011060-PA;CFLO006734-PA Reactome: R-HSA-209931 Serotonin and melatonin biosynthesis 1 CFLO004689-PA KEGG: 00030+4.1.2.13 Pentose phosphate pathway 1 CFLO005131-PA MetaCyc: PWY-6731 Starch degradation III 1 CFLO001588-PA Reactome: R-HSA-176187 Activation of ATR in response to replication stress 30 CFLO004463-PA;CFLO004877-PA;CFLO011907-PA;CFLO008817-PA;CFLO008828-PA;CFLO006346-PA;CFLO004394-PA;CFLO009733-PA;CFLO018836-PA;CFLO002602-PA;CFLO004726-PA;CFLO000913-PA;CFLO010604-PA;CFLO001616-PA;CFLO012315-PA;CFLO008927-PA;CFLO002077-PA;CFLO015230-PA;CFLO005301-PA;CFLO008924-PA;CFLO003010-PA;CFLO010055-PA;CFLO010697-PA;CFLO001338-PA;CFLO018658-PA;CFLO003334-PA;CFLO011309-PA;CFLO008121-PA;CFLO012323-PA;CFLO012555-PA KEGG: 00500+3.2.1.1 Starch and sucrose metabolism 2 CFLO010589-PA;CFLO013083-PA KEGG: 00520+5.3.1.9 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 1 CFLO019811-PA Reactome: R-HSA-2871809 FCERI mediated Ca+2 mobilization 3 CFLO002753-PA;CFLO004869-PA;CFLO007261-PA KEGG: 00511+3.2.1.25 Other glycan degradation 1 CFLO003984-PA Reactome: R-HSA-9665245 Resistance of ERBB2 KD mutants to tesevatinib 1 CFLO005384-PA MetaCyc: PWY-7778 2-methylpropene degradation 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA Reactome: R-HSA-5651801 PCNA-Dependent Long Patch Base Excision Repair 18 CFLO003985-PA;CFLO013771-PA;CFLO010332-PA;CFLO011911-PA;CFLO009733-PA;CFLO008828-PA;CFLO006346-PA;CFLO003314-PA;CFLO019810-PA;CFLO019062-PA;CFLO012555-PA;CFLO012323-PA;CFLO008680-PA;CFLO002994-PA;CFLO008121-PA;CFLO011309-PA;CFLO018166-PA;CFLO004549-PA MetaCyc: PWY-7337 10-cis-heptadecenoyl-CoA degradation (yeast) 2 CFLO013479-PA;CFLO013638-PA MetaCyc: PWY-6946 Cholesterol degradation to androstenedione II (cholesterol dehydrogenase) 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-3928665 EPH-ephrin mediated repulsion of cells 10 CFLO008212-PA;CFLO000978-PA;CFLO013544-PA;CFLO001428-PA;CFLO005139-PA;CFLO013513-PA;CFLO004342-PA;CFLO000979-PA;CFLO006324-PA;CFLO015617-PA Reactome: R-HSA-2871837 FCERI mediated NF-kB activation 41 CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO004457-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO008104-PA;CFLO011518-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO012235-PA;CFLO015469-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO009082-PA;CFLO003059-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO009081-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO006007-PA;CFLO001064-PA Reactome: R-HSA-9608290 Defective MUTYH substrate processing 1 CFLO013757-PA Reactome: R-HSA-977347 Serine biosynthesis 2 CFLO003969-PA;CFLO001010-PA Reactome: R-HSA-174411 Polymerase switching on the C-strand of the telomere 17 CFLO012204-PA;CFLO007147-PA;CFLO013771-PA;CFLO011911-PA;CFLO002987-PA;CFLO010332-PA;CFLO003314-PA;CFLO019810-PA;CFLO012555-PA;CFLO012323-PA;CFLO008121-PA;CFLO002994-PA;CFLO001238-PA;CFLO011309-PA;CFLO008680-PA;CFLO018166-PA;CFLO015227-PA Reactome: R-HSA-73780 RNA Polymerase III Chain Elongation 11 CFLO010911-PA;CFLO019378-PA;CFLO019070-PA;CFLO000558-PA;CFLO014021-PA;CFLO001122-PA;CFLO017331-PA;CFLO002623-PA;CFLO003937-PA;CFLO010673-PA;CFLO004196-PA Reactome: R-HSA-8957275 Post-translational protein phosphorylation 8 CFLO004964-PA;CFLO011060-PA;CFLO019853-PA;CFLO011745-PA;CFLO012683-PA;CFLO018165-PA;CFLO002286-PA;CFLO009918-PA Reactome: R-HSA-8874081 MET activates PTK2 signaling 5 CFLO007163-PA;CFLO002173-PA;CFLO018020-PA;CFLO002172-PA;CFLO002821-PA Reactome: R-HSA-354192 Integrin signaling 1 CFLO008104-PA MetaCyc: PWY-7181 Pyrimidine deoxyribonucleosides degradation 1 CFLO018007-PA Reactome: R-HSA-389357 CD28 dependent PI3K/Akt signaling 6 CFLO005740-PA;CFLO000209-PA;CFLO014421-PA;CFLO018008-PA;CFLO014425-PA;CFLO008104-PA Reactome: R-HSA-200425 Carnitine metabolism 2 CFLO000948-PA;CFLO005702-PA KEGG: 00670+1.5.1.5+3.5.4.9 One carbon pool by folate 3 CFLO003993-PA;CFLO001271-PA;CFLO004433-PA KEGG: 00730+3.1.3.1 Thiamine metabolism 2 CFLO018375-PA;CFLO006125-PA MetaCyc: PWY-5154 L-arginine biosynthesis III (via N-acetyl-L-citrulline) 1 CFLO011964-PA Reactome: R-HSA-881907 Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK 1 CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-5620912 Anchoring of the basal body to the plasma membrane 16 CFLO018088-PA;CFLO000300-PA;CFLO010998-PA;CFLO009450-PA;CFLO011480-PA;CFLO010053-PA;CFLO013823-PA;CFLO002610-PA;CFLO001997-PA;CFLO007730-PA;CFLO012223-PA;CFLO005157-PA;CFLO000317-PA;CFLO009630-PA;CFLO004227-PA;CFLO001996-PA Reactome: R-HSA-2644606 Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants 24 CFLO004594-PA;CFLO007222-PA;CFLO001395-PA;CFLO016304-PA;CFLO009368-PA;CFLO002615-PA;CFLO008515-PA;CFLO005540-PA;CFLO001394-PA;CFLO010507-PA;CFLO002956-PA;CFLO008006-PA;CFLO001428-PA;CFLO011086-PA;CFLO006007-PA;CFLO009082-PA;CFLO008212-PA;CFLO002955-PA;CFLO015617-PA;CFLO000142-PA;CFLO001797-PA;CFLO008793-PA;CFLO009081-PA;CFLO015438-PA Reactome: R-HSA-6785470 tRNA processing in the mitochondrion 4 CFLO004010-PA;CFLO007327-PA;CFLO012013-PA;CFLO005532-PA Reactome: R-HSA-6803157 Antimicrobial peptides 4 CFLO004161-PA;CFLO000073-PA;CFLO007364-PA;CFLO003190-PA KEGG: 00480+1.17.4.1 Glutathione metabolism 4 CFLO000684-PA;CFLO000685-PA;CFLO001680-PA;CFLO012552-PA Reactome: R-HSA-8951671 RUNX3 regulates YAP1-mediated transcription 1 CFLO006971-PA MetaCyc: PWY-7268 NAD/NADP-NADH/NADPH cytosolic interconversion (yeast) 6 CFLO014828-PA;CFLO008875-PA;CFLO008606-PA;CFLO006142-PA;CFLO009985-PA;CFLO019576-PA KEGG: 00600+2.4.1.80 Sphingolipid metabolism 1 CFLO006369-PA Reactome: R-HSA-6803529 FGFR2 alternative splicing 9 CFLO019592-PA;CFLO007118-PA;CFLO007113-PA;CFLO004196-PA;CFLO007012-PA;CFLO010911-PA;CFLO015637-PA;CFLO014021-PA;CFLO013992-PA KEGG: 00970+6.1.1.2 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 2 CFLO008118-PA;CFLO001281-PA Reactome: R-HSA-6785807 Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling 1 CFLO000296-PA KEGG: 00310+4.2.1.17 Lysine degradation 1 CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-9633012 Response of EIF2AK4 (GCN2) to amino acid deficiency 79 CFLO010554-PA;CFLO006630-PA;CFLO013929-PA;CFLO013459-PA;CFLO000612-PA;CFLO001260-PA;CFLO017942-PA;CFLO005789-PA;CFLO008263-PA;CFLO000349-PA;CFLO010240-PA;CFLO013848-PA;CFLO005334-PA;CFLO000889-PA;CFLO018655-PA;CFLO012596-PA;CFLO005150-PA;CFLO018800-PA;CFLO017594-PA;CFLO008061-PA;CFLO008228-PA;CFLO000339-PA;CFLO004441-PA;CFLO003083-PA;CFLO014117-PA;CFLO019663-PA;CFLO004181-PA;CFLO012297-PA;CFLO000918-PA;CFLO005822-PA;CFLO000325-PA;CFLO009848-PA;CFLO005804-PA;CFLO001584-PA;CFLO002568-PA;CFLO014395-PA;CFLO000043-PA;CFLO008851-PA;CFLO004278-PA;CFLO000326-PA;CFLO004325-PA;CFLO012584-PA;CFLO010962-PA;CFLO017946-PA;CFLO000629-PA;CFLO011483-PA;CFLO017730-PA;CFLO005709-PA;CFLO000744-PA;CFLO005096-PA;CFLO004405-PA;CFLO016897-PA;CFLO006768-PA;CFLO018839-PA;CFLO013407-PA;CFLO013411-PA;CFLO004825-PA;CFLO019287-PA;CFLO014883-PA;CFLO004224-PA;CFLO017947-PA;CFLO006483-PA;CFLO008335-PA;CFLO002901-PA;CFLO014026-PA;CFLO002329-PA;CFLO012240-PA;CFLO015631-PA;CFLO003320-PA;CFLO012333-PA;CFLO002739-PA;CFLO010712-PA;CFLO016302-PA;CFLO010535-PA;CFLO003311-PA;CFLO011221-PA;CFLO004176-PA;CFLO013281-PA;CFLO004217-PA MetaCyc: PWY-7039 Phosphatidate metabolism, as a signaling molecule 13 CFLO005526-PA;CFLO008821-PA;CFLO010224-PA;CFLO009620-PA;CFLO016462-PA;CFLO006116-PA;CFLO001719-PA;CFLO006114-PA;CFLO013725-PA;CFLO006115-PA;CFLO005525-PA;CFLO007261-PA;CFLO001388-PA Reactome: R-HSA-73621 Pyrimidine catabolism 4 CFLO000145-PA;CFLO002281-PA;CFLO003449-PA;CFLO014447-PA Reactome: R-HSA-3656253 Defective EXT1 causes exostoses 1, TRPS2 and CHDS 5 CFLO019476-PA;CFLO005601-PA;CFLO012312-PA;CFLO012314-PA;CFLO013499-PA MetaCyc: PWY-6638 Sulfolactate degradation III 2 CFLO000623-PA;CFLO003306-PA Reactome: R-HSA-168276 NS1 Mediated Effects on Host Pathways 24 CFLO004818-PA;CFLO000572-PA;CFLO000853-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO014832-PA;CFLO006635-PA;CFLO014833-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO012487-PA;CFLO005698-PA;CFLO008087-PA;CFLO013550-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO005636-PA;CFLO004819-PA;CFLO004815-PA;CFLO008090-PA;CFLO003977-PA;CFLO010441-PA;CFLO014829-PA;CFLO012747-PA MetaCyc: PWY-5663 Erythro-tetrahydrobiopterin biosynthesis I 2 CFLO011963-PA;CFLO002629-PA KEGG: 00260+2.1.2.1 Glycine, serine and threonine metabolism 2 CFLO010087-PA;CFLO014967-PA Reactome: R-HSA-5693579 Homologous DNA Pairing and Strand Exchange 15 CFLO012610-PA;CFLO001967-PA;CFLO005651-PA;CFLO005586-PA;CFLO015680-PA;CFLO005778-PA;CFLO008873-PA;CFLO010802-PA;CFLO015674-PA;CFLO014613-PA;CFLO013974-PA;CFLO010805-PA;CFLO001240-PA;CFLO002907-PA;CFLO006542-PA MetaCyc: PWY-6174 Mevalonate pathway II (archaea) 3 CFLO006604-PA;CFLO008710-PA;CFLO006521-PA Reactome: R-HSA-8939242 RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of keratinocytes 2 CFLO007362-PA;CFLO007361-PA KEGG: 00260+2.3.1.29 Glycine, serine and threonine metabolism 1 CFLO012225-PA Reactome: R-HSA-8852276 The role of GTSE1 in G2/M progression after G2 checkpoint 43 CFLO011518-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO004457-PA;CFLO002905-PA;CFLO014186-PA;CFLO000566-PA;CFLO001242-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO010590-PA;CFLO015469-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA;CFLO006561-PA;CFLO000953-PA;CFLO009841-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO007718-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO001064-PA;CFLO008841-PA;CFLO004179-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO016852-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA Reactome: R-HSA-196843 Vitamin B2 (riboflavin) metabolism 2 CFLO006180-PA;CFLO001559-PA Reactome: R-HSA-9636383 Prevention of phagosomal-lysosomal fusion 1 CFLO014328-PA MetaCyc: PWY-7343 UDP-alpha-D-glucose biosynthesis I 1 CFLO009992-PA Reactome: R-HSA-5625740 RHO GTPases activate PKNs 4 CFLO002794-PA;CFLO000223-PA;CFLO008104-PA;CFLO018046-PA Reactome: R-HSA-1474151 Tetrahydrobiopterin (BH4) synthesis, recycling, salvage and regulation 3 CFLO002629-PA;CFLO011963-PA;CFLO012613-PA Reactome: R-HSA-380972 Energy dependent regulation of mTOR by LKB1-AMPK 12 CFLO015380-PA;CFLO016893-PA;CFLO011980-PA;CFLO015017-PA;CFLO003386-PA;CFLO018008-PA;CFLO004835-PA;CFLO003088-PA;CFLO012097-PA;CFLO015160-PA;CFLO005629-PA;CFLO009016-PA MetaCyc: PWY-5789 3-hydroxypropanoate/4-hydroxybutanate cycle 7 CFLO008550-PA;CFLO011836-PA;CFLO016169-PA;CFLO015478-PA;CFLO005702-PA;CFLO003089-PA;CFLO012118-PA Reactome: R-HSA-3371511 HSF1 activation 4 CFLO009733-PA;CFLO016610-PA;CFLO008828-PA;CFLO006346-PA Reactome: R-HSA-5578749 Transcriptional regulation by small RNAs 39 CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO005636-PA;CFLO007012-PA;CFLO014829-PA;CFLO010441-PA;CFLO008090-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO010821-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO011812-PA;CFLO000572-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO004196-PA;CFLO002036-PA;CFLO005698-PA;CFLO013550-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO008087-PA;CFLO000120-PA;CFLO014833-PA;CFLO015637-PA;CFLO007391-PA;CFLO004815-PA;CFLO004819-PA;CFLO012747-PA;CFLO006277-PA;CFLO014832-PA;CFLO004818-PA;CFLO013546-PA;CFLO010911-PA;CFLO007437-PA;CFLO002998-PA;CFLO014021-PA;CFLO012487-PA KEGG: 00480+3.4.11.1 Glutathione metabolism 2 CFLO008609-PA;CFLO008607-PA KEGG: 00052+3.2.1.23 Galactose metabolism 3 CFLO003987-PA;CFLO012387-PA;CFLO002031-PA Reactome: R-HSA-432040 Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins 4 CFLO008619-PA;CFLO019116-PA;CFLO008792-PA;CFLO015242-PA KEGG: 00600+3.1.3.4 Sphingolipid metabolism 1 CFLO000216-PA Reactome: R-HSA-418990 Adherens junctions interactions 2 CFLO014444-PA;CFLO011784-PA Reactome: R-HSA-210744 Regulation of gene expression in late stage (branching morphogenesis) pancreatic bud precursor cells 5 CFLO008793-PA;CFLO015438-PA;CFLO008515-PA;CFLO016304-PA;CFLO004594-PA Reactome: R-HSA-113418 Formation of the Early Elongation Complex 24 CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO004196-PA;CFLO010322-PA;CFLO007118-PA;CFLO006370-PA;CFLO002885-PA;CFLO008811-PA;CFLO013674-PA;CFLO011191-PA;CFLO006247-PA;CFLO015637-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO010911-PA;CFLO015189-PA;CFLO007012-PA;CFLO008569-PA;CFLO018085-PA;CFLO007113-PA;CFLO005353-PA;CFLO019592-PA;CFLO013992-PA;CFLO012310-PA Reactome: R-HSA-444821 Relaxin receptors 1 CFLO002695-PA Reactome: R-HSA-400511 Synthesis, secretion, and inactivation of Glucose-dependent Insulinotropic Polypeptide (GIP) 3 CFLO008115-PA;CFLO013862-PA;CFLO002192-PA MetaCyc: PWY-6722 Candicidin biosynthesis 3 CFLO008550-PA;CFLO015478-PA;CFLO005702-PA Reactome: R-HSA-389513 CTLA4 inhibitory signaling 2 CFLO015916-PA;CFLO001327-PA Reactome: R-HSA-4085377 SUMOylation of SUMOylation proteins 21 CFLO000572-PA;CFLO004818-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO014832-PA;CFLO000120-PA;CFLO002998-PA;CFLO014833-PA;CFLO012487-PA;CFLO005698-PA;CFLO002763-PA;CFLO008088-PA;CFLO013550-PA;CFLO008087-PA;CFLO004819-PA;CFLO005636-PA;CFLO004815-PA;CFLO008090-PA;CFLO012747-PA;CFLO014829-PA;CFLO010441-PA KEGG: 00770+2.7.1.33 Pantothenate and CoA biosynthesis 2 CFLO019517-PA;CFLO006703-PA Reactome: R-HSA-2565942 Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition 16 CFLO018088-PA;CFLO009450-PA;CFLO011480-PA;CFLO002615-PA;CFLO000300-PA;CFLO010998-PA;CFLO015205-PA;CFLO002610-PA;CFLO007730-PA;CFLO005157-PA;CFLO006007-PA;CFLO012235-PA;CFLO009082-PA;CFLO000317-PA;CFLO009081-PA;CFLO004227-PA Reactome: R-HSA-8874211 CREB3 factors activate genes 2 CFLO009918-PA;CFLO005873-PA Reactome: R-HSA-69473 G2/M DNA damage checkpoint 36 CFLO012610-PA;CFLO008121-PA;CFLO011309-PA;CFLO012555-PA;CFLO007391-PA;CFLO010805-PA;CFLO006542-PA;CFLO001967-PA;CFLO015680-PA;CFLO013546-PA;CFLO007437-PA;CFLO005778-PA;CFLO010802-PA;CFLO008817-PA;CFLO014613-PA;CFLO004394-PA;CFLO006346-PA;CFLO008828-PA;CFLO005651-PA;CFLO012323-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO010821-PA;CFLO004457-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO017458-PA;CFLO000913-PA;CFLO002036-PA;CFLO008873-PA;CFLO015674-PA;CFLO008042-PA;CFLO011903-PA;CFLO004197-PA;CFLO009733-PA;CFLO011812-PA MetaCyc: PWY-5386 Methylglyoxal degradation I 1 CFLO002707-PA MetaCyc: PWY-7198 Pyrimidine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis IV 11 CFLO005692-PA;CFLO000685-PA;CFLO012552-PA;CFLO001680-PA;CFLO012591-PA;CFLO005088-PA;CFLO005098-PA;CFLO010539-PA;CFLO014417-PA;CFLO015574-PA;CFLO000684-PA Reactome: R-HSA-73817 Purine ribonucleoside monophosphate biosynthesis 11 CFLO015327-PA;CFLO006608-PA;CFLO013827-PA;CFLO019130-PA;CFLO019131-PA;CFLO004461-PA;CFLO009307-PA;CFLO002187-PA;CFLO004460-PA;CFLO017671-PA;CFLO004073-PA Reactome: R-HSA-5467340 AXIN missense mutants destabilize the destruction complex 3 CFLO015916-PA;CFLO007019-PA;CFLO001327-PA Reactome: R-HSA-2028269 Signaling by Hippo 2 CFLO017998-PA;CFLO010702-PA Reactome: R-HSA-450302 activated TAK1 mediates p38 MAPK activation 1 CFLO000259-PA Reactome: R-HSA-1482798 Acyl chain remodeling of CL 2 CFLO011836-PA;CFLO005370-PA Reactome: R-HSA-936440 Negative regulators of DDX58/IFIH1 signaling 3 CFLO014989-PA;CFLO018531-PA;CFLO012750-PA KEGG: 00240+2.7.4.9 Pyrimidine metabolism 1 CFLO014417-PA KEGG: 00010+4.1.2.13 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO005131-PA KEGG: 00020+1.1.1.37 Citrate cycle (TCA cycle) 2 CFLO018047-PA;CFLO007214-PA KEGG: 00640+1.3.3.6 Propanoate metabolism 2 CFLO013479-PA;CFLO013638-PA KEGG: 00510+2.4.1.144 N-Glycan biosynthesis 1 CFLO016452-PA KEGG: 00240+6.3.4.2 Pyrimidine metabolism 1 CFLO000638-PA KEGG: 00280+1.8.1.4 Valine, leucine and isoleucine degradation 1 CFLO000151-PA Reactome: R-HSA-110312 Translesion synthesis by REV1 13 CFLO012555-PA;CFLO011309-PA;CFLO008121-PA;CFLO002994-PA;CFLO008680-PA;CFLO007174-PA;CFLO012323-PA;CFLO006346-PA;CFLO018166-PA;CFLO008828-PA;CFLO009733-PA;CFLO010332-PA;CFLO019810-PA KEGG: 00500+2.4.1.18 Starch and sucrose metabolism 3 CFLO016492-PA;CFLO010589-PA;CFLO013083-PA Reactome: R-HSA-68884 Mitotic Telophase/Cytokinesis 1 CFLO001745-PA Reactome: R-HSA-3295583 TRP channels 9 CFLO011361-PA;CFLO002128-PA;CFLO011362-PA;CFLO000387-PA;CFLO009327-PA;CFLO009329-PA;CFLO002127-PA;CFLO011367-PA;CFLO006298-PA Reactome: R-HSA-71240 Tryptophan catabolism 4 CFLO015919-PA;CFLO015918-PA;CFLO016899-PA;CFLO006361-PA Reactome: R-HSA-975574 Reactions specific to the hybrid N-glycan synthesis pathway 1 CFLO016452-PA KEGG: 00510+2.4.1.258 N-Glycan biosynthesis 1 CFLO003953-PA Reactome: R-HSA-6806664 Metabolism of vitamin K 2 CFLO013131-PA;CFLO018015-PA Reactome: R-HSA-75955 RNA Polymerase II Transcription Elongation 35 CFLO006247-PA;CFLO006370-PA;CFLO007118-PA;CFLO008811-PA;CFLO010322-PA;CFLO010911-PA;CFLO005811-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO015226-PA;CFLO004744-PA;CFLO004758-PA;CFLO006869-PA;CFLO007113-PA;CFLO018085-PA;CFLO008569-PA;CFLO012310-PA;CFLO005799-PA;CFLO011191-PA;CFLO019772-PA;CFLO002134-PA;CFLO000994-PA;CFLO013674-PA;CFLO002885-PA;CFLO004196-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO015189-PA;CFLO015637-PA;CFLO005353-PA;CFLO019592-PA;CFLO009375-PA;CFLO000122-PA;CFLO007012-PA;CFLO006374-PA Reactome: R-HSA-8949613 Cristae formation 21 CFLO006344-PA;CFLO004787-PA;CFLO004589-PA;CFLO012377-PA;CFLO012143-PA;CFLO011409-PA;CFLO005895-PA;CFLO009654-PA;CFLO019061-PA;CFLO000027-PA;CFLO012495-PA;CFLO001235-PA;CFLO009316-PA;CFLO016536-PA;CFLO003030-PA;CFLO016537-PA;CFLO008117-PA;CFLO000600-PA;CFLO003028-PA;CFLO004180-PA;CFLO009840-PA MetaCyc: PWY-6558 Heparan sulfate biosynthesis (late stages) 3 CFLO000703-PA;CFLO000704-PA;CFLO008170-PA KEGG: 00010+1.1.1.27 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO007170-PA KEGG: 00270+3.1.3.77 Cysteine and methionine metabolism 1 CFLO008721-PA Reactome: R-HSA-9609523 Insertion of tail-anchored proteins into the endoplasmic reticulum membrane 5 CFLO006739-PA;CFLO005676-PA;CFLO008291-PA;CFLO018775-PA;CFLO003677-PA KEGG: 00740+3.6.1.9 Riboflavin metabolism 1 CFLO002000-PA Reactome: R-HSA-6811440 Retrograde transport at the Trans-Golgi-Network 20 CFLO011136-PA;CFLO019786-PA;CFLO009975-PA;CFLO002682-PA;CFLO015256-PA;CFLO005434-PA;CFLO018213-PA;CFLO016459-PA;CFLO011183-PA;CFLO002140-PA;CFLO012991-PA;CFLO002793-PA;CFLO016440-PA;CFLO008922-PA;CFLO018759-PA;CFLO012720-PA;CFLO004702-PA;CFLO004446-PA;CFLO012257-PA;CFLO010963-PA Reactome: R-HSA-2470946 Cohesin Loading onto Chromatin 6 CFLO017511-PA;CFLO013783-PA;CFLO000269-PA;CFLO009091-PA;CFLO001352-PA;CFLO017514-PA MetaCyc: PWY-6351 D-myo-inositol (1,4,5)-trisphosphate biosynthesis 8 CFLO005526-PA;CFLO008821-PA;CFLO000498-PA;CFLO009620-PA;CFLO013725-PA;CFLO005525-PA;CFLO007261-PA;CFLO001388-PA Reactome: R-HSA-2022857 Keratan sulfate degradation 7 CFLO007240-PA;CFLO005047-PA;CFLO005046-PA;CFLO014190-PA;CFLO019181-PA;CFLO007387-PA;CFLO000660-PA Reactome: R-HSA-917937 Iron uptake and transport 6 CFLO009082-PA;CFLO002615-PA;CFLO009081-PA;CFLO006007-PA;CFLO005695-PA;CFLO007267-PA MetaCyc: PWY-5078 L-isoleucine degradation II 2 CFLO016846-PA;CFLO006978-PA Reactome: R-HSA-426496 Post-transcriptional silencing by small RNAs 5 CFLO012806-PA;CFLO011446-PA;CFLO005758-PA;CFLO012800-PA;CFLO001535-PA KEGG: 00360+1.14.16.1 Phenylalanine metabolism 1 CFLO009716-PA Reactome: R-HSA-1614517 Sulfide oxidation to sulfate 2 CFLO005665-PA;CFLO006876-PA Reactome: R-HSA-156902 Peptide chain elongation 75 CFLO013848-PA;CFLO000349-PA;CFLO010240-PA;CFLO008263-PA;CFLO017942-PA;CFLO005789-PA;CFLO001260-PA;CFLO000612-PA;CFLO013459-PA;CFLO013929-PA;CFLO006630-PA;CFLO010554-PA;CFLO014117-PA;CFLO003083-PA;CFLO004441-PA;CFLO000339-PA;CFLO008061-PA;CFLO008228-PA;CFLO018800-PA;CFLO017594-PA;CFLO005150-PA;CFLO012596-PA;CFLO000889-PA;CFLO005334-PA;CFLO005804-PA;CFLO005822-PA;CFLO000325-PA;CFLO009848-PA;CFLO000918-PA;CFLO012297-PA;CFLO004181-PA;CFLO019663-PA;CFLO005709-PA;CFLO017730-PA;CFLO011483-PA;CFLO017946-PA;CFLO000629-PA;CFLO012584-PA;CFLO010962-PA;CFLO004325-PA;CFLO000326-PA;CFLO004278-PA;CFLO008851-PA;CFLO014395-PA;CFLO002568-PA;CFLO001584-PA;CFLO006768-PA;CFLO016897-PA;CFLO004405-PA;CFLO005096-PA;CFLO000744-PA;CFLO008335-PA;CFLO006483-PA;CFLO004224-PA;CFLO014883-PA;CFLO019287-PA;CFLO004825-PA;CFLO013411-PA;CFLO013407-PA;CFLO018839-PA;CFLO016302-PA;CFLO010712-PA;CFLO002739-PA;CFLO015631-PA;CFLO012333-PA;CFLO003320-PA;CFLO012240-PA;CFLO002329-PA;CFLO014026-PA;CFLO002901-PA;CFLO013281-PA;CFLO004176-PA;CFLO011221-PA;CFLO003311-PA;CFLO010535-PA MetaCyc: PWY-6952 Glycerophosphodiester degradation 1 CFLO008294-PA MetaCyc: PWY-31 Canavanine degradation 1 CFLO004683-PA MetaCyc: PWY-6134 L-tyrosine biosynthesis IV 1 CFLO009716-PA Reactome: R-HSA-4043916 Defective MPI causes MPI-CDG (CDG-1b) 1 CFLO000596-PA Reactome: R-HSA-5654706 FRS-mediated FGFR3 signaling 1 CFLO001520-PA Reactome: R-HSA-167200 Formation of HIV-1 elongation complex containing HIV-1 Tat 27 CFLO010911-PA;CFLO005811-PA;CFLO015189-PA;CFLO015637-PA;CFLO007399-PA;CFLO014021-PA;CFLO013674-PA;CFLO011191-PA;CFLO006247-PA;CFLO000994-PA;CFLO009087-PA;CFLO004196-PA;CFLO012515-PA;CFLO010322-PA;CFLO002885-PA;CFLO007118-PA;CFLO006370-PA;CFLO008811-PA;CFLO013992-PA;CFLO012310-PA;CFLO005353-PA;CFLO019592-PA;CFLO008569-PA;CFLO018085-PA;CFLO007012-PA;CFLO006869-PA;CFLO007113-PA Reactome: R-HSA-983712 Ion channel transport 14 CFLO004757-PA;CFLO003437-PA;CFLO009346-PA;CFLO006081-PA;CFLO011996-PA;CFLO019332-PA;CFLO006875-PA;CFLO018080-PA;CFLO009916-PA;CFLO002131-PA;CFLO007986-PA;CFLO002135-PA;CFLO006711-PA;CFLO007384-PA KEGG: 00471+3.5.1.2 D-Glutamine and D-glutamate metabolism 1 CFLO012576-PA KEGG: 04151+2.7.1.153 PI3K-Akt signaling pathway 1 CFLO011291-PA Reactome: R-HSA-8951664 Neddylation 87 CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO002622-PA;CFLO015013-PA;CFLO004893-PA;CFLO001477-PA;CFLO000939-PA;CFLO010547-PA;CFLO002304-PA;CFLO006886-PA;CFLO001696-PA;CFLO002616-PA;CFLO008722-PA;CFLO012372-PA;CFLO001802-PA;CFLO006593-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO009081-PA;CFLO001070-PA;CFLO001064-PA;CFLO005879-PA;CFLO018970-PA;CFLO006007-PA;CFLO011545-PA;CFLO008822-PA;CFLO000566-PA;CFLO007376-PA;CFLO012019-PA;CFLO003236-PA;CFLO004116-PA;CFLO011096-PA;CFLO002440-PA;CFLO011518-PA;CFLO007173-PA;CFLO000053-PA;CFLO003204-PA;CFLO004457-PA;CFLO000953-PA;CFLO001568-PA;CFLO006992-PA;CFLO015983-PA;CFLO006885-PA;CFLO004448-PA;CFLO018530-PA;CFLO002818-PA;CFLO009082-PA;CFLO004367-PA;CFLO006171-PA;CFLO008250-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO012313-PA;CFLO002257-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO015639-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO005108-PA;CFLO019335-PA;CFLO010548-PA;CFLO009983-PA;CFLO006008-PA;CFLO014819-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO014227-PA;CFLO015409-PA;CFLO001478-PA;CFLO002731-PA;CFLO000673-PA;CFLO010518-PA;CFLO014805-PA;CFLO011036-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO002258-PA;CFLO000992-PA;CFLO000267-PA;CFLO012235-PA;CFLO015469-PA;CFLO000879-PA;CFLO003452-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA Reactome: R-HSA-72165 mRNA Splicing - Minor Pathway 32 CFLO001068-PA;CFLO007113-PA;CFLO002948-PA;CFLO018003-PA;CFLO014696-PA;CFLO002441-PA;CFLO014700-PA;CFLO004994-PA;CFLO012325-PA;CFLO007118-PA;CFLO008198-PA;CFLO008033-PA;CFLO015654-PA;CFLO014021-PA;CFLO010911-PA;CFLO013907-PA;CFLO004326-PA;CFLO007012-PA;CFLO009568-PA;CFLO006242-PA;CFLO019592-PA;CFLO013795-PA;CFLO013992-PA;CFLO014704-PA;CFLO016182-PA;CFLO004196-PA;CFLO002679-PA;CFLO011253-PA;CFLO008171-PA;CFLO015637-PA;CFLO005552-PA;CFLO014705-PA Reactome: R-HSA-2206282 MPS IIIB - Sanfilippo syndrome B 1 CFLO001981-PA Reactome: R-HSA-3371571 HSF1-dependent transactivation 4 CFLO018008-PA;CFLO003386-PA;CFLO017592-PA;CFLO005536-PA Reactome: R-HSA-5696397 Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in GG-NER 18 CFLO018166-PA;CFLO012555-PA;CFLO012323-PA;CFLO008121-PA;CFLO002994-PA;CFLO011309-PA;CFLO008680-PA;CFLO009733-PA;CFLO011911-PA;CFLO010332-PA;CFLO006346-PA;CFLO003314-PA;CFLO008828-PA;CFLO019810-PA;CFLO019062-PA;CFLO007174-PA;CFLO003985-PA;CFLO013771-PA Reactome: R-HSA-174430 Telomere C-strand synthesis initiation 7 CFLO002987-PA;CFLO015227-PA;CFLO012204-PA;CFLO003985-PA;CFLO007147-PA;CFLO019062-PA;CFLO001238-PA Reactome: R-HSA-77387 Insulin receptor recycling 14 CFLO018080-PA;CFLO006875-PA;CFLO009916-PA;CFLO002131-PA;CFLO004757-PA;CFLO009346-PA;CFLO003437-PA;CFLO006081-PA;CFLO011996-PA;CFLO019332-PA;CFLO006711-PA;CFLO007384-PA;CFLO007986-PA;CFLO002135-PA Reactome: R-HSA-446193 Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein 11 CFLO006499-PA;CFLO016451-PA;CFLO009306-PA;CFLO004933-PA;CFLO003953-PA;CFLO002826-PA;CFLO006286-PA;CFLO007254-PA;CFLO008725-PA;CFLO011990-PA;CFLO011797-PA KEGG: 00983+6.3.5.2 Drug metabolism - other enzymes 1 CFLO006608-PA Reactome: R-HSA-2151209 Activation of PPARGC1A (PGC-1alpha) by phosphorylation 1 CFLO015380-PA Reactome: R-HSA-5654693 FRS-mediated FGFR1 signaling 1 CFLO001520-PA Reactome: R-HSA-174154 APC/C:Cdc20 mediated degradation of Securin 43 CFLO007015-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO004457-PA;CFLO000953-PA;CFLO007123-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO006211-PA;CFLO014805-PA;CFLO006992-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO007718-PA;CFLO010492-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO012167-PA;CFLO005584-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO009576-PA;CFLO001064-PA KEGG: 00240+1.3.5.2 Pyrimidine metabolism 1 CFLO006108-PA Reactome: R-HSA-8856828 Clathrin-mediated endocytosis 19 CFLO007954-PA;CFLO002286-PA;CFLO006587-PA;CFLO001979-PA;CFLO014328-PA;CFLO004342-PA;CFLO002536-PA;CFLO006324-PA;CFLO013570-PA;CFLO003326-PA;CFLO014345-PA;CFLO013544-PA;CFLO005139-PA;CFLO008855-PA;CFLO015261-PA;CFLO019853-PA;CFLO012666-PA;CFLO011745-PA;CFLO016459-PA Reactome: R-HSA-5655862 Translesion synthesis by POLK 13 CFLO009733-PA;CFLO010332-PA;CFLO018166-PA;CFLO006346-PA;CFLO008828-PA;CFLO019810-PA;CFLO012555-PA;CFLO007174-PA;CFLO012323-PA;CFLO008121-PA;CFLO011309-PA;CFLO002994-PA;CFLO008680-PA Reactome: R-HSA-8948700 Competing endogenous RNAs (ceRNAs) regulate PTEN translation 5 CFLO011446-PA;CFLO012806-PA;CFLO012800-PA;CFLO001535-PA;CFLO005758-PA Reactome: R-HSA-192823 Viral mRNA Translation 75 CFLO013459-PA;CFLO000612-PA;CFLO006630-PA;CFLO013929-PA;CFLO010554-PA;CFLO013848-PA;CFLO008263-PA;CFLO010240-PA;CFLO000349-PA;CFLO001260-PA;CFLO017942-PA;CFLO005789-PA;CFLO012596-PA;CFLO005150-PA;CFLO005334-PA;CFLO000889-PA;CFLO003083-PA;CFLO014117-PA;CFLO000339-PA;CFLO004441-PA;CFLO017594-PA;CFLO018800-PA;CFLO008061-PA;CFLO008228-PA;CFLO019663-PA;CFLO004181-PA;CFLO005804-PA;CFLO005822-PA;CFLO000325-PA;CFLO009848-PA;CFLO000918-PA;CFLO012297-PA;CFLO010962-PA;CFLO012584-PA;CFLO000326-PA;CFLO004278-PA;CFLO004325-PA;CFLO014395-PA;CFLO008851-PA;CFLO001584-PA;CFLO002568-PA;CFLO005709-PA;CFLO011483-PA;CFLO017730-PA;CFLO000629-PA;CFLO017946-PA;CFLO004405-PA;CFLO016897-PA;CFLO000744-PA;CFLO005096-PA;CFLO006768-PA;CFLO004825-PA;CFLO013411-PA;CFLO018839-PA;CFLO013407-PA;CFLO006483-PA;CFLO008335-PA;CFLO004224-PA;CFLO019287-PA;CFLO014883-PA;CFLO012333-PA;CFLO015631-PA;CFLO003320-PA;CFLO002739-PA;CFLO002329-PA;CFLO012240-PA;CFLO014026-PA;CFLO002901-PA;CFLO016302-PA;CFLO010712-PA;CFLO011221-PA;CFLO003311-PA;CFLO010535-PA;CFLO013281-PA;CFLO004176-PA MetaCyc: PWY-3722 Glycine betaine biosynthesis II (Gram-positive bacteria) 5 CFLO000494-PA;CFLO005749-PA;CFLO003254-PA;CFLO001229-PA;CFLO005748-PA Reactome: R-HSA-171007 p38MAPK events 2 CFLO000259-PA;CFLO005675-PA Reactome: R-HSA-73776 RNA Polymerase II Promoter Escape 26 CFLO011191-PA;CFLO006247-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO004196-PA;CFLO001309-PA;CFLO010322-PA;CFLO006370-PA;CFLO007118-PA;CFLO001312-PA;CFLO010911-PA;CFLO015169-PA;CFLO000074-PA;CFLO003054-PA;CFLO015637-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO000007-PA;CFLO019592-PA;CFLO007012-PA;CFLO006498-PA;CFLO007113-PA;CFLO019377-PA;CFLO012113-PA;CFLO008336-PA;CFLO012310-PA Reactome: R-HSA-73728 RNA Polymerase I Promoter Opening 12 CFLO007408-PA;CFLO007368-PA;CFLO011812-PA;CFLO007391-PA;CFLO004197-PA;CFLO008042-PA;CFLO007437-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO010821-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA Reactome: R-HSA-4570464 SUMOylation of RNA binding proteins 21 CFLO008090-PA;CFLO010441-PA;CFLO012747-PA;CFLO014829-PA;CFLO005636-PA;CFLO004819-PA;CFLO004815-PA;CFLO012487-PA;CFLO014833-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO008087-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO013550-PA;CFLO005698-PA;CFLO004818-PA;CFLO000572-PA;CFLO014832-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA KEGG: 00710+4.1.2.13 Carbon fixation in photosynthetic organisms 1 CFLO005131-PA Reactome: R-HSA-174048 APC/C:Cdc20 mediated degradation of Cyclin B 8 CFLO010492-PA;CFLO006992-PA;CFLO009576-PA;CFLO006211-PA;CFLO005584-PA;CFLO012167-PA;CFLO007123-PA;CFLO007015-PA Reactome: R-HSA-4719360 Defective DPM3 causes DPM3-CDG (CDG-1o) 2 CFLO005971-PA;CFLO013866-PA MetaCyc: PWY-6958 Icosapentaenoate biosynthesis I (lower eukaryotes) 2 CFLO007106-PA;CFLO006701-PA MetaCyc: PWY-5537 Pyruvate fermentation to acetate V 4 CFLO005915-PA;CFLO001710-PA;CFLO008726-PA;CFLO004169-PA MetaCyc: PWY-5905 Hypusine biosynthesis 1 CFLO011979-PA Reactome: R-HSA-1660517 Synthesis of PIPs at the late endosome membrane 2 CFLO014990-PA;CFLO008697-PA Reactome: R-HSA-9029558 NR1H2 & NR1H3 regulate gene expression linked to lipogenesis 4 CFLO002012-PA;CFLO019654-PA;CFLO016519-PA;CFLO002013-PA Reactome: R-HSA-917977 Transferrin endocytosis and recycling 14 CFLO002135-PA;CFLO007986-PA;CFLO007384-PA;CFLO006711-PA;CFLO011996-PA;CFLO019332-PA;CFLO006081-PA;CFLO003437-PA;CFLO009346-PA;CFLO004757-PA;CFLO002131-PA;CFLO009916-PA;CFLO006875-PA;CFLO018080-PA KEGG: 00030+5.1.3.1 Pentose phosphate pathway 1 CFLO013167-PA Reactome: R-HSA-2682334 EPH-Ephrin signaling 3 CFLO000979-PA;CFLO000978-PA;CFLO013513-PA Reactome: R-HSA-4090294 SUMOylation of intracellular receptors 2 CFLO001457-PA;CFLO011295-PA Reactome: R-HSA-5358565 Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) 11 CFLO011589-PA;CFLO011597-PA;CFLO011911-PA;CFLO009733-PA;CFLO008828-PA;CFLO003314-PA;CFLO006346-PA;CFLO001995-PA;CFLO005651-PA;CFLO013771-PA;CFLO008680-PA KEGG: 00010+5.3.1.9 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO019811-PA MetaCyc: PWY-4841 UDP-alpha-D-glucuronate biosynthesis (from myo-inositol) 1 CFLO014480-PA KEGG: 00970+6.3.5.7 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 4 CFLO014338-PA;CFLO013139-PA;CFLO011441-PA;CFLO003653-PA Reactome: R-HSA-186763 Downstream signal transduction 3 CFLO008854-PA;CFLO016939-PA;CFLO009017-PA MetaCyc: PWY-801 Homocysteine and cysteine interconversion 1 CFLO009899-PA KEGG: 05235+3.1.3.16 PD-L1 expression and PD-1 checkpoint pathway in cancer 27 CFLO002328-PA;CFLO002906-PA;CFLO019072-PA;CFLO006089-PA;CFLO009585-PA;CFLO013622-PA;CFLO000943-PA;CFLO002009-PA;CFLO013102-PA;CFLO019070-PA;CFLO013630-PA;CFLO016792-PA;CFLO000693-PA;CFLO012317-PA;CFLO008811-PA;CFLO016889-PA;CFLO000144-PA;CFLO016888-PA;CFLO007145-PA;CFLO002883-PA;CFLO008119-PA;CFLO015657-PA;CFLO007785-PA;CFLO014456-PA;CFLO003025-PA;CFLO010525-PA;CFLO008568-PA KEGG: 00450+6.1.1.10 Selenocompound metabolism 2 CFLO012281-PA;CFLO000657-PA Reactome: R-HSA-77285 Beta oxidation of myristoyl-CoA to lauroyl-CoA 1 CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-2453902 The canonical retinoid cycle in rods (twilight vision) 1 CFLO003353-PA KEGG: 00270+2.1.1.37 Cysteine and methionine metabolism 11 CFLO018793-PA;CFLO015399-PA;CFLO009757-PA;CFLO003536-PA;CFLO018137-PA;CFLO006881-PA;CFLO017475-PA;CFLO015398-PA;CFLO013421-PA;CFLO015598-PA;CFLO014404-PA KEGG: 00254+6.4.1.2 Aflatoxin biosynthesis 1 CFLO005702-PA KEGG: 00270+1.13.11.20 Cysteine and methionine metabolism 1 CFLO002449-PA Reactome: R-HSA-432142 Platelet sensitization by LDL 6 CFLO019853-PA;CFLO015916-PA;CFLO011745-PA;CFLO010039-PA;CFLO001327-PA;CFLO002286-PA Reactome: R-HSA-3000484 Scavenging by Class F Receptors 3 CFLO002286-PA;CFLO011745-PA;CFLO019853-PA KEGG: 04660+2.7.10.2 T cell receptor signaling pathway 8 CFLO008194-PA;CFLO013134-PA;CFLO009134-PA;CFLO011034-PA;CFLO013105-PA;CFLO009130-PA;CFLO000296-PA;CFLO009366-PA KEGG: 00760+2.7.1.23 Nicotinate and nicotinamide metabolism 2 CFLO019576-PA;CFLO006142-PA KEGG: 00983+2.7.4.14 Drug metabolism - other enzymes 1 CFLO005147-PA Reactome: R-HSA-168138 Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade 2 CFLO008697-PA;CFLO008046-PA Reactome: R-HSA-199220 Vitamin B5 (pantothenate) metabolism 5 CFLO019654-PA;CFLO002012-PA;CFLO000719-PA;CFLO002013-PA;CFLO016519-PA MetaCyc: PWY-6545 Pyrimidine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis III 10 CFLO015574-PA;CFLO000684-PA;CFLO005692-PA;CFLO000685-PA;CFLO012552-PA;CFLO012591-PA;CFLO001680-PA;CFLO002000-PA;CFLO010539-PA;CFLO014417-PA Reactome: R-HSA-4549356 Defective DPAGT1 causes DPAGT1-CDG (CDG-1j) and CMSTA2 1 CFLO016451-PA KEGG: 00970+6.1.1.6 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 1 CFLO013263-PA KEGG: 00960+2.6.1.1 Tropane, piperidine and pyridine alkaloid biosynthesis 2 CFLO003306-PA;CFLO000623-PA KEGG: 00281+4.2.1.17 Geraniol degradation 1 CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-3000171 Non-integrin membrane-ECM interactions 8 CFLO012358-PA;CFLO002172-PA;CFLO009857-PA;CFLO007163-PA;CFLO018020-PA;CFLO002821-PA;CFLO003353-PA;CFLO002173-PA KEGG: 00330+2.6.1.1 Arginine and proline metabolism 2 CFLO000623-PA;CFLO003306-PA Reactome: R-HSA-76042 RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance 26 CFLO008336-PA;CFLO012310-PA;CFLO019377-PA;CFLO012113-PA;CFLO007113-PA;CFLO007012-PA;CFLO006498-PA;CFLO019592-PA;CFLO000007-PA;CFLO015637-PA;CFLO003054-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO015169-PA;CFLO000074-PA;CFLO001312-PA;CFLO010911-PA;CFLO006370-PA;CFLO007118-PA;CFLO004196-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO010322-PA;CFLO001309-PA;CFLO011191-PA;CFLO006247-PA KEGG: 00052+2.7.1.11 Galactose metabolism 1 CFLO000222-PA KEGG: 00950+2.6.1.5 Isoquinoline alkaloid biosynthesis 1 CFLO012357-PA MetaCyc: PWY-7857 Adlupulone and adhumulone biosynthesis 2 CFLO016902-PA;CFLO016628-PA Reactome: R-HSA-70221 Glycogen breakdown (glycogenolysis) 5 CFLO004313-PA;CFLO018464-PA;CFLO001588-PA;CFLO004850-PA;CFLO017742-PA Reactome: R-HSA-9037629 Lewis blood group biosynthesis 2 CFLO008450-PA;CFLO001386-PA Reactome: R-HSA-201688 WNT mediated activation of DVL 1 CFLO003187-PA Reactome: R-HSA-165158 Activation of AKT2 1 CFLO008104-PA KEGG: 00310+2.3.1.61 Lysine degradation 2 CFLO015982-PA;CFLO015979-PA Reactome: R-HSA-180746 Nuclear import of Rev protein 22 CFLO004815-PA;CFLO004819-PA;CFLO005636-PA;CFLO012747-PA;CFLO014829-PA;CFLO010441-PA;CFLO006277-PA;CFLO008090-PA;CFLO014832-PA;CFLO001720-PA;CFLO004183-PA;CFLO000572-PA;CFLO004818-PA;CFLO008088-PA;CFLO013550-PA;CFLO002763-PA;CFLO008087-PA;CFLO005698-PA;CFLO012487-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO014833-PA Reactome: R-HSA-163680 AMPK inhibits chREBP transcriptional activation activity 1 CFLO012097-PA Reactome: R-HSA-163359 Glucagon signaling in metabolic regulation 4 CFLO015242-PA;CFLO008792-PA;CFLO019116-PA;CFLO008619-PA Reactome: R-HSA-6807505 RNA polymerase II transcribes snRNA genes 37 CFLO019592-PA;CFLO005353-PA;CFLO006498-PA;CFLO007012-PA;CFLO008375-PA;CFLO009452-PA;CFLO013992-PA;CFLO013674-PA;CFLO015968-PA;CFLO014104-PA;CFLO001309-PA;CFLO015495-PA;CFLO002921-PA;CFLO004196-PA;CFLO015488-PA;CFLO001312-PA;CFLO000007-PA;CFLO015637-PA;CFLO001380-PA;CFLO007113-PA;CFLO018085-PA;CFLO002604-PA;CFLO014024-PA;CFLO007988-PA;CFLO007963-PA;CFLO002883-PA;CFLO017732-PA;CFLO000861-PA;CFLO007118-PA;CFLO016792-PA;CFLO001441-PA;CFLO014105-PA;CFLO009455-PA;CFLO017559-PA;CFLO010911-PA;CFLO014021-PA;CFLO002574-PA Reactome: R-HSA-5693568 Resolution of D-loop Structures through Holliday Junction Intermediates 20 CFLO006542-PA;CFLO002907-PA;CFLO001240-PA;CFLO010805-PA;CFLO003301-PA;CFLO005586-PA;CFLO005651-PA;CFLO012610-PA;CFLO013974-PA;CFLO014613-PA;CFLO009542-PA;CFLO010802-PA;CFLO015674-PA;CFLO008873-PA;CFLO005778-PA;CFLO005130-PA;CFLO015680-PA;CFLO001598-PA;CFLO001967-PA;CFLO012234-PA Reactome: R-HSA-427601 Multifunctional anion exchangers 1 CFLO004096-PA KEGG: 04714+2.7.11.1 Thermogenesis 39 CFLO009016-PA;CFLO008862-PA;CFLO004394-PA;CFLO013134-PA;CFLO011904-PA;CFLO010318-PA;CFLO018537-PA;CFLO000579-PA;CFLO007329-PA;CFLO018633-PA;CFLO014993-PA;CFLO008981-PA;CFLO010702-PA;CFLO012986-PA;CFLO017854-PA;CFLO012169-PA;CFLO005902-PA;CFLO013251-PA;CFLO006720-PA;CFLO002667-PA;CFLO019568-PA;CFLO008870-PA;CFLO012097-PA;CFLO005479-PA;CFLO000334-PA;CFLO012344-PA;CFLO019454-PA;CFLO008104-PA;CFLO016607-PA;CFLO012988-PA;CFLO004063-PA;CFLO013482-PA;CFLO000259-PA;CFLO018008-PA;CFLO019202-PA;CFLO012394-PA;CFLO015084-PA;CFLO004217-PA;CFLO019399-PA Reactome: R-HSA-1655829 Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) 7 CFLO005873-PA;CFLO007010-PA;CFLO006277-PA;CFLO009918-PA;CFLO009908-PA;CFLO001053-PA;CFLO019401-PA KEGG: 00620+3.6.1.7 Pyruvate metabolism 1 CFLO001578-PA Reactome: R-HSA-170968 Frs2-mediated activation 1 CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-162699 Synthesis of dolichyl-phosphate mannose 2 CFLO005971-PA;CFLO013866-PA KEGG: 00901+2.7.1.222 Indole alkaloid biosynthesis 18 CFLO013518-PA;CFLO006959-PA;CFLO006960-PA;CFLO007510-PA;CFLO006251-PA;CFLO009113-PA;CFLO006961-PA;CFLO000999-PA;CFLO013107-PA;CFLO011430-PA;CFLO003427-PA;CFLO006963-PA;CFLO013288-PA;CFLO018451-PA;CFLO006958-PA;CFLO003396-PA;CFLO001001-PA;CFLO000993-PA Reactome: R-HSA-3359462 Defective AMN causes hereditary megaloblastic anemia 1 1 CFLO006303-PA Reactome: R-HSA-171319 Telomere Extension By Telomerase 4 CFLO012508-PA;CFLO007135-PA;CFLO012980-PA;CFLO009735-PA Reactome: R-HSA-525793 Myogenesis 5 CFLO005173-PA;CFLO014756-PA;CFLO005718-PA;CFLO017024-PA;CFLO002670-PA KEGG: 00430+2.3.2.2 Taurine and hypotaurine metabolism 3 CFLO007834-PA;CFLO000938-PA;CFLO000936-PA KEGG: 00240+3.6.1.6 Pyrimidine metabolism 2 CFLO010203-PA;CFLO010201-PA MetaCyc: PWY-5690 TCA cycle II (plants and fungi) 9 CFLO005915-PA;CFLO013472-PA;CFLO007214-PA;CFLO001710-PA;CFLO004684-PA;CFLO018047-PA;CFLO004169-PA;CFLO006431-PA;CFLO008726-PA Reactome: R-HSA-1234176 Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha 35 CFLO007718-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO001064-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO004457-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO015469-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO010590-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA Reactome: R-HSA-381426 Regulation of Insulin-like Growth Factor (IGF) transport and uptake by Insulin-like Growth Factor Binding Proteins (IGFBPs) 8 CFLO004964-PA;CFLO011060-PA;CFLO011745-PA;CFLO019853-PA;CFLO012683-PA;CFLO018165-PA;CFLO002286-PA;CFLO009918-PA Reactome: R-HSA-4551638 SUMOylation of chromatin organization proteins 35 CFLO004819-PA;CFLO007391-PA;CFLO004815-PA;CFLO000648-PA;CFLO012747-PA;CFLO004818-PA;CFLO014832-PA;CFLO012487-PA;CFLO002998-PA;CFLO007437-PA;CFLO013546-PA;CFLO016512-PA;CFLO005636-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO010821-PA;CFLO008090-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO014829-PA;CFLO010441-PA;CFLO008042-PA;CFLO000572-PA;CFLO004197-PA;CFLO011812-PA;CFLO001720-PA;CFLO004183-PA;CFLO000120-PA;CFLO014833-PA;CFLO013550-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO008087-PA;CFLO002036-PA;CFLO005698-PA Reactome: R-HSA-382556 ABC-family proteins mediated transport 41 CFLO007718-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO017947-PA;CFLO000939-PA;CFLO005348-PA;CFLO003990-PA;CFLO016610-PA;CFLO004489-PA;CFLO001064-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO013733-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO004457-PA;CFLO011518-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO015469-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO001095-PA;CFLO001500-PA;CFLO004896-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA Reactome: R-HSA-5676590 NIK-->noncanonical NF-kB signaling 40 CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO000939-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO002304-PA;CFLO002615-PA;CFLO007718-PA;CFLO015984-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO009081-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO001064-PA;CFLO006007-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO014819-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO011518-PA;CFLO004457-PA;CFLO000953-PA;CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO010590-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO009082-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO015469-PA;CFLO012235-PA KEGG: 00790+1.14.16.1 Folate biosynthesis 1 CFLO009716-PA MetaCyc: PWY-6596 Adenosine nucleotides degradation I 4 CFLO011228-PA;CFLO009913-PA;CFLO004073-PA;CFLO011225-PA KEGG: 00860+1.3.3.3 Porphyrin and chlorophyll metabolism 2 CFLO016564-PA;CFLO001664-PA Reactome: R-HSA-2453864 Retinoid cycle disease events 1 CFLO003353-PA KEGG: 00230+4.3.2.2 Purine metabolism 1 CFLO013827-PA Reactome: R-HSA-5661270 Formation of xylulose-5-phosphate 1 CFLO001808-PA KEGG: 00670+2.1.2.10 One carbon pool by folate 4 CFLO010049-PA;CFLO004456-PA;CFLO006134-PA;CFLO002410-PA Reactome: R-HSA-8940973 RUNX2 regulates osteoblast differentiation 3 CFLO013244-PA;CFLO007362-PA;CFLO007361-PA Reactome: R-HSA-9018676 Biosynthesis of D-series resolvins 1 CFLO007753-PA MetaCyc: PWY-6829 Trna methylation (yeast) 11 CFLO014232-PA;CFLO008014-PA;CFLO008044-PA;CFLO009842-PA;CFLO013137-PA;CFLO010917-PA;CFLO017925-PA;CFLO009640-PA;CFLO005795-PA;CFLO016301-PA;CFLO001963-PA KEGG: 00380+2.3.1.61 Tryptophan metabolism 2 CFLO015979-PA;CFLO015982-PA MetaCyc: PWY-6703 Preq0 biosynthesis 1 CFLO002629-PA Reactome: R-HSA-77595 Processing of Intronless Pre-mRNAs 9 CFLO013926-PA;CFLO014491-PA;CFLO008706-PA;CFLO011459-PA;CFLO008219-PA;CFLO008709-PA;CFLO000562-PA;CFLO007295-PA;CFLO013992-PA KEGG: 00630+1.11.1.6 Glyoxylate and dicarboxylate metabolism 1 CFLO003960-PA MetaCyc: PWY-5751 Phenylethanol biosynthesis 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-77310 Beta oxidation of lauroyl-CoA to decanoyl-CoA-CoA 1 CFLO011836-PA MetaCyc: PWY-8106 Queuosine biosynthesis III (queuosine salvage) 2 CFLO015201-PA;CFLO015628-PA Reactome: R-HSA-77305 Beta oxidation of palmitoyl-CoA to myristoyl-CoA 1 CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-5684264 MAP3K8 (TPL2)-dependent MAPK1/3 activation 5 CFLO006007-PA;CFLO012235-PA;CFLO002615-PA;CFLO009081-PA;CFLO009082-PA Reactome: R-HSA-450385 Butyrate Response Factor 1 (BRF1) binds and destabilizes mRNA 13 CFLO015655-PA;CFLO009644-PA;CFLO010929-PA;CFLO012566-PA;CFLO015852-PA;CFLO015909-PA;CFLO018054-PA;CFLO011214-PA;CFLO006571-PA;CFLO005696-PA;CFLO019015-PA;CFLO006212-PA;CFLO001443-PA Reactome: R-HSA-8939245 RUNX1 regulates transcription of genes involved in BCR signaling 2 CFLO007361-PA;CFLO007362-PA Reactome: R-HSA-400206 Regulation of lipid metabolism by PPARalpha 4 CFLO013084-PA;CFLO009647-PA;CFLO016506-PA;CFLO006718-PA KEGG: 00564+2.3.1.51 Glycerophospholipid metabolism 5 CFLO002146-PA;CFLO011434-PA;CFLO014422-PA;CFLO011437-PA;CFLO015620-PA KEGG: 00565+3.1.3.4 Ether lipid metabolism 1 CFLO000216-PA KEGG: 00900+3.4.24.84 Terpenoid backbone biosynthesis 1 CFLO007976-PA Reactome: R-HSA-180585 Vif-mediated degradation of APOBEC3G 35 CFLO001064-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO007718-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO010590-PA;CFLO015469-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO001095-PA;CFLO000953-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO011518-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO004457-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA MetaCyc: PWY-5046 2-oxoisovalerate decarboxylation to isobutanoyl-CoA 1 CFLO000151-PA KEGG: 00230+2.4.2.1 Purine metabolism 1 CFLO016529-PA Reactome: R-HSA-9635465 Suppression of apoptosis 1 CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-975138 TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation 1 CFLO019450-PA Reactome: R-HSA-9649948 Signaling downstream of RAS mutants 4 CFLO013244-PA;CFLO017592-PA;CFLO011904-PA;CFLO010617-PA Reactome: R-HSA-2151201 Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis 17 CFLO005122-PA;CFLO016842-PA;CFLO014188-PA;CFLO014150-PA;CFLO016506-PA;CFLO009623-PA;CFLO005777-PA;CFLO004951-PA;CFLO014187-PA;CFLO001544-PA;CFLO014351-PA;CFLO006718-PA;CFLO012308-PA;CFLO003349-PA;CFLO014354-PA;CFLO013084-PA;CFLO000981-PA MetaCyc: PWY-7277 Sphingolipid biosynthesis (mammals) 1 CFLO003152-PA KEGG: 00604+3.2.1.52 Glycosphingolipid biosynthesis - ganglio series 8 CFLO007387-PA;CFLO006861-PA;CFLO019181-PA;CFLO014190-PA;CFLO005046-PA;CFLO005047-PA;CFLO018671-PA;CFLO007240-PA Reactome: R-HSA-73843 5-Phosphoribose 1-diphosphate biosynthesis 1 CFLO005535-PA KEGG: 00270+2.6.1.1 Cysteine and methionine metabolism 2 CFLO000623-PA;CFLO003306-PA Reactome: R-HSA-71336 Pentose phosphate pathway 6 CFLO007188-PA;CFLO006969-PA;CFLO001993-PA;CFLO006551-PA;CFLO013167-PA;CFLO000118-PA KEGG: 00230+2.7.6.1 Purine metabolism 2 CFLO005535-PA;CFLO004111-PA Reactome: R-HSA-111471 Apoptotic factor-mediated response 1 CFLO009619-PA MetaCyc: PWY-5738 GDP-6-deoxy-D-talose biosynthesis 1 CFLO002873-PA KEGG: 00270+6.3.2.3 Cysteine and methionine metabolism 1 CFLO002150-PA Reactome: R-HSA-975577 N-Glycan antennae elongation 2 CFLO007738-PA;CFLO014412-PA MetaCyc: PWY-3581 (S)-reticuline biosynthesis I 1 CFLO000009-PA KEGG: 00561+2.3.1.15 Glycerolipid metabolism 2 CFLO007382-PA;CFLO004213-PA MetaCyc: PWY-5132 Lupulone and humulone biosynthesis 2 CFLO016628-PA;CFLO016902-PA Reactome: R-HSA-8869496 TFAP2A acts as a transcriptional repressor during retinoic acid induced cell differentiation 2 CFLO009681-PA;CFLO013577-PA Reactome: R-HSA-1268020 Mitochondrial protein import 28 CFLO008197-PA;CFLO000921-PA;CFLO009681-PA;CFLO006717-PA;CFLO013824-PA;CFLO005886-PA;CFLO001994-PA;CFLO000484-PA;CFLO001382-PA;CFLO004699-PA;CFLO002546-PA;CFLO009645-PA;CFLO005148-PA;CFLO006639-PA;CFLO002397-PA;CFLO011409-PA;CFLO007821-PA;CFLO017924-PA;CFLO012495-PA;CFLO016778-PA;CFLO013984-PA;CFLO005370-PA;CFLO000027-PA;CFLO014618-PA;CFLO007190-PA;CFLO005777-PA;CFLO016911-PA;CFLO007397-PA MetaCyc: PWY-5480 Pyruvate fermentation to ethanol I 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-190861 Gap junction assembly 8 CFLO008841-PA;CFLO002905-PA;CFLO004179-PA;CFLO001242-PA;CFLO009841-PA;CFLO006561-PA;CFLO014186-PA;CFLO016852-PA MetaCyc: PWY-8055 Palmitoyl ethanolamide biosynthesis 8 CFLO002146-PA;CFLO004213-PA;CFLO014422-PA;CFLO011437-PA;CFLO007382-PA;CFLO000216-PA;CFLO011434-PA;CFLO015620-PA MetaCyc: PWY-6453 Stigma estolide biosynthesis 8 CFLO002146-PA;CFLO004213-PA;CFLO014422-PA;CFLO011437-PA;CFLO007382-PA;CFLO000216-PA;CFLO011434-PA;CFLO015620-PA KEGG: 00310+1.8.1.4 Lysine degradation 1 CFLO000151-PA MetaCyc: PWY-6920 6-gingerol analog biosynthesis (engineered) 2 CFLO013638-PA;CFLO013479-PA Reactome: R-HSA-6804116 TP53 Regulates Transcription of Genes Involved in G1 Cell Cycle Arrest 1 CFLO001098-PA Reactome: R-HSA-5654700 FRS-mediated FGFR2 signaling 1 CFLO001520-PA MetaCyc: PWY-7158 L-phenylalanine degradation V 1 CFLO009716-PA KEGG: 00670+1.5.1.20 One carbon pool by folate 1 CFLO013394-PA MetaCyc: PWY-3841 Folate transformations II (plants) 9 CFLO013394-PA;CFLO012613-PA;CFLO010087-PA;CFLO005088-PA;CFLO005098-PA;CFLO014967-PA;CFLO004433-PA;CFLO001271-PA;CFLO003993-PA KEGG: 00270+4.2.1.22 Cysteine and methionine metabolism 1 CFLO009899-PA Reactome: R-HSA-8949275 RUNX3 Regulates Immune Response and Cell Migration 2 CFLO007361-PA;CFLO007362-PA Reactome: R-HSA-4793952 Defective MGAT2 causes MGAT2-CDG (CDG-2a) 2 CFLO013982-PA;CFLO013983-PA Reactome: R-HSA-5654733 Negative regulation of FGFR4 signaling 1 CFLO013244-PA MetaCyc: PWY-7601 Arachidonate biosynthesis IV (8-detaturase, lower eukaryotes) 15 CFLO007106-PA;CFLO008778-PA;CFLO008781-PA;CFLO006701-PA;CFLO008779-PA;CFLO010863-PA;CFLO010956-PA;CFLO010625-PA;CFLO010959-PA;CFLO015666-PA;CFLO010957-PA;CFLO008782-PA;CFLO015015-PA;CFLO004004-PA;CFLO008780-PA MetaCyc: PWY-7574 Propanoyl-coa degradation II 2 CFLO013479-PA;CFLO013638-PA MetaCyc: PWY-6607 Guanosine nucleotides degradation I 2 CFLO011228-PA;CFLO011225-PA MetaCyc: PWY-7234 Inosine-5'-phosphate biosynthesis III 4 CFLO013827-PA;CFLO017671-PA;CFLO004460-PA;CFLO015327-PA MetaCyc: PWY-7625 Phosphatidylinositol biosynthesis II (eukaryotes) 1 CFLO000498-PA Reactome: R-HSA-9029569 NR1H3 & NR1H2 regulate gene expression linked to cholesterol transport and efflux 8 CFLO005758-PA;CFLO001535-PA;CFLO012800-PA;CFLO010724-PA;CFLO016868-PA;CFLO011446-PA;CFLO012806-PA;CFLO001484-PA Reactome: R-HSA-8866652 Synthesis of active ubiquitin: roles of E1 and E2 enzymes 1 CFLO010420-PA MetaCyc: PWY-7347 Sucrose biosynthesis III 1 CFLO019811-PA KEGG: 00270+1.1.1.37 Cysteine and methionine metabolism 2 CFLO018047-PA;CFLO007214-PA MetaCyc: PWY-5083 NAD/NADH phosphorylation and dephosphorylation 2 CFLO006142-PA;CFLO019576-PA MetaCyc: PWY-6907 Thiamine diphosphate biosynthesis III (Staphylococcus) 1 CFLO003438-PA Reactome: R-HSA-8876725 Protein methylation 7 CFLO001830-PA;CFLO011221-PA;CFLO004278-PA;CFLO016566-PA;CFLO017923-PA;CFLO009910-PA;CFLO016610-PA KEGG: 00510+2.4.1.256 N-Glycan biosynthesis 1 CFLO007254-PA KEGG: 00670+2.1.2.2 One carbon pool by folate 1 CFLO019130-PA MetaCyc: PWY-5331 Taurine biosynthesis I 1 CFLO002449-PA Reactome: R-HSA-375165 NCAM signaling for neurite out-growth 3 CFLO013244-PA;CFLO012259-PA;CFLO010486-PA Reactome: R-HSA-6782135 Dual incision in TC-NER 42 CFLO012323-PA;CFLO011905-PA;CFLO007012-PA;CFLO009851-PA;CFLO007174-PA;CFLO013771-PA;CFLO015637-PA;CFLO011911-PA;CFLO009733-PA;CFLO011191-PA;CFLO002882-PA;CFLO010420-PA;CFLO019810-PA;CFLO016962-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO004196-PA;CFLO009853-PA;CFLO006603-PA;CFLO012555-PA;CFLO012310-PA;CFLO008680-PA;CFLO002994-PA;CFLO011309-PA;CFLO008121-PA;CFLO018166-PA;CFLO010911-PA;CFLO009854-PA;CFLO003985-PA;CFLO007399-PA;CFLO014021-PA;CFLO004174-PA;CFLO006247-PA;CFLO010332-PA;CFLO008828-PA;CFLO006346-PA;CFLO003314-PA;CFLO003335-PA;CFLO006370-PA;CFLO010322-PA;CFLO019062-PA;CFLO000937-PA Reactome: R-HSA-209968 Thyroxine biosynthesis 1 CFLO002666-PA Reactome: R-HSA-6814848 Glycerophospholipid catabolism 1 CFLO000973-PA Reactome: R-HSA-4641257 Degradation of AXIN 36 CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO014819-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO004457-PA;CFLO000953-PA;CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO010590-PA;CFLO015983-PA;CFLO013450-PA;CFLO007207-PA;CFLO001095-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO015469-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO000939-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO002304-PA;CFLO007718-PA;CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO001064-PA MetaCyc: PWY-7384 Anaerobic energy metabolism (invertebrates, mitochondrial) 5 CFLO005915-PA;CFLO001710-PA;CFLO004684-PA;CFLO008726-PA;CFLO004169-PA KEGG: 00230+3.5.3.4 Purine metabolism 1 CFLO016115-PA Reactome: R-HSA-112382 Formation of RNA Pol II elongation complex 36 CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO005811-PA;CFLO010911-PA;CFLO008811-PA;CFLO006370-PA;CFLO007118-PA;CFLO010322-PA;CFLO006247-PA;CFLO012310-PA;CFLO005799-PA;CFLO007113-PA;CFLO006869-PA;CFLO004744-PA;CFLO004758-PA;CFLO008569-PA;CFLO018085-PA;CFLO015226-PA;CFLO015637-PA;CFLO015189-PA;CFLO002885-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO004196-PA;CFLO019772-PA;CFLO002134-PA;CFLO000994-PA;CFLO011191-PA;CFLO013674-PA;CFLO013992-PA;CFLO006374-PA;CFLO007012-PA;CFLO000122-PA;CFLO019592-PA;CFLO005353-PA;CFLO009375-PA MetaCyc: PWY-5697 Allantoin degradation to ureidoglycolate I (urea producing) 2 CFLO016115-PA;CFLO017986-PA Reactome: R-HSA-114508 Effects of PIP2 hydrolysis 7 CFLO006114-PA;CFLO016462-PA;CFLO002753-PA;CFLO010224-PA;CFLO001719-PA;CFLO006116-PA;CFLO006115-PA KEGG: 00020+4.1.1.32 Citrate cycle (TCA cycle) 1 CFLO000017-PA Reactome: R-HSA-6791226 Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol 132 CFLO008851-PA;CFLO014542-PA;CFLO000326-PA;CFLO004325-PA;CFLO010962-PA;CFLO002749-PA;CFLO000629-PA;CFLO017730-PA;CFLO013096-PA;CFLO005709-PA;CFLO004181-PA;CFLO011214-PA;CFLO012689-PA;CFLO006045-PA;CFLO007521-PA;CFLO012297-PA;CFLO005901-PA;CFLO003184-PA;CFLO000325-PA;CFLO005822-PA;CFLO009848-PA;CFLO001028-PA;CFLO005804-PA;CFLO005334-PA;CFLO000889-PA;CFLO002408-PA;CFLO008228-PA;CFLO006752-PA;CFLO006212-PA;CFLO004441-PA;CFLO003083-PA;CFLO010554-PA;CFLO005798-PA;CFLO010496-PA;CFLO006571-PA;CFLO013459-PA;CFLO001260-PA;CFLO017942-PA;CFLO000349-PA;CFLO010240-PA;CFLO013848-PA;CFLO007792-PA;CFLO004176-PA;CFLO013281-PA;CFLO005972-PA;CFLO009644-PA;CFLO002329-PA;CFLO012240-PA;CFLO010242-PA;CFLO015631-PA;CFLO002739-PA;CFLO018539-PA;CFLO010712-PA;CFLO016302-PA;CFLO012344-PA;CFLO000574-PA;CFLO013411-PA;CFLO004825-PA;CFLO012570-PA;CFLO014883-PA;CFLO001666-PA;CFLO006483-PA;CFLO000744-PA;CFLO005096-PA;CFLO011550-PA;CFLO009063-PA;CFLO002568-PA;CFLO001584-PA;CFLO010929-PA;CFLO014395-PA;CFLO004278-PA;CFLO011261-PA;CFLO012584-PA;CFLO017946-PA;CFLO000826-PA;CFLO011483-PA;CFLO019663-PA;CFLO018054-PA;CFLO015382-PA;CFLO001519-PA;CFLO000918-PA;CFLO002879-PA;CFLO012596-PA;CFLO005150-PA;CFLO015909-PA;CFLO014085-PA;CFLO002079-PA;CFLO017594-PA;CFLO018800-PA;CFLO008061-PA;CFLO000339-PA;CFLO009380-PA;CFLO014117-PA;CFLO015655-PA;CFLO006630-PA;CFLO013929-PA;CFLO008833-PA;CFLO000612-PA;CFLO000170-PA;CFLO005789-PA;CFLO019015-PA;CFLO008263-PA;CFLO001443-PA;CFLO010535-PA;CFLO003311-PA;CFLO011221-PA;CFLO004166-PA;CFLO000701-PA;CFLO004025-PA;CFLO002901-PA;CFLO014026-PA;CFLO003320-PA;CFLO010627-PA;CFLO012333-PA;CFLO018839-PA;CFLO002141-PA;CFLO013407-PA;CFLO017472-PA;CFLO010508-PA;CFLO012379-PA;CFLO004367-PA;CFLO006720-PA;CFLO019287-PA;CFLO004224-PA;CFLO008335-PA;CFLO016897-PA;CFLO004405-PA;CFLO016891-PA;CFLO019059-PA;CFLO000315-PA;CFLO006768-PA;CFLO012586-PA KEGG: 00240+2.1.1.45 Pyrimidine metabolism 2 CFLO005098-PA;CFLO005088-PA Reactome: R-HSA-196741 Cobalamin (Cbl, vitamin B12) transport and metabolism 4 CFLO012107-PA;CFLO005722-PA;CFLO006303-PA;CFLO004532-PA KEGG: 00531+3.2.1.52 Glycosaminoglycan degradation 8 CFLO014190-PA;CFLO006861-PA;CFLO019181-PA;CFLO018671-PA;CFLO007240-PA;CFLO005046-PA;CFLO005047-PA;CFLO007387-PA MetaCyc: PWY-7204 Pyridoxal 5'-phosphate salvage II (plants) 3 CFLO004155-PA;CFLO015233-PA;CFLO011458-PA Reactome: R-HSA-8964616 G beta:gamma signalling through CDC42 1 CFLO005173-PA Reactome: R-HSA-70688 Proline catabolism 1 CFLO017737-PA Reactome: R-HSA-442660 Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters 1 CFLO007889-PA MetaCyc: PWY-7918 Protein N-glycosylation processing phase (yeast) 2 CFLO015264-PA;CFLO019370-PA MetaCyc: PWY-4202 Arsenate detoxification I (mammalian) 1 CFLO016529-PA Reactome: R-HSA-3214847 HATs acetylate histones 48 CFLO010984-PA;CFLO001524-PA;CFLO004594-PA;CFLO007391-PA;CFLO013600-PA;CFLO006485-PA;CFLO003791-PA;CFLO016304-PA;CFLO018009-PA;CFLO000919-PA;CFLO004655-PA;CFLO009655-PA;CFLO013272-PA;CFLO013546-PA;CFLO012620-PA;CFLO010681-PA;CFLO012190-PA;CFLO007437-PA;CFLO015438-PA;CFLO006482-PA;CFLO002673-PA;CFLO001266-PA;CFLO018241-PA;CFLO000983-PA;CFLO012508-PA;CFLO007135-PA;CFLO004385-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO011231-PA;CFLO010821-PA;CFLO010927-PA;CFLO019377-PA;CFLO012113-PA;CFLO012595-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO009651-PA;CFLO015759-PA;CFLO002036-PA;CFLO003024-PA;CFLO015973-PA;CFLO001265-PA;CFLO018551-PA;CFLO011812-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO008262-PA MetaCyc: PWY-2301 Myo-inositol biosynthesis 2 CFLO017716-PA;CFLO017717-PA KEGG: 00603+3.2.1.22 Glycosphingolipid biosynthesis - globo and isoglobo series 1 CFLO009658-PA MetaCyc: PWY-1042 Glycolysis IV (plant cytosol) 8 CFLO015634-PA;CFLO000222-PA;CFLO017154-PA;CFLO016901-PA;CFLO009751-PA;CFLO009597-PA;CFLO005131-PA;CFLO003967-PA Reactome: R-HSA-8850843 Phosphate bond hydrolysis by NTPDase proteins 1 CFLO015291-PA KEGG: 00520+5.4.2.10 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 3 CFLO001597-PA;CFLO005966-PA;CFLO008700-PA Reactome: R-HSA-202040 G-protein activation 1 CFLO001625-PA Reactome: R-HSA-5339700 TCF7L2 mutants don't bind CTBP 1 CFLO002960-PA Reactome: R-HSA-192456 Digestion of dietary lipid 2 CFLO004627-PA;CFLO004631-PA Reactome: R-HSA-2979096 NOTCH2 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus 9 CFLO002955-PA;CFLO008212-PA;CFLO007222-PA;CFLO001395-PA;CFLO001428-PA;CFLO002956-PA;CFLO010507-PA;CFLO001394-PA;CFLO015617-PA Reactome: R-HSA-110331 Cleavage of the damaged purine 15 CFLO010821-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO003212-PA;CFLO007437-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO011812-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO013757-PA;CFLO007391-PA;CFLO017341-PA KEGG: 00630+4.2.1.3 Glyoxylate and dicarboxylate metabolism 2 CFLO007267-PA;CFLO013824-PA KEGG: 00564+2.7.7.41 Glycerophospholipid metabolism 2 CFLO006541-PA;CFLO019403-PA Reactome: R-HSA-69183 Processive synthesis on the lagging strand 9 CFLO001238-PA;CFLO007147-PA;CFLO008680-PA;CFLO013771-PA;CFLO012204-PA;CFLO003314-PA;CFLO015227-PA;CFLO011911-PA;CFLO002987-PA KEGG: 00900+5.3.3.2 Terpenoid backbone biosynthesis 1 CFLO008710-PA KEGG: 00860+2.5.1.17 Porphyrin and chlorophyll metabolism 1 CFLO004532-PA MetaCyc: PWY-6969 TCA cycle V (2-oxoglutarate:ferredoxin oxidoreductase) 11 CFLO013472-PA;CFLO005915-PA;CFLO007214-PA;CFLO004169-PA;CFLO010827-PA;CFLO008726-PA;CFLO006431-PA;CFLO001710-PA;CFLO004684-PA;CFLO018047-PA;CFLO009985-PA Reactome: R-HSA-5683371 Defective ABCB6 causes isolated colobomatous microphthalmia 7 (MCOPCB7) 1 CFLO004167-PA KEGG: 00480+1.1.1.44 Glutathione metabolism 1 CFLO007188-PA KEGG: 04070+2.7.4.24+2.7.4.21 Phosphatidylinositol signaling system 1 CFLO018799-PA Reactome: R-HSA-400253 Circadian Clock 17 CFLO009755-PA;CFLO015438-PA;CFLO009081-PA;CFLO014456-PA;CFLO009082-PA;CFLO016506-PA;CFLO006007-PA;CFLO013888-PA;CFLO016177-PA;CFLO014354-PA;CFLO013084-PA;CFLO013898-PA;CFLO006718-PA;CFLO006089-PA;CFLO014351-PA;CFLO002615-PA;CFLO016304-PA Reactome: R-HSA-180910 Vpr-mediated nuclear import of PICs 21 CFLO005698-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO013550-PA;CFLO008087-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO014833-PA;CFLO012487-PA;CFLO001720-PA;CFLO004183-PA;CFLO014832-PA;CFLO000572-PA;CFLO004818-PA;CFLO012747-PA;CFLO014829-PA;CFLO010441-PA;CFLO008090-PA;CFLO004815-PA;CFLO004819-PA;CFLO005636-PA Reactome: R-HSA-4411364 Binding of TCF/LEF:CTNNB1 to target gene promoters 1 CFLO009267-PA Reactome: R-HSA-210990 PECAM1 interactions 1 CFLO010039-PA Reactome: R-HSA-2122948 Activated NOTCH1 Transmits Signal to the Nucleus 11 CFLO001428-PA;CFLO002956-PA;CFLO002955-PA;CFLO008212-PA;CFLO009368-PA;CFLO011086-PA;CFLO007222-PA;CFLO001395-PA;CFLO015617-PA;CFLO010507-PA;CFLO001394-PA KEGG: 00740+3.1.3.2 Riboflavin metabolism 2 CFLO013516-PA;CFLO011184-PA MetaCyc: PWY-7894 Procollagen hydroxylation and glycosylation 2 CFLO011235-PA;CFLO011237-PA Reactome: R-HSA-9665247 Resistance of ERBB2 KD mutants to osimertinib 1 CFLO005384-PA KEGG: 00240+2.1.3.2 Pyrimidine metabolism 1 CFLO011966-PA Reactome: R-HSA-9664565 Signaling by ERBB2 KD Mutants 2 CFLO009698-PA;CFLO005384-PA Reactome: R-HSA-1660514 Synthesis of PIPs at the Golgi membrane 2 CFLO014990-PA;CFLO008697-PA Reactome: R-HSA-6796648 TP53 Regulates Transcription of DNA Repair Genes 30 CFLO005072-PA;CFLO013674-PA;CFLO004394-PA;CFLO000994-PA;CFLO006247-PA;CFLO011191-PA;CFLO010322-PA;CFLO004196-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO007118-PA;CFLO008811-PA;CFLO002885-PA;CFLO006370-PA;CFLO005811-PA;CFLO010911-PA;CFLO015189-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO015637-PA;CFLO019592-PA;CFLO005353-PA;CFLO007012-PA;CFLO008569-PA;CFLO018085-PA;CFLO019085-PA;CFLO007113-PA;CFLO006869-PA;CFLO012310-PA;CFLO001995-PA Reactome: R-HSA-8854691 Interleukin-20 family signaling 3 CFLO017052-PA;CFLO005850-PA;CFLO000296-PA MetaCyc: PWY-6606 Guanosine nucleotides degradation II 3 CFLO011228-PA;CFLO011185-PA;CFLO011225-PA KEGG: 04070+2.7.1.137 Phosphatidylinositol signaling system 1 CFLO008697-PA KEGG: 00720+2.3.3.8 Carbon fixation pathways in prokaryotes 1 CFLO004169-PA MetaCyc: PWY-3341 L-proline biosynthesis III (from L-ornithine) 3 CFLO002109-PA;CFLO000590-PA;CFLO003287-PA KEGG: 00520+3.2.1.14 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 10 CFLO004926-PA;CFLO004916-PA;CFLO010218-PA;CFLO001957-PA;CFLO006976-PA;CFLO010596-PA;CFLO001724-PA;CFLO008050-PA;CFLO001781-PA;CFLO008237-PA MetaCyc: PWY-7821 Tunicamycin biosynthesis 3 CFLO011228-PA;CFLO002000-PA;CFLO011225-PA Reactome: R-HSA-70263 Gluconeogenesis 12 CFLO009751-PA;CFLO009597-PA;CFLO007214-PA;CFLO017154-PA;CFLO015634-PA;CFLO019811-PA;CFLO015688-PA;CFLO015687-PA;CFLO018047-PA;CFLO005131-PA;CFLO009994-PA;CFLO000017-PA Reactome: R-HSA-8964026 Chylomicron clearance 3 CFLO002286-PA;CFLO011745-PA;CFLO019853-PA MetaCyc: PWY-7159 3,8-divinyl-chlorophyllide a biosynthesis III (aerobic, light independent) 4 CFLO001664-PA;CFLO008202-PA;CFLO019161-PA;CFLO016564-PA Reactome: R-HSA-5694530 Cargo concentration in the ER 5 CFLO007010-PA;CFLO002332-PA;CFLO019401-PA;CFLO009908-PA;CFLO001053-PA Reactome: R-HSA-6804758 Regulation of TP53 Activity through Acetylation 4 CFLO010681-PA;CFLO013600-PA;CFLO005894-PA;CFLO009089-PA KEGG: 00450+2.7.9.3 Selenocompound metabolism 1 CFLO016280-PA KEGG: 00270+2.5.1.6 Cysteine and methionine metabolism 1 CFLO017970-PA Reactome: R-HSA-5654726 Negative regulation of FGFR1 signaling 1 CFLO013244-PA KEGG: 00240+2.4.2.10 Pyrimidine metabolism 1 CFLO005916-PA KEGG: 00051+2.7.1.3 Fructose and mannose metabolism 1 CFLO007293-PA MetaCyc: PWY-7199 Pyrimidine deoxyribonucleosides salvage 3 CFLO005098-PA;CFLO005088-PA;CFLO018007-PA KEGG: 00240+4.1.1.23 Pyrimidine metabolism 1 CFLO005916-PA MetaCyc: PWY-5129 Sphingolipid biosynthesis (plants) 2 CFLO006369-PA;CFLO018552-PA MetaCyc: PWY-6863 Pyruvate fermentation to hexanol (engineered) 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA KEGG: 00630+6.2.1.1 Glyoxylate and dicarboxylate metabolism 2 CFLO016628-PA;CFLO016902-PA KEGG: 00010+5.1.3.3 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO014121-PA Reactome: R-HSA-2132295 MHC class II antigen presentation 37 CFLO014006-PA;CFLO001053-PA;CFLO004019-PA;CFLO009841-PA;CFLO006561-PA;CFLO009919-PA;CFLO000598-PA;CFLO001745-PA;CFLO006324-PA;CFLO012642-PA;CFLO010998-PA;CFLO005634-PA;CFLO002905-PA;CFLO000836-PA;CFLO001242-PA;CFLO014186-PA;CFLO001296-PA;CFLO019401-PA;CFLO000348-PA;CFLO007730-PA;CFLO008841-PA;CFLO007010-PA;CFLO004179-PA;CFLO016898-PA;CFLO018890-PA;CFLO016852-PA;CFLO002965-PA;CFLO015176-PA;CFLO001473-PA;CFLO005139-PA;CFLO001034-PA;CFLO011480-PA;CFLO008775-PA;CFLO010396-PA;CFLO001653-PA;CFLO007308-PA;CFLO009908-PA Reactome: R-HSA-8948751 Regulation of PTEN stability and activity 37 CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO000953-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO000256-PA;CFLO003059-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO010590-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO014819-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO004457-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO015984-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO001064-PA;CFLO003187-PA;CFLO000939-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO007718-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO002304-PA Reactome: R-HSA-375280 Amine ligand-binding receptors 1 CFLO003223-PA Reactome: R-HSA-2142789 Ubiquinol biosynthesis 6 CFLO018371-PA;CFLO018555-PA;CFLO002566-PA;CFLO005148-PA;CFLO001545-PA;CFLO016124-PA KEGG: 00760+2.4.2.1 Nicotinate and nicotinamide metabolism 1 CFLO016529-PA KEGG: 00562+2.7.1.153 Inositol phosphate metabolism 1 CFLO011291-PA Reactome: R-HSA-114604 GPVI-mediated activation cascade 5 CFLO005740-PA;CFLO010039-PA;CFLO004869-PA;CFLO008104-PA;CFLO005173-PA KEGG: 00230+4.1.1.97 Purine metabolism 1 CFLO010622-PA Reactome: R-HSA-77346 Beta oxidation of decanoyl-CoA to octanoyl-CoA-CoA 1 CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-8951911 RUNX3 regulates RUNX1-mediated transcription 2 CFLO007361-PA;CFLO007362-PA Reactome: R-HSA-8873719 RAB geranylgeranylation 5 CFLO003171-PA;CFLO001097-PA;CFLO002824-PA;CFLO010543-PA;CFLO002710-PA Reactome: R-HSA-111465 Apoptotic cleavage of cellular proteins 2 CFLO007019-PA;CFLO012768-PA Reactome: R-HSA-420499 Class C/3 (Metabotropic glutamate/pheromone receptors) 8 CFLO009560-PA;CFLO015411-PA;CFLO002292-PA;CFLO005907-PA;CFLO015412-PA;CFLO005908-PA;CFLO019066-PA;CFLO000060-PA Reactome: R-HSA-8936459 RUNX1 regulates genes involved in megakaryocyte differentiation and platelet function 19 CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO007437-PA;CFLO011812-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO009647-PA;CFLO010821-PA;CFLO005758-PA;CFLO007391-PA;CFLO007368-PA;CFLO003342-PA;CFLO004416-PA;CFLO007408-PA;CFLO007362-PA;CFLO004334-PA;CFLO007361-PA MetaCyc: PWY-7727 Docosahexaenoate biosynthesis IV (4-desaturase, mammals) 2 CFLO007106-PA;CFLO006701-PA Reactome: R-HSA-8931987 RUNX1 regulates estrogen receptor mediated transcription 2 CFLO007362-PA;CFLO007361-PA KEGG: 00562+1.13.99.1 Inositol phosphate metabolism 1 CFLO014480-PA KEGG: 04070+2.7.11.13 Phosphatidylinositol signaling system 3 CFLO002794-PA;CFLO008701-PA;CFLO006373-PA Reactome: R-HSA-1660499 Synthesis of PIPs at the plasma membrane 5 CFLO005740-PA;CFLO010543-PA;CFLO011291-PA;CFLO002536-PA;CFLO008697-PA Reactome: R-HSA-156581 Methylation 1 CFLO017970-PA Reactome: R-HSA-2206291 MPS IIIC - Sanfilippo syndrome C 1 CFLO010946-PA KEGG: 00520+5.1.3.2 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 2 CFLO006591-PA;CFLO001267-PA KEGG: 04070+2.7.1.159 Phosphatidylinositol signaling system 1 CFLO002434-PA Reactome: R-HSA-77075 RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE 24 CFLO007012-PA;CFLO018085-PA;CFLO007113-PA;CFLO012985-PA;CFLO013864-PA;CFLO019592-PA;CFLO005353-PA;CFLO012310-PA;CFLO013865-PA;CFLO010322-PA;CFLO009087-PA;CFLO004196-PA;CFLO012515-PA;CFLO004855-PA;CFLO007118-PA;CFLO006370-PA;CFLO006247-PA;CFLO011191-PA;CFLO014021-PA;CFLO002046-PA;CFLO007399-PA;CFLO018730-PA;CFLO015637-PA;CFLO010911-PA Reactome: R-HSA-8875555 MET activates RAP1 and RAC1 1 CFLO009017-PA Reactome: R-HSA-5218921 VEGFR2 mediated cell proliferation 3 CFLO002753-PA;CFLO008104-PA;CFLO008854-PA KEGG: 00240+2.7.4.14 Pyrimidine metabolism 1 CFLO005147-PA Reactome: R-HSA-6804759 Regulation of TP53 Activity through Association with Co-factors 1 CFLO006104-PA KEGG: 00563+2.4.1.198 Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis 2 CFLO012115-PA;CFLO007207-PA Reactome: R-HSA-901032 ER Quality Control Compartment (ERQC) 5 CFLO016288-PA;CFLO010975-PA;CFLO010968-PA;CFLO010966-PA;CFLO016290-PA Reactome: R-HSA-164939 Nef mediated downregulation of CD28 cell surface expression 1 CFLO006324-PA Reactome: R-HSA-181430 Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle 1 CFLO002413-PA Reactome: R-HSA-1483226 Synthesis of PI 1 CFLO000498-PA Reactome: R-HSA-6799198 Complex I biogenesis 34 CFLO001444-PA;CFLO012727-PA;CFLO005957-PA;CFLO012224-PA;CFLO002139-PA;CFLO012334-PA;CFLO018840-PA;CFLO001346-PA;CFLO014059-PA;CFLO015618-PA;CFLO013985-PA;CFLO017365-PA;CFLO002848-PA;CFLO015263-PA;CFLO003629-PA;CFLO010215-PA;CFLO014618-PA;CFLO009092-PA;CFLO002101-PA;CFLO008777-PA;CFLO007445-PA;CFLO006783-PA;CFLO019189-PA;CFLO006789-PA;CFLO005865-PA;CFLO005471-PA;CFLO012099-PA;CFLO016959-PA;CFLO015466-PA;CFLO007297-PA;CFLO013492-PA;CFLO000569-PA;CFLO009837-PA;CFLO019450-PA MetaCyc: PWY-6871 3-methylbutanol biosynthesis (engineered) 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-389957 Prefoldin mediated transfer of substrate to CCT/TriC 14 CFLO002869-PA;CFLO011380-PA;CFLO012044-PA;CFLO015538-PA;CFLO002719-PA;CFLO012172-PA;CFLO018650-PA;CFLO007063-PA;CFLO009580-PA;CFLO004305-PA;CFLO000032-PA;CFLO008820-PA;CFLO009676-PA;CFLO014339-PA Reactome: R-HSA-3249367 STAT6-mediated induction of chemokines 1 CFLO003723-PA MetaCyc: PWY-7197 Pyrimidine deoxyribonucleotide phosphorylation 5 CFLO014417-PA;CFLO010539-PA;CFLO015574-PA;CFLO005692-PA;CFLO012591-PA KEGG: 00630+2.1.2.1 Glyoxylate and dicarboxylate metabolism 2 CFLO010087-PA;CFLO014967-PA Reactome: R-HSA-68827 CDT1 association with the CDC6:ORC:origin complex 45 CFLO000953-PA;CFLO014805-PA;CFLO002602-PA;CFLO004726-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO010590-PA;CFLO000045-PA;CFLO007207-PA;CFLO018836-PA;CFLO015983-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO001095-PA;CFLO015469-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO014819-PA;CFLO010697-PA;CFLO010055-PA;CFLO011518-PA;CFLO003334-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO015230-PA;CFLO002077-PA;CFLO004457-PA;CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO001064-PA;CFLO004463-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO000939-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO002304-PA;CFLO007718-PA MetaCyc: PWY-7176 UTP and CTP de novo biosynthesis 6 CFLO012591-PA;CFLO005692-PA;CFLO015574-PA;CFLO010539-PA;CFLO005147-PA;CFLO000638-PA Reactome: R-HSA-5607761 Dectin-1 mediated noncanonical NF-kB signaling 40 CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO009081-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO001064-PA;CFLO006007-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO011518-PA;CFLO004457-PA;CFLO000953-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO014805-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO012235-PA;CFLO001095-PA;CFLO009082-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA Reactome: R-HSA-8963889 Assembly of active LPL and LIPC lipase complexes 3 CFLO009918-PA;CFLO008724-PA;CFLO005873-PA Reactome: R-HSA-3238698 WNT ligand biogenesis and trafficking 11 CFLO014442-PA;CFLO001566-PA;CFLO016803-PA;CFLO012503-PA;CFLO000912-PA;CFLO016801-PA;CFLO004491-PA;CFLO012505-PA;CFLO001565-PA;CFLO001007-PA;CFLO010340-PA Reactome: R-HSA-189483 Heme degradation 1 CFLO005695-PA MetaCyc: PWY-7250 [2Fe-2S] iron-sulfur cluster biosynthesis 1 CFLO006634-PA Reactome: R-HSA-69231 Cyclin D associated events in G1 13 CFLO006247-PA;CFLO018058-PA;CFLO004333-PA;CFLO018059-PA;CFLO006007-PA;CFLO010322-PA;CFLO009082-PA;CFLO002615-PA;CFLO018056-PA;CFLO004431-PA;CFLO011464-PA;CFLO009081-PA;CFLO004335-PA Reactome: R-HSA-5689877 Josephin domain DUBs 5 CFLO018666-PA;CFLO005708-PA;CFLO016610-PA;CFLO000911-PA;CFLO007989-PA Reactome: R-HSA-196783 Coenzyme A biosynthesis 4 CFLO012381-PA;CFLO017130-PA;CFLO006703-PA;CFLO019517-PA MetaCyc: PWY-4981 L-proline biosynthesis II (from arginine) 3 CFLO002109-PA;CFLO000590-PA;CFLO003287-PA Reactome: R-HSA-162710 Synthesis of glycosylphosphatidylinositol (GPI) 13 CFLO017624-PA;CFLO015692-PA;CFLO005885-PA;CFLO007874-PA;CFLO007207-PA;CFLO016637-PA;CFLO013001-PA;CFLO012115-PA;CFLO016180-PA;CFLO000715-PA;CFLO012406-PA;CFLO012641-PA;CFLO010334-PA KEGG: 00270+4.2.1.109 Cysteine and methionine metabolism 1 CFLO002725-PA Reactome: R-HSA-983695 Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers 1 CFLO002753-PA Reactome: R-HSA-2559584 Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) 2 CFLO015867-PA;CFLO007501-PA Reactome: R-HSA-202733 Cell surface interactions at the vascular wall 6 CFLO002286-PA;CFLO001501-PA;CFLO012318-PA;CFLO011745-PA;CFLO019853-PA;CFLO019476-PA Reactome: R-HSA-444257 RSK activation 3 CFLO004063-PA;CFLO008104-PA;CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-9028731 Activated NTRK2 signals through FRS2 and FRS3 1 CFLO001520-PA KEGG: 00230+3.1.3.5 Purine metabolism 2 CFLO011225-PA;CFLO011228-PA MetaCyc: PWY-7817 Type I lipoteichoic acid biosynthesis (S. aureus) 9 CFLO006116-PA;CFLO016462-PA;CFLO019403-PA;CFLO010224-PA;CFLO006115-PA;CFLO006541-PA;CFLO009992-PA;CFLO001719-PA;CFLO006114-PA Reactome: R-HSA-196108 Pregnenolone biosynthesis 4 CFLO002662-PA;CFLO006117-PA;CFLO010536-PA;CFLO001497-PA KEGG: 00220+6.3.1.2 Arginine biosynthesis 3 CFLO007634-PA;CFLO007632-PA;CFLO007633-PA Reactome: R-HSA-168638 NOD1/2 Signaling Pathway 1 CFLO005675-PA KEGG: 00052+2.7.1.6 Galactose metabolism 2 CFLO002812-PA;CFLO014859-PA MetaCyc: PWY-5870 Ubiquinol-8 biosynthesis (eukaryotic) 4 CFLO005148-PA;CFLO018371-PA;CFLO002566-PA;CFLO001545-PA Reactome: R-HSA-187577 SCF(Skp2)-mediated degradation of p27/p21 37 CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO009081-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO001064-PA;CFLO006007-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO000953-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO010590-PA;CFLO001098-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO009082-PA Reactome: R-HSA-416476 G alpha (q) signalling events 14 CFLO016834-PA;CFLO003448-PA;CFLO018673-PA;CFLO005740-PA;CFLO005525-PA;CFLO013725-PA;CFLO012042-PA;CFLO009620-PA;CFLO005526-PA;CFLO000434-PA;CFLO016845-PA;CFLO015987-PA;CFLO003223-PA;CFLO017229-PA KEGG: 00860+2.5.1.61 Porphyrin and chlorophyll metabolism 1 CFLO016469-PA MetaCyc: PWY-7902 Glucosylglycerol biosynthesis 3 CFLO006892-PA;CFLO006890-PA;CFLO006857-PA Reactome: R-HSA-9033241 Peroxisomal protein import 14 CFLO014414-PA;CFLO013479-PA;CFLO006695-PA;CFLO005374-PA;CFLO010925-PA;CFLO000240-PA;CFLO000846-PA;CFLO011230-PA;CFLO018754-PA;CFLO018074-PA;CFLO009319-PA;CFLO013638-PA;CFLO003960-PA;CFLO015854-PA MetaCyc: PWY-1361 Benzoyl-coa degradation I (aerobic) 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA Reactome: R-HSA-8866907 Activation of the TFAP2 (AP-2) family of transcription factors 3 CFLO011851-PA;CFLO016304-PA;CFLO015438-PA Reactome: R-HSA-6781823 Formation of TC-NER Pre-Incision Complex 26 CFLO011191-PA;CFLO006247-PA;CFLO010420-PA;CFLO002882-PA;CFLO004448-PA;CFLO006370-PA;CFLO009087-PA;CFLO004196-PA;CFLO012515-PA;CFLO010322-PA;CFLO016962-PA;CFLO009854-PA;CFLO010911-PA;CFLO009851-PA;CFLO015637-PA;CFLO007399-PA;CFLO014021-PA;CFLO004174-PA;CFLO015409-PA;CFLO007012-PA;CFLO009853-PA;CFLO006171-PA;CFLO006603-PA;CFLO011905-PA;CFLO004893-PA;CFLO012310-PA Reactome: R-HSA-167238 Pausing and recovery of Tat-mediated HIV elongation 18 CFLO005811-PA;CFLO010911-PA;CFLO015189-PA;CFLO014021-PA;CFLO015637-PA;CFLO013674-PA;CFLO000994-PA;CFLO004196-PA;CFLO008811-PA;CFLO007118-PA;CFLO002885-PA;CFLO019592-PA;CFLO005353-PA;CFLO007012-PA;CFLO008569-PA;CFLO018085-PA;CFLO006869-PA;CFLO007113-PA MetaCyc: PWY-8047 Bryostatin biosynthesis 3 CFLO002012-PA;CFLO002013-PA;CFLO016519-PA Reactome: R-HSA-389960 Formation of tubulin folding intermediates by CCT/TriC 12 CFLO018650-PA;CFLO009580-PA;CFLO014186-PA;CFLO011380-PA;CFLO015538-PA;CFLO009676-PA;CFLO004179-PA;CFLO014339-PA;CFLO002905-PA;CFLO004305-PA;CFLO000032-PA;CFLO008820-PA Reactome: R-HSA-168325 Viral Messenger RNA Synthesis 29 CFLO004818-PA;CFLO000572-PA;CFLO007118-PA;CFLO004196-PA;CFLO001720-PA;CFLO004183-PA;CFLO014832-PA;CFLO014833-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO012487-PA;CFLO014021-PA;CFLO015637-PA;CFLO005698-PA;CFLO008087-PA;CFLO008088-PA;CFLO010911-PA;CFLO013550-PA;CFLO002763-PA;CFLO007113-PA;CFLO007012-PA;CFLO005636-PA;CFLO004819-PA;CFLO004815-PA;CFLO019592-PA;CFLO008090-PA;CFLO010441-PA;CFLO014829-PA;CFLO012747-PA KEGG: 00982+2.5.1.18 Drug metabolism - cytochrome P450 2 CFLO008203-PA;CFLO008220-PA Reactome: R-HSA-1362300 Transcription of E2F targets under negative control by p107 (RBL1) and p130 (RBL2) in complex with HDAC1 4 CFLO007346-PA;CFLO002764-PA;CFLO001098-PA;CFLO013980-PA Reactome: R-HSA-432720 Lysosome Vesicle Biogenesis 5 CFLO004449-PA;CFLO000660-PA;CFLO014328-PA;CFLO004342-PA;CFLO009344-PA Reactome: R-HSA-5173214 O-glycosylation of TSR domain-containing proteins 16 CFLO009361-PA;CFLO004125-PA;CFLO003305-PA;CFLO015912-PA;CFLO009453-PA;CFLO000419-PA;CFLO008165-PA;CFLO003729-PA;CFLO014598-PA;CFLO000389-PA;CFLO000420-PA;CFLO012350-PA;CFLO008163-PA;CFLO003728-PA;CFLO012348-PA;CFLO006657-PA Reactome: R-HSA-3772470 Negative regulation of TCF-dependent signaling by WNT ligand antagonists 1 CFLO001546-PA Reactome: R-HSA-9008059 Interleukin-37 signaling 1 CFLO010039-PA Reactome: R-HSA-71737 Pyrophosphate hydrolysis 1 CFLO016830-PA MetaCyc: PWY-8088 Dipicolinate biosynthesis 2 CFLO001389-PA;CFLO012037-PA Reactome: R-HSA-389948 PD-1 signaling 1 CFLO010039-PA Reactome: R-HSA-83936 Transport of nucleosides and free purine and pyrimidine bases across the plasma membrane 6 CFLO011800-PA;CFLO006133-PA;CFLO002373-PA;CFLO016516-PA;CFLO006136-PA;CFLO006138-PA MetaCyc: PWY-7426 Complex N-linked glycan biosynthesis (vertebrates) 4 CFLO013983-PA;CFLO013982-PA;CFLO016452-PA;CFLO015339-PA Reactome: R-HSA-156711 Polo-like kinase mediated events 3 CFLO007346-PA;CFLO002764-PA;CFLO013980-PA Reactome: R-HSA-8964539 Glutamate and glutamine metabolism 10 CFLO012576-PA;CFLO000590-PA;CFLO014188-PA;CFLO007633-PA;CFLO007634-PA;CFLO003287-PA;CFLO002293-PA;CFLO014187-PA;CFLO002109-PA;CFLO007632-PA MetaCyc: PWY-5366 Palmitoleate biosynthesis II (plants and bacteria) 3 CFLO016519-PA;CFLO002013-PA;CFLO002012-PA KEGG: 00562+2.7.8.11 Inositol phosphate metabolism 1 CFLO000498-PA MetaCyc: PWY-7218 Photosynthetic 3-hydroxybutanoate biosynthesis (engineered) 3 CFLO003967-PA;CFLO009597-PA;CFLO016901-PA Reactome: R-HSA-77350 Beta oxidation of hexanoyl-CoA to butanoyl-CoA 1 CFLO011836-PA KEGG: 00051+5.3.1.1 Fructose and mannose metabolism 1 CFLO017154-PA MetaCyc: PWY-5076 L-leucine degradation III 2 CFLO016846-PA;CFLO006978-PA KEGG: 00750+2.6.1.52 Vitamin B6 metabolism 1 CFLO003969-PA Reactome: R-HSA-6802952 Signaling by BRAF and RAF fusions 6 CFLO017592-PA;CFLO011904-PA;CFLO004205-PA;CFLO005484-PA;CFLO004761-PA;CFLO013244-PA KEGG: 00760+6.3.1.5 Nicotinate and nicotinamide metabolism 1 CFLO006318-PA KEGG: 00280+4.2.1.17+1.1.1.35 Valine, leucine and isoleucine degradation 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA Reactome: R-HSA-171306 Packaging Of Telomere Ends 12 CFLO010821-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO007437-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO004197-PA;CFLO008042-PA;CFLO007408-PA;CFLO007368-PA;CFLO011812-PA;CFLO007391-PA KEGG: 00190+7.1.2.2 Oxidative phosphorylation 6 CFLO017035-PA;CFLO007384-PA;CFLO006081-PA;CFLO017030-PA;CFLO012495-PA;CFLO017029-PA Reactome: R-HSA-76066 RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 2 Promoter 17 CFLO019070-PA;CFLO019378-PA;CFLO000558-PA;CFLO003936-PA;CFLO001456-PA;CFLO010673-PA;CFLO000884-PA;CFLO002097-PA;CFLO013811-PA;CFLO010911-PA;CFLO001122-PA;CFLO014021-PA;CFLO017331-PA;CFLO002623-PA;CFLO003937-PA;CFLO004196-PA;CFLO004462-PA Reactome: R-HSA-6802955 Paradoxical activation of RAF signaling by kinase inactive BRAF 4 CFLO013244-PA;CFLO010617-PA;CFLO011904-PA;CFLO017592-PA KEGG: 00270+5.3.1.23 Cysteine and methionine metabolism 4 CFLO009367-PA;CFLO018203-PA;CFLO005639-PA;CFLO019081-PA Reactome: R-HSA-5609978 Defective GALT can cause Galactosemia 1 CFLO002708-PA Reactome: R-HSA-5696400 Dual Incision in GG-NER 28 CFLO012323-PA;CFLO012310-PA;CFLO002994-PA;CFLO011309-PA;CFLO008121-PA;CFLO008680-PA;CFLO012226-PA;CFLO012555-PA;CFLO006603-PA;CFLO018166-PA;CFLO007174-PA;CFLO003985-PA;CFLO013771-PA;CFLO007399-PA;CFLO006370-PA;CFLO000937-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO019810-PA;CFLO019062-PA;CFLO011911-PA;CFLO011191-PA;CFLO009733-PA;CFLO010332-PA;CFLO003335-PA;CFLO006346-PA;CFLO003314-PA;CFLO008828-PA Reactome: R-HSA-72764 Eukaryotic Translation Termination 76 CFLO016897-PA;CFLO004405-PA;CFLO000744-PA;CFLO005096-PA;CFLO006768-PA;CFLO011906-PA;CFLO004825-PA;CFLO013411-PA;CFLO018839-PA;CFLO013407-PA;CFLO008335-PA;CFLO006483-PA;CFLO004224-PA;CFLO014883-PA;CFLO019287-PA;CFLO003320-PA;CFLO015631-PA;CFLO012333-PA;CFLO002739-PA;CFLO002329-PA;CFLO012240-PA;CFLO014026-PA;CFLO002901-PA;CFLO016302-PA;CFLO010712-PA;CFLO011221-PA;CFLO003311-PA;CFLO010535-PA;CFLO013281-PA;CFLO004176-PA;CFLO013459-PA;CFLO000612-PA;CFLO006630-PA;CFLO013929-PA;CFLO010554-PA;CFLO013848-PA;CFLO008263-PA;CFLO000349-PA;CFLO010240-PA;CFLO001260-PA;CFLO017942-PA;CFLO005789-PA;CFLO012596-PA;CFLO005150-PA;CFLO005334-PA;CFLO000889-PA;CFLO003083-PA;CFLO014117-PA;CFLO000339-PA;CFLO004441-PA;CFLO017594-PA;CFLO018800-PA;CFLO008061-PA;CFLO008228-PA;CFLO019663-PA;CFLO004181-PA;CFLO005804-PA;CFLO000325-PA;CFLO005822-PA;CFLO009848-PA;CFLO000918-PA;CFLO012297-PA;CFLO012584-PA;CFLO010962-PA;CFLO000326-PA;CFLO004278-PA;CFLO004325-PA;CFLO014395-PA;CFLO008851-PA;CFLO001584-PA;CFLO002568-PA;CFLO005709-PA;CFLO011483-PA;CFLO017730-PA;CFLO017946-PA;CFLO000629-PA MetaCyc: PWY-5667 CDP-diacylglycerol biosynthesis I 12 CFLO007382-PA;CFLO006541-PA;CFLO011434-PA;CFLO006890-PA;CFLO006892-PA;CFLO015620-PA;CFLO002146-PA;CFLO014422-PA;CFLO004213-PA;CFLO006857-PA;CFLO019403-PA;CFLO011437-PA Reactome: R-HSA-349425 Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1 35 CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO007718-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO001064-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO004457-PA;CFLO000953-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO010590-PA;CFLO015469-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO001095-PA Reactome: R-HSA-2514859 Inactivation, recovery and regulation of the phototransduction cascade 4 CFLO002274-PA;CFLO000148-PA;CFLO016402-PA;CFLO003344-PA Reactome: R-HSA-174490 Membrane binding and targetting of GAG proteins 5 CFLO012133-PA;CFLO009636-PA;CFLO013092-PA;CFLO013467-PA;CFLO018740-PA KEGG: 00770+3.6.1.9 Pantothenate and CoA biosynthesis 1 CFLO002000-PA Reactome: R-HSA-8851805 MET activates RAS signaling 1 CFLO015351-PA Reactome: R-HSA-8941326 RUNX2 regulates bone development 2 CFLO007361-PA;CFLO007362-PA KEGG: 00480+2.5.1.18+1.8.5.1 Glutathione metabolism 2 CFLO008220-PA;CFLO008203-PA Reactome: R-HSA-9609736 Assembly and cell surface presentation of NMDA receptors 11 CFLO006561-PA;CFLO014186-PA;CFLO001242-PA;CFLO009841-PA;CFLO002951-PA;CFLO016852-PA;CFLO006070-PA;CFLO008841-PA;CFLO004179-PA;CFLO017592-PA;CFLO002905-PA KEGG: 00643+3.7.1.2 Styrene degradation 1 CFLO002938-PA KEGG: 00710+1.1.1.37 Carbon fixation in photosynthetic organisms 2 CFLO018047-PA;CFLO007214-PA Reactome: R-HSA-3359463 Defective CUBN causes hereditary megaloblastic anemia 1 1 CFLO006303-PA MetaCyc: PWY-5659 GDP-mannose biosynthesis 3 CFLO003382-PA;CFLO019811-PA;CFLO000596-PA Reactome: R-HSA-212436 Generic Transcription Pathway 22 CFLO016292-PA;CFLO007386-PA;CFLO013116-PA;CFLO010732-PA;CFLO006176-PA;CFLO006867-PA;CFLO016910-PA;CFLO016914-PA;CFLO009859-PA;CFLO004160-PA;CFLO005483-PA;CFLO007241-PA;CFLO003118-PA;CFLO001646-PA;CFLO008213-PA;CFLO005127-PA;CFLO001065-PA;CFLO017124-PA;CFLO008204-PA;CFLO013084-PA;CFLO001481-PA;CFLO004157-PA MetaCyc: PWY-7779 Methyl tert-butyl ether degradation 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA KEGG: 00500+2.4.1.11 Starch and sucrose metabolism 2 CFLO015783-PA;CFLO015784-PA Reactome: R-HSA-196807 Nicotinate metabolism 7 CFLO002281-PA;CFLO006318-PA;CFLO000145-PA;CFLO019576-PA;CFLO006197-PA;CFLO006142-PA;CFLO006198-PA MetaCyc: PWY-7184 Pyrimidine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis I 12 CFLO005098-PA;CFLO005088-PA;CFLO002000-PA;CFLO010539-PA;CFLO014417-PA;CFLO005692-PA;CFLO000685-PA;CFLO012552-PA;CFLO012591-PA;CFLO001680-PA;CFLO000684-PA;CFLO015574-PA Reactome: R-HSA-1989781 PPARA activates gene expression 37 CFLO001544-PA;CFLO015438-PA;CFLO006229-PA;CFLO005483-PA;CFLO009588-PA;CFLO015437-PA;CFLO006867-PA;CFLO006521-PA;CFLO000702-PA;CFLO016914-PA;CFLO007386-PA;CFLO004157-PA;CFLO008204-PA;CFLO017124-PA;CFLO006604-PA;CFLO016304-PA;CFLO005127-PA;CFLO006718-PA;CFLO008213-PA;CFLO008860-PA;CFLO003118-PA;CFLO009859-PA;CFLO004160-PA;CFLO016910-PA;CFLO016506-PA;CFLO012611-PA;CFLO010732-PA;CFLO013116-PA;CFLO001481-PA;CFLO014390-PA;CFLO000237-PA;CFLO013084-PA;CFLO001065-PA;CFLO000235-PA;CFLO001646-PA;CFLO010555-PA;CFLO001484-PA Reactome: R-HSA-77288 mitochondrial fatty acid beta-oxidation of unsaturated fatty acids 1 CFLO011836-PA MetaCyc: PWY-5530 Sorbitol biosynthesis II 1 CFLO001701-PA MetaCyc: PWY-5532 Nucleoside and nucleotide degradation (archaea) 2 CFLO003449-PA;CFLO016529-PA Reactome: R-HSA-8949664 Processing of SMDT1 8 CFLO003456-PA;CFLO002308-PA;CFLO005463-PA;CFLO000180-PA;CFLO016913-PA;CFLO018097-PA;CFLO018098-PA;CFLO005900-PA KEGG: 00740+2.7.1.26 Riboflavin metabolism 1 CFLO006180-PA KEGG: 00480+1.11.1.15 Glutathione metabolism 5 CFLO008570-PA;CFLO014496-PA;CFLO010540-PA;CFLO006891-PA;CFLO001653-PA Reactome: R-HSA-9609690 HCMV Early Events 48 CFLO014832-PA;CFLO008841-PA;CFLO004818-PA;CFLO004179-PA;CFLO016512-PA;CFLO013546-PA;CFLO007437-PA;CFLO002998-PA;CFLO012487-PA;CFLO016852-PA;CFLO004815-PA;CFLO007391-PA;CFLO004819-PA;CFLO008775-PA;CFLO012747-PA;CFLO010396-PA;CFLO001720-PA;CFLO004183-PA;CFLO005894-PA;CFLO011812-PA;CFLO004197-PA;CFLO000572-PA;CFLO008042-PA;CFLO005698-PA;CFLO002036-PA;CFLO006561-PA;CFLO008087-PA;CFLO009841-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO013550-PA;CFLO014833-PA;CFLO000120-PA;CFLO000598-PA;CFLO007408-PA;CFLO012305-PA;CFLO007368-PA;CFLO001484-PA;CFLO005636-PA;CFLO002905-PA;CFLO010441-PA;CFLO014186-PA;CFLO014829-PA;CFLO001242-PA;CFLO001629-PA;CFLO008090-PA;CFLO001638-PA;CFLO010821-PA Reactome: R-HSA-5635838 Activation of SMO 3 CFLO003136-PA;CFLO018031-PA;CFLO018032-PA Reactome: R-HSA-5576893 Phase 2 - plateau phase 6 CFLO014207-PA;CFLO019824-PA;CFLO014204-PA;CFLO001551-PA;CFLO002975-PA;CFLO015260-PA KEGG: 00640+6.2.1.1 Propanoate metabolism 2 CFLO016628-PA;CFLO016902-PA Reactome: R-HSA-8876198 RAB GEFs exchange GTP for GDP on RABs 38 CFLO010498-PA;CFLO001593-PA;CFLO000350-PA;CFLO007798-PA;CFLO018536-PA;CFLO007320-PA;CFLO001097-PA;CFLO004347-PA;CFLO002652-PA;CFLO001525-PA;CFLO018354-PA;CFLO005103-PA;CFLO010543-PA;CFLO018351-PA;CFLO002824-PA;CFLO019786-PA;CFLO003277-PA;CFLO004541-PA;CFLO013986-PA;CFLO012248-PA;CFLO009888-PA;CFLO009975-PA;CFLO005156-PA;CFLO002357-PA;CFLO001069-PA;CFLO012728-PA;CFLO008030-PA;CFLO002710-PA;CFLO004539-PA;CFLO003429-PA;CFLO008169-PA;CFLO009395-PA;CFLO005154-PA;CFLO015868-PA;CFLO004446-PA;CFLO004281-PA;CFLO009900-PA;CFLO009391-PA Reactome: R-HSA-3000170 Syndecan interactions 1 CFLO019476-PA Reactome: R-HSA-9635644 Inhibition of membrane repair 1 CFLO014328-PA Reactome: R-HSA-2730905 Role of LAT2/NTAL/LAB on calcium mobilization 1 CFLO008104-PA KEGG: 00900+2.3.3.10 Terpenoid backbone biosynthesis 1 CFLO006521-PA MetaCyc: PWY-6133 (S)-reticuline biosynthesis II 1 CFLO000009-PA Reactome: R-HSA-5637810 Constitutive Signaling by EGFRvIII 1 CFLO005384-PA Reactome: R-HSA-5607764 CLEC7A (Dectin-1) signaling 41 CFLO015469-PA;CFLO012235-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO009082-PA;CFLO001095-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO010590-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO004457-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO008104-PA;CFLO015980-PA;CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO006007-PA;CFLO001064-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO009081-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA KEGG: 00230+2.7.4.8 Purine metabolism 5 CFLO012155-PA;CFLO016867-PA;CFLO004064-PA;CFLO008196-PA;CFLO005942-PA MetaCyc: PWY-7003 Glycerol degradation to butanol 6 CFLO017154-PA;CFLO003967-PA;CFLO015634-PA;CFLO016901-PA;CFLO009751-PA;CFLO009597-PA Reactome: R-HSA-189451 Heme biosynthesis 12 CFLO001831-PA;CFLO001664-PA;CFLO008202-PA;CFLO016469-PA;CFLO001018-PA;CFLO004493-PA;CFLO013489-PA;CFLO019161-PA;CFLO016564-PA;CFLO009885-PA;CFLO016708-PA;CFLO016710-PA KEGG: 00561+3.1.1.3 Glycerolipid metabolism 2 CFLO004631-PA;CFLO004627-PA MetaCyc: PWY-7220 Adenosine deoxyribonucleotides de novo biosynthesis II 8 CFLO010539-PA;CFLO000685-PA;CFLO012552-PA;CFLO001680-PA;CFLO012591-PA;CFLO005692-PA;CFLO000684-PA;CFLO015574-PA KEGG: 04660+3.1.3.16 T cell receptor signaling pathway 27 CFLO008119-PA;CFLO015657-PA;CFLO007785-PA;CFLO010525-PA;CFLO008568-PA;CFLO014456-PA;CFLO003025-PA;CFLO000693-PA;CFLO016792-PA;CFLO012317-PA;CFLO008811-PA;CFLO013630-PA;CFLO016888-PA;CFLO007145-PA;CFLO000144-PA;CFLO016889-PA;CFLO002883-PA;CFLO000943-PA;CFLO019070-PA;CFLO013102-PA;CFLO002009-PA;CFLO019072-PA;CFLO002906-PA;CFLO002328-PA;CFLO006089-PA;CFLO009585-PA;CFLO013622-PA Reactome: R-HSA-69563 p53-Dependent G1 DNA Damage Response 1 CFLO001098-PA Reactome: R-HSA-3371497 HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) 17 CFLO012642-PA;CFLO010998-PA;CFLO002905-PA;CFLO011480-PA;CFLO001242-PA;CFLO001296-PA;CFLO008775-PA;CFLO014186-PA;CFLO010396-PA;CFLO007730-PA;CFLO008841-PA;CFLO004179-PA;CFLO009841-PA;CFLO006561-PA;CFLO000598-PA;CFLO009919-PA;CFLO016852-PA Reactome: R-HSA-8951936 RUNX3 regulates p14-ARF 2 CFLO007361-PA;CFLO007362-PA Reactome: R-HSA-72163 mRNA Splicing - Major Pathway 86 CFLO015654-PA;CFLO015653-PA;CFLO014491-PA;CFLO007118-PA;CFLO009854-PA;CFLO002904-PA;CFLO004174-PA;CFLO013673-PA;CFLO007473-PA;CFLO002441-PA;CFLO018802-PA;CFLO005095-PA;CFLO004851-PA;CFLO007347-PA;CFLO018003-PA;CFLO007113-PA;CFLO001068-PA;CFLO012325-PA;CFLO017848-PA;CFLO009853-PA;CFLO002580-PA;CFLO007295-PA;CFLO011253-PA;CFLO002882-PA;CFLO003235-PA;CFLO004290-PA;CFLO008231-PA;CFLO004196-PA;CFLO008706-PA;CFLO000562-PA;CFLO013126-PA;CFLO014705-PA;CFLO005552-PA;CFLO004904-PA;CFLO013732-PA;CFLO015637-PA;CFLO013926-PA;CFLO019592-PA;CFLO008773-PA;CFLO018801-PA;CFLO013907-PA;CFLO012982-PA;CFLO016182-PA;CFLO007963-PA;CFLO017533-PA;CFLO007349-PA;CFLO010661-PA;CFLO008709-PA;CFLO010911-PA;CFLO002098-PA;CFLO014021-PA;CFLO014696-PA;CFLO002948-PA;CFLO011459-PA;CFLO001758-PA;CFLO003284-PA;CFLO008515-PA;CFLO004994-PA;CFLO012023-PA;CFLO000570-PA;CFLO014700-PA;CFLO011593-PA;CFLO003072-PA;CFLO002679-PA;CFLO000171-PA;CFLO016962-PA;CFLO001799-PA;CFLO008219-PA;CFLO008171-PA;CFLO009851-PA;CFLO013795-PA;CFLO014071-PA;CFLO004177-PA;CFLO006242-PA;CFLO004326-PA;CFLO007012-PA;CFLO009568-PA;CFLO010268-PA;CFLO001970-PA;CFLO013992-PA;CFLO000316-PA;CFLO000181-PA;CFLO014704-PA;CFLO015385-PA;CFLO002750-PA;CFLO011905-PA Reactome: R-HSA-6793080 rRNA modification in the mitochondrion 1 CFLO007992-PA Reactome: R-HSA-6804760 Regulation of TP53 Activity through Methylation 4 CFLO011293-PA;CFLO018761-PA;CFLO018760-PA;CFLO000526-PA Reactome: R-HSA-1475029 Reversible hydration of carbon dioxide 1 CFLO016169-PA Reactome: R-HSA-74217 Purine salvage 9 CFLO012580-PA;CFLO013599-PA;CFLO002148-PA;CFLO012573-PA;CFLO004445-PA;CFLO016529-PA;CFLO009913-PA;CFLO013761-PA;CFLO000881-PA Reactome: R-HSA-2214320 Anchoring fibril formation 2 CFLO012358-PA;CFLO016400-PA KEGG: 00720+1.5.1.5+3.5.4.9 Carbon fixation pathways in prokaryotes 3 CFLO004433-PA;CFLO003993-PA;CFLO001271-PA Reactome: R-HSA-5578999 Defective GCLC causes Hemolytic anemia due to gamma-glutamylcysteine synthetase deficiency (HAGGSD) 1 CFLO011825-PA MetaCyc: PWY-7391 Isoprene biosynthesis II (engineered) 5 CFLO001964-PA;CFLO012239-PA;CFLO008710-PA;CFLO006604-PA;CFLO006521-PA Reactome: R-HSA-2514853 Condensation of Prometaphase Chromosomes 7 CFLO000899-PA;CFLO004020-PA;CFLO001787-PA;CFLO012254-PA;CFLO001339-PA;CFLO003187-PA;CFLO011690-PA Reactome: R-HSA-1296072 Voltage gated Potassium channels 14 CFLO004425-PA;CFLO014181-PA;CFLO016363-PA;CFLO004424-PA;CFLO005167-PA;CFLO016364-PA;CFLO010612-PA;CFLO014183-PA;CFLO007237-PA;CFLO015876-PA;CFLO015877-PA;CFLO005116-PA;CFLO008990-PA;CFLO017760-PA Reactome: R-HSA-437239 Recycling pathway of L1 12 CFLO001242-PA;CFLO009841-PA;CFLO006561-PA;CFLO014186-PA;CFLO002667-PA;CFLO016852-PA;CFLO006324-PA;CFLO008841-PA;CFLO004063-PA;CFLO005139-PA;CFLO002905-PA;CFLO004179-PA Reactome: R-HSA-5626467 RHO GTPases activate IQGAPs 12 CFLO005173-PA;CFLO008841-PA;CFLO004179-PA;CFLO002905-PA;CFLO014186-PA;CFLO011060-PA;CFLO015009-PA;CFLO006561-PA;CFLO009841-PA;CFLO001242-PA;CFLO013646-PA;CFLO016852-PA Reactome: R-HSA-1236394 Signaling by ERBB4 2 CFLO000001-PA;CFLO001112-PA Reactome: R-HSA-4608870 Asymmetric localization of PCP proteins 35 CFLO001064-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO007718-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO010590-PA;CFLO015469-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA;CFLO000953-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO004457-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA Reactome: R-HSA-1614603 Cysteine formation from homocysteine 2 CFLO011897-PA;CFLO009899-PA Reactome: R-HSA-446205 Synthesis of GDP-mannose 3 CFLO003382-PA;CFLO013101-PA;CFLO000596-PA KEGG: 00710+2.6.1.1 Carbon fixation in photosynthetic organisms 2 CFLO003306-PA;CFLO000623-PA Reactome: R-HSA-8939902 Regulation of RUNX2 expression and activity 42 CFLO014819-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO007362-PA;CFLO004457-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO011518-PA;CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO000953-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO000256-PA;CFLO009082-PA;CFLO003059-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO015469-PA;CFLO010590-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO000939-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO007361-PA;CFLO002615-PA;CFLO007718-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO002304-PA;CFLO009081-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO015984-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO006007-PA;CFLO001064-PA Reactome: R-HSA-2173788 Downregulation of TGF-beta receptor signaling 7 CFLO014456-PA;CFLO001592-PA;CFLO016472-PA;CFLO000256-PA;CFLO006089-PA;CFLO002284-PA;CFLO011249-PA Reactome: R-HSA-1221632 Meiotic synapsis 14 CFLO004197-PA;CFLO008042-PA;CFLO007408-PA;CFLO011812-PA;CFLO007368-PA;CFLO004394-PA;CFLO007391-PA;CFLO010821-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO007437-PA;CFLO001352-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA Reactome: R-HSA-163765 ChREBP activates metabolic gene expression 6 CFLO016519-PA;CFLO002013-PA;CFLO002012-PA;CFLO019654-PA;CFLO004169-PA;CFLO005702-PA KEGG: 00650+4.2.1.17 Butanoate metabolism 1 CFLO011836-PA MetaCyc: PWY-6583 Pyruvate fermentation to butanol I 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA KEGG: 00380+1.8.1.4 Tryptophan metabolism 1 CFLO000151-PA Reactome: R-HSA-2173789 TGF-beta receptor signaling activates SMADs 1 CFLO002284-PA KEGG: 00511+3.2.1.45 Other glycan degradation 1 CFLO003423-PA Reactome: R-HSA-381676 Glucagon-like Peptide-1 (GLP1) regulates insulin secretion 1 CFLO002753-PA KEGG: 00230+3.5.2.17 Purine metabolism 1 CFLO003353-PA MetaCyc: PWY-7800 Ac/N-end rule pathway 3 CFLO004440-PA;CFLO000148-PA;CFLO016402-PA Reactome: R-HSA-77289 Mitochondrial Fatty Acid Beta-Oxidation 1 CFLO014059-PA Reactome: R-HSA-9617629 Regulation of FOXO transcriptional activity by acetylation 2 CFLO015438-PA;CFLO016304-PA MetaCyc: PWY-7394 Urate conversion to allantoin II 2 CFLO003353-PA;CFLO010622-PA MetaCyc: PWY-4061 Glutathione-mediated detoxification I 5 CFLO000936-PA;CFLO008203-PA;CFLO007834-PA;CFLO008220-PA;CFLO000938-PA Reactome: R-HSA-1237044 Erythrocytes take up carbon dioxide and release oxygen 3 CFLO003654-PA;CFLO009579-PA;CFLO004584-PA MetaCyc: PWY-8049 Pederin biosynthesis 3 CFLO002013-PA;CFLO016519-PA;CFLO002012-PA MetaCyc: PWY-7328 Superpathway of UDP-glucose-derived O-antigen building blocks biosynthesis 2 CFLO006591-PA;CFLO001267-PA KEGG: 00561+3.1.3.4 Glycerolipid metabolism 1 CFLO000216-PA MetaCyc: PWY-5651 L-tryptophan degradation to 2-amino-3-carboxymuconate semialdehyde 1 CFLO006361-PA Reactome: R-HSA-3000178 ECM proteoglycans 3 CFLO007163-PA;CFLO009857-PA;CFLO012358-PA MetaCyc: PWY-3661 Glycine betaine degradation I 2 CFLO014967-PA;CFLO010087-PA Reactome: R-HSA-73856 RNA Polymerase II Transcription Termination 28 CFLO013673-PA;CFLO013732-PA;CFLO017483-PA;CFLO013126-PA;CFLO008709-PA;CFLO007349-PA;CFLO000562-PA;CFLO008219-PA;CFLO016375-PA;CFLO008706-PA;CFLO014491-PA;CFLO003235-PA;CFLO002733-PA;CFLO007295-PA;CFLO013992-PA;CFLO015268-PA;CFLO013670-PA;CFLO007347-PA;CFLO004326-PA;CFLO011459-PA;CFLO013907-PA;CFLO001068-PA;CFLO010491-PA;CFLO013795-PA;CFLO007400-PA;CFLO013926-PA;CFLO012401-PA;CFLO000613-PA Reactome: R-HSA-5668599 RHO GTPases Activate NADPH Oxidases 2 CFLO008697-PA;CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-72203 Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA 11 CFLO003269-PA;CFLO019592-PA;CFLO004196-PA;CFLO007012-PA;CFLO007118-PA;CFLO017979-PA;CFLO007113-PA;CFLO010911-PA;CFLO015637-PA;CFLO014021-PA;CFLO013992-PA KEGG: 00051+3.1.3.11 Fructose and mannose metabolism 1 CFLO009994-PA Reactome: R-HSA-68911 G2 Phase 1 CFLO001098-PA KEGG: 00600+3.5.1.23 Sphingolipid metabolism 2 CFLO017233-PA;CFLO017230-PA KEGG: 00310+1.2.4.2 Lysine degradation 3 CFLO011452-PA;CFLO011450-PA;CFLO001581-PA KEGG: 00531+3.2.1.50 Glycosaminoglycan degradation 1 CFLO001981-PA MetaCyc: PWY-3961 Phosphopantothenate biosynthesis II 2 CFLO019517-PA;CFLO006703-PA MetaCyc: PWY-6724 Starch degradation II 1 CFLO018464-PA Reactome: R-HSA-3371568 Attenuation phase 2 CFLO015438-PA;CFLO016304-PA MetaCyc: PWY-1801 Formaldehyde oxidation II (glutathione-dependent) 2 CFLO016846-PA;CFLO000622-PA KEGG: 00051+5.3.1.6 Fructose and mannose metabolism 1 CFLO001993-PA MetaCyc: PWY-6483 Ceramide degradation (generic) 2 CFLO017230-PA;CFLO017233-PA Reactome: R-HSA-5205685 Pink/Parkin Mediated Mitophagy 7 CFLO006639-PA;CFLO009315-PA;CFLO012750-PA;CFLO018652-PA;CFLO007821-PA;CFLO018531-PA;CFLO007989-PA Reactome: R-HSA-111469 SMAC, XIAP-regulated apoptotic response 1 CFLO012256-PA Reactome: R-HSA-901042 Calnexin/calreticulin cycle 2 CFLO012683-PA;CFLO004964-PA MetaCyc: PWY-6992 1,5-anhydrofructose degradation 2 CFLO000596-PA;CFLO019811-PA MetaCyc: PWY-7383 Anaerobic energy metabolism (invertebrates, cytosol) 7 CFLO007214-PA;CFLO003967-PA;CFLO000017-PA;CFLO003043-PA;CFLO003306-PA;CFLO000623-PA;CFLO018047-PA KEGG: 00270+4.1.1.50 Cysteine and methionine metabolism 2 CFLO006590-PA;CFLO006589-PA Reactome: R-HSA-4615885 SUMOylation of DNA replication proteins 25 CFLO008680-PA;CFLO008090-PA;CFLO012747-PA;CFLO014829-PA;CFLO010441-PA;CFLO004819-PA;CFLO002362-PA;CFLO005636-PA;CFLO002880-PA;CFLO004815-PA;CFLO012487-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO014833-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO013550-PA;CFLO008087-PA;CFLO003172-PA;CFLO005698-PA;CFLO000572-PA;CFLO004818-PA;CFLO014832-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA Reactome: R-HSA-380259 Loss of Nlp from mitotic centrosomes 10 CFLO002610-PA;CFLO000317-PA;CFLO004227-PA;CFLO007730-PA;CFLO018088-PA;CFLO005157-PA;CFLO000300-PA;CFLO010998-PA;CFLO009450-PA;CFLO011480-PA Reactome: R-HSA-69052 Switching of origins to a post-replicative state 8 CFLO018658-PA;CFLO001338-PA;CFLO008924-PA;CFLO005301-PA;CFLO008927-PA;CFLO012315-PA;CFLO001616-PA;CFLO010604-PA Reactome: R-HSA-8868766 rRNA processing in the mitochondrion 3 CFLO007327-PA;CFLO012013-PA;CFLO005532-PA KEGG: 00970+6.1.1.19 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 2 CFLO018002-PA;CFLO008857-PA MetaCyc: PWY-7224 Purine deoxyribonucleosides salvage 4 CFLO012591-PA;CFLO005692-PA;CFLO015574-PA;CFLO010539-PA MetaCyc: PWY-7571 Ferrichrome A biosynthesis 1 CFLO006521-PA Reactome: R-HSA-388841 Costimulation by the CD28 family 2 CFLO010039-PA;CFLO005740-PA Reactome: R-HSA-1170546 Prolactin receptor signaling 5 CFLO002615-PA;CFLO009081-PA;CFLO002010-PA;CFLO009082-PA;CFLO006007-PA Reactome: R-HSA-201681 TCF dependent signaling in response to WNT 6 CFLO010720-PA;CFLO013450-PA;CFLO010726-PA;CFLO010725-PA;CFLO010721-PA;CFLO001546-PA KEGG: 00072+2.3.3.10 Synthesis and degradation of ketone bodies 1 CFLO006521-PA Reactome: R-HSA-429958 mRNA decay by 3' to 5' exoribonuclease 12 CFLO006212-PA;CFLO001443-PA;CFLO013256-PA;CFLO019015-PA;CFLO006758-PA;CFLO011214-PA;CFLO006571-PA;CFLO015655-PA;CFLO009644-PA;CFLO010929-PA;CFLO018054-PA;CFLO015909-PA MetaCyc: PWY-7791 UMP biosynthesis III 3 CFLO011964-PA;CFLO005916-PA;CFLO011966-PA Reactome: R-HSA-2408508 Metabolism of ingested SeMet, Sec, MeSec into H2Se 2 CFLO011897-PA;CFLO012483-PA Reactome: R-HSA-5662702 Melanin biosynthesis 5 CFLO013592-PA;CFLO015797-PA;CFLO003182-PA;CFLO011199-PA;CFLO008164-PA MetaCyc: PWY-6987 Lipoate biosynthesis and incorporation III (Bacillus) 4 CFLO003398-PA;CFLO006879-PA;CFLO004843-PA;CFLO001063-PA KEGG: 00564+1.1.5.3 Glycerophospholipid metabolism 1 CFLO008294-PA MetaCyc: PWY-6608 Guanosine nucleotides degradation III 4 CFLO011185-PA;CFLO011228-PA;CFLO011225-PA;CFLO016529-PA KEGG: 00071+4.2.1.17+1.1.1.35 Fatty acid degradation 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-456926 Thrombin signalling through proteinase activated receptors (PARs) 3 CFLO013244-PA;CFLO003448-PA;CFLO014070-PA MetaCyc: PWY-5855 Ubiquinol-7 biosynthesis (prokaryotic) 4 CFLO001545-PA;CFLO002566-PA;CFLO018371-PA;CFLO005148-PA Reactome: R-HSA-6814122 Cooperation of PDCL (PhLP1) and TRiC/CCT in G-protein beta folding 15 CFLO015538-PA;CFLO011380-PA;CFLO009580-PA;CFLO018650-PA;CFLO017314-PA;CFLO015943-PA;CFLO000032-PA;CFLO008820-PA;CFLO001625-PA;CFLO004305-PA;CFLO012008-PA;CFLO003187-PA;CFLO009676-PA;CFLO009322-PA;CFLO014339-PA Reactome: R-HSA-6802948 Signaling by high-kinase activity BRAF mutants 2 CFLO011904-PA;CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-9013973 TICAM1-dependent activation of IRF3/IRF7 1 CFLO014989-PA MetaCyc: PWY-5384 Sucrose degradation IV (sucrose phosphorylase) 1 CFLO019811-PA Reactome: R-HSA-182971 EGFR downregulation 2 CFLO014328-PA;CFLO005173-PA KEGG: 00230+3.5.4.4 Purine metabolism 2 CFLO012580-PA;CFLO012573-PA Reactome: R-HSA-9603505 NTRK3 as a dependence receptor 1 CFLO002885-PA KEGG: 00860+1.14.14.18 Porphyrin and chlorophyll metabolism 1 CFLO005695-PA Reactome: R-HSA-5649702 APEX1-Independent Resolution of AP Sites via the Single Nucleotide Replacement Pathway 2 CFLO003212-PA;CFLO004817-PA Reactome: R-HSA-383280 Nuclear Receptor transcription pathway 29 CFLO006930-PA;CFLO000635-PA;CFLO012705-PA;CFLO003097-PA;CFLO000692-PA;CFLO013701-PA;CFLO016640-PA;CFLO019213-PA;CFLO001236-PA;CFLO009451-PA;CFLO007130-PA;CFLO011257-PA;CFLO011296-PA;CFLO009449-PA;CFLO007131-PA;CFLO005219-PA;CFLO004212-PA;CFLO011295-PA;CFLO017609-PA;CFLO017608-PA;CFLO007871-PA;CFLO018180-PA;CFLO004252-PA;CFLO012701-PA;CFLO013702-PA;CFLO013084-PA;CFLO010314-PA;CFLO004652-PA;CFLO000264-PA KEGG: 00280+4.2.1.17 Valine, leucine and isoleucine degradation 1 CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-909733 Interferon alpha/beta signaling 2 CFLO010039-PA;CFLO003346-PA Reactome: R-HSA-1483101 Synthesis of PS 1 CFLO001690-PA MetaCyc: PWY-3162 L-tryptophan degradation V (side chain pathway) 1 CFLO016846-PA MetaCyc: PWY-6121 5-aminoimidazole ribonucleotide biosynthesis I 4 CFLO019130-PA;CFLO009307-PA;CFLO004461-PA;CFLO019131-PA Reactome: R-HSA-1660662 Glycosphingolipid metabolism 19 CFLO006369-PA;CFLO013231-PA;CFLO007240-PA;CFLO013504-PA;CFLO014190-PA;CFLO005172-PA;CFLO004135-PA;CFLO001009-PA;CFLO007387-PA;CFLO006772-PA;CFLO005046-PA;CFLO005047-PA;CFLO003152-PA;CFLO017230-PA;CFLO019181-PA;CFLO013232-PA;CFLO017233-PA;CFLO013230-PA;CFLO003423-PA KEGG: 00061+1.1.1.100+2.3.1.85+4.2.1.59+2.3.1.39+2.3.1.41+3.1.2.14 Fatty acid biosynthesis 3 CFLO002012-PA;CFLO002013-PA;CFLO016519-PA Reactome: R-HSA-204626 Hypusine synthesis from eIF5A-lysine 2 CFLO011979-PA;CFLO003100-PA Reactome: R-HSA-445355 Smooth Muscle Contraction 8 CFLO007287-PA;CFLO012007-PA;CFLO005105-PA;CFLO007288-PA;CFLO007286-PA;CFLO005107-PA;CFLO003956-PA;CFLO009325-PA Reactome: R-HSA-8878166 Transcriptional regulation by RUNX2 2 CFLO007361-PA;CFLO007362-PA KEGG: 00910+4.2.1.1 Nitrogen metabolism 2 CFLO003089-PA;CFLO016169-PA KEGG: 00281+4.2.1.17+1.1.1.35 Geraniol degradation 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA KEGG: 00270+2.5.1.16 Cysteine and methionine metabolism 3 CFLO017572-PA;CFLO013290-PA;CFLO013289-PA Reactome: R-HSA-982772 Growth hormone receptor signaling 3 CFLO002010-PA;CFLO009368-PA;CFLO013244-PA MetaCyc: PWY-5973 Cis-vaccenate biosynthesis 3 CFLO002012-PA;CFLO002013-PA;CFLO016519-PA Reactome: R-HSA-2299718 Condensation of Prophase Chromosomes 16 CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO000899-PA;CFLO011812-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO007437-PA;CFLO001339-PA;CFLO007391-PA;CFLO018761-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO010821-PA;CFLO018760-PA KEGG: 00250+6.3.5.5 Alanine, aspartate and glutamate metabolism 1 CFLO011964-PA Reactome: R-HSA-2142700 Synthesis of Lipoxins (LX) 1 CFLO000694-PA Reactome: R-HSA-70350 Fructose catabolism 3 CFLO010852-PA;CFLO002737-PA;CFLO007293-PA Reactome: R-HSA-70635 Urea cycle 1 CFLO004683-PA KEGG: 00051+2.7.1.11 Fructose and mannose metabolism 1 CFLO000222-PA Reactome: R-HSA-8866904 Negative regulation of activity of TFAP2 (AP-2) family transcription factors 1 CFLO011851-PA Reactome: R-HSA-110330 Recognition and association of DNA glycosylase with site containing an affected purine 15 CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO007391-PA;CFLO013757-PA;CFLO017341-PA;CFLO007368-PA;CFLO011812-PA;CFLO007408-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO010821-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO003212-PA;CFLO007437-PA MetaCyc: PWY-7664 Oleate biosynthesis IV (anaerobic) 3 CFLO002012-PA;CFLO002013-PA;CFLO016519-PA Reactome: R-HSA-73980 RNA Polymerase III Transcription Termination 13 CFLO012668-PA;CFLO017331-PA;CFLO012670-PA;CFLO002623-PA;CFLO003937-PA;CFLO010673-PA;CFLO004196-PA;CFLO010911-PA;CFLO019378-PA;CFLO019070-PA;CFLO000558-PA;CFLO014021-PA;CFLO001122-PA MetaCyc: PWY-7839 Lacto-series glycosphingolipids biosynthesis 1 CFLO006369-PA Reactome: R-HSA-176408 Regulation of APC/C activators between G1/S and early anaphase 9 CFLO007123-PA;CFLO007015-PA;CFLO012167-PA;CFLO005584-PA;CFLO006211-PA;CFLO006992-PA;CFLO009576-PA;CFLO001098-PA;CFLO010492-PA KEGG: 00230+4.1.1.21 Purine metabolism 1 CFLO004460-PA Reactome: R-HSA-110328 Recognition and association of DNA glycosylase with site containing an affected pyrimidine 16 CFLO000698-PA;CFLO007391-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO010821-PA;CFLO013426-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO011812-PA;CFLO009850-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO003212-PA;CFLO007437-PA KEGG: 00230+1.1.1.205 Purine metabolism 1 CFLO004073-PA MetaCyc: PWY-5675 Nitrate reduction V (assimilatory) 3 CFLO007634-PA;CFLO007633-PA;CFLO007632-PA MetaCyc: PWY-7082 Ammonia oxidation IV (autotrophic ammonia oxidizers) 1 CFLO007517-PA Reactome: R-HSA-72086 mRNA Capping 25 CFLO010911-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO002046-PA;CFLO015637-PA;CFLO018730-PA;CFLO006247-PA;CFLO011191-PA;CFLO010322-PA;CFLO004196-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO004855-PA;CFLO006370-PA;CFLO007118-PA;CFLO013865-PA;CFLO013992-PA;CFLO012310-PA;CFLO013864-PA;CFLO019592-PA;CFLO005353-PA;CFLO007012-PA;CFLO018085-PA;CFLO012985-PA;CFLO007113-PA KEGG: 00520+2.7.1.6 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 2 CFLO014859-PA;CFLO002812-PA MetaCyc: PWY-7286 7-(3-amino-3-carboxypropyl)-wyosine biosynthesis 5 CFLO005795-PA;CFLO008044-PA;CFLO016301-PA;CFLO013137-PA;CFLO001963-PA Reactome: R-HSA-9620244 Long-term potentiation 1 CFLO017592-PA Reactome: R-HSA-202424 Downstream TCR signaling 41 CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO012235-PA;CFLO001095-PA;CFLO009082-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO010590-PA;CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO004457-PA;CFLO000631-PA;CFLO008104-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO009081-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO006007-PA;CFLO001064-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA Reactome: R-HSA-1971475 A tetrasaccharide linker sequence is required for GAG synthesis 8 CFLO005601-PA;CFLO012312-PA;CFLO015250-PA;CFLO004669-PA;CFLO013499-PA;CFLO001363-PA;CFLO019476-PA;CFLO012314-PA KEGG: 00380+4.2.1.17+1.1.1.35 Tryptophan metabolism 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA KEGG: 00860+6.1.1.17 Porphyrin and chlorophyll metabolism 2 CFLO019070-PA;CFLO001718-PA Reactome: R-HSA-174403 Glutathione synthesis and recycling 5 CFLO011825-PA;CFLO002150-PA;CFLO013383-PA;CFLO014549-PA;CFLO014547-PA MetaCyc: PWY-5695 Inosine 5'-phosphate degradation 4 CFLO011225-PA;CFLO016529-PA;CFLO004073-PA;CFLO011228-PA KEGG: 00030+3.1.1.31 Pentose phosphate pathway 1 CFLO007127-PA Reactome: R-HSA-8964011 HDL clearance 1 CFLO006303-PA KEGG: 00330+1.5.1.2 Arginine and proline metabolism 2 CFLO000590-PA;CFLO002109-PA MetaCyc: PWY-5691 Urate conversion to allantoin I 2 CFLO010622-PA;CFLO003353-PA KEGG: 00270+1.13.11.54 Cysteine and methionine metabolism 1 CFLO001681-PA Reactome: R-HSA-8964572 Lipid particle organization 1 CFLO012026-PA KEGG: 00983+1.17.4.1 Drug metabolism - other enzymes 4 CFLO012552-PA;CFLO001680-PA;CFLO000685-PA;CFLO000684-PA Reactome: R-HSA-6804114 TP53 Regulates Transcription of Genes Involved in G2 Cell Cycle Arrest 1 CFLO008680-PA KEGG: 00900+2.5.1.58 Terpenoid backbone biosynthesis 1 CFLO003344-PA KEGG: 00620+6.2.1.1 Pyruvate metabolism 2 CFLO016628-PA;CFLO016902-PA KEGG: 00400+2.6.1.5 Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis 1 CFLO012357-PA KEGG: 00650+2.3.3.10 Butanoate metabolism 1 CFLO006521-PA Reactome: R-HSA-379726 Mitochondrial tRNA aminoacylation 7 CFLO013263-PA;CFLO018893-PA;CFLO002330-PA;CFLO001281-PA;CFLO004692-PA;CFLO017484-PA;CFLO001718-PA Reactome: R-HSA-1257604 PIP3 activates AKT signaling 7 CFLO008104-PA;CFLO014425-PA;CFLO009698-PA;CFLO018008-PA;CFLO014421-PA;CFLO000209-PA;CFLO005740-PA MetaCyc: PWY-5874 Heme degradation I 1 CFLO005695-PA MetaCyc: PWY-7077 N-acetyl-D-galactosamine degradation 1 CFLO018399-PA MetaCyc: PWY-4041 Gamma-glutamyl cycle 3 CFLO007834-PA;CFLO000938-PA;CFLO000936-PA KEGG: 00720+4.2.1.17+1.1.1.35 Carbon fixation pathways in prokaryotes 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA KEGG: 00640+1.1.1.27 Propanoate metabolism 1 CFLO007170-PA Reactome: R-HSA-1169408 ISG15 antiviral mechanism 24 CFLO012747-PA;CFLO014829-PA;CFLO010441-PA;CFLO003977-PA;CFLO008090-PA;CFLO004815-PA;CFLO004819-PA;CFLO005636-PA;CFLO008088-PA;CFLO013550-PA;CFLO002763-PA;CFLO008087-PA;CFLO005698-PA;CFLO012487-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO014833-PA;CFLO014832-PA;CFLO006635-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO000572-PA;CFLO000853-PA;CFLO004818-PA Reactome: R-HSA-159227 Transport of the SLBP independent Mature mRNA 22 CFLO010441-PA;CFLO014829-PA;CFLO012747-PA;CFLO008090-PA;CFLO013992-PA;CFLO004815-PA;CFLO005636-PA;CFLO004819-PA;CFLO005698-PA;CFLO008087-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO013550-PA;CFLO014833-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO012487-PA;CFLO001720-PA;CFLO004183-PA;CFLO014832-PA;CFLO004818-PA;CFLO000572-PA MetaCyc: PWY-5461 Betanidin degradation 1 CFLO008216-PA KEGG: 00670+2.1.2.9 One carbon pool by folate 4 CFLO000135-PA;CFLO019130-PA;CFLO000137-PA;CFLO008961-PA MetaCyc: PWY-5538 Pyruvate fermentation to acetate VI 4 CFLO004169-PA;CFLO008726-PA;CFLO001710-PA;CFLO005915-PA Reactome: R-HSA-5628897 TP53 Regulates Metabolic Genes 36 CFLO012127-PA;CFLO012546-PA;CFLO018008-PA;CFLO015017-PA;CFLO019662-PA;CFLO016893-PA;CFLO005758-PA;CFLO012576-PA;CFLO012779-PA;CFLO002121-PA;CFLO003088-PA;CFLO005629-PA;CFLO003386-PA;CFLO005178-PA;CFLO019811-PA;CFLO001535-PA;CFLO000241-PA;CFLO014496-PA;CFLO005664-PA;CFLO018046-PA;CFLO015160-PA;CFLO012308-PA;CFLO011980-PA;CFLO000223-PA;CFLO011446-PA;CFLO007743-PA;CFLO017652-PA;CFLO012800-PA;CFLO012806-PA;CFLO009016-PA;CFLO012622-PA;CFLO005777-PA;CFLO004951-PA;CFLO006719-PA;CFLO015380-PA;CFLO001543-PA MetaCyc: PWY-7382 Lipoate biosynthesis and incorporation IV (yeast) 4 CFLO004843-PA;CFLO001063-PA;CFLO006879-PA;CFLO003398-PA Reactome: R-HSA-427389 ERCC6 (CSB) and EHMT2 (G9a) positively regulate rRNA expression 14 CFLO010821-PA;CFLO001629-PA;CFLO009089-PA;CFLO001638-PA;CFLO007437-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO004197-PA;CFLO008042-PA;CFLO007408-PA;CFLO011812-PA;CFLO007368-PA;CFLO016183-PA;CFLO007391-PA Reactome: R-HSA-73762 RNA Polymerase I Transcription Initiation 19 CFLO002136-PA;CFLO007128-PA;CFLO011191-PA;CFLO006247-PA;CFLO006370-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO004196-PA;CFLO010322-PA;CFLO010911-PA;CFLO007399-PA;CFLO014021-PA;CFLO004594-PA;CFLO016183-PA;CFLO003630-PA;CFLO019070-PA;CFLO008703-PA;CFLO009089-PA;CFLO012310-PA MetaCyc: PWY-5723 Rubisco shunt 7 CFLO000118-PA;CFLO009597-PA;CFLO016901-PA;CFLO013167-PA;CFLO003967-PA;CFLO001993-PA;CFLO006969-PA Reactome: R-HSA-68877 Mitotic Prometaphase 34 CFLO003075-PA;CFLO013646-PA;CFLO012217-PA;CFLO001242-PA;CFLO014829-PA;CFLO014186-PA;CFLO002905-PA;CFLO000525-PA;CFLO002880-PA;CFLO001646-PA;CFLO000598-PA;CFLO014833-PA;CFLO014329-PA;CFLO006290-PA;CFLO009841-PA;CFLO006561-PA;CFLO003172-PA;CFLO001327-PA;CFLO013088-PA;CFLO012124-PA;CFLO002636-PA;CFLO010396-PA;CFLO012319-PA;CFLO017731-PA;CFLO008775-PA;CFLO001592-PA;CFLO012487-PA;CFLO016852-PA;CFLO002998-PA;CFLO015008-PA;CFLO004179-PA;CFLO008841-PA;CFLO015916-PA;CFLO014832-PA KEGG: 00350+3.7.1.2 Tyrosine metabolism 1 CFLO002938-PA Reactome: R-HSA-4570571 Defective RFT1 causes RFT1-CDG (CDG-1n) 1 CFLO011797-PA KEGG: 00280+2.3.3.10 Valine, leucine and isoleucine degradation 1 CFLO006521-PA KEGG: 00051+4.2.1.68 Fructose and mannose metabolism 1 CFLO007683-PA MetaCyc: PWY-6383 Mono-trans, poly-cis decaprenyl phosphate biosynthesis 1 CFLO008710-PA MetaCyc: PWY-7013 (S)-propane-1,2-diol degradation 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-2032785 YAP1- and WWTR1 (TAZ)-stimulated gene expression 1 CFLO006971-PA MetaCyc: PWY-5049 Rosmarinic acid biosynthesis II 1 CFLO000009-PA MetaCyc: PWY-7437 Protein O-[N-acetyl]-glucosylation 2 CFLO012595-PA;CFLO008093-PA Reactome: R-HSA-204005 COPII-mediated vesicle transport 21 CFLO015619-PA;CFLO002332-PA;CFLO009908-PA;CFLO019401-PA;CFLO012764-PA;CFLO005434-PA;CFLO018213-PA;CFLO017507-PA;CFLO003429-PA;CFLO001053-PA;CFLO019169-PA;CFLO012728-PA;CFLO002652-PA;CFLO007010-PA;CFLO000860-PA;CFLO009900-PA;CFLO012765-PA;CFLO015868-PA;CFLO005154-PA;CFLO000367-PA;CFLO018354-PA KEGG: 00480+6.3.2.3 Glutathione metabolism 1 CFLO002150-PA KEGG: 04151+2.7.11.1 PI3K-Akt signaling pathway 39 CFLO012988-PA;CFLO004063-PA;CFLO008104-PA;CFLO016607-PA;CFLO013482-PA;CFLO000259-PA;CFLO018008-PA;CFLO019202-PA;CFLO012394-PA;CFLO015084-PA;CFLO004217-PA;CFLO019399-PA;CFLO008870-PA;CFLO012097-PA;CFLO005479-PA;CFLO000334-PA;CFLO012344-PA;CFLO019454-PA;CFLO014993-PA;CFLO018633-PA;CFLO008981-PA;CFLO012169-PA;CFLO017854-PA;CFLO010702-PA;CFLO012986-PA;CFLO013251-PA;CFLO006720-PA;CFLO005902-PA;CFLO019568-PA;CFLO002667-PA;CFLO009016-PA;CFLO004394-PA;CFLO008862-PA;CFLO011904-PA;CFLO013134-PA;CFLO018537-PA;CFLO000579-PA;CFLO010318-PA;CFLO007329-PA KEGG: 00500+3.2.1.4 Starch and sucrose metabolism 1 CFLO000491-PA Reactome: R-HSA-5357956 TNFR1-induced NFkappaB signaling pathway 2 CFLO000640-PA;CFLO013134-PA Reactome: R-HSA-76071 RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 3 Promoter 15 CFLO010673-PA;CFLO003937-PA;CFLO004196-PA;CFLO001380-PA;CFLO002623-PA;CFLO017331-PA;CFLO014021-PA;CFLO001122-PA;CFLO003936-PA;CFLO000558-PA;CFLO002604-PA;CFLO008375-PA;CFLO010911-PA;CFLO019378-PA;CFLO019070-PA KEGG: 00980+1.1.1.1 Metabolism of xenobiotics by cytochrome P450 1 CFLO016846-PA MetaCyc: PWY-5912 2'-deoxymugineic acid phytosiderophore biosynthesis 1 CFLO017970-PA KEGG: 00720+6.3.4.3 Carbon fixation pathways in prokaryotes 1 CFLO003993-PA KEGG: 00051+1.1.1.271 Fructose and mannose metabolism 1 CFLO004610-PA Reactome: R-HSA-9013508 NOTCH3 Intracellular Domain Regulates Transcription 5 CFLO004594-PA;CFLO015438-PA;CFLO008793-PA;CFLO008515-PA;CFLO016304-PA KEGG: 00030+2.2.1.2 Pentose phosphate pathway 2 CFLO006969-PA;CFLO000118-PA KEGG: 00230+3.5.4.10+2.1.2.3 Purine metabolism 2 CFLO017671-PA;CFLO015327-PA Reactome: R-HSA-1538133 G0 and Early G1 4 CFLO001098-PA;CFLO002764-PA;CFLO007346-PA;CFLO013980-PA KEGG: 00410+4.1.1.9 beta-Alanine metabolism 1 CFLO018074-PA Reactome: R-HSA-75953 RNA Polymerase II Transcription Initiation 26 CFLO012310-PA;CFLO008336-PA;CFLO012113-PA;CFLO019377-PA;CFLO019592-PA;CFLO007113-PA;CFLO006498-PA;CFLO007012-PA;CFLO000074-PA;CFLO015169-PA;CFLO001312-PA;CFLO010911-PA;CFLO000007-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO003054-PA;CFLO015637-PA;CFLO006247-PA;CFLO011191-PA;CFLO007118-PA;CFLO006370-PA;CFLO001309-PA;CFLO010322-PA;CFLO012515-PA;CFLO009087-PA;CFLO004196-PA KEGG: 00260+2.3.1.37 Glycine, serine and threonine metabolism 1 CFLO001018-PA Reactome: R-HSA-1266695 Interleukin-7 signaling 1 CFLO005740-PA Reactome: R-HSA-1369062 ABC transporters in lipid homeostasis 14 CFLO000464-PA;CFLO013743-PA;CFLO015658-PA;CFLO004734-PA;CFLO006196-PA;CFLO003146-PA;CFLO000028-PA;CFLO004733-PA;CFLO003180-PA;CFLO015635-PA;CFLO000029-PA;CFLO016120-PA;CFLO011038-PA;CFLO013740-PA MetaCyc: PWY-5097 L-lysine biosynthesis VI 2 CFLO012037-PA;CFLO001389-PA KEGG: 00900+2.2.1.7 Terpenoid backbone biosynthesis 1 CFLO014211-PA KEGG: 00071+2.3.1.21 Fatty acid degradation 1 CFLO015175-PA MetaCyc: PWY-7782 Plasmalogen biosynthesis 19 CFLO008716-PA;CFLO008720-PA;CFLO008715-PA;CFLO008157-PA;CFLO005715-PA;CFLO008158-PA;CFLO008159-PA;CFLO013406-PA;CFLO007205-PA;CFLO011437-PA;CFLO002146-PA;CFLO013399-PA;CFLO014422-PA;CFLO004570-PA;CFLO013401-PA;CFLO015620-PA;CFLO000216-PA;CFLO013403-PA;CFLO011434-PA MetaCyc: PWY-5737 (5R)-carbapenem carboxylate biosynthesis 1 CFLO017737-PA Reactome: R-HSA-71384 Ethanol oxidation 3 CFLO016846-PA;CFLO008552-PA;CFLO007199-PA Reactome: R-HSA-9022537 Loss of MECP2 binding ability to the NCoR/SMRT complex 1 CFLO001484-PA MetaCyc: PWY-7841 Neolacto-series glycosphingolipids biosynthesis 1 CFLO006369-PA Reactome: R-HSA-8964208 Phenylalanine metabolism 1 CFLO009716-PA Reactome: R-HSA-6798163 Choline catabolism 33 CFLO003256-PA;CFLO004766-PA;CFLO002305-PA;CFLO008931-PA;CFLO001229-PA;CFLO018724-PA;CFLO003259-PA;CFLO004371-PA;CFLO006702-PA;CFLO000494-PA;CFLO003255-PA;CFLO003254-PA;CFLO008225-PA;CFLO003258-PA;CFLO018718-PA;CFLO009692-PA;CFLO005749-PA;CFLO018725-PA;CFLO018431-PA;CFLO003261-PA;CFLO018913-PA;CFLO000099-PA;CFLO002800-PA;CFLO003260-PA;CFLO008928-PA;CFLO005748-PA;CFLO003257-PA;CFLO008930-PA;CFLO003253-PA;CFLO008929-PA;CFLO010320-PA;CFLO008934-PA;CFLO000495-PA MetaCyc: PWY-6610 Adenine salvage 1 CFLO000881-PA MetaCyc: PWY-8051 Anandamide biosynthesis I 17 CFLO014422-PA;CFLO002146-PA;CFLO011437-PA;CFLO016978-PA;CFLO017976-PA;CFLO011434-PA;CFLO005099-PA;CFLO002075-PA;CFLO000216-PA;CFLO007382-PA;CFLO015620-PA;CFLO000557-PA;CFLO004213-PA;CFLO006994-PA;CFLO013271-PA;CFLO005379-PA;CFLO003207-PA KEGG: 00730+3.1.3.2 Thiamine metabolism 2 CFLO013516-PA;CFLO011184-PA Reactome: R-HSA-4717374 Defective DPM1 causes DPM1-CDG (CDG-1e) 2 CFLO005971-PA;CFLO013866-PA KEGG: 00670+2.1.2.1 One carbon pool by folate 2 CFLO010087-PA;CFLO014967-PA KEGG: 00760+6.3.5.1 Nicotinate and nicotinamide metabolism 1 CFLO006318-PA Reactome: R-HSA-8941332 RUNX2 regulates genes involved in cell migration 2 CFLO007362-PA;CFLO007361-PA Reactome: R-HSA-68689 CDC6 association with the ORC:origin complex 9 CFLO004726-PA;CFLO002602-PA;CFLO003334-PA;CFLO018836-PA;CFLO010055-PA;CFLO010697-PA;CFLO002077-PA;CFLO015230-PA;CFLO004463-PA Reactome: R-HSA-179409 APC-Cdc20 mediated degradation of Nek2A 8 CFLO007123-PA;CFLO007015-PA;CFLO006211-PA;CFLO005584-PA;CFLO012167-PA;CFLO006992-PA;CFLO009576-PA;CFLO010492-PA MetaCyc: PWY-6689 Trna splicing I 3 CFLO006585-PA;CFLO001248-PA;CFLO002797-PA Reactome: R-HSA-5663213 RHO GTPases Activate WASPs and WAVEs 11 CFLO006678-PA;CFLO008920-PA;CFLO012666-PA;CFLO001131-PA;CFLO013244-PA;CFLO008919-PA;CFLO013930-PA;CFLO005173-PA;CFLO003326-PA;CFLO006587-PA;CFLO011975-PA MetaCyc: PWY-7285 Methylwyosine biosynthesis 5 CFLO001963-PA;CFLO016301-PA;CFLO013137-PA;CFLO005795-PA;CFLO008044-PA Reactome: R-HSA-9665249 Resistance of ERBB2 KD mutants to afatinib 1 CFLO005384-PA Reactome: R-HSA-5358606 Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH3 (MutSbeta) 9 CFLO006346-PA;CFLO003314-PA;CFLO008828-PA;CFLO009733-PA;CFLO011911-PA;CFLO013771-PA;CFLO008680-PA;CFLO005651-PA;CFLO001995-PA KEGG: 00640+4.2.1.17 Propanoate metabolism 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA KEGG: 00520+3.5.1.25 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 1 CFLO018399-PA MetaCyc: PWY-7442 Drosopterin and aurodrosopterin biosynthesis 3 CFLO011185-PA;CFLO002629-PA;CFLO011963-PA KEGG: 00600+3.2.1.22 Sphingolipid metabolism 1 CFLO009658-PA MetaCyc: PWY-7766 Heme b biosynthesis IV (Gram-positive bacteria) 1 CFLO008202-PA Reactome: R-HSA-72689 Formation of a pool of free 40S subunits 87 CFLO004181-PA;CFLO019663-PA;CFLO010904-PA;CFLO012297-PA;CFLO000918-PA;CFLO000325-PA;CFLO005822-PA;CFLO009848-PA;CFLO005804-PA;CFLO001584-PA;CFLO002568-PA;CFLO008851-PA;CFLO014395-PA;CFLO004325-PA;CFLO004278-PA;CFLO000326-PA;CFLO014362-PA;CFLO010962-PA;CFLO012584-PA;CFLO017946-PA;CFLO000629-PA;CFLO015650-PA;CFLO005537-PA;CFLO017730-PA;CFLO011483-PA;CFLO005709-PA;CFLO010554-PA;CFLO013929-PA;CFLO006630-PA;CFLO000612-PA;CFLO013459-PA;CFLO017942-PA;CFLO005789-PA;CFLO005013-PA;CFLO001260-PA;CFLO010240-PA;CFLO000349-PA;CFLO008263-PA;CFLO013848-PA;CFLO000889-PA;CFLO005334-PA;CFLO005150-PA;CFLO012596-PA;CFLO008061-PA;CFLO008228-PA;CFLO017594-PA;CFLO018800-PA;CFLO004441-PA;CFLO000339-PA;CFLO014117-PA;CFLO003095-PA;CFLO003083-PA;CFLO002901-PA;CFLO014026-PA;CFLO012240-PA;CFLO002329-PA;CFLO002739-PA;CFLO015631-PA;CFLO003320-PA;CFLO012333-PA;CFLO010712-PA;CFLO016302-PA;CFLO010535-PA;CFLO004727-PA;CFLO003311-PA;CFLO008829-PA;CFLO017333-PA;CFLO011221-PA;CFLO004176-PA;CFLO013281-PA;CFLO000744-PA;CFLO005096-PA;CFLO004405-PA;CFLO016897-PA;CFLO014479-PA;CFLO006768-PA;CFLO013407-PA;CFLO012160-PA;CFLO018839-PA;CFLO013411-PA;CFLO004825-PA;CFLO019287-PA;CFLO014883-PA;CFLO012191-PA;CFLO004224-PA;CFLO008335-PA;CFLO006483-PA KEGG: 00564+1.1.1.8 Glycerophospholipid metabolism 2 CFLO006857-PA;CFLO006890-PA KEGG: 00250+2.1.3.2 Alanine, aspartate and glutamate metabolism 1 CFLO011966-PA Reactome: R-HSA-69601 Ubiquitin Mediated Degradation of Phosphorylated Cdc25A 35 CFLO004457-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO014819-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO001095-PA;CFLO015469-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO010590-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO014805-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO000953-PA;CFLO007718-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO002304-PA;CFLO000939-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO001064-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA KEGG: 00531+3.2.1.23 Glycosaminoglycan degradation 3 CFLO003987-PA;CFLO012387-PA;CFLO002031-PA KEGG: 00250+6.3.5.4 Alanine, aspartate and glutamate metabolism 1 CFLO000043-PA MetaCyc: PWY-6964 Ammonia assimilation cycle II 3 CFLO007634-PA;CFLO007632-PA;CFLO007633-PA Reactome: R-HSA-2173796 SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription 2 CFLO008515-PA;CFLO011060-PA MetaCyc: PWY-6554 1D-myo-inositol hexakisphosphate biosynthesis V (from Ins(1,3,4)P3) 1 CFLO002434-PA Reactome: R-HSA-3371453 Regulation of HSF1-mediated heat shock response 40 CFLO004818-PA;CFLO012098-PA;CFLO013635-PA;CFLO004394-PA;CFLO011409-PA;CFLO008828-PA;CFLO014832-PA;CFLO006346-PA;CFLO005926-PA;CFLO009190-PA;CFLO002998-PA;CFLO012487-PA;CFLO004819-PA;CFLO004815-PA;CFLO014812-PA;CFLO013244-PA;CFLO014027-PA;CFLO012747-PA;CFLO012255-PA;CFLO000572-PA;CFLO019590-PA;CFLO001720-PA;CFLO004183-PA;CFLO009733-PA;CFLO014203-PA;CFLO014833-PA;CFLO000120-PA;CFLO005698-PA;CFLO008087-PA;CFLO002763-PA;CFLO008088-PA;CFLO013550-PA;CFLO005636-PA;CFLO008090-PA;CFLO014398-PA;CFLO004492-PA;CFLO010441-PA;CFLO014829-PA;CFLO014205-PA;CFLO016523-PA KEGG: 00053+1.8.5.1 Ascorbate and aldarate metabolism 2 CFLO008203-PA;CFLO008220-PA Reactome: R-HSA-111464 SMAC(DIABLO)-mediated dissociation of IAP:caspase complexes 5 CFLO012308-PA;CFLO012256-PA;CFLO005777-PA;CFLO003390-PA;CFLO004951-PA Reactome: R-HSA-5423646 Aflatoxin activation and detoxification 9 CFLO009467-PA;CFLO019744-PA;CFLO009463-PA;CFLO009464-PA;CFLO015237-PA;CFLO007698-PA;CFLO015238-PA;CFLO009465-PA;CFLO008122-PA KEGG: 00030+1.1.1.49 Pentose phosphate pathway 3 CFLO008875-PA;CFLO014828-PA;CFLO008606-PA KEGG: 04070+2.7.7.41 Phosphatidylinositol signaling system 2 CFLO006541-PA;CFLO019403-PA Reactome: R-HSA-426486 Small interfering RNA (siRNA) biogenesis 8 CFLO012800-PA;CFLO012983-PA;CFLO001535-PA;CFLO011446-PA;CFLO001224-PA;CFLO000984-PA;CFLO000311-PA;CFLO012806-PA KEGG: 00401+2.6.1.1 Novobiocin biosynthesis 2 CFLO003306-PA;CFLO000623-PA Reactome: R-HSA-6781827 Transcription-Coupled Nucleotide Excision Repair (TC-NER) 21 CFLO007012-PA;CFLO011905-PA;CFLO012310-PA;CFLO009853-PA;CFLO006370-PA;CFLO009087-PA;CFLO004196-PA;CFLO012515-PA;CFLO016962-PA;CFLO010322-PA;CFLO011191-PA;CFLO006247-PA;CFLO010420-PA;CFLO002882-PA;CFLO009851-PA;CFLO015637-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO004174-PA;CFLO010911-PA;CFLO009854-PA KEGG: 00410+4.2.1.17 beta-Alanine metabolism 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-9614657 FOXO-mediated transcription of cell death genes 4 CFLO008860-PA;CFLO015438-PA;CFLO012097-PA;CFLO016304-PA KEGG: 00620+2.3.1.12 Pyruvate metabolism 1 CFLO013555-PA MetaCyc: PWY-7833 Biosynthesis of Lewis epitopes (H. pylori) 1 CFLO000956-PA Reactome: R-HSA-176974 Unwinding of DNA 14 CFLO018658-PA;CFLO001783-PA;CFLO007044-PA;CFLO001338-PA;CFLO003010-PA;CFLO005301-PA;CFLO008924-PA;CFLO001253-PA;CFLO004877-PA;CFLO008927-PA;CFLO004524-PA;CFLO012315-PA;CFLO001616-PA;CFLO010604-PA Reactome: R-HSA-9604323 Negative regulation of NOTCH4 signaling 36 CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO009082-PA;CFLO001095-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO011518-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO009081-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO006007-PA;CFLO001064-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA KEGG: 00650+1.3.5.1 Butanoate metabolism 2 CFLO013472-PA;CFLO006431-PA MetaCyc: PWY-7375 Mrna capping I 6 CFLO002046-PA;CFLO018730-PA;CFLO012985-PA;CFLO004855-PA;CFLO013864-PA;CFLO013865-PA KEGG: 00250+4.3.2.2 Alanine, aspartate and glutamate metabolism 1 CFLO013827-PA KEGG: 00460+2.1.2.1 Cyanoamino acid metabolism 2 CFLO010087-PA;CFLO014967-PA MetaCyc: PWY-922 Mevalonate pathway I 5 CFLO006521-PA;CFLO012239-PA;CFLO006604-PA;CFLO008710-PA;CFLO001964-PA KEGG: 00720+6.2.1.1 Carbon fixation pathways in prokaryotes 2 CFLO016902-PA;CFLO016628-PA Reactome: R-HSA-3560783 Defective B4GALT7 causes EDS, progeroid type 5 CFLO012312-PA;CFLO012314-PA;CFLO005601-PA;CFLO019476-PA;CFLO013499-PA MetaCyc: PWY-7723 Bacterial bioluminescence 3 CFLO002013-PA;CFLO016519-PA;CFLO002012-PA KEGG: 00051+2.7.1.105+3.1.3.46 Fructose and mannose metabolism 2 CFLO011587-PA;CFLO016835-PA Reactome: R-HSA-2691232 Constitutive Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants 8 CFLO010507-PA;CFLO001394-PA;CFLO002956-PA;CFLO009368-PA;CFLO011086-PA;CFLO007222-PA;CFLO001395-PA;CFLO002955-PA MetaCyc: PWY-7919 Protein N-glycosylation processing phase (plants and animals) 2 CFLO015264-PA;CFLO019370-PA Reactome: R-HSA-427975 Proton/oligopeptide cotransporters 1 CFLO007160-PA MetaCyc: PWY-6348 Phosphate acquisition 2 CFLO013516-PA;CFLO011184-PA MetaCyc: PWY-381 Nitrate reduction II (assimilatory) 3 CFLO007632-PA;CFLO007633-PA;CFLO007634-PA KEGG: 00230+2.7.1.40 Purine metabolism 1 CFLO003967-PA Reactome: R-HSA-3656532 TGFBR1 KD Mutants in Cancer 1 CFLO002284-PA KEGG: 00710+1.2.1.12 Carbon fixation in photosynthetic organisms 1 CFLO009751-PA MetaCyc: PWY-46 Putrescine biosynthesis III 1 CFLO004683-PA KEGG: 05163+2.7.1.153 Human cytomegalovirus infection 1 CFLO011291-PA Reactome: R-HSA-1234158 Regulation of gene expression by Hypoxia-inducible Factor 2 CFLO016304-PA;CFLO015438-PA KEGG: 00010+1.8.1.4 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO000151-PA Reactome: R-HSA-5083633 Defective POMT1 causes MDDGA1, MDDGB1 and MDDGC1 3 CFLO001486-PA;CFLO002995-PA;CFLO009857-PA Reactome: R-HSA-5578998 Defective OPLAH causes 5-oxoprolinase deficiency (OPLAHD) 2 CFLO014549-PA;CFLO014547-PA Reactome: R-HSA-8849473 PTK6 Expression 1 CFLO018539-PA MetaCyc: PWY-7559 Glutathione degradation (DUG pathway 3 CFLO000938-PA;CFLO007834-PA;CFLO000936-PA MetaCyc: PWY-7854 Crotonyl-coa/ethylmalonyl-coa/hydroxybutyryl-coa cycle (engineered) 3 CFLO013638-PA;CFLO010827-PA;CFLO013479-PA Reactome: R-HSA-69273 Cyclin A/B1/B2 associated events during G2/M transition 7 CFLO001098-PA;CFLO007183-PA;CFLO010322-PA;CFLO007807-PA;CFLO016686-PA;CFLO001592-PA;CFLO006247-PA KEGG: 00520+3.5.99.6 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 2 CFLO006957-PA;CFLO007127-PA KEGG: 04150+2.7.1.153 mTOR signaling pathway 1 CFLO011291-PA MetaCyc: PWY-5172 Acetyl-coa biosynthesis III (from citrate) 1 CFLO004169-PA KEGG: 00051+4.1.2.13 Fructose and mannose metabolism 1 CFLO005131-PA Reactome: R-HSA-163210 Formation of ATP by chemiosmotic coupling 11 CFLO005895-PA;CFLO009654-PA;CFLO019061-PA;CFLO008117-PA;CFLO012495-PA;CFLO009316-PA;CFLO016536-PA;CFLO009840-PA;CFLO004180-PA;CFLO012143-PA;CFLO016537-PA KEGG: 00510+2.4.1.143 N-Glycan biosynthesis 2 CFLO013982-PA;CFLO013983-PA Reactome: R-HSA-5607763 CLEC7A (Dectin-1) induces NFAT activation 1 CFLO002753-PA MetaCyc: PWY-6365 D-myo-inositol (3,4,5,6)-tetrakisphosphate biosynthesis 1 CFLO002434-PA Reactome: R-HSA-350054 Notch-HLH transcription pathway 8 CFLO005540-PA;CFLO000142-PA;CFLO001797-PA;CFLO008793-PA;CFLO008515-PA;CFLO008006-PA;CFLO004594-PA;CFLO000670-PA Reactome: R-HSA-445144 Signal transduction by L1 2 CFLO003187-PA;CFLO013244-PA MetaCyc: PWY-7858 (5Z)-dodecenoate biosynthesis II 5 CFLO013638-PA;CFLO016519-PA;CFLO002013-PA;CFLO013479-PA;CFLO002012-PA Reactome: R-HSA-389359 CD28 dependent Vav1 pathway 1 CFLO005173-PA KEGG: 00020+1.2.4.2 Citrate cycle (TCA cycle) 3 CFLO011452-PA;CFLO011450-PA;CFLO001581-PA Reactome: R-HSA-9022692 Regulation of MECP2 expression and activity 8 CFLO011446-PA;CFLO005758-PA;CFLO001535-PA;CFLO007735-PA;CFLO012800-PA;CFLO001484-PA;CFLO012806-PA;CFLO017592-PA Reactome: R-HSA-9617324 Negative regulation of NMDA receptor-mediated neuronal transmission 1 CFLO017592-PA Reactome: R-HSA-2206292 MPS VII - Sly syndrome 2 CFLO012387-PA;CFLO003984-PA Reactome: R-HSA-111932 CaMK IV-mediated phosphorylation of CREB 1 CFLO017592-PA KEGG: 00620+6.4.1.2 Pyruvate metabolism 1 CFLO005702-PA Reactome: R-HSA-512988 Interleukin-3, Interleukin-5 and GM-CSF signaling 2 CFLO005740-PA;CFLO010039-PA KEGG: 00230+1.7.1.7 Purine metabolism 1 CFLO002148-PA MetaCyc: PWY-7909 Formaldehyde oxidation VII (THF pathway) 3 CFLO004433-PA;CFLO001271-PA;CFLO003993-PA Reactome: R-HSA-425561 Sodium/Calcium exchangers 9 CFLO005169-PA;CFLO011794-PA;CFLO005166-PA;CFLO006413-PA;CFLO006575-PA;CFLO018824-PA;CFLO014842-PA;CFLO005171-PA;CFLO006573-PA Reactome: R-HSA-917729 Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT) 11 CFLO006759-PA;CFLO016514-PA;CFLO005766-PA;CFLO013092-PA;CFLO009636-PA;CFLO018740-PA;CFLO013467-PA;CFLO004473-PA;CFLO014328-PA;CFLO012133-PA;CFLO005918-PA MetaCyc: PWY-7118 Chitin degradation to ethanol 4 CFLO016628-PA;CFLO016846-PA;CFLO016902-PA;CFLO010827-PA MetaCyc: PWY-7533 Gliotoxin biosynthesis 13 CFLO019817-PA;CFLO009463-PA;CFLO015237-PA;CFLO009464-PA;CFLO009467-PA;CFLO008220-PA;CFLO019744-PA;CFLO015238-PA;CFLO008122-PA;CFLO009465-PA;CFLO006249-PA;CFLO007698-PA;CFLO008203-PA Reactome: R-HSA-9608287 Defective MUTYH substrate binding 1 CFLO013757-PA MetaCyc: PWY-6317 D-galactose degradation I (Leloir pathway) 6 CFLO006591-PA;CFLO002812-PA;CFLO002708-PA;CFLO014121-PA;CFLO001267-PA;CFLO014859-PA Reactome: R-HSA-8953750 Transcriptional Regulation by E2F6 5 CFLO018385-PA;CFLO004577-PA;CFLO003390-PA;CFLO001240-PA;CFLO016512-PA Reactome: R-HSA-5674135 MAP2K and MAPK activation 2 CFLO013244-PA;CFLO011904-PA Reactome: R-HSA-170145 Phosphorylation of proteins involved in the G2/M transition by Cyclin A:Cdc2 complexes 1 CFLO001098-PA KEGG: 00010+2.7.1.40 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO003967-PA MetaCyc: PWY-6613 Tetrahydrofolate salvage from 5,10-methenyltetrahydrofolate 4 CFLO004433-PA;CFLO019130-PA;CFLO003993-PA;CFLO001271-PA MetaCyc: PWY-3881 Mannitol biosynthesis 1 CFLO000596-PA KEGG: 00514+2.4.1.255 Other types of O-glycan biosynthesis 1 CFLO012595-PA Reactome: R-HSA-5545483 Defective Mismatch Repair Associated With MLH1 1 CFLO001995-PA MetaCyc: PWY-5884 Wax esters biosynthesis I 13 CFLO008158-PA;CFLO005715-PA;CFLO008159-PA;CFLO013403-PA;CFLO013401-PA;CFLO008157-PA;CFLO008716-PA;CFLO013399-PA;CFLO004570-PA;CFLO008715-PA;CFLO008720-PA;CFLO013406-PA;CFLO007205-PA KEGG: 00410+1.3.3.6 beta-Alanine metabolism 2 CFLO013638-PA;CFLO013479-PA MetaCyc: PWY-7606 Docosahexaenoate biosynthesis III (6-desaturase, mammals) 6 CFLO013638-PA;CFLO007106-PA;CFLO013479-PA;CFLO012118-PA;CFLO011836-PA;CFLO006701-PA Reactome: R-HSA-159740 Gamma-carboxylation of protein precursors 1 CFLO004889-PA Reactome: R-HSA-212676 Dopamine Neurotransmitter Release Cycle 5 CFLO002413-PA;CFLO012712-PA;CFLO002951-PA;CFLO012708-PA;CFLO006070-PA MetaCyc: PWY-6892 Thiazole biosynthesis I (facultative anaerobic bacteria) 1 CFLO014211-PA Reactome: R-HSA-5221030 TET1,2,3 and TDG demethylate DNA 2 CFLO001506-PA;CFLO000698-PA Reactome: R-HSA-2393930 Phosphate bond hydrolysis by NUDT proteins 2 CFLO008863-PA;CFLO000256-PA MetaCyc: PWY-7456 Beta-(1,4)-mannan degradation 2 CFLO000596-PA;CFLO003382-PA KEGG: 00220+2.6.1.1 Arginine biosynthesis 2 CFLO003306-PA;CFLO000623-PA Reactome: R-HSA-8963901 Chylomicron remodeling 3 CFLO019853-PA;CFLO011745-PA;CFLO002286-PA MetaCyc: PWY-3821 D-galactose detoxification 4 CFLO014859-PA;CFLO001267-PA;CFLO006591-PA;CFLO002812-PA Reactome: R-HSA-5334118 DNA methylation 16 CFLO010821-PA;CFLO006881-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO014404-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO007391-PA;CFLO007437-PA;CFLO013421-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO018793-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO011812-PA Reactome: R-HSA-2559582 Senescence-Associated Secretory Phenotype (SASP) 22 CFLO011812-PA;CFLO009576-PA;CFLO006992-PA;CFLO001098-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO007437-PA;CFLO007123-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO006211-PA;CFLO005584-PA;CFLO012167-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO007391-PA;CFLO010492-PA;CFLO007015-PA;CFLO013244-PA;CFLO010821-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA Reactome: R-HSA-947581 Molybdenum cofactor biosynthesis 5 CFLO000312-PA;CFLO011045-PA;CFLO003369-PA;CFLO002709-PA;CFLO006634-PA MetaCyc: PWY-6519 8-amino-7-oxononanoate biosynthesis I 3 CFLO016519-PA;CFLO002013-PA;CFLO002012-PA MetaCyc: PWY-6549 L-glutamine biosynthesis III 4 CFLO009985-PA;CFLO007634-PA;CFLO007633-PA;CFLO007632-PA Reactome: R-HSA-173599 Formation of the active cofactor, UDP-glucuronate 2 CFLO009992-PA;CFLO003101-PA KEGG: 00640+4.1.1.9 Propanoate metabolism 1 CFLO018074-PA Reactome: R-HSA-9646399 Aggrephagy 14 CFLO001242-PA;CFLO007989-PA;CFLO009841-PA;CFLO006561-PA;CFLO016610-PA;CFLO008775-PA;CFLO014186-PA;CFLO000598-PA;CFLO016852-PA;CFLO010396-PA;CFLO008841-PA;CFLO003119-PA;CFLO002905-PA;CFLO004179-PA MetaCyc: PWY-6901 Superpathway of glucose and xylose degradation 6 CFLO015634-PA;CFLO003967-PA;CFLO009597-PA;CFLO009751-PA;CFLO007170-PA;CFLO016901-PA Reactome: R-HSA-3232118 SUMOylation of transcription factors 1 CFLO001457-PA MetaCyc: PWY-4661 1D-myo-inositol hexakisphosphate biosynthesis III (Spirodela polyrrhiza) 3 CFLO002434-PA;CFLO017717-PA;CFLO017716-PA Reactome: R-HSA-422356 Regulation of insulin secretion 1 CFLO002753-PA KEGG: 00970+2.1.2.9 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 4 CFLO000137-PA;CFLO019130-PA;CFLO000135-PA;CFLO008961-PA Reactome: R-HSA-5660862 Defective SLC7A7 causes lysinuric protein intolerance (LPI) 2 CFLO015918-PA;CFLO015919-PA Reactome: R-HSA-1296052 Ca2+ activated K+ channels 3 CFLO001734-PA;CFLO019787-PA;CFLO001735-PA KEGG: 00052+2.7.7.9 Galactose metabolism 1 CFLO009992-PA Reactome: R-HSA-5656121 Translesion synthesis by POLI 13 CFLO018166-PA;CFLO006346-PA;CFLO008828-PA;CFLO009733-PA;CFLO010332-PA;CFLO019810-PA;CFLO012555-PA;CFLO011309-PA;CFLO008121-PA;CFLO002994-PA;CFLO008680-PA;CFLO007174-PA;CFLO012323-PA MetaCyc: PWY-6367 D-myo-inositol-5-phosphate metabolism 8 CFLO007261-PA;CFLO001388-PA;CFLO013725-PA;CFLO005525-PA;CFLO009620-PA;CFLO008821-PA;CFLO005526-PA;CFLO006091-PA Reactome: R-HSA-352230 Amino acid transport across the plasma membrane 2 CFLO015919-PA;CFLO015918-PA KEGG: 00592+1.3.3.6 alpha-Linolenic acid metabolism 2 CFLO013638-PA;CFLO013479-PA KEGG: 00860+4.2.1.24 Porphyrin and chlorophyll metabolism 1 CFLO004493-PA Reactome: R-HSA-381753 Olfactory Signaling Pathway 2 CFLO008960-PA;CFLO005891-PA Reactome: R-HSA-5419276 Mitochondrial translation termination 49 CFLO008273-PA;CFLO004978-PA;CFLO000368-PA;CFLO014229-PA;CFLO000163-PA;CFLO016920-PA;CFLO012499-PA;CFLO003945-PA;CFLO000324-PA;CFLO000394-PA;CFLO002743-PA;CFLO007143-PA;CFLO016807-PA;CFLO008626-PA;CFLO001318-PA;CFLO008846-PA;CFLO019069-PA;CFLO004033-PA;CFLO007760-PA;CFLO012287-PA;CFLO018124-PA;CFLO012369-PA;CFLO007023-PA;CFLO008786-PA;CFLO009700-PA;CFLO018418-PA;CFLO006493-PA;CFLO017155-PA;CFLO015389-PA;CFLO012130-PA;CFLO009221-PA;CFLO010710-PA;CFLO006168-PA;CFLO003031-PA;CFLO011956-PA;CFLO004314-PA;CFLO005125-PA;CFLO001247-PA;CFLO015387-PA;CFLO008755-PA;CFLO018653-PA;CFLO011982-PA;CFLO004662-PA;CFLO001694-PA;CFLO010952-PA;CFLO014432-PA;CFLO006227-PA;CFLO002303-PA;CFLO009374-PA KEGG: 00020+4.2.1.3 Citrate cycle (TCA cycle) 2 CFLO013824-PA;CFLO007267-PA MetaCyc: PWY-7291 Oleate beta-oxidation (isomerase-dependent, yeast) 2 CFLO013638-PA;CFLO013479-PA KEGG: 00900+2.7.7.60 Terpenoid backbone biosynthesis 1 CFLO017896-PA Reactome: R-HSA-5693548 Sensing of DNA Double Strand Breaks 4 CFLO015680-PA;CFLO015674-PA;CFLO010802-PA;CFLO010805-PA Reactome: R-HSA-390696 Adrenoceptors 1 CFLO012042-PA Reactome: R-HSA-450341 Activation of the AP-1 family of transcription factors 3 CFLO014413-PA;CFLO013244-PA;CFLO014527-PA Reactome: R-HSA-6791055 TALDO1 deficiency: failed conversion of SH7P, GA3P to Fru(6)P, E4P 2 CFLO006969-PA;CFLO000118-PA MetaCyc: PWY-7849 Urate conversion to allantoin III 2 CFLO003353-PA;CFLO010622-PA Reactome: R-HSA-9020265 Biosynthesis of aspirin-triggered D-series resolvins 1 CFLO007753-PA MetaCyc: PWY-7728 (4Z,7Z,10Z,13Z,16Z)-docosa-4,7,10,13,16-pentaenoate biosynthesis II (4-desaturase) 2 CFLO006701-PA;CFLO007106-PA KEGG: 00511+3.2.1.96 Other glycan degradation 1 CFLO013918-PA MetaCyc: PWY-6824 Justicidin B biosynthesis 1 CFLO008216-PA Reactome: R-HSA-8934593 Regulation of RUNX1 Expression and Activity 8 CFLO007361-PA;CFLO007362-PA;CFLO012806-PA;CFLO005894-PA;CFLO005758-PA;CFLO012800-PA;CFLO001535-PA;CFLO011446-PA KEGG: 00052+3.5.1.25 Galactose metabolism 1 CFLO018399-PA MetaCyc: PWY-6397 Mycolyl-arabinogalactan-peptidoglycan complex biosynthesis 2 CFLO001267-PA;CFLO006591-PA MetaCyc: PWY-7765 3-hydroxy-4-methyl-anthranilate biosynthesis II 1 CFLO006361-PA MetaCyc: PWY-7783 Plasmalogen degradation 9 CFLO005379-PA;CFLO002075-PA;CFLO005099-PA;CFLO003207-PA;CFLO000557-PA;CFLO006994-PA;CFLO016978-PA;CFLO013271-PA;CFLO017976-PA Reactome: R-HSA-8983711 OAS antiviral response 1 CFLO003346-PA Reactome: R-HSA-4420097 VEGFA-VEGFR2 Pathway 10 CFLO008919-PA;CFLO011034-PA;CFLO001131-PA;CFLO004869-PA;CFLO010318-PA;CFLO000259-PA;CFLO008920-PA;CFLO005675-PA;CFLO016939-PA;CFLO005173-PA KEGG: 00260+2.1.2.10 Glycine, serine and threonine metabolism 4 CFLO010049-PA;CFLO004456-PA;CFLO002410-PA;CFLO006134-PA Reactome: R-HSA-5657562 Essential fructosuria 1 CFLO007293-PA Reactome: R-HSA-9656256 Defective OGG1 Substrate Processing 1 CFLO003212-PA MetaCyc: PWY-5491 Diethylphosphate degradation 2 CFLO018375-PA;CFLO006125-PA MetaCyc: PWY-6842 Glutathione-mediated detoxification II 5 CFLO000936-PA;CFLO000938-PA;CFLO007834-PA;CFLO008220-PA;CFLO008203-PA Reactome: R-HSA-9665250 Resistance of ERBB2 KD mutants to AEE788 1 CFLO005384-PA Reactome: R-HSA-109704 PI3K Cascade 1 CFLO008697-PA KEGG: 00790+1.14.16.4 Folate biosynthesis 1 CFLO004689-PA MetaCyc: PWY-5966-1 Fatty acid biosynthesis initiation (animals and fungi, cytoplasm) 4 CFLO016519-PA;CFLO002013-PA;CFLO005702-PA;CFLO002012-PA MetaCyc: PWY-5891 Menaquinol-11 biosynthesis 1 CFLO018555-PA Reactome: R-HSA-427652 Sodium-coupled phosphate cotransporters 1 CFLO007257-PA Reactome: R-HSA-167287 HIV elongation arrest and recovery 18 CFLO005353-PA;CFLO019592-PA;CFLO007113-PA;CFLO006869-PA;CFLO008569-PA;CFLO018085-PA;CFLO007012-PA;CFLO000994-PA;CFLO013674-PA;CFLO007118-PA;CFLO008811-PA;CFLO002885-PA;CFLO004196-PA;CFLO015189-PA;CFLO010911-PA;CFLO005811-PA;CFLO015637-PA;CFLO014021-PA MetaCyc: PWY-6891 Thiazole biosynthesis II (aerobic bacteria) 1 CFLO014211-PA KEGG: 00260+1.4.4.2 Glycine, serine and threonine metabolism 1 CFLO007134-PA Reactome: R-HSA-75893 TNF signaling 1 CFLO009368-PA Reactome: R-HSA-5358747 S33 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated 3 CFLO015916-PA;CFLO007019-PA;CFLO001327-PA KEGG: 00511+3.2.1.23 Other glycan degradation 3 CFLO002031-PA;CFLO003987-PA;CFLO012387-PA Reactome: R-HSA-8934903 Receptor Mediated Mitophagy 3 CFLO012750-PA;CFLO003187-PA;CFLO018531-PA KEGG: 00680+2.6.1.52 Methane metabolism 1 CFLO003969-PA KEGG: 00240+3.5.2.3 Pyrimidine metabolism 1 CFLO011966-PA Reactome: R-HSA-170670 Adenylate cyclase inhibitory pathway 4 CFLO008619-PA;CFLO019116-PA;CFLO008792-PA;CFLO015242-PA Reactome: R-HSA-6782315 tRNA modification in the nucleus and cytosol 24 CFLO002033-PA;CFLO017925-PA;CFLO012590-PA;CFLO006988-PA;CFLO008014-PA;CFLO005922-PA;CFLO000632-PA;CFLO015628-PA;CFLO003060-PA;CFLO006710-PA;CFLO004716-PA;CFLO000026-PA;CFLO019070-PA;CFLO005399-PA;CFLO010917-PA;CFLO001088-PA;CFLO007178-PA;CFLO018366-PA;CFLO015201-PA;CFLO014993-PA;CFLO015871-PA;CFLO002418-PA;CFLO004102-PA;CFLO009640-PA Reactome: R-HSA-4551295 Defective ALG11 causes ALG11-CDG (CDG-1p) 2 CFLO002826-PA;CFLO004933-PA Reactome: R-HSA-418359 Reduction of cytosolic Ca++ levels 4 CFLO004514-PA;CFLO006573-PA;CFLO006575-PA;CFLO004389-PA MetaCyc: PWY-882 L-ascorbate biosynthesis I (L-galactose pathway) 2 CFLO003382-PA;CFLO000596-PA KEGG: 00310+4.2.1.17+1.1.1.35 Lysine degradation 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA MetaCyc: PWY-7179 Purine deoxyribonucleosides degradation I 3 CFLO012573-PA;CFLO012580-PA;CFLO016529-PA Reactome: R-HSA-8863795 Downregulation of ERBB2 signaling 3 CFLO000256-PA;CFLO005384-PA;CFLO009698-PA Reactome: R-HSA-174113 SCF-beta-TrCP mediated degradation of Emi1 39 CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO004457-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO015469-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO009082-PA;CFLO001095-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO009081-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO006007-PA;CFLO001064-PA KEGG: 00400+2.6.1.1 Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis 2 CFLO003306-PA;CFLO000623-PA Reactome: R-HSA-3214858 RMTs methylate histone arginines 44 CFLO010819-PA;CFLO007370-PA;CFLO008494-PA;CFLO007690-PA;CFLO007877-PA;CFLO013488-PA;CFLO007391-PA;CFLO017263-PA;CFLO007437-PA;CFLO013546-PA;CFLO002552-PA;CFLO011254-PA;CFLO013535-PA;CFLO013540-PA;CFLO004186-PA;CFLO001636-PA;CFLO005853-PA;CFLO011293-PA;CFLO016551-PA;CFLO013555-PA;CFLO018277-PA;CFLO010821-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO011221-PA;CFLO004278-PA;CFLO007408-PA;CFLO008026-PA;CFLO007084-PA;CFLO007368-PA;CFLO007979-PA;CFLO005211-PA;CFLO008797-PA;CFLO008493-PA;CFLO002036-PA;CFLO008286-PA;CFLO004197-PA;CFLO016944-PA;CFLO007435-PA;CFLO002072-PA;CFLO008042-PA;CFLO008253-PA;CFLO011812-PA;CFLO007389-PA Reactome: R-HSA-389661 Glyoxylate metabolism and glycine degradation 20 CFLO005278-PA;CFLO000502-PA;CFLO001063-PA;CFLO011230-PA;CFLO000151-PA;CFLO005279-PA;CFLO007139-PA;CFLO012483-PA;CFLO015982-PA;CFLO011294-PA;CFLO013555-PA;CFLO004843-PA;CFLO014059-PA;CFLO005276-PA;CFLO002102-PA;CFLO015854-PA;CFLO006879-PA;CFLO011450-PA;CFLO015979-PA;CFLO001581-PA MetaCyc: PWY-6983 Threo-tetrahydrobiopterin biosynthesis 2 CFLO002629-PA;CFLO011963-PA Reactome: R-HSA-1855204 Synthesis of IP3 and IP4 in the cytosol 9 CFLO002434-PA;CFLO013725-PA;CFLO005525-PA;CFLO001388-PA;CFLO007261-PA;CFLO009620-PA;CFLO005526-PA;CFLO008821-PA;CFLO006751-PA MetaCyc: PWY-7185 UTP and CTP dephosphorylation I 5 CFLO010201-PA;CFLO011225-PA;CFLO011228-PA;CFLO010203-PA;CFLO000638-PA Reactome: R-HSA-8877330 RUNX1 and FOXP3 control the development of regulatory T lymphocytes (Tregs) 2 CFLO007362-PA;CFLO007361-PA MetaCyc: PWY-7888 Trna-uridine 2-thiolation (cytoplasmic) 1 CFLO009640-PA MetaCyc: PWY-5067 Glycogen biosynthesis II (from UDP-D-Glucose) 5 CFLO016492-PA;CFLO015784-PA;CFLO013083-PA;CFLO010589-PA;CFLO015783-PA KEGG: 00500+2.7.1.1 Starch and sucrose metabolism 1 CFLO006809-PA Reactome: R-HSA-606279 Deposition of new CENPA-containing nucleosomes at the centromere 15 CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO007437-PA;CFLO000616-PA;CFLO012217-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO010821-PA;CFLO007391-PA;CFLO002636-PA;CFLO007408-PA;CFLO011812-PA;CFLO007368-PA;CFLO004197-PA;CFLO008042-PA MetaCyc: PWY-8086 (S)-lactate fermentation to propanoate, acetate and hydrogen 4 CFLO007214-PA;CFLO004684-PA;CFLO018047-PA;CFLO007170-PA Reactome: R-HSA-141430 Inactivation of APC/C via direct inhibition of the APC/C complex 8 CFLO007123-PA;CFLO007015-PA;CFLO006211-PA;CFLO005584-PA;CFLO012167-PA;CFLO009576-PA;CFLO006992-PA;CFLO010492-PA KEGG: 00660+6.2.1.5 C5-Branched dibasic acid metabolism 4 CFLO001710-PA;CFLO005915-PA;CFLO004169-PA;CFLO008726-PA MetaCyc: PWY-7883 Anhydromuropeptides recycling II 8 CFLO007387-PA;CFLO014190-PA;CFLO019181-PA;CFLO006861-PA;CFLO018671-PA;CFLO007240-PA;CFLO005046-PA;CFLO005047-PA KEGG: 00785+2.8.1.8 Lipoic acid metabolism 1 CFLO001063-PA Reactome: R-HSA-112126 ALKBH3 mediated reversal of alkylation damage 1 CFLO015301-PA Reactome: R-HSA-174417 Telomere C-strand (Lagging Strand) Synthesis 4 CFLO003314-PA;CFLO011911-PA;CFLO008680-PA;CFLO013771-PA KEGG: 00720+6.2.1.5 Carbon fixation pathways in prokaryotes 4 CFLO008726-PA;CFLO004169-PA;CFLO005915-PA;CFLO001710-PA KEGG: 00640+6.2.1.5 Propanoate metabolism 4 CFLO004169-PA;CFLO008726-PA;CFLO001710-PA;CFLO005915-PA Reactome: R-HSA-2500257 Resolution of Sister Chromatid Cohesion 38 CFLO002636-PA;CFLO013088-PA;CFLO012124-PA;CFLO001327-PA;CFLO009841-PA;CFLO003172-PA;CFLO006561-PA;CFLO017511-PA;CFLO000598-PA;CFLO014833-PA;CFLO014329-PA;CFLO006290-PA;CFLO002880-PA;CFLO001646-PA;CFLO002905-PA;CFLO000525-PA;CFLO003075-PA;CFLO013646-PA;CFLO012217-PA;CFLO001242-PA;CFLO014186-PA;CFLO014829-PA;CFLO014832-PA;CFLO015916-PA;CFLO008841-PA;CFLO013783-PA;CFLO004179-PA;CFLO015008-PA;CFLO012487-PA;CFLO016852-PA;CFLO002998-PA;CFLO017514-PA;CFLO012319-PA;CFLO001592-PA;CFLO001352-PA;CFLO008775-PA;CFLO017731-PA;CFLO010396-PA KEGG: 00785+6.3.1.20 Lipoic acid metabolism 1 CFLO004843-PA Reactome: R-HSA-432722 Golgi Associated Vesicle Biogenesis 4 CFLO018084-PA;CFLO014508-PA;CFLO016459-PA;CFLO009344-PA Reactome: R-HSA-1169091 Activation of NF-kappaB in B cells 40 CFLO006007-PA;CFLO001064-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO009081-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO015469-PA;CFLO012235-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO009082-PA;CFLO001095-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO004457-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA MetaCyc: PWY-7409 Phospholipid remodeling (phosphatidylethanolamine, yeast) 9 CFLO016978-PA;CFLO017976-PA;CFLO013271-PA;CFLO006994-PA;CFLO000557-PA;CFLO003207-PA;CFLO005379-PA;CFLO002075-PA;CFLO005099-PA MetaCyc: PWY-7807 Glyphosate degradation III 3 CFLO016830-PA;CFLO000881-PA;CFLO004939-PA Reactome: R-HSA-3899300 SUMOylation of transcription cofactors 5 CFLO001457-PA;CFLO016304-PA;CFLO015438-PA;CFLO003119-PA;CFLO012305-PA Reactome: R-HSA-8955332 Carboxyterminal post-translational modifications of tubulin 18 CFLO009351-PA;CFLO002607-PA;CFLO009849-PA;CFLO002905-PA;CFLO006319-PA;CFLO014186-PA;CFLO001242-PA;CFLO011041-PA;CFLO002609-PA;CFLO008841-PA;CFLO004179-PA;CFLO001800-PA;CFLO006561-PA;CFLO009841-PA;CFLO005284-PA;CFLO013282-PA;CFLO017655-PA;CFLO016852-PA MetaCyc: PWY-5030 L-histidine degradation III 3 CFLO003993-PA;CFLO001271-PA;CFLO004433-PA Reactome: R-HSA-499943 Interconversion of nucleotide di- and triphosphates 16 CFLO005098-PA;CFLO005476-PA;CFLO005088-PA;CFLO000685-PA;CFLO001680-PA;CFLO012552-PA;CFLO004064-PA;CFLO012591-PA;CFLO010539-PA;CFLO014417-PA;CFLO016779-PA;CFLO000638-PA;CFLO005147-PA;CFLO000886-PA;CFLO016279-PA;CFLO000684-PA KEGG: 00982+1.1.1.1 Drug metabolism - cytochrome P450 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-5656169 Termination of translesion DNA synthesis 21 CFLO019810-PA;CFLO019062-PA;CFLO011911-PA;CFLO009733-PA;CFLO010332-PA;CFLO006346-PA;CFLO003314-PA;CFLO008828-PA;CFLO007174-PA;CFLO013923-PA;CFLO003985-PA;CFLO013771-PA;CFLO006509-PA;CFLO007975-PA;CFLO018166-PA;CFLO012323-PA;CFLO008121-PA;CFLO002994-PA;CFLO011309-PA;CFLO008680-PA;CFLO012555-PA MetaCyc: PWY-7822 Chitin degradation III (Serratia) 18 CFLO007387-PA;CFLO006976-PA;CFLO010596-PA;CFLO001724-PA;CFLO005046-PA;CFLO005047-PA;CFLO019181-PA;CFLO004926-PA;CFLO004916-PA;CFLO010218-PA;CFLO001957-PA;CFLO018671-PA;CFLO007240-PA;CFLO008050-PA;CFLO001781-PA;CFLO014190-PA;CFLO008237-PA;CFLO006861-PA KEGG: 04070+3.1.3.78 Phosphatidylinositol signaling system 1 CFLO006091-PA Reactome: R-HSA-9613354 Lipophagy 1 CFLO015380-PA KEGG: 00513+3.2.1.52 Various types of N-glycan biosynthesis 8 CFLO006861-PA;CFLO019181-PA;CFLO014190-PA;CFLO005047-PA;CFLO005046-PA;CFLO018671-PA;CFLO007240-PA;CFLO007387-PA KEGG: 00513+2.4.1.143 Various types of N-glycan biosynthesis 2 CFLO013982-PA;CFLO013983-PA KEGG: 00900+2.7.4.2 Terpenoid backbone biosynthesis 1 CFLO012239-PA Reactome: R-HSA-388479 Vasopressin-like receptors 2 CFLO015987-PA;CFLO018673-PA Reactome: R-HSA-2467813 Separation of Sister Chromatids 82 CFLO004439-PA;CFLO012487-PA;CFLO013534-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO005584-PA;CFLO013783-PA;CFLO014832-PA;CFLO015916-PA;CFLO001064-PA;CFLO008841-PA;CFLO000939-PA;CFLO010396-PA;CFLO004489-PA;CFLO001352-PA;CFLO001592-PA;CFLO003990-PA;CFLO002304-PA;CFLO017511-PA;CFLO006211-PA;CFLO000598-PA;CFLO014833-PA;CFLO014329-PA;CFLO006290-PA;CFLO001568-PA;CFLO000953-PA;CFLO002818-PA;CFLO001327-PA;CFLO018530-PA;CFLO002636-PA;CFLO013088-PA;CFLO012124-PA;CFLO015983-PA;CFLO006992-PA;CFLO003075-PA;CFLO013646-PA;CFLO003236-PA;CFLO014186-PA;CFLO000566-PA;CFLO000525-PA;CFLO004457-PA;CFLO002880-PA;CFLO011518-PA;CFLO016852-PA;CFLO012167-PA;CFLO002998-PA;CFLO015008-PA;CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO004179-PA;CFLO009576-PA;CFLO012319-PA;CFLO008775-PA;CFLO017731-PA;CFLO010492-PA;CFLO007718-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO017514-PA;CFLO014805-PA;CFLO000673-PA;CFLO009841-PA;CFLO003172-PA;CFLO006561-PA;CFLO007123-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA;CFLO015469-PA;CFLO003452-PA;CFLO010590-PA;CFLO007207-PA;CFLO014819-PA;CFLO012217-PA;CFLO001242-PA;CFLO014829-PA;CFLO007015-PA;CFLO002905-PA;CFLO015259-PA;CFLO001646-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA MetaCyc: PWY-6807 Xyloglucan degradation II (exoglucanase) 5 CFLO002031-PA;CFLO013233-PA;CFLO010922-PA;CFLO012387-PA;CFLO003987-PA Reactome: R-HSA-450321 JNK (c-Jun kinases) phosphorylation and activation mediated by activated human TAK1 2 CFLO014413-PA;CFLO014527-PA KEGG: 00230+6.3.2.6 Purine metabolism 1 CFLO004460-PA KEGG: 00680+4.1.2.13 Methane metabolism 1 CFLO005131-PA Reactome: R-HSA-9634600 Regulation of glycolysis by fructose 2,6-bisphosphate metabolism 2 CFLO011587-PA;CFLO016835-PA KEGG: 00562+5.3.1.1 Inositol phosphate metabolism 1 CFLO017154-PA KEGG: 00564+3.1.1.7 Glycerophospholipid metabolism 1 CFLO001058-PA MetaCyc: PWY-7193 Pyrimidine ribonucleosides salvage I 3 CFLO009649-PA;CFLO018007-PA;CFLO000970-PA KEGG: 00500+2.7.7.9 Starch and sucrose metabolism 1 CFLO009992-PA KEGG: 00290+4.2.1.33 Valine, leucine and isoleucine biosynthesis 2 CFLO007267-PA;CFLO013824-PA MetaCyc: PWY-4381 Fatty acid biosynthesis initiation (bacteria and plants) 6 CFLO002012-PA;CFLO005702-PA;CFLO015478-PA;CFLO016519-PA;CFLO002013-PA;CFLO008550-PA Reactome: R-HSA-9648895 Response of EIF2AK1 (HRI) to heme deficiency 2 CFLO017947-PA;CFLO000043-PA KEGG: 00130+1.17.4.4 Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis 1 CFLO013131-PA KEGG: 00230+3.1.4.53 Purine metabolism 1 CFLO010012-PA KEGG: 00480+2.3.2.2+3.4.19.13 Glutathione metabolism 3 CFLO007834-PA;CFLO000938-PA;CFLO000936-PA MetaCyc: PWY-6620 Guanine and guanosine salvage 1 CFLO016529-PA KEGG: 00930+4.2.1.17+1.1.1.35 Caprolactam degradation 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA KEGG: 00051+5.4.2.8 Fructose and mannose metabolism 1 CFLO003382-PA KEGG: 00052+3.2.1.22 Galactose metabolism 1 CFLO009658-PA KEGG: 00592+4.2.1.17 alpha-Linolenic acid metabolism 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA Reactome: R-HSA-933541 TRAF6 mediated IRF7 activation 3 CFLO014989-PA;CFLO016304-PA;CFLO015438-PA Reactome: R-HSA-6807004 Negative regulation of MET activity 3 CFLO014328-PA;CFLO004324-PA;CFLO001114-PA MetaCyc: PWY-7936 Psilocybin biosynthesis 18 CFLO001001-PA;CFLO006958-PA;CFLO003396-PA;CFLO000993-PA;CFLO006963-PA;CFLO018451-PA;CFLO013288-PA;CFLO006961-PA;CFLO009113-PA;CFLO000999-PA;CFLO011430-PA;CFLO013107-PA;CFLO003427-PA;CFLO006959-PA;CFLO013518-PA;CFLO006251-PA;CFLO006960-PA;CFLO007510-PA KEGG: 00670+1.5.1.3 One carbon pool by folate 1 CFLO012613-PA KEGG: 00640+6.2.1.4 Propanoate metabolism 1 CFLO005915-PA Reactome: R-HSA-5673000 RAF activation 4 CFLO015916-PA;CFLO010617-PA;CFLO001327-PA;CFLO017592-PA Reactome: R-HSA-5632928 Defective Mismatch Repair Associated With MSH2 3 CFLO011597-PA;CFLO002711-PA;CFLO011589-PA Reactome: R-HSA-8854050 FBXL7 down-regulates AURKA during mitotic entry and in early mitosis 39 CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO009081-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO006007-PA;CFLO001064-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO009082-PA;CFLO003059-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO004457-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA Reactome: R-HSA-373753 Nephrin family interactions 4 CFLO019826-PA;CFLO010189-PA;CFLO010486-PA;CFLO016939-PA KEGG: 00230+3.5.2.5 Purine metabolism 1 CFLO017986-PA KEGG: 00260+1.2.1.8+1.1.99.1 Glycine, serine and threonine metabolism 5 CFLO005748-PA;CFLO001229-PA;CFLO000494-PA;CFLO005749-PA;CFLO003254-PA MetaCyc: PWY-7511 Protein ubiquitination 68 CFLO000825-PA;CFLO013575-PA;CFLO004203-PA;CFLO015097-PA;CFLO014479-PA;CFLO003317-PA;CFLO004583-PA;CFLO006565-PA;CFLO000968-PA;CFLO002686-PA;CFLO008881-PA;CFLO002774-PA;CFLO001804-PA;CFLO010507-PA;CFLO002683-PA;CFLO015006-PA;CFLO018559-PA;CFLO013133-PA;CFLO004191-PA;CFLO018557-PA;CFLO015669-PA;CFLO001953-PA;CFLO015004-PA;CFLO006262-PA;CFLO008391-PA;CFLO018013-PA;CFLO011905-PA;CFLO015096-PA;CFLO004808-PA;CFLO011343-PA;CFLO005912-PA;CFLO017453-PA;CFLO011342-PA;CFLO000592-PA;CFLO002773-PA;CFLO007242-PA;CFLO006306-PA;CFLO001968-PA;CFLO003228-PA;CFLO016563-PA;CFLO014210-PA;CFLO006584-PA;CFLO012174-PA;CFLO012286-PA;CFLO007162-PA;CFLO017345-PA;CFLO004267-PA;CFLO011344-PA;CFLO015914-PA;CFLO000885-PA;CFLO004190-PA;CFLO018365-PA;CFLO001961-PA;CFLO000256-PA;CFLO001542-PA;CFLO013095-PA;CFLO008248-PA;CFLO002882-PA;CFLO000063-PA;CFLO004457-PA;CFLO006533-PA;CFLO007222-PA;CFLO007757-PA;CFLO007124-PA;CFLO007213-PA;CFLO007950-PA;CFLO001451-PA;CFLO002635-PA Reactome: R-HSA-111447 Activation of BAD and translocation to mitochondria 2 CFLO000223-PA;CFLO018046-PA Reactome: R-HSA-6791462 TALDO1 deficiency: failed conversion of Fru(6)P, E4P to SH7P, GA3P 2 CFLO006969-PA;CFLO000118-PA Reactome: R-HSA-418592 ADP signalling through P2Y purinoceptor 1 1 CFLO003448-PA MetaCyc: PWY-7295 L-arabinose degradation IV 1 CFLO010827-PA Reactome: R-HSA-5678895 Defective CFTR causes cystic fibrosis 40 CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO013733-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO001064-PA;CFLO004489-PA;CFLO016610-PA;CFLO003990-PA;CFLO005348-PA;CFLO000939-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO002304-PA;CFLO007718-PA;CFLO000953-PA;CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO010590-PA;CFLO015983-PA;CFLO004896-PA;CFLO007207-PA;CFLO001500-PA;CFLO001095-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO015469-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO014819-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO004457-PA MetaCyc: PWY-6372 1D-myo-inositol hexakisphosphate biosynthesis IV (Dictyostelium) 2 CFLO017717-PA;CFLO017716-PA MetaCyc: PWY-7119 Ceramide and sphingolipid recycling and degradation (yeast) 2 CFLO017233-PA;CFLO017230-PA Reactome: R-HSA-3359471 Defective MMAB causes methylmalonic aciduria type cblB 1 CFLO004532-PA MetaCyc: PWY-622 Starch biosynthesis 4 CFLO019811-PA;CFLO016492-PA;CFLO013083-PA;CFLO010589-PA Reactome: R-HSA-442982 Ras activation upon Ca2+ influx through NMDA receptor 1 CFLO017592-PA KEGG: 00010+5.3.1.1 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO017154-PA MetaCyc: PWY-5872 Ubiquinol-10 biosynthesis (eukaryotic) 4 CFLO001545-PA;CFLO005148-PA;CFLO002566-PA;CFLO018371-PA Reactome: R-HSA-9010553 Regulation of expression of SLITs and ROBOs 119 CFLO013281-PA;CFLO014819-PA;CFLO013992-PA;CFLO009857-PA;CFLO004176-PA;CFLO011221-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO010535-PA;CFLO003311-PA;CFLO000673-PA;CFLO016302-PA;CFLO014805-PA;CFLO010712-PA;CFLO012240-PA;CFLO015469-PA;CFLO002329-PA;CFLO003452-PA;CFLO003059-PA;CFLO002739-PA;CFLO015631-PA;CFLO001095-PA;CFLO003320-PA;CFLO012333-PA;CFLO002901-PA;CFLO007207-PA;CFLO014026-PA;CFLO010590-PA;CFLO004224-PA;CFLO006483-PA;CFLO002660-PA;CFLO008335-PA;CFLO019287-PA;CFLO014883-PA;CFLO007718-PA;CFLO004825-PA;CFLO013407-PA;CFLO018839-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO013411-PA;CFLO011906-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO006768-PA;CFLO015984-PA;CFLO005096-PA;CFLO000744-PA;CFLO016897-PA;CFLO004405-PA;CFLO017730-PA;CFLO011483-PA;CFLO005709-PA;CFLO000566-PA;CFLO000629-PA;CFLO017946-PA;CFLO003236-PA;CFLO004325-PA;CFLO000326-PA;CFLO004278-PA;CFLO004457-PA;CFLO010962-PA;CFLO012584-PA;CFLO011518-PA;CFLO002568-PA;CFLO001584-PA;CFLO008851-PA;CFLO014395-PA;CFLO001568-PA;CFLO009848-PA;CFLO005822-PA;CFLO000325-PA;CFLO013732-PA;CFLO005804-PA;CFLO012297-PA;CFLO000953-PA;CFLO013126-PA;CFLO000918-PA;CFLO018530-PA;CFLO002818-PA;CFLO004181-PA;CFLO015983-PA;CFLO019663-PA;CFLO003235-PA;CFLO004441-PA;CFLO000339-PA;CFLO014117-PA;CFLO000939-PA;CFLO003083-PA;CFLO008061-PA;CFLO008228-PA;CFLO017594-PA;CFLO018800-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000889-PA;CFLO002304-PA;CFLO005334-PA;CFLO005150-PA;CFLO012596-PA;CFLO012166-PA;CFLO012372-PA;CFLO000349-PA;CFLO010240-PA;CFLO008263-PA;CFLO006593-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO013848-PA;CFLO013673-PA;CFLO017942-PA;CFLO005789-PA;CFLO001260-PA;CFLO013929-PA;CFLO006630-PA;CFLO000612-PA;CFLO013459-PA;CFLO010554-PA;CFLO001064-PA Reactome: R-HSA-8866423 VLDL assembly 7 CFLO011745-PA;CFLO019853-PA;CFLO002286-PA;CFLO016031-PA;CFLO004961-PA;CFLO014120-PA;CFLO002306-PA KEGG: 00230+2.7.4.3 Purine metabolism 5 CFLO016779-PA;CFLO016279-PA;CFLO005476-PA;CFLO005147-PA;CFLO000886-PA Reactome: R-HSA-1660661 Sphingolipid de novo biosynthesis 6 CFLO008701-PA;CFLO018552-PA;CFLO009258-PA;CFLO007812-PA;CFLO011962-PA;CFLO008023-PA MetaCyc: PWY-5994 Palmitate biosynthesis (animals and fungi, cytoplasm) 3 CFLO002013-PA;CFLO016519-PA;CFLO002012-PA KEGG: 00564+3.1.3.4 Glycerophospholipid metabolism 1 CFLO000216-PA Reactome: R-HSA-4641262 Disassembly of the destruction complex and recruitment of AXIN to the membrane 3 CFLO007019-PA;CFLO015916-PA;CFLO001327-PA Reactome: R-HSA-2559586 DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence 17 CFLO010805-PA;CFLO007391-PA;CFLO007408-PA;CFLO007368-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO010821-PA;CFLO004197-PA;CFLO001098-PA;CFLO008042-PA;CFLO010802-PA;CFLO015674-PA;CFLO011812-PA;CFLO015680-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO007437-PA Reactome: R-HSA-3000480 Scavenging by Class A Receptors 3 CFLO019853-PA;CFLO011745-PA;CFLO002286-PA KEGG: 00650+5.1.2.3+4.2.1.17+1.1.1.35 Butanoate metabolism 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA MetaCyc: PWY-7863 Roseoflavin biosynthesis 1 CFLO006180-PA KEGG: 00040+5.1.3.1 Pentose and glucuronate interconversions 1 CFLO013167-PA KEGG: 00330+1.14.11.2 Arginine and proline metabolism 2 CFLO011237-PA;CFLO011235-PA Reactome: R-HSA-71288 Creatine metabolism 3 CFLO002164-PA;CFLO004163-PA;CFLO001686-PA Reactome: R-HSA-211976 Endogenous sterols 3 CFLO002662-PA;CFLO001497-PA;CFLO010536-PA KEGG: 00010+3.1.3.11 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO009994-PA KEGG: 00030+3.1.1.17 Pentose phosphate pathway 1 CFLO001701-PA Reactome: R-HSA-6804757 Regulation of TP53 Degradation 8 CFLO012305-PA;CFLO010420-PA;CFLO008104-PA;CFLO001098-PA;CFLO018008-PA;CFLO014425-PA;CFLO014421-PA;CFLO000209-PA MetaCyc: PWY-6898 Thiamine salvage III 1 CFLO003438-PA KEGG: 00360+2.6.1.1 Phenylalanine metabolism 2 CFLO003306-PA;CFLO000623-PA KEGG: 00983+2.5.1.18 Drug metabolism - other enzymes 2 CFLO008220-PA;CFLO008203-PA Reactome: R-HSA-159231 Transport of Mature mRNA Derived from an Intronless Transcript 26 CFLO014829-PA;CFLO012747-PA;CFLO010441-PA;CFLO007295-PA;CFLO013992-PA;CFLO008090-PA;CFLO004815-PA;CFLO004819-PA;CFLO011459-PA;CFLO005636-PA;CFLO002763-PA;CFLO008088-PA;CFLO013550-PA;CFLO000562-PA;CFLO008087-PA;CFLO005698-PA;CFLO012487-PA;CFLO000120-PA;CFLO002998-PA;CFLO014833-PA;CFLO014832-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO000572-PA;CFLO008706-PA;CFLO004818-PA KEGG: 00730+2.8.1.7 Thiamine metabolism 1 CFLO006634-PA Reactome: R-HSA-2024101 CS/DS degradation 7 CFLO007240-PA;CFLO005047-PA;CFLO005046-PA;CFLO014190-PA;CFLO019181-PA;CFLO007387-PA;CFLO004328-PA MetaCyc: PWY-7798 Protein S-nitrosylation and denitrosylation 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-418890 Role of second messengers in netrin-1 signaling 6 CFLO009329-PA;CFLO002128-PA;CFLO002127-PA;CFLO009327-PA;CFLO006298-PA;CFLO000387-PA KEGG: 00380+1.2.4.2 Tryptophan metabolism 3 CFLO011452-PA;CFLO011450-PA;CFLO001581-PA Reactome: R-HSA-69091 Polymerase switching 17 CFLO012204-PA;CFLO007147-PA;CFLO013771-PA;CFLO003314-PA;CFLO010332-PA;CFLO002987-PA;CFLO011911-PA;CFLO019810-PA;CFLO012555-PA;CFLO008680-PA;CFLO008121-PA;CFLO002994-PA;CFLO011309-PA;CFLO001238-PA;CFLO012323-PA;CFLO015227-PA;CFLO018166-PA Reactome: R-HSA-75109 Triglyceride biosynthesis 3 CFLO015003-PA;CFLO003232-PA;CFLO000216-PA KEGG: 00072+4.1.3.4 Synthesis and degradation of ketone bodies 1 CFLO005374-PA Reactome: R-HSA-167160 RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE during HIV infection 24 CFLO013865-PA;CFLO012310-PA;CFLO005353-PA;CFLO019592-PA;CFLO013864-PA;CFLO007113-PA;CFLO012985-PA;CFLO007012-PA;CFLO018085-PA;CFLO010911-PA;CFLO015637-PA;CFLO018730-PA;CFLO014021-PA;CFLO002046-PA;CFLO007399-PA;CFLO011191-PA;CFLO006247-PA;CFLO006370-PA;CFLO007118-PA;CFLO004855-PA;CFLO004196-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO010322-PA MetaCyc: PWY-6342 Noradrenaline and adrenaline degradation 1 CFLO016846-PA MetaCyc: PWY-6333 Acetaldehyde biosynthesis I 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-1855183 Synthesis of IP2, IP, and Ins in the cytosol 4 CFLO006751-PA;CFLO014480-PA;CFLO017717-PA;CFLO017716-PA Reactome: R-HSA-8866654 E3 ubiquitin ligases ubiquitinate target proteins 16 CFLO010925-PA;CFLO016607-PA;CFLO000122-PA;CFLO006262-PA;CFLO004758-PA;CFLO004744-PA;CFLO016610-PA;CFLO005799-PA;CFLO008680-PA;CFLO000240-PA;CFLO019772-PA;CFLO002134-PA;CFLO014414-PA;CFLO006695-PA;CFLO000579-PA;CFLO009319-PA Reactome: R-HSA-5610783 Degradation of GLI2 by the proteasome 40 CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO009081-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO001064-PA;CFLO006007-PA;CFLO005641-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO011518-PA;CFLO004457-PA;CFLO000953-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO014805-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO010590-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO001095-PA;CFLO009082-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA Reactome: R-HSA-1482925 Acyl chain remodelling of PG 8 CFLO000557-PA;CFLO006994-PA;CFLO016978-PA;CFLO013271-PA;CFLO005379-PA;CFLO005099-PA;CFLO002075-PA;CFLO003207-PA Reactome: R-HSA-1442490 Collagen degradation 5 CFLO012358-PA;CFLO018020-PA;CFLO009368-PA;CFLO016374-PA;CFLO011086-PA Reactome: R-HSA-500753 Pyrimidine biosynthesis 4 CFLO002076-PA;CFLO005916-PA;CFLO006108-PA;CFLO011966-PA MetaCyc: PWY-5743 3-hydroxypropanoate cycle 5 CFLO008550-PA;CFLO005702-PA;CFLO015478-PA;CFLO016169-PA;CFLO003089-PA MetaCyc: PWY-7395 D-galactosamine and N-acetyl-D-galactosamine degradation 1 CFLO018399-PA MetaCyc: PWY-3661-1 Glycine betaine degradation II (mammalian) 2 CFLO010087-PA;CFLO014967-PA Reactome: R-HSA-5368286 Mitochondrial translation initiation 51 CFLO011956-PA;CFLO003031-PA;CFLO006168-PA;CFLO004314-PA;CFLO015389-PA;CFLO017155-PA;CFLO001429-PA;CFLO010710-PA;CFLO012130-PA;CFLO009221-PA;CFLO008755-PA;CFLO018653-PA;CFLO001247-PA;CFLO005125-PA;CFLO015387-PA;CFLO001694-PA;CFLO014432-PA;CFLO009362-PA;CFLO010952-PA;CFLO004662-PA;CFLO011982-PA;CFLO009374-PA;CFLO002303-PA;CFLO006227-PA;CFLO016920-PA;CFLO000163-PA;CFLO008961-PA;CFLO000368-PA;CFLO004978-PA;CFLO008273-PA;CFLO014229-PA;CFLO000394-PA;CFLO012499-PA;CFLO000324-PA;CFLO003945-PA;CFLO007143-PA;CFLO002743-PA;CFLO019069-PA;CFLO008846-PA;CFLO007760-PA;CFLO004033-PA;CFLO016807-PA;CFLO008626-PA;CFLO001318-PA;CFLO018418-PA;CFLO006493-PA;CFLO018124-PA;CFLO012287-PA;CFLO008786-PA;CFLO007023-PA;CFLO012369-PA Reactome: R-HSA-427413 NoRC negatively regulates rRNA expression 35 CFLO002136-PA;CFLO006247-PA;CFLO006370-PA;CFLO009643-PA;CFLO010322-PA;CFLO013546-PA;CFLO010911-PA;CFLO007437-PA;CFLO007399-PA;CFLO014021-PA;CFLO007391-PA;CFLO006485-PA;CFLO011840-PA;CFLO009647-PA;CFLO012310-PA;CFLO006881-PA;CFLO007128-PA;CFLO012680-PA;CFLO011191-PA;CFLO011812-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO004196-PA;CFLO002036-PA;CFLO007368-PA;CFLO003630-PA;CFLO007408-PA;CFLO019070-PA;CFLO008703-PA;CFLO014404-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO010821-PA KEGG: 04926+2.7.11.1 Relaxin signaling pathway 39 CFLO018633-PA;CFLO014993-PA;CFLO008981-PA;CFLO010702-PA;CFLO012986-PA;CFLO017854-PA;CFLO012169-PA;CFLO005902-PA;CFLO013251-PA;CFLO006720-PA;CFLO019568-PA;CFLO002667-PA;CFLO009016-PA;CFLO004394-PA;CFLO008862-PA;CFLO013134-PA;CFLO011904-PA;CFLO010318-PA;CFLO018537-PA;CFLO000579-PA;CFLO007329-PA;CFLO008104-PA;CFLO016607-PA;CFLO012988-PA;CFLO004063-PA;CFLO013482-PA;CFLO000259-PA;CFLO019202-PA;CFLO018008-PA;CFLO012394-PA;CFLO015084-PA;CFLO004217-PA;CFLO019399-PA;CFLO008870-PA;CFLO012097-PA;CFLO005479-PA;CFLO000334-PA;CFLO012344-PA;CFLO019454-PA Reactome: R-HSA-6787450 tRNA modification in the mitochondrion 5 CFLO003060-PA;CFLO003156-PA;CFLO019663-PA;CFLO007327-PA;CFLO009565-PA MetaCyc: PWY-7230 Ubiquinol-6 biosynthesis from 4-aminobenzoate (yeast) 3 CFLO001545-PA;CFLO018371-PA;CFLO002566-PA MetaCyc: PWY-4302 Aerobic respiration III (alternative oxidase pathway) 2 CFLO013472-PA;CFLO006431-PA KEGG: 00350+1.14.16.2 Tyrosine metabolism 1 CFLO000009-PA KEGG: 00130+4.1.1.90 Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis 1 CFLO004889-PA MetaCyc: PWY-7179-1 Purine deoxyribonucleosides degradation II 3 CFLO016529-PA;CFLO012573-PA;CFLO012580-PA MetaCyc: PWY-7592 Arachidonate biosynthesis III (6-desaturase, mammals) 2 CFLO006701-PA;CFLO007106-PA Reactome: R-HSA-8853884 Transcriptional Regulation by VENTX 9 CFLO007123-PA;CFLO007015-PA;CFLO005584-PA;CFLO012167-PA;CFLO005758-PA;CFLO006211-PA;CFLO009576-PA;CFLO006992-PA;CFLO010492-PA Reactome: R-HSA-72649 Translation initiation complex formation 46 CFLO010904-PA;CFLO014026-PA;CFLO012297-PA;CFLO005822-PA;CFLO009848-PA;CFLO005804-PA;CFLO001584-PA;CFLO010535-PA;CFLO004727-PA;CFLO004278-PA;CFLO008829-PA;CFLO014362-PA;CFLO011221-PA;CFLO017333-PA;CFLO012584-PA;CFLO015650-PA;CFLO000629-PA;CFLO017946-PA;CFLO005537-PA;CFLO013281-PA;CFLO005709-PA;CFLO000744-PA;CFLO004405-PA;CFLO016897-PA;CFLO013459-PA;CFLO006768-PA;CFLO005013-PA;CFLO014479-PA;CFLO005789-PA;CFLO017942-PA;CFLO008263-PA;CFLO000349-PA;CFLO013848-PA;CFLO005334-PA;CFLO013407-PA;CFLO012160-PA;CFLO012596-PA;CFLO017594-PA;CFLO008061-PA;CFLO019287-PA;CFLO004224-PA;CFLO012191-PA;CFLO017947-PA;CFLO003095-PA;CFLO014117-PA;CFLO006483-PA KEGG: 00680+3.1.3.11 Methane metabolism 1 CFLO009994-PA KEGG: 05170+2.7.11.1 Human immunodeficiency virus 1 infection 39 CFLO004394-PA;CFLO008862-PA;CFLO009016-PA;CFLO011904-PA;CFLO013134-PA;CFLO000579-PA;CFLO018537-PA;CFLO010318-PA;CFLO007329-PA;CFLO008981-PA;CFLO014993-PA;CFLO018633-PA;CFLO017854-PA;CFLO012169-PA;CFLO012986-PA;CFLO010702-PA;CFLO013251-PA;CFLO006720-PA;CFLO005902-PA;CFLO002667-PA;CFLO019568-PA;CFLO008870-PA;CFLO005479-PA;CFLO012097-PA;CFLO000334-PA;CFLO019454-PA;CFLO012344-PA;CFLO004063-PA;CFLO012988-PA;CFLO016607-PA;CFLO008104-PA;CFLO013482-PA;CFLO012394-PA;CFLO019202-PA;CFLO018008-PA;CFLO000259-PA;CFLO019399-PA;CFLO004217-PA;CFLO015084-PA Reactome: R-HSA-912694 Regulation of IFNA signaling 1 CFLO010039-PA MetaCyc: PWY-6435 4-hydroxybenzoate biosynthesis III (plants) 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA KEGG: 00760+2.7.7.18 Nicotinate and nicotinamide metabolism 2 CFLO006197-PA;CFLO006198-PA KEGG: 00020+1.1.1.42 Citrate cycle (TCA cycle) 1 CFLO009985-PA Reactome: R-HSA-5099900 WNT5A-dependent internalization of FZD4 3 CFLO006324-PA;CFLO005139-PA;CFLO004342-PA Reactome: R-HSA-68867 Assembly of the pre-replicative complex 19 CFLO010697-PA;CFLO001338-PA;CFLO010055-PA;CFLO003010-PA;CFLO018658-PA;CFLO003334-PA;CFLO008927-PA;CFLO015230-PA;CFLO002077-PA;CFLO005301-PA;CFLO008924-PA;CFLO001616-PA;CFLO012315-PA;CFLO002602-PA;CFLO004726-PA;CFLO010604-PA;CFLO000045-PA;CFLO018836-PA;CFLO004463-PA KEGG: 00030+5.3.1.9 Pentose phosphate pathway 1 CFLO019811-PA Reactome: R-HSA-190873 Gap junction degradation 3 CFLO013544-PA;CFLO004342-PA;CFLO006324-PA Reactome: R-HSA-426048 Arachidonate production from DAG 2 CFLO007819-PA;CFLO004614-PA KEGG: 00010+2.7.2.3 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO015634-PA KEGG: 00460+2.3.2.2 Cyanoamino acid metabolism 3 CFLO000936-PA;CFLO000938-PA;CFLO007834-PA Reactome: R-HSA-975871 MyD88 cascade initiated on plasma membrane 1 CFLO019450-PA Reactome: R-HSA-5620924 Intraflagellar transport 9 CFLO010638-PA;CFLO019451-PA;CFLO013735-PA;CFLO002997-PA;CFLO013621-PA;CFLO015432-PA;CFLO017707-PA;CFLO013727-PA;CFLO008775-PA Reactome: R-HSA-9018896 Biosynthesis of E-series 18(S)-resolvins 1 CFLO007753-PA MetaCyc: PWY-7892 Trna-uridine 2-thiolation and selenation (bacteria) 1 CFLO009565-PA MetaCyc: PWY-6113 Superpathway of mycolate biosynthesis 3 CFLO016519-PA;CFLO002013-PA;CFLO002012-PA KEGG: 00510+2.4.1.117 N-Glycan biosynthesis 1 CFLO008802-PA Reactome: R-HSA-399719 Trafficking of AMPA receptors 1 CFLO017592-PA Reactome: R-HSA-8950505 Gene and protein expression by JAK-STAT signaling after Interleukin-12 stimulation 7 CFLO016842-PA;CFLO006969-PA;CFLO005173-PA;CFLO011409-PA;CFLO004305-PA;CFLO006143-PA;CFLO000118-PA Reactome: R-HSA-5627117 RHO GTPases Activate ROCKs 1 CFLO010318-PA KEGG: 00980+2.5.1.18 Metabolism of xenobiotics by cytochrome P450 2 CFLO008203-PA;CFLO008220-PA Reactome: R-HSA-2559585 Oncogene Induced Senescence 2 CFLO005758-PA;CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-912631 Regulation of signaling by CBL 2 CFLO005740-PA;CFLO009017-PA Reactome: R-HSA-177929 Signaling by EGFR 2 CFLO009368-PA;CFLO011086-PA KEGG: 00670+6.3.4.3 One carbon pool by folate 1 CFLO003993-PA MetaCyc: PWY-7999 Vitamin K-epoxide cycle 2 CFLO013131-PA;CFLO004889-PA KEGG: 00511+3.2.1.51 Other glycan degradation 2 CFLO010922-PA;CFLO013233-PA MetaCyc: PWY-6470 Peptidoglycan biosynthesis V (beta-lactam resistance) 2 CFLO008725-PA;CFLO016451-PA Reactome: R-HSA-1222556 ROS and RNS production in phagocytes 16 CFLO007384-PA;CFLO002135-PA;CFLO009916-PA;CFLO018080-PA;CFLO019332-PA;CFLO009346-PA;CFLO010397-PA;CFLO004757-PA;CFLO006711-PA;CFLO015446-PA;CFLO007986-PA;CFLO002131-PA;CFLO006875-PA;CFLO011996-PA;CFLO006081-PA;CFLO003437-PA MetaCyc: PWY-5109 Fermentation to 2-methylbutanoate 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-68949 Orc1 removal from chromatin 59 CFLO004463-PA;CFLO006007-PA;CFLO001064-PA;CFLO010604-PA;CFLO009081-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO012315-PA;CFLO002615-PA;CFLO007718-PA;CFLO005301-PA;CFLO008924-PA;CFLO018658-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO003010-PA;CFLO002304-PA;CFLO000939-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO001095-PA;CFLO009082-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO001098-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO010590-PA;CFLO018836-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO000045-PA;CFLO002602-PA;CFLO004726-PA;CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO001616-PA;CFLO000953-PA;CFLO015230-PA;CFLO002077-PA;CFLO008927-PA;CFLO004457-PA;CFLO010697-PA;CFLO010055-PA;CFLO001338-PA;CFLO003334-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO011518-PA;CFLO014819-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA Reactome: R-HSA-6802953 RAS signaling downstream of NF1 loss-of-function variants 1 CFLO002663-PA Reactome: R-HSA-75105 Fatty acyl-CoA biosynthesis 20 CFLO007341-PA;CFLO014202-PA;CFLO010611-PA;CFLO002013-PA;CFLO000289-PA;CFLO006350-PA;CFLO006349-PA;CFLO016519-PA;CFLO014193-PA;CFLO002012-PA;CFLO010303-PA;CFLO014192-PA;CFLO000435-PA;CFLO001725-PA;CFLO004169-PA;CFLO019654-PA;CFLO001401-PA;CFLO008276-PA;CFLO013378-PA;CFLO011608-PA MetaCyc: PWY-7346 UDP-alpha-D-glucuronate biosynthesis (from UDP-glucose) 1 CFLO003101-PA KEGG: 00780+6.3.4.15 Biotin metabolism 1 CFLO003398-PA MetaCyc: PWY-5394 Betalamic acid biosynthesis 1 CFLO000009-PA KEGG: 00562+5.5.1.4 Inositol phosphate metabolism 2 CFLO017717-PA;CFLO017716-PA Reactome: R-HSA-9023661 Biosynthesis of E-series 18(R)-resolvins 1 CFLO007753-PA Reactome: R-HSA-5578775 Ion homeostasis 14 CFLO017511-PA;CFLO000817-PA;CFLO000818-PA;CFLO004514-PA;CFLO017428-PA;CFLO000810-PA;CFLO017440-PA;CFLO018170-PA;CFLO017592-PA;CFLO006573-PA;CFLO002751-PA;CFLO006575-PA;CFLO002753-PA;CFLO004389-PA MetaCyc: PWY-7746 Mycobacterial sulfolipid biosynthesis 3 CFLO002012-PA;CFLO002013-PA;CFLO016519-PA Reactome: R-HSA-205043 NRIF signals cell death from the nucleus 4 CFLO008212-PA;CFLO015617-PA;CFLO018652-PA;CFLO001428-PA KEGG: 00564+3.1.1.4+3.1.1.5 Glycerophospholipid metabolism 1 CFLO017976-PA KEGG: 00790+3.5.4.16 Folate biosynthesis 1 CFLO002629-PA MetaCyc: PWY-6978 Plastoquinol-9 biosynthesis II 1 CFLO005148-PA KEGG: 00720+1.1.1.37 Carbon fixation pathways in prokaryotes 2 CFLO007214-PA;CFLO018047-PA Reactome: R-HSA-5685938 HDR through Single Strand Annealing (SSA) 24 CFLO008873-PA;CFLO005778-PA;CFLO015680-PA;CFLO000913-PA;CFLO001967-PA;CFLO006346-PA;CFLO003335-PA;CFLO008828-PA;CFLO009733-PA;CFLO004394-PA;CFLO008817-PA;CFLO014613-PA;CFLO010802-PA;CFLO015674-PA;CFLO012555-PA;CFLO008121-PA;CFLO011309-PA;CFLO012323-PA;CFLO005651-PA;CFLO012610-PA;CFLO006542-PA;CFLO001240-PA;CFLO010805-PA;CFLO009875-PA Reactome: R-HSA-1236978 Cross-presentation of soluble exogenous antigens (endosomes) 35 CFLO001064-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO007718-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO004457-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO011518-PA;CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA KEGG: 00620+1.1.1.27 Pyruvate metabolism 1 CFLO007170-PA Reactome: R-HSA-480985 Synthesis of dolichyl-phosphate-glucose 1 CFLO008802-PA Reactome: R-HSA-417973 Adenosine P1 receptors 1 CFLO003153-PA KEGG: 00680+1.1.1.284 Methane metabolism 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-5467337 APC truncation mutants have impaired AXIN binding 3 CFLO007019-PA;CFLO015916-PA;CFLO001327-PA MetaCyc: PWY-8012 Mupirocin biosynthesis 3 CFLO002012-PA;CFLO016519-PA;CFLO002013-PA KEGG: 00511+3.2.1.24 Other glycan degradation 1 CFLO018023-PA Reactome: R-HSA-5693571 Nonhomologous End-Joining (NHEJ) 25 CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO007391-PA;CFLO010805-PA;CFLO016607-PA;CFLO004457-PA;CFLO010821-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO011812-PA;CFLO010841-PA;CFLO008042-PA;CFLO010802-PA;CFLO015674-PA;CFLO011903-PA;CFLO004197-PA;CFLO016316-PA;CFLO007437-PA;CFLO000579-PA;CFLO000386-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO015680-PA;CFLO017458-PA;CFLO017589-PA KEGG: 00940+1.11.1.7 Phenylpropanoid biosynthesis 1 CFLO008216-PA Reactome: R-HSA-351202 Metabolism of polyamines 5 CFLO017572-PA;CFLO013290-PA;CFLO013289-PA;CFLO006589-PA;CFLO006590-PA KEGG: 00053+3.1.1.17 Ascorbate and aldarate metabolism 1 CFLO001701-PA KEGG: 00903+4.2.1.17 Limonene and pinene degradation 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA KEGG: 00603+3.2.1.52 Glycosphingolipid biosynthesis - globo and isoglobo series 8 CFLO006861-PA;CFLO019181-PA;CFLO014190-PA;CFLO005046-PA;CFLO005047-PA;CFLO007240-PA;CFLO018671-PA;CFLO007387-PA Reactome: R-HSA-1482801 Acyl chain remodelling of PS 8 CFLO003207-PA;CFLO005099-PA;CFLO002075-PA;CFLO005379-PA;CFLO013271-PA;CFLO016978-PA;CFLO000557-PA;CFLO006994-PA KEGG: 00480+2.5.1.16 Glutathione metabolism 3 CFLO017572-PA;CFLO013290-PA;CFLO013289-PA KEGG: 00710+3.1.3.11 Carbon fixation in photosynthetic organisms 1 CFLO009994-PA MetaCyc: PWY-5381 Pyridine nucleotide cycling (plants) 6 CFLO006318-PA;CFLO011228-PA;CFLO002055-PA;CFLO006197-PA;CFLO011225-PA;CFLO006198-PA MetaCyc: PWY-7035 (9Z)-tricosene biosynthesis 15 CFLO010625-PA;CFLO010959-PA;CFLO015666-PA;CFLO008779-PA;CFLO010863-PA;CFLO010956-PA;CFLO006701-PA;CFLO007106-PA;CFLO008778-PA;CFLO008781-PA;CFLO008780-PA;CFLO015015-PA;CFLO004004-PA;CFLO010957-PA;CFLO008782-PA Reactome: R-HSA-975634 Retinoid metabolism and transport 10 CFLO005601-PA;CFLO012312-PA;CFLO019853-PA;CFLO011745-PA;CFLO003353-PA;CFLO019476-PA;CFLO017976-PA;CFLO012314-PA;CFLO013499-PA;CFLO002286-PA MetaCyc: PWY-7417 Phospholipid remodeling (phosphatidate, yeast) 14 CFLO011437-PA;CFLO017976-PA;CFLO013271-PA;CFLO016978-PA;CFLO000557-PA;CFLO006994-PA;CFLO014422-PA;CFLO002146-PA;CFLO015620-PA;CFLO003207-PA;CFLO005099-PA;CFLO002075-PA;CFLO011434-PA;CFLO005379-PA MetaCyc: PWY-6700 Queuosine biosynthesis I (de novo) 2 CFLO015628-PA;CFLO015201-PA Reactome: R-HSA-2408557 Selenocysteine synthesis 76 CFLO016302-PA;CFLO010712-PA;CFLO012240-PA;CFLO002329-PA;CFLO002739-PA;CFLO015631-PA;CFLO003320-PA;CFLO012333-PA;CFLO002901-PA;CFLO014026-PA;CFLO013281-PA;CFLO004176-PA;CFLO011221-PA;CFLO010535-PA;CFLO003311-PA;CFLO006768-PA;CFLO005096-PA;CFLO000744-PA;CFLO004405-PA;CFLO016897-PA;CFLO004224-PA;CFLO006483-PA;CFLO008335-PA;CFLO014883-PA;CFLO019287-PA;CFLO004825-PA;CFLO013407-PA;CFLO018839-PA;CFLO013411-PA;CFLO000325-PA;CFLO005822-PA;CFLO009848-PA;CFLO005804-PA;CFLO012297-PA;CFLO000918-PA;CFLO004181-PA;CFLO019663-PA;CFLO017730-PA;CFLO011483-PA;CFLO005709-PA;CFLO017946-PA;CFLO000629-PA;CFLO004325-PA;CFLO000326-PA;CFLO004278-PA;CFLO010962-PA;CFLO012584-PA;CFLO001584-PA;CFLO002568-PA;CFLO008851-PA;CFLO014395-PA;CFLO000349-PA;CFLO010240-PA;CFLO008263-PA;CFLO013848-PA;CFLO009893-PA;CFLO005789-PA;CFLO017942-PA;CFLO001260-PA;CFLO013929-PA;CFLO006630-PA;CFLO000612-PA;CFLO013459-PA;CFLO010554-PA;CFLO004441-PA;CFLO000339-PA;CFLO014117-PA;CFLO003083-PA;CFLO008061-PA;CFLO008228-PA;CFLO018800-PA;CFLO017594-PA;CFLO000889-PA;CFLO005334-PA;CFLO005150-PA;CFLO012596-PA KEGG: 00330+2.7.2.11+1.2.1.41 Arginine and proline metabolism 1 CFLO002293-PA KEGG: 00220+3.5.1.2 Arginine biosynthesis 1 CFLO012576-PA KEGG: 00790+3.1.3.1 Folate biosynthesis 2 CFLO018375-PA;CFLO006125-PA MetaCyc: PWY-7338 10-trans-heptadecenoyl-CoA degradation (reductase-dependent, yeast) 2 CFLO013479-PA;CFLO013638-PA KEGG: 00510+2.4.1.131 N-Glycan biosynthesis 2 CFLO004933-PA;CFLO002826-PA MetaCyc: PWY-5054 D-sorbitol biosynthesis I 1 CFLO019811-PA Reactome: R-HSA-211733 Regulation of activated PAK-2p34 by proteasome mediated degradation 35 CFLO004457-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO014819-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO001095-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO010590-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO000953-PA;CFLO007718-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO002304-PA;CFLO000939-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO001064-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA MetaCyc: PWY-5041 S-adenosyl-L-methionine cycle II 3 CFLO004712-PA;CFLO017970-PA;CFLO014221-PA Reactome: R-HSA-425393 Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides 1 CFLO008786-PA KEGG: 00970+6.1.1.9 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 2 CFLO012249-PA;CFLO000243-PA Reactome: R-HSA-6783984 Glycine degradation 5 CFLO015277-PA;CFLO007134-PA;CFLO000151-PA;CFLO006134-PA;CFLO011294-PA Reactome: R-HSA-9652282 Drug-mediated inhibition of ERBB2 signaling 1 CFLO005384-PA KEGG: 00640+1.8.1.4 Propanoate metabolism 1 CFLO000151-PA Reactome: R-HSA-191273 Cholesterol biosynthesis 5 CFLO012239-PA;CFLO006604-PA;CFLO008710-PA;CFLO002184-PA;CFLO001964-PA KEGG: 00230+4.6.1.2 Purine metabolism 5 CFLO009325-PA;CFLO011010-PA;CFLO005105-PA;CFLO005107-PA;CFLO012007-PA Reactome: R-HSA-2465910 MASTL Facilitates Mitotic Progression 1 CFLO013079-PA Reactome: R-HSA-1614558 Degradation of cysteine and homocysteine 3 CFLO002449-PA;CFLO000824-PA;CFLO011897-PA Reactome: R-HSA-182218 Nef Mediated CD8 Down-regulation 5 CFLO002131-PA;CFLO005139-PA;CFLO002135-PA;CFLO006324-PA;CFLO004757-PA MetaCyc: PWY-7524 Mevalonate pathway III (archaea) 3 CFLO006604-PA;CFLO008710-PA;CFLO006521-PA Reactome: R-HSA-5689901 Metalloprotease DUBs 3 CFLO006206-PA;CFLO011903-PA;CFLO017458-PA KEGG: 00330+4.1.1.50 Arginine and proline metabolism 2 CFLO006590-PA;CFLO006589-PA KEGG: 00010+1.1.1.1 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-5674400 Constitutive Signaling by AKT1 E17K in Cancer 8 CFLO011980-PA;CFLO018008-PA;CFLO014425-PA;CFLO000209-PA;CFLO014421-PA;CFLO007329-PA;CFLO008104-PA;CFLO005536-PA Reactome: R-HSA-4549349 Defective ALG2 causes ALG2-CDG (CDG-1i) 1 CFLO006499-PA KEGG: 00270+3.3.1.1 Cysteine and methionine metabolism 2 CFLO014221-PA;CFLO004712-PA Reactome: R-HSA-181429 Serotonin Neurotransmitter Release Cycle 3 CFLO012708-PA;CFLO012712-PA;CFLO002413-PA KEGG: 00720+4.2.1.2 Carbon fixation pathways in prokaryotes 1 CFLO004684-PA Reactome: R-HSA-390247 Beta-oxidation of very long chain fatty acids 1 CFLO018074-PA MetaCyc: PWY-66 GDP-L-fucose biosynthesis I (from GDP-D-mannose) 1 CFLO002873-PA KEGG: 00230+3.6.1.6 Purine metabolism 2 CFLO010203-PA;CFLO010201-PA MetaCyc: PWY-8052 2-arachidonoylglycerol biosynthesis 8 CFLO008821-PA;CFLO005526-PA;CFLO009620-PA;CFLO000216-PA;CFLO005525-PA;CFLO013725-PA;CFLO001388-PA;CFLO007261-PA Reactome: R-HSA-5689603 UCH proteinases 45 CFLO007156-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO002304-PA;CFLO016472-PA;CFLO007718-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO011804-PA;CFLO000939-PA;CFLO001064-PA;CFLO012808-PA;CFLO005863-PA;CFLO015984-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO012595-PA;CFLO011518-PA;CFLO004457-PA;CFLO003236-PA;CFLO012814-PA;CFLO000566-PA;CFLO014819-PA;CFLO010590-PA;CFLO013619-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO001095-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO000988-PA;CFLO015759-PA;CFLO000953-PA;CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA KEGG: 00520+1.1.1.22 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 1 CFLO003101-PA MetaCyc: PWY-6803 Phosphatidylcholine acyl editing 9 CFLO013271-PA;CFLO017976-PA;CFLO016978-PA;CFLO006994-PA;CFLO000557-PA;CFLO003207-PA;CFLO005379-PA;CFLO005099-PA;CFLO002075-PA MetaCyc: PWY-8010 L-cysteine biosynthesis IX (Trichomonas vaginalis) 1 CFLO003969-PA Reactome: R-HSA-1296061 HCN channels 1 CFLO002381-PA KEGG: 00760+2.3.1.286 Nicotinate and nicotinamide metabolism 6 CFLO009005-PA;CFLO005378-PA;CFLO001583-PA;CFLO013994-PA;CFLO000981-PA;CFLO017593-PA Reactome: R-HSA-186797 Signaling by PDGF 2 CFLO004232-PA;CFLO012358-PA KEGG: 00040+2.7.1.17 Pentose and glucuronate interconversions 1 CFLO001808-PA Reactome: R-HSA-5357905 Regulation of TNFR1 signaling 2 CFLO013134-PA;CFLO000640-PA Reactome: R-HSA-2022854 Keratan sulfate biosynthesis 2 CFLO014412-PA;CFLO007738-PA Reactome: R-HSA-174084 Autodegradation of Cdh1 by Cdh1:APC/C 40 CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO007718-PA;CFLO010492-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO005584-PA;CFLO006593-PA;CFLO012167-PA;CFLO012372-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO009576-PA;CFLO001064-PA;CFLO007015-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO007123-PA;CFLO000953-PA;CFLO001568-PA;CFLO006211-PA;CFLO014805-PA;CFLO006992-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO001095-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA Reactome: R-HSA-8939247 RUNX1 regulates transcription of genes involved in interleukin signaling 2 CFLO007361-PA;CFLO007362-PA MetaCyc: PWY-5844 Menaquinol-9 biosynthesis 1 CFLO018555-PA MetaCyc: PWY-8040 Ansatrienin biosynthesis 1 CFLO003043-PA KEGG: 00062+4.2.1.17+1.1.1.35 Fatty acid elongation 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA KEGG: 00562+2.7.1.137 Inositol phosphate metabolism 1 CFLO008697-PA MetaCyc: PWY-7587 Oleate biosynthesis III (cyanobacteria) 7 CFLO011437-PA;CFLO015620-PA;CFLO004213-PA;CFLO011434-PA;CFLO014422-PA;CFLO007382-PA;CFLO002146-PA KEGG: 00564+1.1.1.94 Glycerophospholipid metabolism 3 CFLO006857-PA;CFLO006892-PA;CFLO006890-PA KEGG: 00330+3.5.3.1 Arginine and proline metabolism 1 CFLO004683-PA MetaCyc: PWY-5469 Sesamin biosynthesis 1 CFLO008216-PA MetaCyc: PWY-5664 Erythro-tetrahydrobiopterin biosynthesis II 2 CFLO011963-PA;CFLO002629-PA Reactome: R-HSA-6785631 ERBB2 Regulates Cell Motility 2 CFLO012016-PA;CFLO009698-PA Reactome: R-HSA-73614 Pyrimidine salvage 4 CFLO009649-PA;CFLO018007-PA;CFLO000970-PA;CFLO003449-PA KEGG: 00860+4.2.1.75 Porphyrin and chlorophyll metabolism 1 CFLO009885-PA KEGG: 00770+2.7.8.7 Pantothenate and CoA biosynthesis 1 CFLO000719-PA MetaCyc: PWY-5921 Glutaminyl-trnagln biosynthesis via transamidation 1 CFLO012576-PA MetaCyc: PWY-6823 Molybdenum cofactor biosynthesis 2 CFLO000312-PA;CFLO011045-PA Reactome: R-HSA-8949215 Mitochondrial calcium ion transport 2 CFLO004894-PA;CFLO003456-PA MetaCyc: PWY-7210 Pyrimidine deoxyribonucleotides biosynthesis from CTP 13 CFLO015574-PA;CFLO000684-PA;CFLO005692-PA;CFLO001680-PA;CFLO012552-PA;CFLO010201-PA;CFLO012591-PA;CFLO000685-PA;CFLO005088-PA;CFLO005098-PA;CFLO010203-PA;CFLO010539-PA;CFLO014417-PA Reactome: R-HSA-9665251 Resistance of ERBB2 KD mutants to lapatinib 1 CFLO005384-PA Reactome: R-HSA-5619061 Defective SLC33A1 causes spastic paraplegia 42 (SPG42) 1 CFLO001115-PA KEGG: 00531+3.1.6.14 Glycosaminoglycan degradation 1 CFLO000660-PA KEGG: 00592+3.1.1.4 alpha-Linolenic acid metabolism 9 CFLO006994-PA;CFLO000557-PA;CFLO016978-PA;CFLO017976-PA;CFLO013271-PA;CFLO005379-PA;CFLO002075-PA;CFLO005099-PA;CFLO003207-PA KEGG: 00533+2.4.1.68 Glycosaminoglycan biosynthesis - keratan sulfate 1 CFLO015339-PA Reactome: R-HSA-5693554 Resolution of D-loop Structures through Synthesis-Dependent Strand Annealing (SDSA) 16 CFLO012610-PA;CFLO005651-PA;CFLO005586-PA;CFLO010805-PA;CFLO001240-PA;CFLO002907-PA;CFLO006542-PA;CFLO001967-PA;CFLO015680-PA;CFLO005778-PA;CFLO008873-PA;CFLO009626-PA;CFLO010802-PA;CFLO015674-PA;CFLO014613-PA;CFLO013974-PA Reactome: R-HSA-8963693 Aspartate and asparagine metabolism 2 CFLO001491-PA;CFLO000043-PA MetaCyc: PWY-6289 Petrobactin biosynthesis 1 CFLO000719-PA KEGG: 00071+1.3.3.6 Fatty acid degradation 2 CFLO013638-PA;CFLO013479-PA KEGG: 00380+1.11.1.6 Tryptophan metabolism 1 CFLO003960-PA Reactome: R-HSA-5601884 PIWI-interacting RNA (piRNA) biogenesis 7 CFLO014021-PA;CFLO007012-PA;CFLO015637-PA;CFLO004196-PA;CFLO004557-PA;CFLO010911-PA;CFLO004556-PA KEGG: 00190+7.1.1.8 Oxidative phosphorylation 1 CFLO007517-PA KEGG: 00561+2.7.1.107 Glycerolipid metabolism 6 CFLO006116-PA;CFLO006115-PA;CFLO006114-PA;CFLO001719-PA;CFLO010224-PA;CFLO016462-PA MetaCyc: PWY-7803 Trna splicing II 3 CFLO006585-PA;CFLO002797-PA;CFLO001248-PA MetaCyc: PWY-7725 Arachidonate biosynthesis V (8-detaturase, mammals) 15 CFLO008782-PA;CFLO010957-PA;CFLO008780-PA;CFLO004004-PA;CFLO015015-PA;CFLO006701-PA;CFLO008778-PA;CFLO008781-PA;CFLO007106-PA;CFLO010625-PA;CFLO015666-PA;CFLO010959-PA;CFLO010956-PA;CFLO010863-PA;CFLO008779-PA MetaCyc: PWY-6611 Adenine and adenosine salvage V 3 CFLO016529-PA;CFLO012580-PA;CFLO012573-PA KEGG: 00130+2.6.1.5 Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis 1 CFLO012357-PA MetaCyc: PWY-5913 Partial TCA cycle (obligate autotrophs) 10 CFLO007214-PA;CFLO005915-PA;CFLO009985-PA;CFLO001710-PA;CFLO004684-PA;CFLO000623-PA;CFLO018047-PA;CFLO004169-PA;CFLO008726-PA;CFLO003306-PA KEGG: 00532+2.4.2.26 Glycosaminoglycan biosynthesis - chondroitin sulfate / dermatan sulfate 1 CFLO015250-PA Reactome: R-HSA-3000471 Scavenging by Class B Receptors 3 CFLO019853-PA;CFLO011745-PA;CFLO002286-PA Reactome: R-HSA-77348 Beta oxidation of octanoyl-CoA to hexanoyl-CoA 1 CFLO011836-PA KEGG: 00230+6.3.3.1 Purine metabolism 1 CFLO019130-PA Reactome: R-HSA-1834941 STING mediated induction of host immune responses 1 CFLO003723-PA KEGG: 00770+6.3.2.5 Pantothenate and CoA biosynthesis 1 CFLO017130-PA KEGG: 00983+1.1.1.205 Drug metabolism - other enzymes 1 CFLO004073-PA MetaCyc: PWY-6886 1-butanol autotrophic biosynthesis (engineered) 4 CFLO003967-PA;CFLO015634-PA;CFLO016901-PA;CFLO009597-PA KEGG: 00401+2.6.1.5 Novobiocin biosynthesis 1 CFLO012357-PA MetaCyc: PWY-5739 GDP-D-perosamine biosynthesis 1 CFLO002873-PA KEGG: 00270+2.6.1.5 Cysteine and methionine metabolism 1 CFLO012357-PA KEGG: 00860+2.5.1.141 Porphyrin and chlorophyll metabolism 1 CFLO013489-PA Reactome: R-HSA-3304356 SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer 1 CFLO002284-PA MetaCyc: PWY-7117 C4 photosynthetic carbon assimilation cycle, PEPCK type 4 CFLO016169-PA;CFLO000623-PA;CFLO003306-PA;CFLO003089-PA MetaCyc: PWY-5981 CDP-diacylglycerol biosynthesis III 10 CFLO011437-PA;CFLO006857-PA;CFLO019403-PA;CFLO014422-PA;CFLO002146-PA;CFLO015620-PA;CFLO006890-PA;CFLO006892-PA;CFLO011434-PA;CFLO006541-PA Reactome: R-HSA-3214841 PKMTs methylate histone lysines 28 CFLO010821-PA;CFLO004788-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO002689-PA;CFLO018760-PA;CFLO018847-PA;CFLO004334-PA;CFLO004416-PA;CFLO007368-PA;CFLO003342-PA;CFLO007408-PA;CFLO009868-PA;CFLO018761-PA;CFLO007391-PA;CFLO010558-PA;CFLO007195-PA;CFLO018747-PA;CFLO007437-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO016512-PA;CFLO018848-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO011812-PA;CFLO013278-PA;CFLO000021-PA Reactome: R-HSA-8875360 InlB-mediated entry of Listeria monocytogenes into host cell 1 CFLO014328-PA Reactome: R-HSA-8939243 RUNX1 interacts with co-factors whose precise effect on RUNX1 targets is not known 13 CFLO016551-PA;CFLO003187-PA;CFLO005853-PA;CFLO007084-PA;CFLO016944-PA;CFLO013488-PA;CFLO007362-PA;CFLO007690-PA;CFLO011254-PA;CFLO007361-PA;CFLO008797-PA;CFLO013292-PA;CFLO004577-PA Reactome: R-HSA-8939211 ESR-mediated signaling 1 CFLO013244-PA KEGG: 00040+2.7.7.9 Pentose and glucuronate interconversions 1 CFLO009992-PA KEGG: 00250+3.5.1.2 Alanine, aspartate and glutamate metabolism 1 CFLO012576-PA KEGG: 00970+6.1.1.3 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 5 CFLO008877-PA;CFLO017347-PA;CFLO019675-PA;CFLO007032-PA;CFLO013498-PA KEGG: 00790+6.3.2.17 Folate biosynthesis 1 CFLO000972-PA Reactome: R-HSA-3065676 SUMO is conjugated to E1 (UBA2:SAE1) 1 CFLO016531-PA KEGG: 00680+3.1.2.12 Methane metabolism 1 CFLO000622-PA KEGG: 00190+3.6.1.1 Oxidative phosphorylation 2 CFLO004939-PA;CFLO016830-PA Reactome: R-HSA-5579006 Defective GSS causes Glutathione synthetase deficiency (GSS deficiency) 1 CFLO002150-PA Reactome: R-HSA-174414 Processive synthesis on the C-strand of the telomere 4 CFLO013771-PA;CFLO008680-PA;CFLO003314-PA;CFLO011911-PA Reactome: R-HSA-427359 SIRT1 negatively regulates rRNA expression 13 CFLO007437-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO010821-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO007408-PA;CFLO011812-PA;CFLO007368-PA;CFLO007391-PA;CFLO004197-PA;CFLO002713-PA;CFLO008042-PA Reactome: R-HSA-8849175 Threonine catabolism 2 CFLO012225-PA;CFLO002420-PA Reactome: R-HSA-2160916 Hyaluronan uptake and degradation 8 CFLO003984-PA;CFLO012387-PA;CFLO007240-PA;CFLO005047-PA;CFLO005046-PA;CFLO014190-PA;CFLO019181-PA;CFLO007387-PA Reactome: R-HSA-426117 Cation-coupled Chloride cotransporters 5 CFLO015640-PA;CFLO000050-PA;CFLO007516-PA;CFLO001445-PA;CFLO001255-PA KEGG: 00362+4.2.1.17+1.1.1.35 Benzoate degradation 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-429947 Deadenylation of mRNA 8 CFLO010912-PA;CFLO010048-PA;CFLO010235-PA;CFLO011315-PA;CFLO016927-PA;CFLO005867-PA;CFLO001927-PA;CFLO010829-PA MetaCyc: PWY-7805 (aminomethyl)phosphonate degradation 3 CFLO016830-PA;CFLO000881-PA;CFLO004939-PA MetaCyc: PWY-7602 Icosapentaenoate biosynthesis V (8-desaturase, lower eukaryotes) 15 CFLO010956-PA;CFLO008779-PA;CFLO010863-PA;CFLO015666-PA;CFLO010625-PA;CFLO010959-PA;CFLO008781-PA;CFLO008778-PA;CFLO007106-PA;CFLO006701-PA;CFLO015015-PA;CFLO004004-PA;CFLO008780-PA;CFLO008782-PA;CFLO010957-PA Reactome: R-HSA-8941858 Regulation of RUNX3 expression and activity 34 CFLO007361-PA;CFLO007718-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO002304-PA;CFLO000939-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO001064-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO015984-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO007362-PA;CFLO011518-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO014819-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO001095-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO010590-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000953-PA Reactome: R-HSA-196299 Beta-catenin phosphorylation cascade 3 CFLO007019-PA;CFLO015916-PA;CFLO001327-PA KEGG: 00720+4.2.1.3 Carbon fixation pathways in prokaryotes 2 CFLO013824-PA;CFLO007267-PA Reactome: R-HSA-1433557 Signaling by SCF-KIT 2 CFLO005740-PA;CFLO009366-PA Reactome: R-HSA-6803205 TP53 regulates transcription of several additional cell death genes whose specific roles in p53-dependent apoptosis remain uncertain 2 CFLO006104-PA;CFLO003171-PA Reactome: R-HSA-416993 Trafficking of GluR2-containing AMPA receptors 3 CFLO001501-PA;CFLO006324-PA;CFLO005139-PA Reactome: R-HSA-110357 Displacement of DNA glycosylase by APEX1 6 CFLO009850-PA;CFLO000698-PA;CFLO017341-PA;CFLO013757-PA;CFLO003212-PA;CFLO013426-PA KEGG: 00250+1.4.1.14 Alanine, aspartate and glutamate metabolism 1 CFLO014447-PA MetaCyc: PWY-7294 D-xylose degradation IV 1 CFLO010827-PA Reactome: R-HSA-71064 Lysine catabolism 4 CFLO015979-PA;CFLO014236-PA;CFLO000151-PA;CFLO015982-PA KEGG: 00071+4.2.1.17+1.1.1.211 Fatty acid degradation 1 CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-74749 Signal attenuation 1 CFLO013244-PA KEGG: 00620+4.2.1.2 Pyruvate metabolism 1 CFLO004684-PA MetaCyc: PWY-7836 Ganglio-series glycosphingolipids biosynthesis 1 CFLO006369-PA Reactome: R-HSA-6783310 Fanconi Anemia Pathway 48 CFLO005541-PA;CFLO018796-PA;CFLO014309-PA;CFLO004583-PA;CFLO013892-PA;CFLO000816-PA;CFLO008918-PA;CFLO019183-PA;CFLO017809-PA;CFLO017870-PA;CFLO016103-PA;CFLO004394-PA;CFLO006346-PA;CFLO014509-PA;CFLO003335-PA;CFLO005072-PA;CFLO016389-PA;CFLO008828-PA;CFLO012234-PA;CFLO005130-PA;CFLO011862-PA;CFLO016878-PA;CFLO003951-PA;CFLO017709-PA;CFLO009443-PA;CFLO018808-PA;CFLO014040-PA;CFLO019085-PA;CFLO015600-PA;CFLO000759-PA;CFLO011645-PA;CFLO013369-PA;CFLO012518-PA;CFLO019709-PA;CFLO017422-PA;CFLO019047-PA;CFLO009542-PA;CFLO009733-PA;CFLO006013-PA;CFLO000982-PA;CFLO010261-PA;CFLO001598-PA;CFLO003575-PA;CFLO016880-PA;CFLO006019-PA;CFLO003772-PA;CFLO016646-PA;CFLO019633-PA Reactome: R-HSA-5663220 RHO GTPases Activate Formins 39 CFLO008232-PA;CFLO010396-PA;CFLO017731-PA;CFLO001592-PA;CFLO008775-PA;CFLO012319-PA;CFLO004179-PA;CFLO007512-PA;CFLO008841-PA;CFLO014832-PA;CFLO015916-PA;CFLO002998-PA;CFLO016852-PA;CFLO012487-PA;CFLO015008-PA;CFLO000525-PA;CFLO002905-PA;CFLO001646-PA;CFLO005173-PA;CFLO008224-PA;CFLO002880-PA;CFLO008226-PA;CFLO014829-PA;CFLO014186-PA;CFLO013646-PA;CFLO012217-PA;CFLO003075-PA;CFLO001242-PA;CFLO001327-PA;CFLO013088-PA;CFLO012124-PA;CFLO002636-PA;CFLO014833-PA;CFLO014329-PA;CFLO006290-PA;CFLO000598-PA;CFLO006561-PA;CFLO003172-PA;CFLO009841-PA Reactome: R-HSA-5467333 APC truncation mutants are not K63 polyubiquitinated 1 CFLO007019-PA KEGG: 00230+4.6.1.1 Purine metabolism 5 CFLO013990-PA;CFLO019116-PA;CFLO008619-PA;CFLO015242-PA;CFLO008792-PA KEGG: 00750+1.4.3.5 Vitamin B6 metabolism 2 CFLO004155-PA;CFLO015233-PA MetaCyc: PWY-5890 Menaquinol-10 biosynthesis 1 CFLO018555-PA Reactome: R-HSA-9665244 Resistance of ERBB2 KD mutants to sapitinib 1 CFLO005384-PA KEGG: 00564+2.7.8.11 Glycerophospholipid metabolism 1 CFLO000498-PA KEGG: 00480+1.1.1.49 Glutathione metabolism 3 CFLO008606-PA;CFLO014828-PA;CFLO008875-PA MetaCyc: PWY-5963 Thio-molybdenum cofactor biosynthesis 1 CFLO003369-PA KEGG: 00330+1.5.5.2 Arginine and proline metabolism 1 CFLO017737-PA Reactome: R-HSA-936837 Ion transport by P-type ATPases 25 CFLO008807-PA;CFLO012165-PA;CFLO005667-PA;CFLO004382-PA;CFLO006633-PA;CFLO018892-PA;CFLO004379-PA;CFLO001538-PA;CFLO004485-PA;CFLO001509-PA;CFLO004514-PA;CFLO019135-PA;CFLO004165-PA;CFLO004026-PA;CFLO005590-PA;CFLO017592-PA;CFLO004381-PA;CFLO012978-PA;CFLO004027-PA;CFLO004389-PA;CFLO004380-PA;CFLO001560-PA;CFLO005593-PA;CFLO005594-PA;CFLO002280-PA KEGG: 00380+1.14.16.4 Tryptophan metabolism 1 CFLO004689-PA Reactome: R-HSA-71403 Citric acid cycle (TCA cycle) 24 CFLO013472-PA;CFLO013824-PA;CFLO009887-PA;CFLO003011-PA;CFLO004930-PA;CFLO018699-PA;CFLO015982-PA;CFLO000484-PA;CFLO008726-PA;CFLO001710-PA;CFLO004684-PA;CFLO009985-PA;CFLO018693-PA;CFLO000151-PA;CFLO015979-PA;CFLO005915-PA;CFLO007190-PA;CFLO012554-PA;CFLO002830-PA;CFLO004169-PA;CFLO006431-PA;CFLO011401-PA;CFLO018543-PA;CFLO018047-PA KEGG: 00680+2.7.1.11 Methane metabolism 1 CFLO000222-PA Reactome: R-HSA-3232142 SUMOylation of ubiquitinylation proteins 22 CFLO004815-PA;CFLO005636-PA;CFLO004819-PA;CFLO010441-PA;CFLO014829-PA;CFLO012747-PA;CFLO008090-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO005894-PA;CFLO014832-PA;CFLO004818-PA;CFLO000572-PA;CFLO005698-PA;CFLO008087-PA;CFLO013550-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO014833-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO012487-PA KEGG: 00860+1.16.3.1 Porphyrin and chlorophyll metabolism 1 CFLO001382-PA KEGG: 00627+4.2.1.17 Aminobenzoate degradation 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-3656237 Defective EXT2 causes exostoses 2 5 CFLO013499-PA;CFLO012312-PA;CFLO012314-PA;CFLO019476-PA;CFLO005601-PA Reactome: R-HSA-5654712 FRS-mediated FGFR4 signaling 1 CFLO001520-PA Reactome: R-HSA-156590 Glutathione conjugation 4 CFLO008203-PA;CFLO011048-PA;CFLO008220-PA;CFLO000622-PA Reactome: R-HSA-6804756 Regulation of TP53 Activity through Phosphorylation 37 CFLO000074-PA;CFLO015169-PA;CFLO005778-PA;CFLO005811-PA;CFLO001967-PA;CFLO015380-PA;CFLO003054-PA;CFLO015680-PA;CFLO009016-PA;CFLO004394-PA;CFLO003187-PA;CFLO006346-PA;CFLO008828-PA;CFLO010802-PA;CFLO008817-PA;CFLO014613-PA;CFLO012555-PA;CFLO018025-PA;CFLO012610-PA;CFLO008121-PA;CFLO011309-PA;CFLO014993-PA;CFLO010805-PA;CFLO006542-PA;CFLO011961-PA;CFLO008873-PA;CFLO000913-PA;CFLO009733-PA;CFLO000994-PA;CFLO015674-PA;CFLO001098-PA;CFLO012097-PA;CFLO012323-PA;CFLO005651-PA;CFLO008336-PA;CFLO019377-PA;CFLO012113-PA MetaCyc: PWY-7838 Globo-series glycosphingolipids biosynthesis 1 CFLO006369-PA Reactome: R-HSA-73779 RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening 26 CFLO001309-PA;CFLO010322-PA;CFLO012515-PA;CFLO009087-PA;CFLO004196-PA;CFLO007118-PA;CFLO006370-PA;CFLO006247-PA;CFLO011191-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO015637-PA;CFLO003054-PA;CFLO000007-PA;CFLO010911-PA;CFLO001312-PA;CFLO015169-PA;CFLO000074-PA;CFLO007012-PA;CFLO006498-PA;CFLO007113-PA;CFLO019592-PA;CFLO012113-PA;CFLO019377-PA;CFLO012310-PA;CFLO008336-PA Reactome: R-HSA-5696395 Formation of Incision Complex in GG-NER 18 CFLO007399-PA;CFLO006247-PA;CFLO011191-PA;CFLO009733-PA;CFLO008828-PA;CFLO006346-PA;CFLO003335-PA;CFLO006370-PA;CFLO010322-PA;CFLO012515-PA;CFLO009087-PA;CFLO000937-PA;CFLO012226-PA;CFLO000294-PA;CFLO006603-PA;CFLO016589-PA;CFLO012310-PA;CFLO018666-PA MetaCyc: PWY-6854 Ethylene biosynthesis III (microbes) 4 CFLO014367-PA;CFLO003046-PA;CFLO016842-PA;CFLO001118-PA Reactome: R-HSA-196780 Biotin transport and metabolism 12 CFLO009772-PA;CFLO003580-PA;CFLO003574-PA;CFLO009775-PA;CFLO018148-PA;CFLO015688-PA;CFLO015687-PA;CFLO008550-PA;CFLO003398-PA;CFLO015478-PA;CFLO005702-PA;CFLO019131-PA MetaCyc: PWY-7177 UTP and CTP dephosphorylation II 1 CFLO000638-PA MetaCyc: PWY-2201 Folate transformations I 6 CFLO014967-PA;CFLO004433-PA;CFLO013394-PA;CFLO001271-PA;CFLO003993-PA;CFLO010087-PA Reactome: R-HSA-9639288 Amino acids regulate mTORC1 28 CFLO006046-PA;CFLO018080-PA;CFLO009916-PA;CFLO015160-PA;CFLO019332-PA;CFLO000893-PA;CFLO004757-PA;CFLO009346-PA;CFLO018008-PA;CFLO007384-PA;CFLO004711-PA;CFLO015017-PA;CFLO002135-PA;CFLO000302-PA;CFLO002131-PA;CFLO006347-PA;CFLO006081-PA;CFLO005629-PA;CFLO011996-PA;CFLO003088-PA;CFLO001934-PA;CFLO006502-PA;CFLO005807-PA;CFLO003386-PA;CFLO008825-PA;CFLO006599-PA;CFLO006711-PA;CFLO007986-PA Reactome: R-HSA-450408 AUF1 (hnRNP D0) binds and destabilizes mRNA 35 CFLO004457-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO001095-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO007718-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO001064-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA Reactome: R-HSA-8948216 Collagen chain trimerization 3 CFLO018020-PA;CFLO012358-PA;CFLO016374-PA Reactome: R-HSA-9634635 Estrogen-stimulated signaling through PRKCZ 1 CFLO008104-PA Reactome: R-HSA-3359473 Defective MMADHC causes methylmalonic aciduria and homocystinuria type cblD 1 CFLO005722-PA Reactome: R-HSA-69017 CDK-mediated phosphorylation and removal of Cdc6 45 CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO004457-PA;CFLO002077-PA;CFLO007015-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO006992-PA;CFLO010590-PA;CFLO001098-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO015469-PA;CFLO001095-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO000953-PA;CFLO007123-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO006211-PA;CFLO014805-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO007718-PA;CFLO010492-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO009576-PA;CFLO001064-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO005584-PA;CFLO006593-PA;CFLO012167-PA;CFLO012372-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA MetaCyc: PWY-7852 6-hydroxymethyl-dihydropterin diphosphate biosynthesis IV (Plasmodium) 1 CFLO002629-PA Reactome: R-HSA-5362517 Signaling by Retinoic Acid 3 CFLO013555-PA;CFLO000151-PA;CFLO011080-PA Reactome: R-HSA-190840 Microtubule-dependent trafficking of connexons from Golgi to the plasma membrane 8 CFLO001242-PA;CFLO009841-PA;CFLO006561-PA;CFLO014186-PA;CFLO016852-PA;CFLO008841-PA;CFLO002905-PA;CFLO004179-PA KEGG: 00010+5.4.2.11 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO007423-PA Reactome: R-HSA-69166 Removal of the Flap Intermediate 14 CFLO004549-PA;CFLO011911-PA;CFLO009733-PA;CFLO002987-PA;CFLO003314-PA;CFLO006346-PA;CFLO015227-PA;CFLO008828-PA;CFLO001967-PA;CFLO001238-PA;CFLO013771-PA;CFLO008680-PA;CFLO007147-PA;CFLO012204-PA Reactome: R-HSA-1799339 SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane 96 CFLO010554-PA;CFLO013929-PA;CFLO016413-PA;CFLO006630-PA;CFLO002192-PA;CFLO000612-PA;CFLO013459-PA;CFLO017942-PA;CFLO005789-PA;CFLO001260-PA;CFLO010240-PA;CFLO000349-PA;CFLO008263-PA;CFLO013848-PA;CFLO000889-PA;CFLO005334-PA;CFLO005150-PA;CFLO012596-PA;CFLO001978-PA;CFLO005916-PA;CFLO008061-PA;CFLO008228-PA;CFLO017594-PA;CFLO018800-PA;CFLO006606-PA;CFLO004441-PA;CFLO000339-PA;CFLO018775-PA;CFLO014117-PA;CFLO003083-PA;CFLO004181-PA;CFLO019663-PA;CFLO008291-PA;CFLO015341-PA;CFLO012297-PA;CFLO006991-PA;CFLO000918-PA;CFLO003325-PA;CFLO005822-PA;CFLO000325-PA;CFLO009848-PA;CFLO005804-PA;CFLO001584-PA;CFLO002568-PA;CFLO008851-PA;CFLO014395-PA;CFLO012332-PA;CFLO004325-PA;CFLO004278-PA;CFLO000326-PA;CFLO012584-PA;CFLO010962-PA;CFLO017946-PA;CFLO000629-PA;CFLO017730-PA;CFLO011483-PA;CFLO005709-PA;CFLO005096-PA;CFLO000744-PA;CFLO004405-PA;CFLO016897-PA;CFLO003678-PA;CFLO006768-PA;CFLO008280-PA;CFLO009884-PA;CFLO004154-PA;CFLO013407-PA;CFLO018839-PA;CFLO013411-PA;CFLO004825-PA;CFLO008115-PA;CFLO019287-PA;CFLO014883-PA;CFLO013862-PA;CFLO004224-PA;CFLO006680-PA;CFLO008335-PA;CFLO006483-PA;CFLO002901-PA;CFLO014026-PA;CFLO012240-PA;CFLO006254-PA;CFLO002329-PA;CFLO002739-PA;CFLO015631-PA;CFLO003320-PA;CFLO012333-PA;CFLO010712-PA;CFLO016302-PA;CFLO010535-PA;CFLO003311-PA;CFLO011221-PA;CFLO016168-PA;CFLO004176-PA;CFLO011084-PA;CFLO013281-PA Reactome: R-HSA-162588 Budding and maturation of HIV virion 6 CFLO018740-PA;CFLO013467-PA;CFLO004473-PA;CFLO009636-PA;CFLO012133-PA;CFLO013092-PA Reactome: R-HSA-5610787 Hedgehog 'off' state 9 CFLO013727-PA;CFLO008619-PA;CFLO005641-PA;CFLO015242-PA;CFLO015432-PA;CFLO002997-PA;CFLO003136-PA;CFLO019116-PA;CFLO008792-PA KEGG: 00350+2.6.1.1 Tyrosine metabolism 2 CFLO000623-PA;CFLO003306-PA Reactome: R-HSA-156842 Eukaryotic Translation Elongation 4 CFLO001021-PA;CFLO008625-PA;CFLO006243-PA;CFLO008180-PA MetaCyc: PWY-7112 4-hydroxy-2-nonenal detoxification 5 CFLO000936-PA;CFLO007834-PA;CFLO008220-PA;CFLO000938-PA;CFLO008203-PA MetaCyc: PWY-7401 Crotonate fermentation (to acetate and cyclohexane carboxylate) 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA Reactome: R-HSA-428543 Inactivation of CDC42 and RAC1 1 CFLO005173-PA MetaCyc: PWY-6313 Serotonin degradation 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-113507 E2F-enabled inhibition of pre-replication complex formation 7 CFLO018836-PA;CFLO003334-PA;CFLO010055-PA;CFLO010697-PA;CFLO004726-PA;CFLO002602-PA;CFLO004463-PA MetaCyc: PWY-6124 Inosine-5'-phosphate biosynthesis II 4 CFLO017671-PA;CFLO013827-PA;CFLO015327-PA;CFLO004460-PA MetaCyc: PWY-7546 Diphthamide biosynthesis II (eukaryotes) 3 CFLO002420-PA;CFLO007609-PA;CFLO003316-PA Reactome: R-HSA-381042 PERK regulates gene expression 2 CFLO004492-PA;CFLO017947-PA Reactome: R-HSA-216083 Integrin cell surface interactions 14 CFLO006631-PA;CFLO004922-PA;CFLO013485-PA;CFLO012685-PA;CFLO008289-PA;CFLO013484-PA;CFLO012358-PA;CFLO001842-PA;CFLO004921-PA;CFLO012695-PA;CFLO006618-PA;CFLO008246-PA;CFLO012686-PA;CFLO004920-PA Reactome: R-HSA-264642 Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle 1 CFLO002413-PA KEGG: 00680+2.1.2.1 Methane metabolism 2 CFLO014967-PA;CFLO010087-PA Reactome: R-HSA-2559580 Oxidative Stress Induced Senescence 19 CFLO014527-PA;CFLO007391-PA;CFLO007408-PA;CFLO007368-PA;CFLO014413-PA;CFLO013244-PA;CFLO000259-PA;CFLO013292-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO005758-PA;CFLO010821-PA;CFLO011812-PA;CFLO004197-PA;CFLO008042-PA;CFLO016512-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO007437-PA Reactome: R-HSA-1855231 Synthesis of IPs in the ER lumen 1 CFLO005656-PA Reactome: R-HSA-3270619 IRF3-mediated induction of type I IFN 7 CFLO010805-PA;CFLO010841-PA;CFLO016607-PA;CFLO000579-PA;CFLO010802-PA;CFLO017589-PA;CFLO003723-PA Reactome: R-HSA-140342 Apoptosis induced DNA fragmentation 1 CFLO008783-PA KEGG: 00930+4.2.1.17 Caprolactam degradation 1 CFLO011836-PA KEGG: 00970+6.1.1.21 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 1 CFLO000362-PA MetaCyc: PWY-6859 All-trans-farnesol biosynthesis 1 CFLO008710-PA KEGG: 00195+7.1.2.2 Photosynthesis 6 CFLO006081-PA;CFLO017030-PA;CFLO017029-PA;CFLO012495-PA;CFLO017035-PA;CFLO007384-PA Reactome: R-HSA-193692 Regulated proteolysis of p75NTR 4 CFLO015617-PA;CFLO001428-PA;CFLO009368-PA;CFLO008212-PA Reactome: R-HSA-450604 KSRP (KHSRP) binds and destabilizes mRNA 12 CFLO006571-PA;CFLO005696-PA;CFLO005867-PA;CFLO011214-PA;CFLO010929-PA;CFLO015909-PA;CFLO018054-PA;CFLO015655-PA;CFLO009644-PA;CFLO001443-PA;CFLO006212-PA;CFLO019015-PA Reactome: R-HSA-2426168 Activation of gene expression by SREBF (SREBP) 12 CFLO005702-PA;CFLO002012-PA;CFLO002013-PA;CFLO001964-PA;CFLO013084-PA;CFLO006604-PA;CFLO006718-PA;CFLO016506-PA;CFLO019654-PA;CFLO016519-PA;CFLO008860-PA;CFLO012239-PA MetaCyc: PWY-7344 UDP-alpha-D-galactose biosynthesis 2 CFLO001267-PA;CFLO006591-PA KEGG: 00500+2.4.1.1 Starch and sucrose metabolism 1 CFLO001588-PA Reactome: R-HSA-5627123 RHO GTPases activate PAKs 1 CFLO005173-PA Reactome: R-HSA-4655427 SUMOylation of DNA methylation proteins 4 CFLO018793-PA;CFLO006881-PA;CFLO013421-PA;CFLO014404-PA MetaCyc: PWY-7996 Menaquinol-4 biosynthesis I 1 CFLO018555-PA KEGG: 00513+2.4.1.68 Various types of N-glycan biosynthesis 1 CFLO015339-PA MetaCyc: PWY-5971 Palmitate biosynthesis II (bacteria and plant cytoplasm) 3 CFLO016519-PA;CFLO002013-PA;CFLO002012-PA Reactome: R-HSA-203754 NOSIP mediated eNOS trafficking 1 CFLO015185-PA Reactome: R-HSA-77588 SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs 6 CFLO013795-PA;CFLO007400-PA;CFLO004326-PA;CFLO013992-PA;CFLO013907-PA;CFLO010491-PA Reactome: R-HSA-435368 Zinc efflux and compartmentalization by the SLC30 family 2 CFLO018068-PA;CFLO000501-PA Reactome: R-HSA-5576894 Phase 1 - inactivation of fast Na+ channels 2 CFLO014183-PA;CFLO014181-PA Reactome: R-HSA-3928662 EPHB-mediated forward signaling 7 CFLO008854-PA;CFLO003326-PA;CFLO006587-PA;CFLO012666-PA;CFLO013930-PA;CFLO005173-PA;CFLO010318-PA Reactome: R-HSA-1237112 Methionine salvage pathway 5 CFLO001681-PA;CFLO002725-PA;CFLO019081-PA;CFLO006143-PA;CFLO008721-PA MetaCyc: PWY-6840 Homoglutathione biosynthesis 1 CFLO011825-PA KEGG: 00010+2.3.1.12 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO013555-PA KEGG: 00720+1.3.5.1 Carbon fixation pathways in prokaryotes 2 CFLO006431-PA;CFLO013472-PA Reactome: R-HSA-1566948 Elastic fibre formation 1 CFLO004646-PA Reactome: R-HSA-110320 Translesion Synthesis by POLH 18 CFLO002994-PA;CFLO008121-PA;CFLO011309-PA;CFLO008680-PA;CFLO004101-PA;CFLO012323-PA;CFLO012555-PA;CFLO016610-PA;CFLO004099-PA;CFLO007975-PA;CFLO018166-PA;CFLO014397-PA;CFLO019810-PA;CFLO006346-PA;CFLO008828-PA;CFLO009733-PA;CFLO005368-PA;CFLO010332-PA Reactome: R-HSA-390450 Folding of actin by CCT/TriC 9 CFLO015538-PA;CFLO011380-PA;CFLO009580-PA;CFLO018650-PA;CFLO000032-PA;CFLO008820-PA;CFLO004305-PA;CFLO009676-PA;CFLO014339-PA Reactome: R-HSA-877312 Regulation of IFNG signaling 1 CFLO010039-PA Reactome: R-HSA-72695 Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex 46 CFLO010904-PA;CFLO014026-PA;CFLO005804-PA;CFLO005822-PA;CFLO009848-PA;CFLO012297-PA;CFLO012584-PA;CFLO011221-PA;CFLO017333-PA;CFLO014362-PA;CFLO008829-PA;CFLO004278-PA;CFLO004727-PA;CFLO010535-PA;CFLO001584-PA;CFLO005709-PA;CFLO013281-PA;CFLO005537-PA;CFLO017946-PA;CFLO000629-PA;CFLO015650-PA;CFLO013459-PA;CFLO016897-PA;CFLO004405-PA;CFLO000744-PA;CFLO013848-PA;CFLO000349-PA;CFLO008263-PA;CFLO017942-PA;CFLO014479-PA;CFLO005789-PA;CFLO006768-PA;CFLO005013-PA;CFLO012596-PA;CFLO013407-PA;CFLO012160-PA;CFLO005334-PA;CFLO006483-PA;CFLO014117-PA;CFLO003095-PA;CFLO017947-PA;CFLO004224-PA;CFLO012191-PA;CFLO019287-PA;CFLO008061-PA;CFLO017594-PA Reactome: R-HSA-167158 Formation of the HIV-1 Early Elongation Complex 24 CFLO002885-PA;CFLO007118-PA;CFLO008811-PA;CFLO006370-PA;CFLO004196-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO010322-PA;CFLO011191-PA;CFLO006247-PA;CFLO013674-PA;CFLO015637-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO015189-PA;CFLO010911-PA;CFLO007113-PA;CFLO007012-PA;CFLO008569-PA;CFLO018085-PA;CFLO005353-PA;CFLO019592-PA;CFLO012310-PA;CFLO013992-PA MetaCyc: PWY-5486 Pyruvate fermentation to ethanol II 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-3134973 LRR FLII-interacting protein 1 (LRRFIP1) activates type I IFN production 2 CFLO016304-PA;CFLO015438-PA Reactome: R-HSA-163560 Triglyceride catabolism 7 CFLO008294-PA;CFLO014456-PA;CFLO003107-PA;CFLO006231-PA;CFLO006089-PA;CFLO019774-PA;CFLO009696-PA Reactome: R-HSA-3299685 Detoxification of Reactive Oxygen Species 17 CFLO009989-PA;CFLO016634-PA;CFLO016842-PA;CFLO003960-PA;CFLO004951-PA;CFLO005777-PA;CFLO012308-PA;CFLO006891-PA;CFLO009990-PA;CFLO014496-PA;CFLO014367-PA;CFLO008570-PA;CFLO015005-PA;CFLO003046-PA;CFLO001653-PA;CFLO001118-PA;CFLO010540-PA Reactome: R-HSA-9013700 NOTCH4 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus 3 CFLO008212-PA;CFLO001428-PA;CFLO015617-PA Reactome: R-HSA-428930 Thromboxane signalling through TP receptor 1 CFLO003448-PA KEGG: 00300+4.3.3.7 Lysine biosynthesis 2 CFLO001389-PA;CFLO012037-PA Reactome: R-HSA-983170 Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC 5 CFLO001053-PA;CFLO009908-PA;CFLO019401-PA;CFLO004492-PA;CFLO007010-PA MetaCyc: PWY-5138 Fatty acid beta-oxidation IV (unsaturated, even number) 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA MetaCyc: PWY-6309 L-tryptophan degradation XI (mammalian, via kynurenine) 1 CFLO006361-PA Reactome: R-HSA-139853 Elevation of cytosolic Ca2+ levels 1 CFLO002753-PA Reactome: R-HSA-5674499 Negative feedback regulation of MAPK pathway 1 CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-110362 POLB-Dependent Long Patch Base Excision Repair 4 CFLO004549-PA;CFLO003077-PA;CFLO012226-PA;CFLO006172-PA Reactome: R-HSA-1482788 Acyl chain remodelling of PC 9 CFLO017976-PA;CFLO013271-PA;CFLO016978-PA;CFLO000557-PA;CFLO006994-PA;CFLO003207-PA;CFLO002075-PA;CFLO005099-PA;CFLO005379-PA Reactome: R-HSA-2894862 Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants 24 CFLO010507-PA;CFLO001394-PA;CFLO005540-PA;CFLO002615-PA;CFLO008515-PA;CFLO009368-PA;CFLO007222-PA;CFLO016304-PA;CFLO001395-PA;CFLO004594-PA;CFLO009081-PA;CFLO008793-PA;CFLO001797-PA;CFLO015438-PA;CFLO000142-PA;CFLO015617-PA;CFLO002955-PA;CFLO009082-PA;CFLO008212-PA;CFLO011086-PA;CFLO006007-PA;CFLO001428-PA;CFLO008006-PA;CFLO002956-PA MetaCyc: PWY-5189 Tetrapyrrole biosynthesis II (from glycine) 4 CFLO001018-PA;CFLO016469-PA;CFLO009885-PA;CFLO004493-PA MetaCyc: PWY-6385 Peptidoglycan biosynthesis III (mycobacteria) 1 CFLO008725-PA KEGG: 00790+1.14.16.2 Folate biosynthesis 1 CFLO000009-PA KEGG: 00970+6.1.1.15 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 1 CFLO019070-PA KEGG: 00983+2.4.2.3 Drug metabolism - other enzymes 1 CFLO003449-PA Reactome: R-HSA-77111 Synthesis of Ketone Bodies 1 CFLO005374-PA Reactome: R-HSA-391160 Signal regulatory protein family interactions 2 CFLO010039-PA;CFLO011034-PA KEGG: 00270+1.1.1.27 Cysteine and methionine metabolism 1 CFLO007170-PA KEGG: 00510+2.4.1.83 N-Glycan biosynthesis 1 CFLO013866-PA Reactome: R-HSA-70895 Branched-chain amino acid catabolism 6 CFLO018806-PA;CFLO000151-PA;CFLO006978-PA;CFLO006170-PA;CFLO004971-PA;CFLO005855-PA KEGG: 00710+5.1.3.1 Carbon fixation in photosynthetic organisms 1 CFLO013167-PA Reactome: R-HSA-162791 Attachment of GPI anchor to uPAR 5 CFLO000255-PA;CFLO001080-PA;CFLO008020-PA;CFLO004207-PA;CFLO015870-PA Reactome: R-HSA-196836 Vitamin C (ascorbate) metabolism 2 CFLO008203-PA;CFLO008220-PA Reactome: R-HSA-2206307 MPS IIIA - Sanfilippo syndrome A 1 CFLO003383-PA Reactome: R-HSA-196757 Metabolism of folate and pterines 8 CFLO013394-PA;CFLO012613-PA;CFLO010087-PA;CFLO004433-PA;CFLO014967-PA;CFLO000972-PA;CFLO003993-PA;CFLO001271-PA Reactome: R-HSA-69656 Cyclin A:Cdk2-associated events at S phase entry 6 CFLO007346-PA;CFLO010322-PA;CFLO001098-PA;CFLO002764-PA;CFLO013980-PA;CFLO006247-PA KEGG: 04070+2.7.8.11 Phosphatidylinositol signaling system 1 CFLO000498-PA Reactome: R-HSA-450513 Tristetraprolin (TTP, ZFP36) binds and destabilizes mRNA 13 CFLO006571-PA;CFLO005696-PA;CFLO011214-PA;CFLO012566-PA;CFLO010929-PA;CFLO015909-PA;CFLO015852-PA;CFLO018054-PA;CFLO015655-PA;CFLO009644-PA;CFLO001443-PA;CFLO006212-PA;CFLO019015-PA Reactome: R-HSA-9619483 Activation of AMPK downstream of NMDARs 10 CFLO015380-PA;CFLO016852-PA;CFLO014186-PA;CFLO006561-PA;CFLO009841-PA;CFLO001242-PA;CFLO004179-PA;CFLO002905-PA;CFLO009016-PA;CFLO008841-PA KEGG: 00290+2.6.1.42 Valine, leucine and isoleucine biosynthesis 1 CFLO006978-PA KEGG: 00280+4.1.3.4 Valine, leucine and isoleucine degradation 1 CFLO005374-PA Reactome: R-HSA-8941284 RUNX2 regulates chondrocyte maturation 2 CFLO007361-PA;CFLO007362-PA Reactome: R-HSA-446203 Asparagine N-linked glycosylation 4 CFLO001978-PA;CFLO016413-PA;CFLO006991-PA;CFLO011386-PA KEGG: 00900+2.1.1.100 Terpenoid backbone biosynthesis 1 CFLO015032-PA KEGG: 00230+6.3.4.13 Purine metabolism 1 CFLO019131-PA MetaCyc: PWY-5142 Acyl-[acyl-carrier protein] thioesterase pathway 3 CFLO002013-PA;CFLO016519-PA;CFLO002012-PA MetaCyc: PWY-5057 L-valine degradation II 2 CFLO016846-PA;CFLO006978-PA Reactome: R-HSA-112409 RAF-independent MAPK1/3 activation 2 CFLO015657-PA;CFLO013244-PA KEGG: 00983+2.4.2.10 Drug metabolism - other enzymes 1 CFLO005916-PA Reactome: R-HSA-877300 Interferon gamma signaling 4 CFLO005894-PA;CFLO000836-PA;CFLO002965-PA;CFLO017592-PA Reactome: R-HSA-2142691 Synthesis of Leukotrienes (LT) and Eoxins (EX) 11 CFLO019744-PA;CFLO009467-PA;CFLO015237-PA;CFLO009464-PA;CFLO009463-PA;CFLO007698-PA;CFLO015238-PA;CFLO008122-PA;CFLO009465-PA;CFLO000694-PA;CFLO007753-PA MetaCyc: PWY-7221 Guanosine ribonucleotides de novo biosynthesis 11 CFLO008196-PA;CFLO015574-PA;CFLO012155-PA;CFLO004073-PA;CFLO005692-PA;CFLO016867-PA;CFLO012591-PA;CFLO004064-PA;CFLO005942-PA;CFLO006608-PA;CFLO010539-PA Reactome: R-HSA-3769402 Deactivation of the beta-catenin transactivating complex 7 CFLO002572-PA;CFLO007019-PA;CFLO006738-PA;CFLO009267-PA;CFLO006734-PA;CFLO011060-PA;CFLO001592-PA Reactome: R-HSA-2243919 Crosslinking of collagen fibrils 3 CFLO012358-PA;CFLO016400-PA;CFLO004646-PA Reactome: R-HSA-381033 ATF6 (ATF6-alpha) activates chaperones 3 CFLO009918-PA;CFLO005873-PA;CFLO004492-PA Reactome: R-HSA-3000497 Scavenging by Class H Receptors 3 CFLO002286-PA;CFLO011745-PA;CFLO019853-PA MetaCyc: PWY-7656 Spodoptera littoralis pheromone biosynthesis 15 CFLO008715-PA;CFLO004570-PA;CFLO012118-PA;CFLO008720-PA;CFLO011836-PA;CFLO008716-PA;CFLO013399-PA;CFLO007205-PA;CFLO013406-PA;CFLO008159-PA;CFLO013403-PA;CFLO008158-PA;CFLO005715-PA;CFLO013401-PA;CFLO008157-PA KEGG: 00650+4.2.1.17+1.1.1.35 Butanoate metabolism 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA MetaCyc: PWY-7416 Phospholipid remodeling (phosphatidylcholine, yeast) 9 CFLO006994-PA;CFLO000557-PA;CFLO016978-PA;CFLO017976-PA;CFLO013271-PA;CFLO005379-PA;CFLO002075-PA;CFLO005099-PA;CFLO003207-PA Reactome: R-HSA-8851708 Signaling by FGFR2 IIIa TM 9 CFLO010911-PA;CFLO014021-PA;CFLO013992-PA;CFLO015637-PA;CFLO019592-PA;CFLO007113-PA;CFLO007118-PA;CFLO007012-PA;CFLO004196-PA KEGG: 00860+2.3.1.37 Porphyrin and chlorophyll metabolism 1 CFLO001018-PA MetaCyc: PWY-7388 Octanoyl-[acyl-carrier protein] biosynthesis (mitochondria, yeast) 3 CFLO002013-PA;CFLO016519-PA;CFLO002012-PA Reactome: R-HSA-167246 Tat-mediated elongation of the HIV-1 transcript 26 CFLO012310-PA;CFLO019592-PA;CFLO005353-PA;CFLO007113-PA;CFLO006869-PA;CFLO018085-PA;CFLO008569-PA;CFLO007012-PA;CFLO015189-PA;CFLO005811-PA;CFLO010911-PA;CFLO007399-PA;CFLO014021-PA;CFLO015637-PA;CFLO000994-PA;CFLO006247-PA;CFLO011191-PA;CFLO013674-PA;CFLO007118-PA;CFLO006370-PA;CFLO002885-PA;CFLO008811-PA;CFLO010322-PA;CFLO004196-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA KEGG: 00513+2.4.1.131 Various types of N-glycan biosynthesis 2 CFLO004933-PA;CFLO002826-PA Reactome: R-HSA-174437 Removal of the Flap Intermediate from the C-strand 9 CFLO003314-PA;CFLO006346-PA;CFLO008828-PA;CFLO009733-PA;CFLO011911-PA;CFLO004549-PA;CFLO013771-PA;CFLO008680-PA;CFLO001967-PA MetaCyc: PWY-7900 Glycogen biosynthesis III (from alpha-maltose 1-phosphate) 3 CFLO013083-PA;CFLO010589-PA;CFLO016492-PA KEGG: 00620+2.3.3.9 Pyruvate metabolism 1 CFLO010827-PA KEGG: 00900+1.1.1.34 Terpenoid backbone biosynthesis 1 CFLO006604-PA KEGG: 00260+4.2.1.22 Glycine, serine and threonine metabolism 1 CFLO009899-PA Reactome: R-HSA-9634638 Estrogen-dependent nuclear events downstream of ESR-membrane signaling 2 CFLO013244-PA;CFLO001592-PA KEGG: 00330+1.2.1.41+2.7.2.11 Arginine and proline metabolism 1 CFLO002293-PA Reactome: R-HSA-8856825 Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis 17 CFLO013544-PA;CFLO015409-PA;CFLO005139-PA;CFLO014345-PA;CFLO011745-PA;CFLO019853-PA;CFLO016459-PA;CFLO006171-PA;CFLO008855-PA;CFLO004893-PA;CFLO004448-PA;CFLO004342-PA;CFLO014328-PA;CFLO001979-PA;CFLO007954-PA;CFLO002286-PA;CFLO006324-PA Reactome: R-HSA-390648 Muscarinic acetylcholine receptors 1 CFLO006504-PA MetaCyc: PWY-6587 Pyruvate fermentation to ethanol III 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-6811436 COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic 21 CFLO004179-PA;CFLO008841-PA;CFLO007730-PA;CFLO000835-PA;CFLO016852-PA;CFLO009919-PA;CFLO000598-PA;CFLO006561-PA;CFLO009841-PA;CFLO011480-PA;CFLO001593-PA;CFLO010998-PA;CFLO010498-PA;CFLO002905-PA;CFLO012642-PA;CFLO010396-PA;CFLO008775-PA;CFLO001296-PA;CFLO000837-PA;CFLO014186-PA;CFLO001242-PA Reactome: R-HSA-8849471 PTK6 Regulates RHO GTPases, RAS GTPase and MAP kinases 1 CFLO008854-PA KEGG: 00983+3.5.4.5 Drug metabolism - other enzymes 1 CFLO018007-PA Reactome: R-HSA-381771 Synthesis, secretion, and inactivation of Glucagon-like Peptide-1 (GLP-1) 3 CFLO013862-PA;CFLO002192-PA;CFLO008115-PA Reactome: R-HSA-433137 Sodium-coupled sulphate, di- and tri-carboxylate transporters 5 CFLO002903-PA;CFLO019683-PA;CFLO012111-PA;CFLO012106-PA;CFLO002859-PA Reactome: R-HSA-9017802 Noncanonical activation of NOTCH3 3 CFLO008212-PA;CFLO015617-PA;CFLO001428-PA KEGG: 00534+2.4.2.26 Glycosaminoglycan biosynthesis - heparan sulfate / heparin 1 CFLO015250-PA KEGG: 00400+1.14.16.1 Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis 1 CFLO009716-PA Reactome: R-HSA-195253 Degradation of beta-catenin by the destruction complex 43 CFLO000953-PA;CFLO001568-PA;CFLO002375-PA;CFLO000673-PA;CFLO014805-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO010590-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO015469-PA;CFLO001327-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO009082-PA;CFLO003059-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO011518-PA;CFLO004457-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO007019-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO009081-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO015916-PA;CFLO001064-PA;CFLO006007-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO000939-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO007718-PA;CFLO002615-PA Reactome: R-HSA-425397 Transport of vitamins, nucleosides, and related molecules 1 CFLO001115-PA Reactome: R-HSA-9615710 Late endosomal microautophagy 6 CFLO018740-PA;CFLO013467-PA;CFLO013092-PA;CFLO012133-PA;CFLO003119-PA;CFLO009636-PA Reactome: R-HSA-2871796 FCERI mediated MAPK activation 5 CFLO007261-PA;CFLO014527-PA;CFLO004869-PA;CFLO014413-PA;CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-9610379 HCMV Late Events 42 CFLO014829-PA;CFLO010441-PA;CFLO010821-PA;CFLO006759-PA;CFLO001638-PA;CFLO008090-PA;CFLO001629-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO005636-PA;CFLO013467-PA;CFLO002763-PA;CFLO008088-PA;CFLO013550-PA;CFLO008087-PA;CFLO002036-PA;CFLO005698-PA;CFLO005766-PA;CFLO016514-PA;CFLO000120-PA;CFLO014833-PA;CFLO011812-PA;CFLO005918-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO008042-PA;CFLO000572-PA;CFLO004197-PA;CFLO012747-PA;CFLO013092-PA;CFLO012133-PA;CFLO007391-PA;CFLO004815-PA;CFLO004819-PA;CFLO007437-PA;CFLO009636-PA;CFLO013546-PA;CFLO012487-PA;CFLO002998-PA;CFLO014832-PA;CFLO004818-PA;CFLO018740-PA Reactome: R-HSA-5658034 HHAT G278V abrogates palmitoylation of Hh-Np 2 CFLO018031-PA;CFLO018032-PA KEGG: 00332+1.2.1.41 Carbapenem biosynthesis 1 CFLO002293-PA MetaCyc: PWY-5082 L-methionine degradation III 1 CFLO016846-PA KEGG: 00052+2.7.7.12 Galactose metabolism 1 CFLO002708-PA KEGG: 00230+2.4.2.14 Purine metabolism 1 CFLO004461-PA MetaCyc: PWY-2261 Ascorbate glutathione cycle 2 CFLO008203-PA;CFLO008220-PA Reactome: R-HSA-376172 DSCAM interactions 1 CFLO005675-PA Reactome: R-HSA-8854518 AURKA Activation by TPX2 11 CFLO011961-PA;CFLO000317-PA;CFLO002610-PA;CFLO004227-PA;CFLO007730-PA;CFLO005157-PA;CFLO018088-PA;CFLO000300-PA;CFLO010998-PA;CFLO009450-PA;CFLO011480-PA MetaCyc: PWY-6122 5-aminoimidazole ribonucleotide biosynthesis II 4 CFLO019130-PA;CFLO004461-PA;CFLO019131-PA;CFLO009307-PA Reactome: R-HSA-5358346 Hedgehog ligand biogenesis 39 CFLO001064-PA;CFLO015984-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO013733-PA;CFLO018031-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO002304-PA;CFLO007718-PA;CFLO004489-PA;CFLO016610-PA;CFLO003990-PA;CFLO000939-PA;CFLO010590-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO001095-PA;CFLO018032-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO015469-PA;CFLO000953-PA;CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO011518-PA;CFLO004457-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO014819-PA MetaCyc: PWY-6370 Ascorbate recycling (cytosolic) 2 CFLO008220-PA;CFLO008203-PA Reactome: R-HSA-9616222 Transcriptional regulation of granulopoiesis 15 CFLO007437-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO010821-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO007408-PA;CFLO011812-PA;CFLO007368-PA;CFLO007391-PA;CFLO005894-PA;CFLO007361-PA;CFLO004197-PA;CFLO008042-PA;CFLO007362-PA Reactome: R-HSA-1250196 SHC1 events in ERBB2 signaling 1 CFLO009698-PA MetaCyc: PWY-6557 Glycosaminoglycan-protein linkage region biosynthesis 1 CFLO015250-PA Reactome: R-HSA-5632968 Defective Mismatch Repair Associated With MSH6 2 CFLO011589-PA;CFLO011597-PA KEGG: 00010+4.1.1.32 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO000017-PA MetaCyc: PWY-5484 Glycolysis II (from fructose 6-phosphate) 10 CFLO007423-PA;CFLO005131-PA;CFLO003967-PA;CFLO009994-PA;CFLO017154-PA;CFLO000222-PA;CFLO015634-PA;CFLO016901-PA;CFLO009597-PA;CFLO009751-PA Reactome: R-HSA-8964038 LDL clearance 6 CFLO005139-PA;CFLO011745-PA;CFLO019853-PA;CFLO006324-PA;CFLO002286-PA;CFLO009612-PA Reactome: R-HSA-9613829 Chaperone Mediated Autophagy 1 CFLO003119-PA Reactome: R-HSA-1369007 Mitochondrial ABC transporters 1 CFLO004167-PA MetaCyc: PWY-7340 9-cis, 11-trans-octadecadienoyl-CoA degradation (isomerase-dependent, yeast) 2 CFLO013638-PA;CFLO013479-PA Reactome: R-HSA-210991 Basigin interactions 2 CFLO015919-PA;CFLO015918-PA Reactome: R-HSA-6809371 Formation of the cornified envelope 11 CFLO001048-PA;CFLO005111-PA;CFLO002165-PA;CFLO000134-PA;CFLO000410-PA;CFLO004365-PA;CFLO000133-PA;CFLO001049-PA;CFLO005081-PA;CFLO005083-PA;CFLO000132-PA Reactome: R-HSA-5685942 HDR through Homologous Recombination (HRR) 34 CFLO001240-PA;CFLO005586-PA;CFLO012323-PA;CFLO005651-PA;CFLO013974-PA;CFLO009733-PA;CFLO011911-PA;CFLO019810-PA;CFLO015674-PA;CFLO008873-PA;CFLO013771-PA;CFLO007174-PA;CFLO002907-PA;CFLO018166-PA;CFLO006542-PA;CFLO010805-PA;CFLO007975-PA;CFLO012555-PA;CFLO008680-PA;CFLO002994-PA;CFLO008121-PA;CFLO011309-PA;CFLO012610-PA;CFLO008828-PA;CFLO003314-PA;CFLO006346-PA;CFLO010332-PA;CFLO019062-PA;CFLO014613-PA;CFLO010802-PA;CFLO005778-PA;CFLO015680-PA;CFLO003985-PA;CFLO001967-PA KEGG: 04070+2.7.1.107 Phosphatidylinositol signaling system 6 CFLO006114-PA;CFLO016462-PA;CFLO001719-PA;CFLO010224-PA;CFLO006116-PA;CFLO006115-PA KEGG: 00520+5.4.2.8 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 1 CFLO003382-PA Reactome: R-HSA-2197563 NOTCH2 intracellular domain regulates transcription 1 CFLO008793-PA Reactome: R-HSA-166208 mTORC1-mediated signalling 8 CFLO015017-PA;CFLO018008-PA;CFLO003386-PA;CFLO005536-PA;CFLO003088-PA;CFLO015160-PA;CFLO005629-PA;CFLO005334-PA Reactome: R-HSA-167172 Transcription of the HIV genome 26 CFLO019592-PA;CFLO006498-PA;CFLO007012-PA;CFLO007113-PA;CFLO012113-PA;CFLO019377-PA;CFLO012310-PA;CFLO008336-PA;CFLO006247-PA;CFLO011191-PA;CFLO010322-PA;CFLO001309-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO004196-PA;CFLO006370-PA;CFLO007118-PA;CFLO001312-PA;CFLO010911-PA;CFLO015169-PA;CFLO000074-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO003054-PA;CFLO015637-PA;CFLO000007-PA MetaCyc: PWY-7049 Icosapentaenoate biosynthesis II (6-desaturase, mammals) 2 CFLO006701-PA;CFLO007106-PA Reactome: R-HSA-170822 Regulation of Glucokinase by Glucokinase Regulatory Protein 21 CFLO008090-PA;CFLO010441-PA;CFLO012747-PA;CFLO014829-PA;CFLO005636-PA;CFLO004819-PA;CFLO004815-PA;CFLO014833-PA;CFLO000120-PA;CFLO002998-PA;CFLO012487-PA;CFLO005698-PA;CFLO008087-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO013550-PA;CFLO004818-PA;CFLO000572-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO014832-PA MetaCyc: PWY-6142 Gluconeogenesis II (Methanobacterium thermoautotrophicum) 8 CFLO009597-PA;CFLO016901-PA;CFLO019811-PA;CFLO017154-PA;CFLO016169-PA;CFLO003089-PA;CFLO003967-PA;CFLO005131-PA KEGG: 00860+4.1.1.37 Porphyrin and chlorophyll metabolism 1 CFLO008202-PA Reactome: R-HSA-5657655 MGMT-mediated DNA damage reversal 1 CFLO014481-PA KEGG: 00770+2.7.1.24 Pantothenate and CoA biosynthesis 1 CFLO009172-PA Reactome: R-HSA-1445148 Translocation of SLC2A4 (GLUT4) to the plasma membrane 19 CFLO011599-PA;CFLO006561-PA;CFLO009841-PA;CFLO015380-PA;CFLO008161-PA;CFLO016852-PA;CFLO010543-PA;CFLO008841-PA;CFLO004179-PA;CFLO006179-PA;CFLO000223-PA;CFLO014186-PA;CFLO001242-PA;CFLO005962-PA;CFLO018657-PA;CFLO004109-PA;CFLO016175-PA;CFLO018046-PA;CFLO002905-PA MetaCyc: PWY-5104 L-isoleucine biosynthesis IV 1 CFLO006978-PA KEGG: 00511+3.2.1.52 Other glycan degradation 8 CFLO014190-PA;CFLO019181-PA;CFLO006861-PA;CFLO007240-PA;CFLO018671-PA;CFLO005046-PA;CFLO005047-PA;CFLO007387-PA Reactome: R-HSA-1368108 BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression 4 CFLO013084-PA;CFLO006718-PA;CFLO016506-PA;CFLO002055-PA KEGG: 00626+1.1.1.1 Naphthalene degradation 1 CFLO016846-PA MetaCyc: PWY-5147 Oleate biosynthesis I (plants) 3 CFLO002012-PA;CFLO016519-PA;CFLO002013-PA Reactome: R-HSA-977443 GABA receptor activation 4 CFLO001112-PA;CFLO004321-PA;CFLO001113-PA;CFLO000001-PA MetaCyc: PWY-5669 Phosphatidylserine and phosphatidylethanolamine biosynthesis I 1 CFLO008188-PA KEGG: 00062+4.2.1.134 Fatty acid elongation 2 CFLO007106-PA;CFLO006701-PA KEGG: 00350+1.1.1.1 Tyrosine metabolism 1 CFLO016846-PA MetaCyc: PWY-5481 Pyruvate fermentation to (S)-lactate 1 CFLO007170-PA Reactome: R-HSA-2395516 Electron transport from NADPH to Ferredoxin 3 CFLO002662-PA;CFLO001497-PA;CFLO010536-PA KEGG: 00010+5.1.3.15 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO009442-PA MetaCyc: PWY-6366 D-myo-inositol (1,4,5,6)-tetrakisphosphate biosynthesis 1 CFLO002434-PA MetaCyc: PWY-6368 3-phosphoinositide degradation 3 CFLO002536-PA;CFLO006751-PA;CFLO006091-PA Reactome: R-HSA-418886 Netrin mediated repulsion signals 1 CFLO002027-PA KEGG: 04070+2.7.1.153 Phosphatidylinositol signaling system 1 CFLO011291-PA Reactome: R-HSA-912526 Interleukin receptor SHC signaling 1 CFLO005740-PA Reactome: R-HSA-209560 NF-kB is activated and signals survival 1 CFLO018652-PA KEGG: 00380+1.14.13.9 Tryptophan metabolism 1 CFLO006361-PA MetaCyc: PWY-5265 Peptidoglycan biosynthesis II (staphylococci) 2 CFLO008725-PA;CFLO016451-PA Reactome: R-HSA-1474244 Extracellular matrix organization 1 CFLO012358-PA MetaCyc: PWY-6123 Inosine-5'-phosphate biosynthesis I 4 CFLO017671-PA;CFLO013827-PA;CFLO015327-PA;CFLO004460-PA MetaCyc: PWY-6737 Starch degradation V 2 CFLO018464-PA;CFLO001588-PA KEGG: 00330+1.2.1.41 Arginine and proline metabolism 1 CFLO002293-PA KEGG: 00730+2.7.4.3 Thiamine metabolism 5 CFLO005147-PA;CFLO005476-PA;CFLO016279-PA;CFLO016779-PA;CFLO000886-PA Reactome: R-HSA-8866427 VLDLR internalisation and degradation 2 CFLO005139-PA;CFLO006324-PA KEGG: 00500+2.4.1.25 Starch and sucrose metabolism 1 CFLO018464-PA Reactome: R-HSA-2029482 Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation 12 CFLO003326-PA;CFLO011975-PA;CFLO006587-PA;CFLO005173-PA;CFLO013930-PA;CFLO008919-PA;CFLO001131-PA;CFLO004869-PA;CFLO013244-PA;CFLO006678-PA;CFLO008920-PA;CFLO012666-PA Reactome: R-HSA-2129379 Molecules associated with elastic fibres 1 CFLO000310-PA KEGG: 00670+2.1.2.3 One carbon pool by folate 2 CFLO017671-PA;CFLO015327-PA Reactome: R-HSA-5693565 Recruitment and ATM-mediated phosphorylation of repair and signaling proteins at DNA double strand breaks 20 CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO010821-PA;CFLO004457-PA;CFLO010805-PA;CFLO007391-PA;CFLO007408-PA;CFLO007368-PA;CFLO017458-PA;CFLO015680-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO007437-PA;CFLO004197-PA;CFLO011903-PA;CFLO001035-PA;CFLO008042-PA;CFLO010802-PA;CFLO015674-PA;CFLO011812-PA KEGG: 00230+3.5.4.3 Purine metabolism 1 CFLO011185-PA MetaCyc: PWY-7379 Mrna capping II 1 CFLO009980-PA Reactome: R-HSA-210500 Glutamate Neurotransmitter Release Cycle 2 CFLO002413-PA;CFLO012576-PA MetaCyc: PWY-6362 1D-myo-inositol hexakisphosphate biosynthesis II (mammalian) 1 CFLO002434-PA MetaCyc: PWY-5367 Petroselinate biosynthesis 3 CFLO002013-PA;CFLO016519-PA;CFLO002012-PA Reactome: R-HSA-177504 Retrograde neurotrophin signalling 2 CFLO006324-PA;CFLO005139-PA KEGG: 00627+3.6.1.7 Aminobenzoate degradation 1 CFLO001578-PA MetaCyc: PWY-7663 Gondoate biosynthesis (anaerobic) 3 CFLO002012-PA;CFLO002013-PA;CFLO016519-PA KEGG: 00240+6.3.5.5 Pyrimidine metabolism 1 CFLO011964-PA Reactome: R-HSA-210455 Astrocytic Glutamate-Glutamine Uptake And Metabolism 3 CFLO007633-PA;CFLO007632-PA;CFLO007634-PA KEGG: 00071+5.1.2.3+4.2.1.17+1.1.1.35 Fatty acid degradation 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA MetaCyc: PWY-7385 1,3-propanediol biosynthesis (engineered) 5 CFLO005131-PA;CFLO019811-PA;CFLO006857-PA;CFLO000222-PA;CFLO006890-PA Reactome: R-HSA-418217 G beta:gamma signalling through PLC beta 1 CFLO013725-PA MetaCyc: PWY-7094 Fatty acid salvage 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA MetaCyc: PWY-6799 Fatty acid biosynthesis initiation (plant mitochondria) 3 CFLO002012-PA;CFLO016519-PA;CFLO002013-PA KEGG: 00720+1.5.1.20 Carbon fixation pathways in prokaryotes 1 CFLO013394-PA Reactome: R-HSA-1660516 Synthesis of PIPs at the early endosome membrane 2 CFLO008697-PA;CFLO014990-PA Reactome: R-HSA-1483191 Synthesis of PC 16 CFLO005109-PA;CFLO003187-PA;CFLO011424-PA;CFLO001083-PA;CFLO007303-PA;CFLO000064-PA;CFLO005376-PA;CFLO010485-PA;CFLO001058-PA;CFLO007791-PA;CFLO003001-PA;CFLO003291-PA;CFLO004710-PA;CFLO000216-PA;CFLO010512-PA;CFLO001596-PA MetaCyc: PWY-6644 Fluoroacetate and fluorothreonine biosynthesis 1 CFLO016529-PA Reactome: R-HSA-189085 Digestion of dietary carbohydrate 44 CFLO010696-PA;CFLO006053-PA;CFLO012039-PA;CFLO012969-PA;CFLO012964-PA;CFLO013825-PA;CFLO013566-PA;CFLO001882-PA;CFLO008579-PA;CFLO019753-PA;CFLO007415-PA;CFLO001756-PA;CFLO008578-PA;CFLO018830-PA;CFLO000589-PA;CFLO014786-PA;CFLO000414-PA;CFLO013083-PA;CFLO012038-PA;CFLO004916-PA;CFLO012934-PA;CFLO000270-PA;CFLO001299-PA;CFLO000124-PA;CFLO001781-PA;CFLO008237-PA;CFLO013822-PA;CFLO012042-PA;CFLO017169-PA;CFLO012041-PA;CFLO008623-PA;CFLO003274-PA;CFLO008252-PA;CFLO014112-PA;CFLO014787-PA;CFLO018829-PA;CFLO010589-PA;CFLO010218-PA;CFLO008622-PA;CFLO013851-PA;CFLO000039-PA;CFLO001957-PA;CFLO006858-PA;CFLO004991-PA Reactome: R-HSA-983231 Factors involved in megakaryocyte development and platelet production 13 CFLO019063-PA;CFLO006287-PA;CFLO012772-PA;CFLO002010-PA;CFLO000157-PA;CFLO005173-PA;CFLO000152-PA;CFLO009315-PA;CFLO011829-PA;CFLO001296-PA;CFLO002434-PA;CFLO008046-PA;CFLO007783-PA Reactome: R-HSA-3214842 HDMs demethylate histones 17 CFLO008036-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO005955-PA;CFLO007437-PA;CFLO004197-PA;CFLO008042-PA;CFLO011812-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO010821-PA;CFLO001142-PA;CFLO003281-PA;CFLO004607-PA;CFLO007391-PA;CFLO007408-PA;CFLO007368-PA Reactome: R-HSA-5654727 Negative regulation of FGFR2 signaling 1 CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-167243 Tat-mediated HIV elongation arrest and recovery 18 CFLO005811-PA;CFLO010911-PA;CFLO015189-PA;CFLO014021-PA;CFLO015637-PA;CFLO013674-PA;CFLO000994-PA;CFLO004196-PA;CFLO007118-PA;CFLO008811-PA;CFLO002885-PA;CFLO019592-PA;CFLO005353-PA;CFLO008569-PA;CFLO007012-PA;CFLO018085-PA;CFLO007113-PA;CFLO006869-PA Reactome: R-HSA-70370 Galactose catabolism 3 CFLO006591-PA;CFLO002708-PA;CFLO001267-PA Reactome: R-HSA-8986944 Transcriptional Regulation by MECP2 5 CFLO005758-PA;CFLO012800-PA;CFLO001535-PA;CFLO012806-PA;CFLO011446-PA MetaCyc: PWY-7979 Protein O-mannosylation III (mammals, core M3) 7 CFLO002995-PA;CFLO002603-PA;CFLO001486-PA;CFLO001127-PA;CFLO013866-PA;CFLO010944-PA;CFLO017852-PA KEGG: 00520+2.7.7.9 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 1 CFLO009992-PA Reactome: R-HSA-6807878 COPI-mediated anterograde transport 42 CFLO005434-PA;CFLO008775-PA;CFLO010396-PA;CFLO006297-PA;CFLO004117-PA;CFLO000147-PA;CFLO011480-PA;CFLO006671-PA;CFLO016852-PA;CFLO000048-PA;CFLO012027-PA;CFLO017597-PA;CFLO012259-PA;CFLO007730-PA;CFLO008841-PA;CFLO004593-PA;CFLO000062-PA;CFLO004179-PA;CFLO012720-PA;CFLO018759-PA;CFLO019169-PA;CFLO001242-PA;CFLO001296-PA;CFLO018213-PA;CFLO014186-PA;CFLO017507-PA;CFLO012028-PA;CFLO010486-PA;CFLO012642-PA;CFLO011136-PA;CFLO015256-PA;CFLO010998-PA;CFLO002905-PA;CFLO009841-PA;CFLO006561-PA;CFLO009919-PA;CFLO000598-PA;CFLO014050-PA;CFLO002793-PA;CFLO006669-PA;CFLO008922-PA;CFLO006668-PA KEGG: 00561+3.2.1.22 Glycerolipid metabolism 1 CFLO009658-PA KEGG: 00500+3.6.1.9 Starch and sucrose metabolism 1 CFLO002000-PA KEGG: 00630+6.3.1.2 Glyoxylate and dicarboxylate metabolism 3 CFLO007634-PA;CFLO007633-PA;CFLO007632-PA Reactome: R-HSA-6811434 COPI-dependent Golgi-to-ER retrograde traffic 47 CFLO014433-PA;CFLO003075-PA;CFLO006510-PA;CFLO001242-PA;CFLO018213-PA;CFLO014186-PA;CFLO005365-PA;CFLO008446-PA;CFLO001427-PA;CFLO012028-PA;CFLO003009-PA;CFLO014409-PA;CFLO006285-PA;CFLO009870-PA;CFLO002905-PA;CFLO015146-PA;CFLO009841-PA;CFLO006561-PA;CFLO001745-PA;CFLO004153-PA;CFLO008445-PA;CFLO014436-PA;CFLO007144-PA;CFLO006669-PA;CFLO006668-PA;CFLO004019-PA;CFLO005434-PA;CFLO004795-PA;CFLO006297-PA;CFLO005818-PA;CFLO007308-PA;CFLO004117-PA;CFLO016840-PA;CFLO000147-PA;CFLO016843-PA;CFLO004813-PA;CFLO006671-PA;CFLO002963-PA;CFLO009043-PA;CFLO009616-PA;CFLO016852-PA;CFLO000048-PA;CFLO012027-PA;CFLO004993-PA;CFLO008841-PA;CFLO004593-PA;CFLO004179-PA MetaCyc: PWY-6642 (R)-cysteate degradation 2 CFLO000623-PA;CFLO003306-PA Reactome: R-HSA-381183 ATF6 (ATF6-alpha) activates chaperone genes 2 CFLO004492-PA;CFLO008860-PA KEGG: 00640+6.4.1.2 Propanoate metabolism 1 CFLO005702-PA KEGG: 00564+2.3.1.15 Glycerophospholipid metabolism 2 CFLO004213-PA;CFLO007382-PA Reactome: R-HSA-418885 DCC mediated attractive signaling 1 CFLO005173-PA Reactome: R-HSA-174184 Cdc20:Phospho-APC/C mediated degradation of Cyclin A 44 CFLO007718-PA;CFLO010492-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO009576-PA;CFLO001064-PA;CFLO006593-PA;CFLO005584-PA;CFLO012167-PA;CFLO012372-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO002095-PA;CFLO014806-PA;CFLO015984-PA;CFLO004457-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO011518-PA;CFLO014819-PA;CFLO007015-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO001098-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO015469-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO006992-PA;CFLO010590-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO006211-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO007123-PA MetaCyc: PWY-7851 Coenzyme A biosynthesis II (eukaryotic) 1 CFLO009172-PA KEGG: 00270+2.6.1.52 Cysteine and methionine metabolism 1 CFLO003969-PA Reactome: R-HSA-110314 Recognition of DNA damage by PCNA-containing replication complex 19 CFLO018166-PA;CFLO012555-PA;CFLO011309-PA;CFLO002994-PA;CFLO008121-PA;CFLO008680-PA;CFLO012323-PA;CFLO003314-PA;CFLO006346-PA;CFLO008828-PA;CFLO011911-PA;CFLO009733-PA;CFLO010332-PA;CFLO006013-PA;CFLO019810-PA;CFLO019062-PA;CFLO006019-PA;CFLO013771-PA;CFLO003985-PA KEGG: 00520+4.2.1.47 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 1 CFLO002873-PA Reactome: R-HSA-9665233 Resistance of ERBB2 KD mutants to trastuzumab 1 CFLO005384-PA Reactome: R-HSA-5609977 Defective GALE can cause Epimerase-deficiency galactosemia (EDG) 2 CFLO006591-PA;CFLO001267-PA KEGG: 00250+2.4.2.14 Alanine, aspartate and glutamate metabolism 1 CFLO004461-PA Reactome: R-HSA-936964 Activation of IRF3/IRF7 mediated by TBK1/IKK epsilon 1 CFLO014989-PA Reactome: R-HSA-9645722 Defective Intrinsic Pathway for Apoptosis Due to p14ARF Loss of Function 1 CFLO009619-PA Reactome: R-HSA-5689880 Ub-specific processing proteases 53 CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO001029-PA;CFLO007718-PA;CFLO010428-PA;CFLO009655-PA;CFLO002304-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO015472-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO012808-PA;CFLO001064-PA;CFLO014819-PA;CFLO004894-PA;CFLO012113-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO012814-PA;CFLO004457-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO014397-PA;CFLO011518-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO014805-PA;CFLO006019-PA;CFLO000953-PA;CFLO013496-PA;CFLO018365-PA;CFLO018530-PA;CFLO001098-PA;CFLO003452-PA;CFLO001476-PA;CFLO015469-PA;CFLO001095-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO007207-PA;CFLO014328-PA;CFLO013450-PA;CFLO015983-PA;CFLO006013-PA;CFLO010420-PA;CFLO010590-PA MetaCyc: PWY-7007 Methyl ketone biosynthesis (engineered) 4 CFLO013638-PA;CFLO013479-PA;CFLO012118-PA;CFLO011836-PA MetaCyc: PWY-4361 S-methyl-5-thio-alpha-D-ribose 1-phosphate degradation I 6 CFLO018203-PA;CFLO009367-PA;CFLO002725-PA;CFLO001681-PA;CFLO019081-PA;CFLO005639-PA MetaCyc: PWY-6938 NADH repair 3 CFLO015107-PA;CFLO015109-PA;CFLO016135-PA KEGG: 00030+2.7.1.11 Pentose phosphate pathway 1 CFLO000222-PA Reactome: R-HSA-202433 Generation of second messenger molecules 2 CFLO004533-PA;CFLO007261-PA KEGG: 00230+2.7.4.10 Purine metabolism 1 CFLO016279-PA Reactome: R-HSA-9615017 FOXO-mediated transcription of oxidative stress, metabolic and neuronal genes 2 CFLO003960-PA;CFLO016842-PA Reactome: R-HSA-5659996 RPIA deficiency: failed conversion of R5P to RU5P 1 CFLO001993-PA MetaCyc: PWY-7255 Ergothioneine biosynthesis I (bacteria) 1 CFLO011825-PA Reactome: R-HSA-380284 Loss of proteins required for interphase microtubule organization from the centrosome 10 CFLO004227-PA;CFLO000317-PA;CFLO002610-PA;CFLO011480-PA;CFLO009450-PA;CFLO010998-PA;CFLO000300-PA;CFLO005157-PA;CFLO018088-PA;CFLO007730-PA Reactome: R-HSA-159230 Transport of the SLBP Dependant Mature mRNA 23 CFLO005698-PA;CFLO008087-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO013550-PA;CFLO014833-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO012487-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO014832-PA;CFLO004818-PA;CFLO000572-PA;CFLO010441-PA;CFLO012747-PA;CFLO014829-PA;CFLO008090-PA;CFLO013992-PA;CFLO004815-PA;CFLO007400-PA;CFLO005636-PA;CFLO004819-PA Reactome: R-HSA-163841 Gamma carboxylation, hypusine formation and arylsulfatase activation 1 CFLO015032-PA MetaCyc: PWY-7288 Fatty acid beta-oxidation VII (yeast peroxisome) 2 CFLO013479-PA;CFLO013638-PA MetaCyc: PWY-5080 Very long chain fatty acid biosynthesis I 15 CFLO010957-PA;CFLO008782-PA;CFLO008780-PA;CFLO004004-PA;CFLO015015-PA;CFLO006701-PA;CFLO007106-PA;CFLO008781-PA;CFLO008778-PA;CFLO010625-PA;CFLO010959-PA;CFLO015666-PA;CFLO010863-PA;CFLO008779-PA;CFLO010956-PA KEGG: 00520+2.7.1.1 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 1 CFLO006809-PA MetaCyc: PWY-6308 L-cysteine biosynthesis II (tRNA-dependent) 3 CFLO015002-PA;CFLO008800-PA;CFLO019828-PA KEGG: 00190+1.3.5.1 Oxidative phosphorylation 2 CFLO013472-PA;CFLO006431-PA Reactome: R-HSA-2206296 MPS II - Hunter syndrome 1 CFLO004328-PA KEGG: 00720+1.1.1.42 Carbon fixation pathways in prokaryotes 1 CFLO009985-PA Reactome: R-HSA-5083628 Defective POMGNT1 causes MDDGA3, MDDGB3 and MDDGC3 1 CFLO009857-PA Reactome: R-HSA-5619107 Defective TPR may confer susceptibility towards thyroid papillary carcinoma (TPC) 21 CFLO014832-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO000572-PA;CFLO004818-PA;CFLO002763-PA;CFLO008088-PA;CFLO013550-PA;CFLO008087-PA;CFLO005698-PA;CFLO012487-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO014833-PA;CFLO004815-PA;CFLO004819-PA;CFLO005636-PA;CFLO012747-PA;CFLO014829-PA;CFLO010441-PA;CFLO008090-PA MetaCyc: PWY-5392 Reductive TCA cycle II 7 CFLO008726-PA;CFLO004169-PA;CFLO018047-PA;CFLO005915-PA;CFLO004684-PA;CFLO001710-PA;CFLO007214-PA Reactome: R-HSA-72731 Recycling of eIF2:GDP 2 CFLO009367-PA;CFLO017947-PA MetaCyc: PWY-5084 2-oxoglutarate decarboxylation to succinyl-CoA 6 CFLO015982-PA;CFLO011452-PA;CFLO000151-PA;CFLO001581-PA;CFLO011450-PA;CFLO015979-PA Reactome: R-HSA-5250924 B-WICH complex positively regulates rRNA expression 22 CFLO002136-PA;CFLO007128-PA;CFLO011812-PA;CFLO004197-PA;CFLO008042-PA;CFLO004196-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO007437-PA;CFLO010911-PA;CFLO014021-PA;CFLO008171-PA;CFLO004594-PA;CFLO007391-PA;CFLO007408-PA;CFLO003630-PA;CFLO007368-PA;CFLO008703-PA;CFLO019070-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO010821-PA KEGG: 00970+6.1.1.16 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 2 CFLO009873-PA;CFLO002896-PA KEGG: 00970+6.1.1.10 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 2 CFLO000657-PA;CFLO012281-PA Reactome: R-HSA-140837 Intrinsic Pathway of Fibrin Clot Formation 1 CFLO009619-PA KEGG: 00480+6.3.2.2 Glutathione metabolism 1 CFLO011825-PA MetaCyc: PWY-6981 Chitin biosynthesis 1 CFLO019811-PA KEGG: 00561+2.7.7.9 Glycerolipid metabolism 1 CFLO009992-PA Reactome: R-HSA-176412 Phosphorylation of the APC/C 8 CFLO006211-PA;CFLO005584-PA;CFLO012167-PA;CFLO007015-PA;CFLO007123-PA;CFLO010492-PA;CFLO009576-PA;CFLO006992-PA KEGG: 00510+3.2.1.106 N-Glycan biosynthesis 2 CFLO019370-PA;CFLO015264-PA MetaCyc: PWY-7831 ABH and Lewis epitopes biosynthesis from type 2 precursor disaccharide 1 CFLO000956-PA MetaCyc: PWY-5698 Allantoin degradation to ureidoglycolate II (ammonia producing) 1 CFLO017986-PA MetaCyc: PWY-5177 Glutaryl-coa degradation 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA MetaCyc: PWY-5686 UMP biosynthesis I 4 CFLO011966-PA;CFLO005916-PA;CFLO006108-PA;CFLO011964-PA MetaCyc: PWY-8043 Ophthalmate biosynthesis 2 CFLO002150-PA;CFLO011825-PA MetaCyc: PWY-5497 Purine nucleobases degradation II (anaerobic) 6 CFLO011185-PA;CFLO004433-PA;CFLO014967-PA;CFLO010087-PA;CFLO001271-PA;CFLO003993-PA KEGG: 00500+3.2.1.28 Starch and sucrose metabolism 3 CFLO014786-PA;CFLO014787-PA;CFLO013822-PA KEGG: 00051+5.3.1.8 Fructose and mannose metabolism 1 CFLO000596-PA MetaCyc: PWY-6111 Mitochondrial L-carnitine shuttle 1 CFLO015175-PA Reactome: R-HSA-5668541 TNFR2 non-canonical NF-kB pathway 35 CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO000939-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO002304-PA;CFLO007718-PA;CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO001064-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO014819-PA;CFLO011518-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO004457-PA;CFLO000953-PA;CFLO014805-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO010590-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA;CFLO015469-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA MetaCyc: PWY-6277 Superpathway of 5-aminoimidazole ribonucleotide biosynthesis 4 CFLO009307-PA;CFLO019131-PA;CFLO004461-PA;CFLO019130-PA Reactome: R-HSA-5625970 RHO GTPases activate KTN1 2 CFLO007308-PA;CFLO005173-PA Reactome: R-HSA-913709 O-linked glycosylation of mucins 10 CFLO008802-PA;CFLO018753-PA;CFLO014258-PA;CFLO013373-PA;CFLO005383-PA;CFLO000031-PA;CFLO003656-PA;CFLO017928-PA;CFLO003230-PA;CFLO013866-PA Reactome: R-HSA-5083630 Defective LFNG causes SCDO3 1 CFLO000670-PA MetaCyc: PWY-6482 Diphthamide biosynthesis I (archaea) 3 CFLO002420-PA;CFLO003316-PA;CFLO007609-PA KEGG: 00240+1.17.4.1 Pyrimidine metabolism 4 CFLO000685-PA;CFLO001680-PA;CFLO012552-PA;CFLO000684-PA MetaCyc: PWY-7233 Ubiquinol-6 bypass biosynthesis (eukaryotic) 3 CFLO001545-PA;CFLO002566-PA;CFLO018371-PA Reactome: R-HSA-70268 Pyruvate metabolism 3 CFLO000151-PA;CFLO013555-PA;CFLO007170-PA KEGG: 00970+6.1.1.4 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 2 CFLO000511-PA;CFLO002330-PA MetaCyc: PWY-5101 L-isoleucine biosynthesis II 1 CFLO006978-PA Reactome: R-HSA-5358749 S37 mutants of beta-catenin aren't phosphorylated 3 CFLO015916-PA;CFLO007019-PA;CFLO001327-PA MetaCyc: PWY-6527 Stachyose degradation 7 CFLO002812-PA;CFLO006591-PA;CFLO009658-PA;CFLO001267-PA;CFLO009992-PA;CFLO014859-PA;CFLO002708-PA KEGG: 00630+1.1.1.37 Glyoxylate and dicarboxylate metabolism 2 CFLO018047-PA;CFLO007214-PA Reactome: R-HSA-9657050 Defective OGG1 Localization 1 CFLO003212-PA MetaCyc: PWY-2941 L-lysine biosynthesis II 2 CFLO012037-PA;CFLO001389-PA KEGG: 00564+3.1.1.4 Glycerophospholipid metabolism 8 CFLO005379-PA;CFLO005099-PA;CFLO002075-PA;CFLO003207-PA;CFLO000557-PA;CFLO006994-PA;CFLO016978-PA;CFLO013271-PA Reactome: R-HSA-189200 Cellular hexose transport 16 CFLO003019-PA;CFLO007412-PA;CFLO009860-PA;CFLO001958-PA;CFLO005678-PA;CFLO005481-PA;CFLO003018-PA;CFLO000005-PA;CFLO006345-PA;CFLO005857-PA;CFLO012168-PA;CFLO011197-PA;CFLO012561-PA;CFLO005935-PA;CFLO010838-PA;CFLO007724-PA KEGG: 00620+4.1.1.32 Pyruvate metabolism 1 CFLO000017-PA MetaCyc: PWY-7589 Palmitoleate biosynthesis III (cyanobacteria) 5 CFLO015620-PA;CFLO011437-PA;CFLO011434-PA;CFLO014422-PA;CFLO002146-PA KEGG: 00240+3.5.4.5 Pyrimidine metabolism 1 CFLO018007-PA Reactome: R-HSA-5693616 Presynaptic phase of homologous DNA pairing and strand exchange 23 CFLO008817-PA;CFLO014613-PA;CFLO015674-PA;CFLO010802-PA;CFLO006346-PA;CFLO008828-PA;CFLO009733-PA;CFLO004394-PA;CFLO015680-PA;CFLO000913-PA;CFLO001967-PA;CFLO005778-PA;CFLO008873-PA;CFLO006542-PA;CFLO002907-PA;CFLO001240-PA;CFLO010805-PA;CFLO011309-PA;CFLO008121-PA;CFLO012323-PA;CFLO005651-PA;CFLO012610-PA;CFLO012555-PA KEGG: 00910+1.4.1.14 Nitrogen metabolism 1 CFLO014447-PA MetaCyc: PWY-7400 L-arginine biosynthesis IV (archaebacteria) 1 CFLO011964-PA KEGG: 00770+2.6.1.42 Pantothenate and CoA biosynthesis 1 CFLO006978-PA Reactome: R-HSA-4719377 Defective DPM2 causes DPM2-CDG (CDG-1u) 2 CFLO013866-PA;CFLO005971-PA KEGG: 00270+2.6.1.42 Cysteine and methionine metabolism 1 CFLO006978-PA Reactome: R-HSA-112311 Neurotransmitter clearance 2 CFLO001058-PA;CFLO007303-PA KEGG: 00053+1.1.1.22 Ascorbate and aldarate metabolism 1 CFLO003101-PA Reactome: R-HSA-111463 SMAC (DIABLO) binds to IAPs 5 CFLO012308-PA;CFLO012256-PA;CFLO004951-PA;CFLO005777-PA;CFLO003390-PA Reactome: R-HSA-110329 Cleavage of the damaged pyrimidine 16 CFLO013426-PA;CFLO010821-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO007408-PA;CFLO007368-PA;CFLO007391-PA;CFLO000698-PA;CFLO007437-PA;CFLO003212-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO009850-PA;CFLO011812-PA;CFLO004197-PA;CFLO008042-PA MetaCyc: PWY-6963 Ammonia assimilation cycle I 4 CFLO007632-PA;CFLO007633-PA;CFLO014447-PA;CFLO007634-PA MetaCyc: PWY-5871 Ubiquinol-9 biosynthesis (eukaryotic) 4 CFLO002566-PA;CFLO018371-PA;CFLO005148-PA;CFLO001545-PA Reactome: R-HSA-6803204 TP53 Regulates Transcription of Genes Involved in Cytochrome C Release 2 CFLO006104-PA;CFLO000995-PA Reactome: R-HSA-380270 Recruitment of mitotic centrosome proteins and complexes 17 CFLO005781-PA;CFLO012171-PA;CFLO002610-PA;CFLO015159-PA;CFLO018088-PA;CFLO000300-PA;CFLO010998-PA;CFLO009450-PA;CFLO011480-PA;CFLO009841-PA;CFLO000317-PA;CFLO004227-PA;CFLO007730-PA;CFLO005157-PA;CFLO015714-PA;CFLO006511-PA;CFLO019367-PA MetaCyc: PWY-6922 L-Ndelta-acetylornithine biosynthesis 4 CFLO004683-PA;CFLO002293-PA;CFLO003287-PA;CFLO017737-PA Reactome: R-HSA-418597 G alpha (z) signalling events 4 CFLO008792-PA;CFLO015242-PA;CFLO008619-PA;CFLO019116-PA Reactome: R-HSA-9665246 Resistance of ERBB2 KD mutants to neratinib 1 CFLO005384-PA MetaCyc: PWY-7165 L-ascorbate biosynthesis VI (engineered pathway) 1 CFLO001701-PA Reactome: R-HSA-5632681 Ligand-receptor interactions 2 CFLO018032-PA;CFLO018031-PA MetaCyc: PWY-7214 Baicalein degradation (hydrogen peroxide detoxification) 1 CFLO008216-PA Reactome: R-HSA-1368082 RORA activates gene expression 5 CFLO013084-PA;CFLO015438-PA;CFLO016506-PA;CFLO006718-PA;CFLO016304-PA Reactome: R-HSA-380994 ATF4 activates genes in response to endoplasmic reticulum stress 14 CFLO001443-PA;CFLO006212-PA;CFLO019015-PA;CFLO006571-PA;CFLO005696-PA;CFLO005867-PA;CFLO011214-PA;CFLO008860-PA;CFLO010929-PA;CFLO000043-PA;CFLO018054-PA;CFLO015909-PA;CFLO015655-PA;CFLO009644-PA MetaCyc: PWY-7356 Thiamine salvage IV (yeast) 1 CFLO003438-PA KEGG: 00230+6.3.5.2 Purine metabolism 1 CFLO006608-PA KEGG: 00750+2.7.1.35 Vitamin B6 metabolism 1 CFLO011458-PA MetaCyc: PWY-6614 Tetrahydrofolate biosynthesis 1 CFLO012613-PA MetaCyc: PWY-5188 Tetrapyrrole biosynthesis I (from glutamate) 5 CFLO004493-PA;CFLO016469-PA;CFLO001718-PA;CFLO009885-PA;CFLO019070-PA Reactome: R-HSA-9636467 Blockage of phagosome acidification 3 CFLO002135-PA;CFLO004757-PA;CFLO002131-PA Reactome: R-HSA-5576886 Phase 4 - resting membrane potential 6 CFLO000361-PA;CFLO007790-PA;CFLO007711-PA;CFLO006323-PA;CFLO002107-PA;CFLO004356-PA KEGG: 00010+2.7.1.1 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO006809-PA KEGG: 00380+1.13.11.11 Tryptophan metabolism 1 CFLO016899-PA MetaCyc: PWY-6902 Chitin degradation II (Vibrio) 18 CFLO018671-PA;CFLO007240-PA;CFLO008050-PA;CFLO001781-PA;CFLO014190-PA;CFLO006861-PA;CFLO008237-PA;CFLO001957-PA;CFLO004926-PA;CFLO010218-PA;CFLO004916-PA;CFLO001724-PA;CFLO005047-PA;CFLO005046-PA;CFLO019181-PA;CFLO007387-PA;CFLO006976-PA;CFLO010596-PA KEGG: 00020+6.2.1.4 Citrate cycle (TCA cycle) 1 CFLO005915-PA Reactome: R-HSA-418555 G alpha (s) signalling events 5 CFLO008792-PA;CFLO015242-PA;CFLO002695-PA;CFLO008619-PA;CFLO019116-PA Reactome: R-HSA-3301854 Nuclear Pore Complex (NPC) Disassembly 21 CFLO000572-PA;CFLO004818-PA;CFLO001720-PA;CFLO004183-PA;CFLO014832-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO014833-PA;CFLO012487-PA;CFLO005698-PA;CFLO002763-PA;CFLO008088-PA;CFLO013550-PA;CFLO008087-PA;CFLO004819-PA;CFLO005636-PA;CFLO004815-PA;CFLO008090-PA;CFLO014829-PA;CFLO012747-PA;CFLO010441-PA MetaCyc: PWY-7279 Aerobic respiration II (cytochrome c) (yeast) 3 CFLO013472-PA;CFLO006431-PA;CFLO007517-PA MetaCyc: PWY-6733 Sporopollenin precursors biosynthesis 13 CFLO008157-PA;CFLO013401-PA;CFLO013403-PA;CFLO008159-PA;CFLO005715-PA;CFLO008158-PA;CFLO007205-PA;CFLO013406-PA;CFLO008720-PA;CFLO004570-PA;CFLO008715-PA;CFLO013399-PA;CFLO008716-PA Reactome: R-HSA-167161 HIV Transcription Initiation 26 CFLO000007-PA;CFLO014021-PA;CFLO007399-PA;CFLO003054-PA;CFLO015637-PA;CFLO000074-PA;CFLO015169-PA;CFLO001312-PA;CFLO010911-PA;CFLO006370-PA;CFLO007118-PA;CFLO010322-PA;CFLO001309-PA;CFLO009087-PA;CFLO012515-PA;CFLO004196-PA;CFLO006247-PA;CFLO011191-PA;CFLO012310-PA;CFLO008336-PA;CFLO012113-PA;CFLO019377-PA;CFLO007113-PA;CFLO007012-PA;CFLO006498-PA;CFLO019592-PA KEGG: 00030+2.7.6.1 Pentose phosphate pathway 2 CFLO005535-PA;CFLO004111-PA Reactome: R-HSA-2022377 Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins 3 CFLO011218-PA;CFLO002937-PA;CFLO005931-PA KEGG: 00330+2.5.1.16 Arginine and proline metabolism 3 CFLO013289-PA;CFLO013290-PA;CFLO017572-PA Reactome: R-HSA-5632684 Hedgehog 'on' state 40 CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO018031-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO001064-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO000939-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO002304-PA;CFLO007718-PA;CFLO000953-PA;CFLO014805-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO003136-PA;CFLO010590-PA;CFLO007207-PA;CFLO015983-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA;CFLO018032-PA;CFLO015469-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO005641-PA;CFLO014819-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO000122-PA;CFLO004457-PA Reactome: R-HSA-6782210 Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in TC-NER 39 CFLO018166-PA;CFLO009853-PA;CFLO012555-PA;CFLO012310-PA;CFLO008680-PA;CFLO011309-PA;CFLO008121-PA;CFLO002994-PA;CFLO010332-PA;CFLO006247-PA;CFLO008828-PA;CFLO006346-PA;CFLO003314-PA;CFLO006370-PA;CFLO010322-PA;CFLO019062-PA;CFLO009854-PA;CFLO010911-PA;CFLO003985-PA;CFLO004174-PA;CFLO007399-PA;CFLO014021-PA;CFLO007012-PA;CFLO012323-PA;CFLO011905-PA;CFLO011911-PA;CFLO011191-PA;CFLO009733-PA;CFLO002882-PA;CFLO010420-PA;CFLO019810-PA;CFLO016962-PA;CFLO009087-PA;CFLO004196-PA;CFLO012515-PA;CFLO009851-PA;CFLO007174-PA;CFLO013771-PA;CFLO015637-PA Reactome: R-HSA-156827 L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression 88 CFLO006768-PA;CFLO014479-PA;CFLO000744-PA;CFLO005096-PA;CFLO016897-PA;CFLO004405-PA;CFLO017947-PA;CFLO012191-PA;CFLO004224-PA;CFLO006483-PA;CFLO008335-PA;CFLO014883-PA;CFLO019287-PA;CFLO004825-PA;CFLO018839-PA;CFLO012160-PA;CFLO013407-PA;CFLO013411-PA;CFLO016302-PA;CFLO010712-PA;CFLO002329-PA;CFLO012240-PA;CFLO003320-PA;CFLO015631-PA;CFLO012333-PA;CFLO002739-PA;CFLO002901-PA;CFLO014026-PA;CFLO013281-PA;CFLO004176-PA;CFLO008829-PA;CFLO011221-PA;CFLO017333-PA;CFLO010535-PA;CFLO004727-PA;CFLO003311-PA;CFLO008263-PA;CFLO010240-PA;CFLO000349-PA;CFLO013848-PA;CFLO005013-PA;CFLO001260-PA;CFLO017942-PA;CFLO005789-PA;CFLO006630-PA;CFLO013929-PA;CFLO013459-PA;CFLO000612-PA;CFLO010554-PA;CFLO000339-PA;CFLO004441-PA;CFLO003083-PA;CFLO003095-PA;CFLO014117-PA;CFLO017594-PA;CFLO018800-PA;CFLO008228-PA;CFLO008061-PA;CFLO005334-PA;CFLO000889-PA;CFLO012596-PA;CFLO005150-PA;CFLO005822-PA;CFLO000325-PA;CFLO009848-PA;CFLO005804-PA;CFLO012297-PA;CFLO000918-PA;CFLO019663-PA;CFLO004181-PA;CFLO010904-PA;CFLO011483-PA;CFLO005537-PA;CFLO017730-PA;CFLO005709-PA;CFLO015650-PA;CFLO017946-PA;CFLO000629-PA;CFLO004278-PA;CFLO000326-PA;CFLO004325-PA;CFLO014362-PA;CFLO010962-PA;CFLO012584-PA;CFLO002568-PA;CFLO001584-PA;CFLO014395-PA;CFLO008851-PA KEGG: 00130+2.1.1.163 Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis 1 CFLO018555-PA Reactome: R-HSA-5620922 BBSome-mediated cargo-targeting to cilium 11 CFLO001100-PA;CFLO003136-PA;CFLO000032-PA;CFLO015814-PA;CFLO004305-PA;CFLO009580-PA;CFLO001102-PA;CFLO006293-PA;CFLO018650-PA;CFLO001101-PA;CFLO008699-PA KEGG: 00592+1.1.1.1 alpha-Linolenic acid metabolism 1 CFLO016846-PA KEGG: 00281+4.1.3.4 Geraniol degradation 1 CFLO005374-PA Reactome: R-HSA-918233 TRAF3-dependent IRF activation pathway 3 CFLO014989-PA;CFLO016304-PA;CFLO015438-PA MetaCyc: PWY-6580 Phosphatidylinositol biosynthesis I (bacteria) 2 CFLO017716-PA;CFLO017717-PA Reactome: R-HSA-1295596 Spry regulation of FGF signaling 1 CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-3214815 HDACs deacetylate histones 20 CFLO007437-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO000142-PA;CFLO011812-PA;CFLO012680-PA;CFLO009643-PA;CFLO008042-PA;CFLO001492-PA;CFLO004197-PA;CFLO010821-PA;CFLO001638-PA;CFLO005540-PA;CFLO009089-PA;CFLO001629-PA;CFLO001484-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO007391-PA;CFLO016183-PA KEGG: 00230+3.5.4.6 Purine metabolism 1 CFLO009913-PA MetaCyc: PWY-6627 Salinosporamide A biosynthesis 1 CFLO016529-PA Reactome: R-HSA-5687128 MAPK6/MAPK4 signaling 42 CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO014819-PA;CFLO005758-PA;CFLO005173-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO004457-PA;CFLO000953-PA;CFLO000673-PA;CFLO001535-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO015469-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA;CFLO011446-PA;CFLO001592-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO012800-PA;CFLO000939-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO007718-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO001064-PA;CFLO012806-PA Reactome: R-HSA-1483255 PI Metabolism 1 CFLO009727-PA KEGG: 00250+6.3.1.2 Alanine, aspartate and glutamate metabolism 3 CFLO007634-PA;CFLO007633-PA;CFLO007632-PA Reactome: R-HSA-1912399 Pre-NOTCH Processing in the Endoplasmic Reticulum 1 CFLO000670-PA MetaCyc: PWY-7724 Icosapentaenoate biosynthesis III (8-desaturase, mammals) 15 CFLO008779-PA;CFLO010863-PA;CFLO010956-PA;CFLO010625-PA;CFLO015666-PA;CFLO010959-PA;CFLO007106-PA;CFLO008781-PA;CFLO008778-PA;CFLO006701-PA;CFLO004004-PA;CFLO015015-PA;CFLO008780-PA;CFLO010957-PA;CFLO008782-PA KEGG: 04658+3.1.3.16 Th1 and Th2 cell differentiation 27 CFLO008119-PA;CFLO015657-PA;CFLO007785-PA;CFLO010525-PA;CFLO008568-PA;CFLO014456-PA;CFLO003025-PA;CFLO012317-PA;CFLO000693-PA;CFLO016792-PA;CFLO008811-PA;CFLO013630-PA;CFLO016888-PA;CFLO007145-PA;CFLO000144-PA;CFLO016889-PA;CFLO002883-PA;CFLO000943-PA;CFLO019070-PA;CFLO013102-PA;CFLO002009-PA;CFLO019072-PA;CFLO002328-PA;CFLO002906-PA;CFLO006089-PA;CFLO009585-PA;CFLO013622-PA KEGG: 00250+2.6.1.1 Alanine, aspartate and glutamate metabolism 2 CFLO003306-PA;CFLO000623-PA MetaCyc: PWY-5103 L-isoleucine biosynthesis III 1 CFLO006978-PA MetaCyc: PWY-8013 UDP-N-acetyl-D-galactosamine biosynthesis III 2 CFLO019811-PA;CFLO017590-PA MetaCyc: PWY-6281 L-selenocysteine biosynthesis II (archaea and eukaryotes) 4 CFLO016280-PA;CFLO006260-PA;CFLO000024-PA;CFLO009893-PA Reactome: R-HSA-532668 N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle 8 CFLO012683-PA;CFLO019370-PA;CFLO004964-PA;CFLO016610-PA;CFLO000294-PA;CFLO013634-PA;CFLO013918-PA;CFLO015264-PA MetaCyc: PWY-5653 NAD biosynthesis from 2-amino-3-carboxymuconate semialdehyde 3 CFLO006318-PA;CFLO006197-PA;CFLO006198-PA Reactome: R-HSA-3371599 Defective HLCS causes multiple carboxylase deficiency 9 CFLO005702-PA;CFLO003398-PA;CFLO018148-PA;CFLO015688-PA;CFLO015687-PA;CFLO009772-PA;CFLO003580-PA;CFLO003574-PA;CFLO009775-PA Reactome: R-HSA-5685939 HDR through MMEJ (alt-NHEJ) 7 CFLO010802-PA;CFLO006699-PA;CFLO015674-PA;CFLO004549-PA;CFLO015680-PA;CFLO012226-PA;CFLO010805-PA Reactome: R-HSA-168333 NEP/NS2 Interacts with the Cellular Export Machinery 23 CFLO010441-PA;CFLO001592-PA;CFLO014829-PA;CFLO012747-PA;CFLO006277-PA;CFLO008090-PA;CFLO004815-PA;CFLO005636-PA;CFLO004819-PA;CFLO008087-PA;CFLO008088-PA;CFLO002763-PA;CFLO013550-PA;CFLO005698-PA;CFLO012487-PA;CFLO014833-PA;CFLO000120-PA;CFLO002998-PA;CFLO014832-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO004818-PA;CFLO000572-PA Reactome: R-HSA-6802946 Signaling by moderate kinase activity BRAF mutants 4 CFLO013244-PA;CFLO011904-PA;CFLO010617-PA;CFLO017592-PA MetaCyc: PWY-6605 Adenine and adenosine salvage II 1 CFLO000881-PA Reactome: R-HSA-9013695 NOTCH4 Intracellular Domain Regulates Transcription 5 CFLO015438-PA;CFLO008793-PA;CFLO008515-PA;CFLO016304-PA;CFLO004594-PA MetaCyc: PWY-5856 Ubiquinol-9 biosynthesis (prokaryotic) 4 CFLO001545-PA;CFLO005148-PA;CFLO002566-PA;CFLO018371-PA Reactome: R-HSA-500657 Presynaptic function of Kainate receptors 1 CFLO013725-PA Reactome: R-HSA-2408522 Selenoamino acid metabolism 11 CFLO008059-PA;CFLO013263-PA;CFLO009369-PA;CFLO019070-PA;CFLO007984-PA;CFLO018002-PA;CFLO011371-PA;CFLO000657-PA;CFLO011372-PA;CFLO000511-PA;CFLO004943-PA MetaCyc: PWY-7726 (4Z,7Z,10Z,13Z,16Z)-docosapentaenoate biosynthesis (6-desaturase) 6 CFLO013638-PA;CFLO007106-PA;CFLO012118-PA;CFLO013479-PA;CFLO011836-PA;CFLO006701-PA Reactome: R-HSA-3878781 Glycogen storage disease type IV (GBE1) 1 CFLO017262-PA KEGG: 00332+1.2.1.41+2.7.2.11 Carbapenem biosynthesis 1 CFLO002293-PA Reactome: R-HSA-193648 NRAGE signals death through JNK 12 CFLO018240-PA;CFLO017955-PA;CFLO002002-PA;CFLO008869-PA;CFLO001027-PA;CFLO004234-PA;CFLO001285-PA;CFLO012352-PA;CFLO008330-PA;CFLO004869-PA;CFLO002001-PA;CFLO003270-PA Reactome: R-HSA-165181 Inhibition of TSC complex formation by PKB 2 CFLO011980-PA;CFLO016893-PA KEGG: 00520+1.1.1.271 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 1 CFLO004610-PA MetaCyc: PWY-7922 Protein O-mannosylation II (mammals, core M1 and core M2) 7 CFLO013866-PA;CFLO010944-PA;CFLO001127-PA;CFLO001486-PA;CFLO002995-PA;CFLO002603-PA;CFLO017852-PA MetaCyc: PWY-6012-1 Acyl carrier protein activation 1 CFLO000719-PA Reactome: R-HSA-428890 Role of ABL in ROBO-SLIT signaling 4 CFLO009134-PA;CFLO011821-PA;CFLO011820-PA;CFLO009130-PA Reactome: R-HSA-983168 Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation 114 CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO009081-PA;CFLO012372-PA;CFLO000351-PA;CFLO007242-PA;CFLO005584-PA;CFLO006306-PA;CFLO006593-PA;CFLO001968-PA;CFLO002616-PA;CFLO006007-PA;CFLO002773-PA;CFLO001064-PA;CFLO000592-PA;CFLO018970-PA;CFLO000939-PA;CFLO004267-PA;CFLO001477-PA;CFLO017345-PA;CFLO007162-PA;CFLO012286-PA;CFLO004190-PA;CFLO004489-PA;CFLO015914-PA;CFLO003990-PA;CFLO001541-PA;CFLO002304-PA;CFLO005671-PA;CFLO004802-PA;CFLO006211-PA;CFLO001568-PA;CFLO012030-PA;CFLO000953-PA;CFLO002818-PA;CFLO009082-PA;CFLO000256-PA;CFLO001961-PA;CFLO018530-PA;CFLO008248-PA;CFLO005368-PA;CFLO015983-PA;CFLO013095-PA;CFLO006992-PA;CFLO001542-PA;CFLO016531-PA;CFLO007950-PA;CFLO010851-PA;CFLO007213-PA;CFLO013785-PA;CFLO003236-PA;CFLO004072-PA;CFLO000566-PA;CFLO007376-PA;CFLO000932-PA;CFLO004457-PA;CFLO007757-PA;CFLO000053-PA;CFLO011518-PA;CFLO012167-PA;CFLO004203-PA;CFLO015097-PA;CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO006624-PA;CFLO013575-PA;CFLO009576-PA;CFLO014862-PA;CFLO019335-PA;CFLO002683-PA;CFLO008250-PA;CFLO002774-PA;CFLO013133-PA;CFLO004761-PA;CFLO018559-PA;CFLO003317-PA;CFLO002615-PA;CFLO007718-PA;CFLO002678-PA;CFLO008881-PA;CFLO011973-PA;CFLO000968-PA;CFLO012313-PA;CFLO012619-PA;CFLO006565-PA;CFLO017740-PA;CFLO011036-PA;CFLO014805-PA;CFLO018557-PA;CFLO013454-PA;CFLO000673-PA;CFLO007989-PA;CFLO001953-PA;CFLO015669-PA;CFLO007123-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA;CFLO012235-PA;CFLO015469-PA;CFLO003452-PA;CFLO010590-PA;CFLO014368-PA;CFLO007207-PA;CFLO004808-PA;CFLO006146-PA;CFLO014819-PA;CFLO015096-PA;CFLO005912-PA;CFLO006008-PA;CFLO007015-PA;CFLO001478-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA MetaCyc: PWY-3801 Sucrose degradation II (sucrose synthase) 2 CFLO019811-PA;CFLO009992-PA KEGG: 05163+2.7.11.1 Human cytomegalovirus infection 39 CFLO005479-PA;CFLO012097-PA;CFLO008870-PA;CFLO019454-PA;CFLO012344-PA;CFLO000334-PA;CFLO013482-PA;CFLO004063-PA;CFLO012988-PA;CFLO016607-PA;CFLO008104-PA;CFLO019399-PA;CFLO004217-PA;CFLO015084-PA;CFLO018008-PA;CFLO019202-PA;CFLO012394-PA;CFLO000259-PA;CFLO011904-PA;CFLO013134-PA;CFLO004394-PA;CFLO008862-PA;CFLO009016-PA;CFLO007329-PA;CFLO000579-PA;CFLO018537-PA;CFLO010318-PA;CFLO012169-PA;CFLO017854-PA;CFLO012986-PA;CFLO010702-PA;CFLO008981-PA;CFLO014993-PA;CFLO018633-PA;CFLO019568-PA;CFLO002667-PA;CFLO006720-PA;CFLO013251-PA;CFLO005902-PA Reactome: R-HSA-211945 Phase I - Functionalization of compounds 2 CFLO002914-PA;CFLO002913-PA Reactome: R-HSA-5632987 Defective Mismatch Repair Associated With PMS2 1 CFLO001995-PA MetaCyc: PWY-5740 GDP-L-colitose biosynthesis 1 CFLO002873-PA Reactome: R-HSA-8963684 Tyrosine catabolism 4 CFLO002938-PA;CFLO011048-PA;CFLO012357-PA;CFLO003143-PA KEGG: 00900+4.1.1.33 Terpenoid backbone biosynthesis 1 CFLO001964-PA Reactome: R-HSA-170660 Adenylate cyclase activating pathway 4 CFLO015242-PA;CFLO008792-PA;CFLO008619-PA;CFLO019116-PA Reactome: R-HSA-5633231 Defective ALG14 causes congenital myasthenic syndrome (ALG14-CMS) 2 CFLO009306-PA;CFLO008725-PA Reactome: R-HSA-70171 Glycolysis 12 CFLO006957-PA;CFLO005131-PA;CFLO003967-PA;CFLO015167-PA;CFLO009597-PA;CFLO009751-PA;CFLO010285-PA;CFLO019811-PA;CFLO015634-PA;CFLO006809-PA;CFLO017154-PA;CFLO000222-PA MetaCyc: PWY-7411 Phosphatidate biosynthesis (yeast) 9 CFLO011437-PA;CFLO006857-PA;CFLO004213-PA;CFLO014422-PA;CFLO002146-PA;CFLO015620-PA;CFLO006890-PA;CFLO011434-PA;CFLO007382-PA Reactome: R-HSA-390471 Association of TriC/CCT with target proteins during biosynthesis 12 CFLO015538-PA;CFLO011380-PA;CFLO009580-PA;CFLO018650-PA;CFLO008820-PA;CFLO000032-PA;CFLO004305-PA;CFLO004135-PA;CFLO012689-PA;CFLO006758-PA;CFLO014339-PA;CFLO009676-PA MetaCyc: PWY-6344 L-ornithine degradation II (Stickland reaction) 3 CFLO002109-PA;CFLO000590-PA;CFLO003287-PA MetaCyc: PWY-6502 8-oxo-(d)GTP detoxification I 1 CFLO008863-PA Reactome: R-HSA-392451 G beta:gamma signalling through PI3Kgamma 1 CFLO008104-PA KEGG: 00970+6.1.1.1 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 2 CFLO004195-PA;CFLO001921-PA Reactome: R-HSA-373080 Class B/2 (Secretin family receptors) 16 CFLO010340-PA;CFLO001565-PA;CFLO010085-PA;CFLO016803-PA;CFLO014442-PA;CFLO018032-PA;CFLO001007-PA;CFLO003136-PA;CFLO012505-PA;CFLO018031-PA;CFLO016801-PA;CFLO006550-PA;CFLO012503-PA;CFLO001566-PA;CFLO000626-PA;CFLO003275-PA Reactome: R-HSA-912446 Meiotic recombination 26 CFLO008873-PA;CFLO007437-PA;CFLO012309-PA;CFLO013546-PA;CFLO002036-PA;CFLO015680-PA;CFLO007723-PA;CFLO008828-PA;CFLO006346-PA;CFLO011812-PA;CFLO009733-PA;CFLO004197-PA;CFLO008042-PA;CFLO010802-PA;CFLO015674-PA;CFLO010821-PA;CFLO001629-PA;CFLO001995-PA;CFLO001638-PA;CFLO002907-PA;CFLO007408-PA;CFLO007368-PA;CFLO010805-PA;CFLO012158-PA;CFLO001240-PA;CFLO007391-PA KEGG: 04070+3.1.3.36 Phosphatidylinositol signaling system 2 CFLO006751-PA;CFLO002536-PA Reactome: R-HSA-8941856 RUNX3 regulates NOTCH signaling 5 CFLO004594-PA;CFLO016304-PA;CFLO008793-PA;CFLO015438-PA;CFLO008515-PA KEGG: 00051+4.2.1.47 Fructose and mannose metabolism 1 CFLO002873-PA MetaCyc: PWY-7654 (8E,10E)-dodeca-8,10-dienol biosynthesis 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA Reactome: R-HSA-4420332 Defective B3GALT6 causes EDSP2 and SEMDJL1 5 CFLO013499-PA;CFLO019476-PA;CFLO005601-PA;CFLO012314-PA;CFLO012312-PA MetaCyc: PWY-7790 UMP biosynthesis II 3 CFLO011966-PA;CFLO011964-PA;CFLO005916-PA KEGG: 00250+3.5.1.1 Alanine, aspartate and glutamate metabolism 1 CFLO001491-PA Reactome: R-HSA-380320 Recruitment of NuMA to mitotic centrosomes 27 CFLO015159-PA;CFLO002610-PA;CFLO001242-PA;CFLO012171-PA;CFLO014186-PA;CFLO005781-PA;CFLO010998-PA;CFLO002905-PA;CFLO000300-PA;CFLO011480-PA;CFLO009450-PA;CFLO018088-PA;CFLO000333-PA;CFLO016852-PA;CFLO004227-PA;CFLO000317-PA;CFLO016856-PA;CFLO009841-PA;CFLO006561-PA;CFLO019367-PA;CFLO006511-PA;CFLO015714-PA;CFLO000072-PA;CFLO004179-PA;CFLO005157-PA;CFLO007730-PA;CFLO008841-PA MetaCyc: PWY-7219 Adenosine ribonucleotides de novo biosynthesis 7 CFLO016279-PA;CFLO002187-PA;CFLO016779-PA;CFLO005476-PA;CFLO005147-PA;CFLO013827-PA;CFLO000886-PA MetaCyc: PWY-7761 NAD salvage pathway II (PNC IV cycle) 3 CFLO006318-PA;CFLO006197-PA;CFLO006198-PA KEGG: 00350+1.13.11.5 Tyrosine metabolism 1 CFLO003143-PA MetaCyc: PWY-7536 2-amino-3-hydroxycyclopent-2-enone biosynthesis 1 CFLO001018-PA MetaCyc: PWY-6834 Spermidine biosynthesis III 2 CFLO006589-PA;CFLO006590-PA Reactome: R-HSA-5675221 Negative regulation of MAPK pathway 5 CFLO001327-PA;CFLO010617-PA;CFLO015657-PA;CFLO015916-PA;CFLO013244-PA KEGG: 00930+3.1.1.17 Caprolactam degradation 1 CFLO001701-PA MetaCyc: PWY-2221 Entner-Doudoroff pathway III (semi-phosphorylative) 4 CFLO009597-PA;CFLO016901-PA;CFLO001701-PA;CFLO003967-PA Reactome: R-HSA-975578 Reactions specific to the complex N-glycan synthesis pathway 3 CFLO013983-PA;CFLO013982-PA;CFLO015339-PA Reactome: R-HSA-381340 Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation 32 CFLO000237-PA;CFLO013084-PA;CFLO001481-PA;CFLO014390-PA;CFLO001646-PA;CFLO010555-PA;CFLO001065-PA;CFLO000235-PA;CFLO009859-PA;CFLO004160-PA;CFLO003118-PA;CFLO012611-PA;CFLO010732-PA;CFLO013116-PA;CFLO016910-PA;CFLO016506-PA;CFLO008204-PA;CFLO017124-PA;CFLO004157-PA;CFLO008213-PA;CFLO005127-PA;CFLO016304-PA;CFLO006718-PA;CFLO006229-PA;CFLO015437-PA;CFLO009588-PA;CFLO005483-PA;CFLO015438-PA;CFLO007386-PA;CFLO006867-PA;CFLO000702-PA;CFLO016914-PA KEGG: 00073+1.2.1.84 Cutin, suberine and wax biosynthesis 13 CFLO013401-PA;CFLO008157-PA;CFLO008159-PA;CFLO013403-PA;CFLO008158-PA;CFLO005715-PA;CFLO007205-PA;CFLO013406-PA;CFLO004570-PA;CFLO008715-PA;CFLO008720-PA;CFLO008716-PA;CFLO013399-PA Reactome: R-HSA-3000157 Laminin interactions 5 CFLO002821-PA;CFLO007163-PA;CFLO002173-PA;CFLO002172-PA;CFLO012358-PA MetaCyc: PWY-1622 Formaldehyde assimilation I (serine pathway) 7 CFLO016901-PA;CFLO018047-PA;CFLO009597-PA;CFLO007423-PA;CFLO014967-PA;CFLO007214-PA;CFLO010087-PA KEGG: 00970+6.1.1.7 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 4 CFLO006488-PA;CFLO018816-PA;CFLO018815-PA;CFLO011839-PA MetaCyc: PWY-7396 Butanol and isobutanol biosynthesis (engineered) 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-112043 PLC beta mediated events 6 CFLO005525-PA;CFLO013725-PA;CFLO001625-PA;CFLO009620-PA;CFLO005526-PA;CFLO002753-PA Reactome: R-HSA-72706 GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit 90 CFLO010904-PA;CFLO000828-PA;CFLO004181-PA;CFLO019663-PA;CFLO005804-PA;CFLO000325-PA;CFLO009848-PA;CFLO005822-PA;CFLO000918-PA;CFLO012297-PA;CFLO010962-PA;CFLO014362-PA;CFLO012584-PA;CFLO004325-PA;CFLO000326-PA;CFLO004278-PA;CFLO008851-PA;CFLO014395-PA;CFLO001584-PA;CFLO002568-PA;CFLO005709-PA;CFLO005537-PA;CFLO017730-PA;CFLO011483-PA;CFLO017946-PA;CFLO000629-PA;CFLO015650-PA;CFLO000612-PA;CFLO013459-PA;CFLO013929-PA;CFLO006630-PA;CFLO010554-PA;CFLO013848-PA;CFLO010240-PA;CFLO000349-PA;CFLO008263-PA;CFLO017942-PA;CFLO005789-PA;CFLO005013-PA;CFLO001260-PA;CFLO005150-PA;CFLO012596-PA;CFLO000889-PA;CFLO005334-PA;CFLO014117-PA;CFLO003095-PA;CFLO003083-PA;CFLO004441-PA;CFLO000339-PA;CFLO008061-PA;CFLO008228-PA;CFLO018800-PA;CFLO017594-PA;CFLO002739-PA;CFLO015631-PA;CFLO003320-PA;CFLO012333-PA;CFLO012240-PA;CFLO002329-PA;CFLO014026-PA;CFLO002901-PA;CFLO016302-PA;CFLO010712-PA;CFLO017333-PA;CFLO011221-PA;CFLO008829-PA;CFLO001752-PA;CFLO004727-PA;CFLO003311-PA;CFLO010535-PA;CFLO013281-PA;CFLO004176-PA;CFLO016897-PA;CFLO004405-PA;CFLO005096-PA;CFLO000744-PA;CFLO014479-PA;CFLO006768-PA;CFLO004825-PA;CFLO013411-PA;CFLO012160-PA;CFLO013407-PA;CFLO018839-PA;CFLO006483-PA;CFLO008335-PA;CFLO012191-PA;CFLO004224-PA;CFLO017947-PA;CFLO019287-PA;CFLO014883-PA Reactome: R-HSA-68952 DNA replication initiation 7 CFLO012204-PA;CFLO015227-PA;CFLO002987-PA;CFLO001238-PA;CFLO007147-PA;CFLO019062-PA;CFLO003985-PA KEGG: 00360+2.6.1.5 Phenylalanine metabolism 1 CFLO012357-PA KEGG: 00521+2.7.1.1 Streptomycin biosynthesis 1 CFLO006809-PA MetaCyc: PWY-7887 Protein SAMPylation and SAMP-mediated thiolation 2 CFLO011045-PA;CFLO009565-PA KEGG: 00062+4.2.1.17+1.1.1.211 Fatty acid elongation 1 CFLO011836-PA MetaCyc: PWY-6598 Sciadonate biosynthesis 15 CFLO008780-PA;CFLO015015-PA;CFLO004004-PA;CFLO010957-PA;CFLO008782-PA;CFLO015666-PA;CFLO010625-PA;CFLO010959-PA;CFLO010863-PA;CFLO008779-PA;CFLO010956-PA;CFLO006701-PA;CFLO007106-PA;CFLO008778-PA;CFLO008781-PA Reactome: R-HSA-432047 Passive transport by Aquaporins 7 CFLO012032-PA;CFLO012035-PA;CFLO006235-PA;CFLO017126-PA;CFLO014501-PA;CFLO014500-PA;CFLO006236-PA KEGG: 00240+2.7.4.6 Pyrimidine metabolism 4 CFLO010539-PA;CFLO015574-PA;CFLO005692-PA;CFLO012591-PA Reactome: R-HSA-419771 Opsins 3 CFLO011095-PA;CFLO009114-PA;CFLO006790-PA MetaCyc: PWY-3781 Aerobic respiration I (cytochrome c) 3 CFLO013472-PA;CFLO006431-PA;CFLO007517-PA KEGG: 00623+1.1.1.35 Toluene degradation 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA MetaCyc: PWY-5514 UDP-N-acetyl-D-galactosamine biosynthesis II 3 CFLO006957-PA;CFLO007127-PA;CFLO019811-PA KEGG: 00230+1.17.4.1 Purine metabolism 4 CFLO001680-PA;CFLO012552-PA;CFLO000685-PA;CFLO000684-PA MetaCyc: PWY-5989 Stearate biosynthesis II (bacteria and plants) 3 CFLO002012-PA;CFLO016519-PA;CFLO002013-PA Reactome: R-HSA-3134975 Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA 1 CFLO003723-PA KEGG: 00240+2.7.1.48 Pyrimidine metabolism 2 CFLO009649-PA;CFLO000970-PA MetaCyc: PWY-6369 Inositol diphosphates biosynthesis 1 CFLO018799-PA Reactome: R-HSA-1912408 Pre-NOTCH Transcription and Translation 23 CFLO011446-PA;CFLO010821-PA;CFLO005758-PA;CFLO001638-PA;CFLO012800-PA;CFLO001629-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO004594-PA;CFLO007391-PA;CFLO000670-PA;CFLO008515-PA;CFLO016304-PA;CFLO007437-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO015438-PA;CFLO008793-PA;CFLO001535-PA;CFLO011812-PA;CFLO012806-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA Reactome: R-HSA-5689896 Ovarian tumor domain proteases 4 CFLO007019-PA;CFLO013412-PA;CFLO016610-PA;CFLO002375-PA Reactome: R-HSA-8948747 Regulation of PTEN localization 2 CFLO010420-PA;CFLO005894-PA Reactome: R-HSA-139915 Activation of PUMA and translocation to mitochondria 1 CFLO006104-PA Reactome: R-HSA-197264 Nicotinamide salvaging 3 CFLO000049-PA;CFLO002055-PA;CFLO002671-PA KEGG: 00970+6.1.1.5 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 2 CFLO017484-PA;CFLO009369-PA MetaCyc: PWY-7920 Complex N-linked glycan biosynthesis (plants) 2 CFLO013983-PA;CFLO013982-PA Reactome: R-HSA-113501 Inhibition of replication initiation of damaged DNA by RB1/E2F1 5 CFLO001238-PA;CFLO007147-PA;CFLO002987-PA;CFLO012204-PA;CFLO015227-PA Reactome: R-HSA-6811438 Intra-Golgi traffic 13 CFLO018213-PA;CFLO005434-PA;CFLO004446-PA;CFLO002793-PA;CFLO011136-PA;CFLO019786-PA;CFLO012720-PA;CFLO018759-PA;CFLO009975-PA;CFLO006756-PA;CFLO015256-PA;CFLO003179-PA;CFLO008922-PA Reactome: R-HSA-198753 ERK/MAPK targets 1 CFLO013244-PA KEGG: 00513+2.4.1.258 Various types of N-glycan biosynthesis 1 CFLO003953-PA MetaCyc: PWY-7717 3-hydroxy-4-methyl-anthranilate biosynthesis I 1 CFLO006361-PA Reactome: R-HSA-4720475 Defective ALG3 causes ALG3-CDG (CDG-1d) 1 CFLO003953-PA Reactome: R-HSA-804914 Transport of fatty acids 2 CFLO010724-PA;CFLO016868-PA KEGG: 00030+1.1.1.47 Pentose phosphate pathway 1 CFLO007199-PA Reactome: R-HSA-2029485 Role of phospholipids in phagocytosis 2 CFLO002753-PA;CFLO007261-PA Reactome: R-HSA-5625886 Activated PKN1 stimulates transcription of AR (androgen receptor) regulated genes KLK2 and KLK3 12 CFLO010821-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO007437-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO011812-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO007391-PA MetaCyc: PWY-6556 Pyrimidine ribonucleosides salvage II 1 CFLO018007-PA MetaCyc: PWY-6168 Flavin biosynthesis III (fungi) 1 CFLO006180-PA Reactome: R-HSA-9018681 Biosynthesis of protectins 1 CFLO007753-PA Reactome: R-HSA-389977 Post-chaperonin tubulin folding pathway 7 CFLO014186-PA;CFLO018249-PA;CFLO004179-PA;CFLO002918-PA;CFLO006707-PA;CFLO019110-PA;CFLO002905-PA MetaCyc: PWY-7820 Teichuronic acid biosynthesis (B. subtilis 168) 1 CFLO003101-PA Reactome: R-HSA-163615 PKA activation 4 CFLO019116-PA;CFLO008619-PA;CFLO015242-PA;CFLO008792-PA Reactome: R-HSA-168271 Transport of Ribonucleoproteins into the Host Nucleus 21 CFLO014832-PA;CFLO004183-PA;CFLO001720-PA;CFLO000572-PA;CFLO004818-PA;CFLO008088-PA;CFLO013550-PA;CFLO002763-PA;CFLO008087-PA;CFLO005698-PA;CFLO012487-PA;CFLO002998-PA;CFLO000120-PA;CFLO014833-PA;CFLO004815-PA;CFLO004819-PA;CFLO005636-PA;CFLO012747-PA;CFLO014829-PA;CFLO010441-PA;CFLO008090-PA KEGG: 00680+4.2.1.11 Methane metabolism 2 CFLO009597-PA;CFLO016901-PA Reactome: R-HSA-9027277 Erythropoietin activates Phospholipase C gamma (PLCG) 1 CFLO007261-PA KEGG: 00480+1.1.1.42 Glutathione metabolism 1 CFLO009985-PA Reactome: R-HSA-438066 Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation 1 CFLO017592-PA Reactome: R-HSA-418594 G alpha (i) signalling events 17 CFLO014528-PA;CFLO007809-PA;CFLO008792-PA;CFLO015943-PA;CFLO019116-PA;CFLO012008-PA;CFLO013450-PA;CFLO015242-PA;CFLO008619-PA;CFLO007250-PA;CFLO017229-PA;CFLO007965-PA;CFLO009322-PA;CFLO012302-PA;CFLO001625-PA;CFLO017314-PA;CFLO000434-PA Reactome: R-HSA-77108 Utilization of Ketone Bodies 1 CFLO015660-PA Reactome: R-HSA-4641258 Degradation of DVL 35 CFLO001064-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO004439-PA;CFLO013534-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA;CFLO007718-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO000939-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO015469-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO004457-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA Reactome: R-HSA-977225 Amyloid fiber formation 16 CFLO007391-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO010821-PA;CFLO003353-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO008212-PA;CFLO011812-PA;CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO015617-PA;CFLO007989-PA;CFLO007437-PA Reactome: R-HSA-350562 Regulation of ornithine decarboxylase (ODC) 36 CFLO004457-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO014819-PA;CFLO000566-PA;CFLO003236-PA;CFLO015469-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO001095-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010590-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO014805-PA;CFLO000953-PA;CFLO007718-PA;CFLO002304-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO000939-PA;CFLO016560-PA;CFLO003990-PA;CFLO004489-PA;CFLO001064-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO015984-PA Reactome: R-HSA-4641265 Repression of WNT target genes 4 CFLO002960-PA;CFLO006734-PA;CFLO006738-PA;CFLO009267-PA KEGG: 00130+2.5.1.39 Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis 1 CFLO005148-PA Reactome: R-HSA-416482 G alpha (12/13) signalling events 14 CFLO008330-PA;CFLO001285-PA;CFLO012352-PA;CFLO017955-PA;CFLO018240-PA;CFLO012042-PA;CFLO002002-PA;CFLO001027-PA;CFLO008869-PA;CFLO002001-PA;CFLO014070-PA;CFLO003270-PA;CFLO010318-PA;CFLO004869-PA Reactome: R-HSA-111459 Activation of caspases through apoptosome-mediated cleavage 4 CFLO004951-PA;CFLO005777-PA;CFLO003390-PA;CFLO012308-PA KEGG: 00521+5.5.1.4 Streptomycin biosynthesis 2 CFLO017716-PA;CFLO017717-PA MetaCyc: PWY-6664 Di-myo-inositol phosphate biosynthesis 2 CFLO017717-PA;CFLO017716-PA MetaCyc: PWY-7619 Juniperonate biosynthesis 15 CFLO010957-PA;CFLO008782-PA;CFLO004004-PA;CFLO015015-PA;CFLO008780-PA;CFLO007106-PA;CFLO008778-PA;CFLO008781-PA;CFLO006701-PA;CFLO010863-PA;CFLO008779-PA;CFLO010956-PA;CFLO010625-PA;CFLO010959-PA;CFLO015666-PA Reactome: R-HSA-8964041 LDL remodeling 3 CFLO002286-PA;CFLO011745-PA;CFLO019853-PA MetaCyc: PWY-8053 Anandamide biosynthesis II 17 CFLO003207-PA;CFLO005379-PA;CFLO013271-PA;CFLO000557-PA;CFLO006994-PA;CFLO004213-PA;CFLO015620-PA;CFLO000216-PA;CFLO007382-PA;CFLO011434-PA;CFLO005099-PA;CFLO002075-PA;CFLO016978-PA;CFLO017976-PA;CFLO011437-PA;CFLO002146-PA;CFLO014422-PA MetaCyc: PWY-7802 N-end rule pathway II (prokaryotic) 1 CFLO001974-PA MetaCyc: PWY-7206 Pyrimidine deoxyribonucleotides dephosphorylation 1 CFLO002000-PA KEGG: 00600+3.2.1.23 Sphingolipid metabolism 3 CFLO002031-PA;CFLO012387-PA;CFLO003987-PA Reactome: R-HSA-376176 Signaling by ROBO receptors 2 CFLO004533-PA;CFLO007512-PA KEGG: 00562+3.1.4.11 Inositol phosphate metabolism 7 CFLO001388-PA;CFLO007261-PA;CFLO013725-PA;CFLO005525-PA;CFLO008821-PA;CFLO005526-PA;CFLO009620-PA KEGG: 00780+1.1.1.100+4.2.1.59+2.3.1.41 Biotin metabolism 3 CFLO002013-PA;CFLO016519-PA;CFLO002012-PA Reactome: R-HSA-1482839 Acyl chain remodelling of PE 8 CFLO016978-PA;CFLO013271-PA;CFLO000557-PA;CFLO006994-PA;CFLO003207-PA;CFLO005379-PA;CFLO002075-PA;CFLO005099-PA MetaCyc: PWY-735 Jasmonic acid biosynthesis 2 CFLO013479-PA;CFLO013638-PA Reactome: R-HSA-5654732 Negative regulation of FGFR3 signaling 1 CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-1855167 Synthesis of pyrophosphates in the cytosol 2 CFLO002434-PA;CFLO018799-PA KEGG: 00790+3.4.19.9 Folate biosynthesis 1 CFLO008834-PA Reactome: R-HSA-76061 RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter 17 CFLO010673-PA;CFLO000884-PA;CFLO019070-PA;CFLO019378-PA;CFLO001456-PA;CFLO000558-PA;CFLO003936-PA;CFLO002623-PA;CFLO017331-PA;CFLO003937-PA;CFLO004462-PA;CFLO004196-PA;CFLO013811-PA;CFLO002097-PA;CFLO010911-PA;CFLO001122-PA;CFLO014021-PA MetaCyc: PWY-6749 CMP-legionaminate biosynthesis I 4 CFLO001597-PA;CFLO005966-PA;CFLO017590-PA;CFLO008700-PA KEGG: 00020+6.2.1.5 Citrate cycle (TCA cycle) 4 CFLO005915-PA;CFLO001710-PA;CFLO008726-PA;CFLO004169-PA KEGG: 00562+3.1.3.36 Inositol phosphate metabolism 2 CFLO006751-PA;CFLO002536-PA MetaCyc: PWY-5079 L-phenylalanine degradation III 1 CFLO016846-PA KEGG: 00261+4.3.3.7 Monobactam biosynthesis 2 CFLO001389-PA;CFLO012037-PA KEGG: 00240+2.4.2.1 Pyrimidine metabolism 1 CFLO016529-PA KEGG: 00260+5.4.2.11 Glycine, serine and threonine metabolism 1 CFLO007423-PA KEGG: 00983+2.7.1.48 Drug metabolism - other enzymes 2 CFLO009649-PA;CFLO000970-PA MetaCyc: PWY-5123 Trans, trans-farnesyl diphosphate biosynthesis 1 CFLO008710-PA MetaCyc: PWY-6908 Thiamine diphosphate biosynthesis IV (eukaryotes) 1 CFLO003438-PA MetaCyc: PWY-5972 Stearate biosynthesis I (animals) 13 CFLO010956-PA;CFLO010863-PA;CFLO008779-PA;CFLO010625-PA;CFLO015666-PA;CFLO010959-PA;CFLO008781-PA;CFLO008778-PA;CFLO015015-PA;CFLO004004-PA;CFLO008780-PA;CFLO008782-PA;CFLO010957-PA MetaCyc: PWY-7111 Pyruvate fermentation to isobutanol (engineered) 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-202427 Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains 2 CFLO004324-PA;CFLO001114-PA Reactome: R-HSA-163282 Mitochondrial transcription initiation 1 CFLO005122-PA MetaCyc: PWY-7174 S-methyl-5-thio-alpha-D-ribose 1-phosphate degradation II 4 CFLO005639-PA;CFLO019081-PA;CFLO009367-PA;CFLO018203-PA Reactome: R-HSA-749476 RNA Polymerase III Abortive And Retractive Initiation 22 CFLO013811-PA;CFLO002097-PA;CFLO010911-PA;CFLO001122-PA;CFLO014021-PA;CFLO002623-PA;CFLO017331-PA;CFLO012670-PA;CFLO003937-PA;CFLO004462-PA;CFLO004196-PA;CFLO002604-PA;CFLO008375-PA;CFLO019378-PA;CFLO019070-PA;CFLO001456-PA;CFLO003936-PA;CFLO000558-PA;CFLO012668-PA;CFLO001380-PA;CFLO010673-PA;CFLO000884-PA MetaCyc: PWY-2161B Glutamate removal from folates 1 CFLO008834-PA KEGG: 00950+2.6.1.1 Isoquinoline alkaloid biosynthesis 2 CFLO000623-PA;CFLO003306-PA Reactome: R-HSA-75815 Ubiquitin-dependent degradation of Cyclin D 35 CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO000939-PA;CFLO002678-PA;CFLO011973-PA;CFLO002304-PA;CFLO007718-PA;CFLO015984-PA;CFLO014806-PA;CFLO002095-PA;CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO012372-PA;CFLO006593-PA;CFLO001064-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO014819-PA;CFLO011518-PA;CFLO000631-PA;CFLO015980-PA;CFLO004457-PA;CFLO000953-PA;CFLO014805-PA;CFLO000673-PA;CFLO001568-PA;CFLO010590-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO003059-PA;CFLO002818-PA;CFLO001095-PA;CFLO015469-PA;CFLO003452-PA;CFLO018530-PA KEGG: 00020+2.3.1.12 Citrate cycle (TCA cycle) 1 CFLO013555-PA MetaCyc: PWY-7238 Sucrose biosynthesis II 4 CFLO019811-PA;CFLO001588-PA;CFLO018464-PA;CFLO009992-PA MetaCyc: PWY-2942 L-lysine biosynthesis III 2 CFLO001389-PA;CFLO012037-PA KEGG: 00330+2.7.2.11 Arginine and proline metabolism 1 CFLO002293-PA Reactome: R-HSA-5140745 WNT5A-dependent internalization of FZD2, FZD5 and ROR2 3 CFLO006324-PA;CFLO004342-PA;CFLO005139-PA MetaCyc: PWY-6857 Retinol biosynthesis 2 CFLO004631-PA;CFLO004627-PA Reactome: R-HSA-1650814 Collagen biosynthesis and modifying enzymes 6 CFLO011235-PA;CFLO011237-PA;CFLO016374-PA;CFLO016400-PA;CFLO018020-PA;CFLO012358-PA Reactome: R-HSA-9634285 Constitutive Signaling by Overexpressed ERBB2 1 CFLO005384-PA Reactome: R-HSA-418457 cGMP effects 2 CFLO018565-PA;CFLO018567-PA Reactome: R-HSA-975144 IRAK1 recruits IKK complex upon TLR7/8 or 9 stimulation 1 CFLO001451-PA Reactome: R-HSA-6787639 GDP-fucose biosynthesis 2 CFLO002873-PA;CFLO004610-PA KEGG: 00052+5.1.3.2 Galactose metabolism 2 CFLO006591-PA;CFLO001267-PA KEGG: 00860+1.3.3.4 Porphyrin and chlorophyll metabolism 1 CFLO019161-PA KEGG: 00604+3.2.1.23 Glycosphingolipid biosynthesis - ganglio series 3 CFLO012387-PA;CFLO003987-PA;CFLO002031-PA Reactome: R-HSA-164843 2-LTR circle formation 2 CFLO010841-PA;CFLO017589-PA Reactome: R-HSA-8853659 RET signaling 8 CFLO005739-PA;CFLO005738-PA;CFLO005732-PA;CFLO005736-PA;CFLO005734-PA;CFLO005735-PA;CFLO005740-PA;CFLO005737-PA Reactome: R-HSA-5576892 Phase 0 - rapid depolarisation 9 CFLO015260-PA;CFLO002975-PA;CFLO017592-PA;CFLO012328-PA;CFLO001551-PA;CFLO019824-PA;CFLO014207-PA;CFLO009836-PA;CFLO014204-PA KEGG: 00785+2.3.1.181 Lipoic acid metabolism 3 CFLO006879-PA;CFLO004843-PA;CFLO003398-PA Reactome: R-HSA-163754 Insulin effects increased synthesis of Xylulose-5-Phosphate 2 CFLO000118-PA;CFLO006969-PA KEGG: 00052+5.1.3.3 Galactose metabolism 1 CFLO014121-PA MetaCyc: PWY-6944 Androstenedione degradation 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA KEGG: 00230+6.3.5.3 Purine metabolism 1 CFLO009307-PA MetaCyc: PWY-5826 Hypoglycin biosynthesis 3 CFLO000936-PA;CFLO000938-PA;CFLO007834-PA Reactome: R-HSA-111367 SLBP independent Processing of Histone Pre-mRNAs 5 CFLO010491-PA;CFLO013907-PA;CFLO013992-PA;CFLO004326-PA;CFLO013795-PA KEGG: 00030+3.1.3.11 Pentose phosphate pathway 1 CFLO009994-PA KEGG: 00514+2.4.1.109 Other types of O-glycan biosynthesis 6 CFLO017852-PA;CFLO010944-PA;CFLO002603-PA;CFLO002995-PA;CFLO001127-PA;CFLO001486-PA Reactome: R-HSA-5083635 Defective B3GALTL causes Peters-plus syndrome (PpS) 16 CFLO006657-PA;CFLO012348-PA;CFLO003728-PA;CFLO008163-PA;CFLO012350-PA;CFLO000420-PA;CFLO000389-PA;CFLO014598-PA;CFLO003729-PA;CFLO008165-PA;CFLO000419-PA;CFLO015912-PA;CFLO009453-PA;CFLO003305-PA;CFLO004125-PA;CFLO009361-PA MetaCyc: PWY-7254 TCA cycle VII (acetate-producers) 4 CFLO009985-PA;CFLO006431-PA;CFLO013472-PA;CFLO004684-PA MetaCyc: PWY-5466 Matairesinol biosynthesis 1 CFLO008216-PA KEGG: 05165+2.7.11.1 Human papillomavirus infection 39 CFLO010318-PA;CFLO000579-PA;CFLO018537-PA;CFLO007329-PA;CFLO004394-PA;CFLO008862-PA;CFLO009016-PA;CFLO013134-PA;CFLO011904-PA;CFLO005902-PA;CFLO006720-PA;CFLO013251-PA;CFLO019568-PA;CFLO002667-PA;CFLO008981-PA;CFLO014993-PA;CFLO018633-PA;CFLO012986-PA;CFLO010702-PA;CFLO017854-PA;CFLO012169-PA;CFLO000334-PA;CFLO019454-PA;CFLO012344-PA;CFLO008870-PA;CFLO005479-PA;CFLO012097-PA;CFLO019202-PA;CFLO018008-PA;CFLO012394-PA;CFLO000259-PA;CFLO004217-PA;CFLO019399-PA;CFLO015084-PA;CFLO016607-PA;CFLO008104-PA;CFLO004063-PA;CFLO012988-PA;CFLO013482-PA Reactome: R-HSA-2424491 DAP12 signaling 1 CFLO007261-PA Reactome: R-HSA-8849932 Synaptic adhesion-like molecules 1 CFLO018678-PA MetaCyc: PWY-7586 Beta-1,4-d-mannosyl-n-acetyl-d-glucosamine degradation 2 CFLO003382-PA;CFLO000596-PA KEGG: 00510+2.7.8.15 N-Glycan biosynthesis 1 CFLO016451-PA KEGG: 00051+2.7.1.1 Fructose and mannose metabolism 1 CFLO006809-PA MetaCyc: PWY-8001 Felinine and 3-methyl-3-sulfanylbutan-1-ol biosynthesis 3 CFLO000936-PA;CFLO000938-PA;CFLO007834-PA KEGG: 00520+2.7.7.12 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 1 CFLO002708-PA MetaCyc: PWY-6728 Methylaspartate cycle 10 CFLO004169-PA;CFLO008726-PA;CFLO006431-PA;CFLO004684-PA;CFLO001710-PA;CFLO018047-PA;CFLO009985-PA;CFLO013472-PA;CFLO005915-PA;CFLO007214-PA KEGG: 00260+1.8.1.4 Glycine, serine and threonine metabolism 1 CFLO000151-PA Reactome: R-HSA-5673001 RAF/MAP kinase cascade 13 CFLO009698-PA;CFLO001520-PA;CFLO013244-PA;CFLO005735-PA;CFLO010486-PA;CFLO005737-PA;CFLO005736-PA;CFLO012259-PA;CFLO005732-PA;CFLO005734-PA;CFLO005739-PA;CFLO017592-PA;CFLO005738-PA KEGG: 00020+4.2.1.2 Citrate cycle (TCA cycle) 1 CFLO004684-PA Reactome: R-HSA-379716 Cytosolic tRNA aminoacylation 18 CFLO000511-PA;CFLO011372-PA;CFLO002570-PA;CFLO019070-PA;CFLO007984-PA;CFLO004692-PA;CFLO013263-PA;CFLO000362-PA;CFLO004943-PA;CFLO011371-PA;CFLO000657-PA;CFLO006488-PA;CFLO004195-PA;CFLO018002-PA;CFLO012249-PA;CFLO008059-PA;CFLO009893-PA;CFLO009369-PA MetaCyc: PWY-6708 Ubiquinol-8 biosynthesis (prokaryotic) 4 CFLO005148-PA;CFLO018371-PA;CFLO002566-PA;CFLO001545-PA Reactome: R-HSA-111957 Cam-PDE 1 activation 1 CFLO007800-PA MetaCyc: PWY-6643 Coenzyme M biosynthesis II 2 CFLO003306-PA;CFLO000623-PA Reactome: R-HSA-111458 Formation of apoptosome 5 CFLO004951-PA;CFLO002725-PA;CFLO005777-PA;CFLO003390-PA;CFLO012308-PA KEGG: 04150+2.7.11.1 mTOR signaling pathway 39 CFLO013482-PA;CFLO016607-PA;CFLO008104-PA;CFLO004063-PA;CFLO012988-PA;CFLO004217-PA;CFLO019399-PA;CFLO015084-PA;CFLO018008-PA;CFLO019202-PA;CFLO012394-PA;CFLO000259-PA;CFLO005479-PA;CFLO012097-PA;CFLO008870-PA;CFLO019454-PA;CFLO012344-PA;CFLO000334-PA;CFLO012986-PA;CFLO010702-PA;CFLO017854-PA;CFLO012169-PA;CFLO008981-PA;CFLO018633-PA;CFLO014993-PA;CFLO019568-PA;CFLO002667-PA;CFLO005902-PA;CFLO006720-PA;CFLO013251-PA;CFLO013134-PA;CFLO011904-PA;CFLO004394-PA;CFLO008862-PA;CFLO009016-PA;CFLO007329-PA;CFLO010318-PA;CFLO000579-PA;CFLO018537-PA Reactome: R-HSA-212300 PRC2 methylates histones and DNA 18 CFLO002036-PA;CFLO013421-PA;CFLO013546-PA;CFLO016512-PA;CFLO007437-PA;CFLO018793-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO011812-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO006881-PA;CFLO010821-PA;CFLO000669-PA;CFLO014404-PA;CFLO007391-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA MetaCyc: PWY-7799 Arg/N-end rule pathway (eukaryotic) 6 CFLO012617-PA;CFLO000148-PA;CFLO016402-PA;CFLO007748-PA;CFLO004440-PA;CFLO001974-PA Reactome: R-HSA-375276 Peptide ligand-binding receptors 6 CFLO007965-PA;CFLO017229-PA;CFLO014528-PA;CFLO000434-PA;CFLO016845-PA;CFLO016834-PA Reactome: R-HSA-6782861 Synthesis of wybutosine at G37 of tRNA(Phe) 1 CFLO008044-PA KEGG: 00680+5.4.2.11 Methane metabolism 1 CFLO007423-PA KEGG: 00061+6.4.1.2 Fatty acid biosynthesis 1 CFLO005702-PA Reactome: R-HSA-5693607 Processing of DNA double-strand break ends 41 CFLO006542-PA;CFLO003071-PA;CFLO010805-PA;CFLO007391-PA;CFLO008121-PA;CFLO011309-PA;CFLO012610-PA;CFLO012555-PA;CFLO001790-PA;CFLO014613-PA;CFLO008817-PA;CFLO014841-PA;CFLO010802-PA;CFLO008828-PA;CFLO006346-PA;CFLO004394-PA;CFLO015680-PA;CFLO001967-PA;CFLO007437-PA;CFLO005778-PA;CFLO013546-PA;CFLO004457-PA;CFLO007408-PA;CFLO007368-PA;CFLO010821-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO012323-PA;CFLO005651-PA;CFLO004197-PA;CFLO011903-PA;CFLO008042-PA;CFLO001098-PA;CFLO015674-PA;CFLO011812-PA;CFLO009733-PA;CFLO000913-PA;CFLO017458-PA;CFLO014839-PA;CFLO008873-PA;CFLO002036-PA MetaCyc: PWY-7560 Methylerythritol phosphate pathway II 3 CFLO008710-PA;CFLO014211-PA;CFLO017896-PA Reactome: R-HSA-6803211 TP53 Regulates Transcription of Death Receptors and Ligands 1 CFLO006104-PA Reactome: R-HSA-5467348 Truncations of AMER1 destabilize the destruction complex 3 CFLO007019-PA;CFLO015916-PA;CFLO001327-PA Reactome: R-HSA-1358803 Downregulation of ERBB2:ERBB3 signaling 1 CFLO007162-PA MetaCyc: PWY-6619 Adenine and adenosine salvage VI 2 CFLO004445-PA;CFLO013599-PA Reactome: R-HSA-196025 Formation of annular gap junctions 3 CFLO004342-PA;CFLO013544-PA;CFLO006324-PA KEGG: 00480+4.3.2.7 Glutathione metabolism 1 CFLO013383-PA Reactome: R-HSA-879415 Advanced glycosylation endproduct receptor signaling 4 CFLO001978-PA;CFLO012683-PA;CFLO004964-PA;CFLO013244-PA Reactome: R-HSA-9018519 Estrogen-dependent gene expression 32 CFLO015637-PA;CFLO001535-PA;CFLO002036-PA;CFLO004196-PA;CFLO004197-PA;CFLO008042-PA;CFLO011812-PA;CFLO005758-PA;CFLO010821-PA;CFLO001629-PA;CFLO001638-PA;CFLO013084-PA;CFLO007012-PA;CFLO006498-PA;CFLO007362-PA;CFLO007408-PA;CFLO007368-PA;CFLO019592-PA;CFLO014021-PA;CFLO015438-PA;CFLO007437-PA;CFLO010911-PA;CFLO013546-PA;CFLO007118-PA;CFLO012806-PA;CFLO012800-PA;CFLO001352-PA;CFLO011446-PA;CFLO007361-PA;CFLO016304-PA;CFLO007113-PA;CFLO007391-PA KEGG: 00430+1.13.11.20 Taurine and hypotaurine metabolism 1 CFLO002449-PA Reactome: R-HSA-5620916 VxPx cargo-targeting to cilium 6 CFLO011599-PA;CFLO016175-PA;CFLO005962-PA;CFLO018657-PA;CFLO006179-PA;CFLO004109-PA Reactome: R-HSA-6804115 TP53 regulates transcription of additional cell cycle genes whose exact role in the p53 pathway remain uncertain 6 CFLO016927-PA;CFLO005157-PA;CFLO010829-PA;CFLO010048-PA;CFLO010235-PA;CFLO001927-PA Reactome: R-HSA-9027276 Erythropoietin activates Phosphoinositide-3-kinase (PI3K) 1 CFLO011291-PA KEGG: 00860+4.4.1.17 Porphyrin and chlorophyll metabolism 1 CFLO000580-PA Reactome: R-HSA-159236 Transport of Mature mRNA derived from an Intron-Containing Transcript 40 CFLO000613-PA;CFLO012401-PA;CFLO005636-PA;CFLO016942-PA;CFLO015268-PA;CFLO014829-PA;CFLO010441-PA;CFLO013992-PA;CFLO008090-PA;CFLO003235-PA;CFLO001720-PA;CFLO004183-PA;CFLO000572-PA;CFLO002763-PA;CFLO008088-PA;CFLO013550-PA;CFLO013126-PA;CFLO008087-PA;CFLO005698-PA;CFLO013732-PA;CFLO000120-PA;CFLO014833-PA;CFLO004815-PA;CFLO004819-PA;CFLO007347-PA;CFLO001068-PA;CFLO012747-PA;CFLO013670-PA;CFLO002733-PA;CFLO014832-PA;CFLO002920-PA;CFLO012836-PA;CFLO016375-PA;CFLO004818-PA;CFLO007349-PA;CFLO013673-PA;CFLO002919-PA;CFLO012487-PA;CFLO002998-PA;CFLO017483-PA Reactome: R-HSA-194840 Rho GTPase cycle 54 CFLO003270-PA;CFLO008869-PA;CFLO018768-PA;CFLO005173-PA;CFLO015262-PA;CFLO015965-PA;CFLO011447-PA;CFLO018240-PA;CFLO017955-PA;CFLO010058-PA;CFLO008479-PA;CFLO002825-PA;CFLO016216-PA;CFLO008047-PA;CFLO009395-PA;CFLO004108-PA;CFLO006082-PA;CFLO018413-PA;CFLO017989-PA;CFLO011917-PA;CFLO016210-PA;CFLO005740-PA;CFLO019032-PA;CFLO014185-PA;CFLO011870-PA;CFLO009027-PA;CFLO006751-PA;CFLO000436-PA;CFLO002002-PA;CFLO005699-PA;CFLO015922-PA;CFLO009303-PA;CFLO001341-PA;CFLO004869-PA;CFLO009354-PA;CFLO018767-PA;CFLO001027-PA;CFLO018748-PA;CFLO009007-PA;CFLO011601-PA;CFLO008330-PA;CFLO012352-PA;CFLO000360-PA;CFLO005723-PA;CFLO001935-PA;CFLO004620-PA;CFLO006722-PA;CFLO002001-PA;CFLO010532-PA;CFLO004113-PA;CFLO010319-PA;CFLO004555-PA;CFLO008516-PA;CFLO001285-PA KEGG: 00620+3.1.2.6 Pyruvate metabolism 1 CFLO002707-PA MetaCyc: PWY-5108 L-isoleucine biosynthesis V 3 CFLO006978-PA;CFLO016902-PA;CFLO016628-PA KEGG: 00010+6.2.1.1 Glycolysis / Gluconeogenesis 2 CFLO016902-PA;CFLO016628-PA Reactome: R-HSA-5083629 Defective POMT2 causes MDDGA2, MDDGB2 and MDDGC2 3 CFLO009857-PA;CFLO001486-PA;CFLO002995-PA KEGG: 00515+2.4.1.109 Mannose type O-glycan biosynthesis 6 CFLO017852-PA;CFLO002603-PA;CFLO002995-PA;CFLO001127-PA;CFLO001486-PA;CFLO010944-PA KEGG: 00270+6.3.2.2 Cysteine and methionine metabolism 1 CFLO011825-PA Reactome: R-HSA-399997 Acetylcholine regulates insulin secretion 2 CFLO003448-PA;CFLO013725-PA Reactome: R-HSA-111457 Release of apoptotic factors from the mitochondria 4 CFLO012308-PA;CFLO012256-PA;CFLO005777-PA;CFLO004951-PA Reactome: R-HSA-2160456 Phenylketonuria 1 CFLO009716-PA KEGG: 00970+6.1.1.20 Aminoacyl-tRNA biosynthesis 4 CFLO018893-PA;CFLO000497-PA;CFLO002570-PA;CFLO007984-PA Reactome: R-HSA-381070 IRE1alpha activates chaperones 1 CFLO004492-PA Reactome: R-HSA-141444 Amplification of signal from unattached kinetochores via a MAD2 inhibitory signal 26 CFLO000525-PA;CFLO002880-PA;CFLO001646-PA;CFLO010396-PA;CFLO013646-PA;CFLO012319-PA;CFLO012217-PA;CFLO003075-PA;CFLO014829-PA;CFLO017731-PA;CFLO008775-PA;CFLO001592-PA;CFLO001327-PA;CFLO013088-PA;CFLO012124-PA;CFLO015916-PA;CFLO014832-PA;CFLO002636-PA;CFLO000598-PA;CFLO012487-PA;CFLO002998-PA;CFLO014329-PA;CFLO014833-PA;CFLO006290-PA;CFLO015008-PA;CFLO003172-PA Reactome: R-HSA-8862803 Deregulated CDK5 triggers multiple neurodegenerative pathways in Alzheimer's disease models 2 CFLO016842-PA;CFLO007807-PA MetaCyc: PWY-6906 Chitin derivatives degradation 3 CFLO007127-PA;CFLO018399-PA;CFLO006957-PA Reactome: R-HSA-8963888 Chylomicron assembly 7 CFLO002306-PA;CFLO014120-PA;CFLO016031-PA;CFLO002286-PA;CFLO004961-PA;CFLO019853-PA;CFLO011745-PA Reactome: R-HSA-381038 XBP1(S) activates chaperone genes 6 CFLO012332-PA;CFLO007730-PA;CFLO004154-PA;CFLO018165-PA;CFLO000481-PA;CFLO008280-PA MetaCyc: PWY-6883 Pyruvate fermentation to butanol II (engineered) 2 CFLO012118-PA;CFLO011836-PA MetaCyc: PWY-5353 Arachidonate biosynthesis I (6-desaturase, lower eukaryotes) 2 CFLO006701-PA;CFLO007106-PA KEGG: 00010+1.2.1.12 Glycolysis / Gluconeogenesis 1 CFLO009751-PA Reactome: R-HSA-3928663 EPHA-mediated growth cone collapse 1 CFLO010318-PA MetaCyc: PWY-6945 Cholesterol degradation to androstenedione I (cholesterol oxidase) 2 CFLO011836-PA;CFLO012118-PA MetaCyc: PWY-7573 GDP-mycosamine biosynthesis 1 CFLO002873-PA Reactome: R-HSA-2672351 Stimuli-sensing channels 26 CFLO013917-PA;CFLO009824-PA;CFLO007202-PA;CFLO007707-PA;CFLO014860-PA;CFLO010692-PA;CFLO013916-PA;CFLO000817-PA;CFLO007153-PA;CFLO007201-PA;CFLO009794-PA;CFLO011179-PA;CFLO008191-PA;CFLO007171-PA;CFLO017440-PA;CFLO003330-PA;CFLO005056-PA;CFLO015440-PA;CFLO019698-PA;CFLO000810-PA;CFLO019203-PA;CFLO005200-PA;CFLO008806-PA;CFLO000818-PA;CFLO005055-PA;CFLO013520-PA Reactome: R-HSA-1362409 Mitochondrial iron-sulfur cluster biogenesis 8 CFLO001497-PA;CFLO018667-PA;CFLO016778-PA;CFLO002662-PA;CFLO004115-PA;CFLO006634-PA;CFLO001382-PA;CFLO001423-PA MetaCyc: PWY-4261 Glycerol degradation I 6 CFLO009826-PA;CFLO003214-PA;CFLO003232-PA;CFLO008294-PA;CFLO015003-PA;CFLO001808-PA Reactome: R-HSA-6798695 Neutrophil degranulation 73 CFLO014187-PA;CFLO016675-PA;CFLO014805-PA;CFLO018092-PA;CFLO018650-PA;CFLO010946-PA;CFLO010922-PA;CFLO000660-PA;CFLO004493-PA;CFLO014819-PA;CFLO014409-PA;CFLO002055-PA;CFLO004050-PA;CFLO009346-PA;CFLO003960-PA;CFLO014806-PA;CFLO004073-PA;CFLO010543-PA;CFLO009580-PA;CFLO017589-PA;CFLO011458-PA;CFLO004324-PA;CFLO010203-PA;CFLO004761-PA;CFLO013233-PA;CFLO012564-PA;CFLO018007-PA;CFLO016610-PA;CFLO003390-PA;CFLO009884-PA;CFLO003317-PA;CFLO016674-PA;CFLO008834-PA;CFLO012030-PA;CFLO013634-PA;CFLO019811-PA;CFLO007364-PA;CFLO003723-PA;CFLO001568-PA;CFLO010841-PA;CFLO018530-PA;CFLO000566-PA;CFLO015017-PA;CFLO003353-PA;CFLO010486-PA;CFLO011439-PA;CFLO018080-PA;CFLO005771-PA;CFLO003951-PA;CFLO000881-PA;CFLO016529-PA;CFLO004174-PA;CFLO013534-PA;CFLO001114-PA;CFLO012372-PA;CFLO003187-PA;CFLO008212-PA;CFLO004169-PA;CFLO002007-PA;CFLO014128-PA;CFLO016459-PA;CFLO004204-PA;CFLO006297-PA;CFLO012573-PA;CFLO003984-PA;CFLO010201-PA;CFLO007753-PA;CFLO002304-PA;CFLO001978-PA;CFLO018464-PA;CFLO016449-PA;CFLO012580-PA;CFLO012387-PA KEGG: 00730+2.2.1.7 Thiamine metabolism 1 CFLO014211-PA Reactome: R-HSA-176407 Conversion from APC/C:Cdc20 to APC/C:Cdh1 in late anaphase 8 CFLO009576-PA;CFLO006992-PA;CFLO010492-PA;CFLO007123-PA;CFLO007015-PA;CFLO006211-PA;CFLO005584-PA;CFLO012167-PA Reactome: R-HSA-2660826 Constitutive Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant 6 CFLO002956-PA;CFLO002955-PA;CFLO001394-PA;CFLO009368-PA;CFLO011086-PA;CFLO001395-PA MetaCyc: PWY-7661 Protein N-glycosylation (Haloferax volcanii) 1 CFLO013866-PA Reactome: R-HSA-156588 Glucuronidation 16 CFLO012506-PA;CFLO010227-PA;CFLO012292-PA;CFLO000377-PA;CFLO017235-PA;CFLO019688-PA;CFLO002700-PA;CFLO006367-PA;CFLO002310-PA;CFLO007006-PA;CFLO004486-PA;CFLO015907-PA;CFLO017850-PA;CFLO002158-PA;CFLO008472-PA;CFLO019855-PA Reactome: R-HSA-2219530 Constitutive Signaling by Aberrant PI3K in Cancer 2 CFLO009698-PA;CFLO005740-PA KEGG: 00830+1.1.1.1 Retinol metabolism 1 CFLO016846-PA Reactome: R-HSA-5617472 Activation of anterior HOX genes in hindbrain development during early embryogenesis 23 CFLO002036-PA;CFLO013546-PA;CFLO016512-PA;CFLO010911-PA;CFLO007437-PA;CFLO015637-PA;CFLO015438-PA;CFLO014021-PA;CFLO011812-PA;CFLO008042-PA;CFLO004197-PA;CFLO004196-PA;CFLO012105-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO002890-PA;CFLO010821-PA;CFLO007391-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO016304-PA;CFLO006718-PA;CFLO007012-PA Reactome: R-HSA-373752 Netrin-1 signaling 1 CFLO018832-PA KEGG: 00340+2.1.1.22 Histidine metabolism 1 CFLO013266-PA Reactome: R-HSA-1614635 Sulfur amino acid metabolism 1 CFLO012612-PA KEGG: 00330+2.6.1.13 Arginine and proline metabolism 1 CFLO003287-PA Reactome: R-HSA-202670 ERKs are inactivated 1 CFLO013244-PA KEGG: 00250+2.6.1.16 Alanine, aspartate and glutamate metabolism 1 CFLO017590-PA Reactome: R-HSA-9640463 Wax biosynthesis 17 CFLO013403-PA;CFLO013401-PA;CFLO004570-PA;CFLO008719-PA;CFLO013399-PA;CFLO013402-PA;CFLO017653-PA;CFLO007205-PA;CFLO013406-PA;CFLO008159-PA;CFLO008158-PA;CFLO005715-PA;CFLO008157-PA;CFLO013404-PA;CFLO008715-PA;CFLO008720-PA;CFLO008716-PA MetaCyc: PWY-3861 Mannitol degradation II 1 CFLO000596-PA Reactome: R-HSA-5579026 Defective CYP11A1 causes Adrenal insufficiency, congenital, with 46,XY sex reversal (AICSR) 3 CFLO010536-PA;CFLO001497-PA;CFLO002662-PA KEGG: 00650+4.1.3.4 Butanoate metabolism 1 CFLO005374-PA KEGG: 00130+2.1.1.222+2.1.1.64 Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis 2 CFLO002566-PA;CFLO018371-PA KEGG: 00950+1.14.16.2 Isoquinoline alkaloid biosynthesis 1 CFLO000009-PA MetaCyc: PWY-6609 Adenine and adenosine salvage III 3 CFLO012580-PA;CFLO012573-PA;CFLO016529-PA Reactome: R-HSA-9648025 EML4 and NUDC in mitotic spindle formation 34 CFLO001327-PA;CFLO002636-PA;CFLO013088-PA;CFLO012124-PA;CFLO000598-PA;CFLO006290-PA;CFLO014833-PA;CFLO014329-PA;CFLO009841-PA;CFLO003172-PA;CFLO006561-PA;CFLO002905-PA;CFLO000525-PA;CFLO002880-PA;CFLO001646-PA;CFLO001242-PA;CFLO013646-PA;CFLO012217-PA;CFLO003075-PA;CFLO014186-PA;CFLO014829-PA;CFLO004179-PA;CFLO015916-PA;CFLO014832-PA;CFLO008841-PA;CFLO016852-PA;CFLO012487-PA;CFLO002998-PA;CFLO015008-PA;CFLO010396-PA;CFLO012319-PA;CFLO008775-PA;CFLO001592-PA;CFLO017731-PA Reactome: R-HSA-1483213 Synthesis of PE 2 CFLO008188-PA;CFLO000216-PA Reactome: R-HSA-6790901 rRNA modification in the nucleus and cytosol 36 CFLO007704-PA;CFLO003184-PA;CFLO002879-PA;CFLO005901-PA;CFLO004025-PA;CFLO005972-PA;CFLO010627-PA;CFLO006045-PA;CFLO007792-PA;CFLO000826-PA;CFLO000701-PA;CFLO005709-PA;CFLO008111-PA;CFLO014542-PA;CFLO004278-PA;CFLO011221-PA;CFLO013848-PA;CFLO012586-PA;CFLO005798-PA;CFLO019059-PA;CFLO008833-PA;CFLO009063-PA;CFLO000315-PA;CFLO004367-PA;CFLO006752-PA;CFLO001666-PA;CFLO016603-PA;CFLO005334-PA;CFLO013577-PA;CFLO000574-PA;CFLO002651-PA;CFLO002408-PA;CFLO009735-PA;CFLO002079-PA;CFLO012379-PA;CFLO017472-PA Reactome: R-HSA-8939236 RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of HSCs 51 CFLO013534-PA;CFLO004439-PA;CFLO006593-PA;CFLO012372-PA;CFLO015984-PA;CFLO007437-PA;CFLO014806-PA;CFLO013546-PA;CFLO002095-PA;CFLO010322-PA;CFLO001064-PA;CFLO006247-PA;CFLO000939-PA;CFLO004489-PA;CFLO003990-PA;CFLO007361-PA;CFLO007718-PA;CFLO011973-PA;CFLO002678-PA;CFLO002304-PA;CFLO007391-PA;CFLO014805-PA;CFLO001568-PA;CFLO000673-PA;CFLO000953-PA;CFLO002036-PA;CFLO001095-PA;CFLO002818-PA;CFLO003059-PA;CFLO008042-PA;CFLO018530-PA;CFLO003452-PA;CFLO004197-PA;CFLO015469-PA;CFLO011812-PA;CFLO010590-PA;CFLO015983-PA;CFLO007207-PA;CFLO010821-PA;CFLO014819-PA;CFLO001638-PA;CFLO001629-PA;CFLO003236-PA;CFLO000566-PA;CFLO004457-PA;CFLO007362-PA;CFLO007368-PA;CFLO007408-PA;CFLO015980-PA;CFLO000631-PA;CFLO011518-PA KEGG: 00250+6.3.4.4 Alanine, aspartate and glutamate metabolism 1 CFLO002187-PA KEGG: 00710+5.3.1.1 Carbon fixation in photosynthetic organisms 1 CFLO017154-PA Reactome: R-HSA-180024 DARPP-32 events 2 CFLO010012-PA;CFLO013102-PA MetaCyc: PWY-1861 Formaldehyde assimilation II (assimilatory RuMP Cycle) 6 CFLO000222-PA;CFLO005131-PA;CFLO006969-PA;CFLO001993-PA;CFLO000118-PA;CFLO013167-PA